More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0802 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_0802  radical SAM family Fe-S protein  100 
 
 		 561 aa  1169    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.93988 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0183  radical SAM domain-containing protein  50.39 
 
 		 608 aa  546  1e-154  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.531791 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0580  Radical SAM domain protein  45.07 
 
 		 513 aa  469  1.0000000000000001e-131  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.720942  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2775  MoaA/NifB/PqqE family protein  43.29 
 
 		 495 aa  445  1e-123  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0603856  normal  0.0689174 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3420  MoaA/NifB/PqqE family protein  41.99 
 
 		 506 aa  427  1e-118  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.53604  normal  0.549751 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1003  radical SAM domain-containing protein  41.77 
 
 		 489 aa  416  9.999999999999999e-116  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00934778  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0843  radical SAM domain-containing protein  42.22 
 
 		 487 aa  414  1e-114  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.996552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2362  Radical SAM domain protein  39.36 
 
 		 512 aa  403  1e-111  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.199489 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0574  radical SAM domain-containing protein  41.52 
 
 		 496 aa  402  9.999999999999999e-111  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.983421  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1106  radical SAM family protein  41 
 
 		 495 aa  397  1e-109  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.289399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0319  hypothetical protein  40.44 
 
 		 491 aa  394  1e-108  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0115  radical SAM domain-containing protein  37.97 
 
 		 559 aa  366  1e-100  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000926294 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1684  radical SAM domain-containing protein  40.21 
 
 		 472 aa  363  6e-99  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.622804  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0703  radical SAM domain-containing protein  36.33 
 
 		 609 aa  358  1.9999999999999998e-97  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0020  radical SAM domain-containing protein  35.36 
 
 		 581 aa  346  7e-94  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00170872 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1446  radical SAM domain-containing protein  37.73 
 
 		 573 aa  345  1e-93  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1809  radical SAM domain-containing protein  36.89 
 
 		 578 aa  343  4e-93  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.335774  normal  0.27889 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1009  radical SAM domain-containing protein  37.05 
 
 		 573 aa  343  5.999999999999999e-93  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.209169  hitchhiker  0.0000165729 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1215  Radical SAM domain protein  35.51 
 
 		 582 aa  340  5e-92  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0970517  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1639  radical SAM domain-containing protein  36.4 
 
 		 579 aa  330  5.0000000000000004e-89  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0089  radical SAM domain-containing protein  34.88 
 
 		 569 aa  317  3e-85  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.63352  normal  0.503154 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0793  radical SAM family Fe-S protein  33.96 
 
 		 706 aa  313  3.9999999999999997e-84  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.768021  normal  0.693881 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0225  Fe-S oxidoreductase  31.12 
 
 		 459 aa  252  1e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1470  Radical SAM domain protein  32.57 
 
 		 445 aa  251  2e-65  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1938  radical SAM domain-containing protein  32.42 
 
 		 727 aa  250  5e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1003  radical SAM domain-containing protein  32.58 
 
 		 458 aa  245  9.999999999999999e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1314  radical SAM domain-containing protein  31.8 
 
 		 470 aa  244  3e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.147685  hitchhiker  0.000205505 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3141  Radical SAM domain protein  31.97 
 
 		 441 aa  242  2e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3275  Radical SAM domain protein  30.96 
 
 		 447 aa  241  2.9999999999999997e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1614  Radical SAM domain protein  31.58 
 
 		 471 aa  241  2.9999999999999997e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3435  Radical SAM domain protein  31.43 
 
 		 492 aa  240  5e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0931  Radical SAM domain protein  29.11 
 
 		 436 aa  233  1e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.996122  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2615  Radical SAM domain protein  31.24 
 
 		 471 aa  231  3e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1889  Radical SAM domain protein  36.31 
 
 		 441 aa  227  6e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1986  radical SAM domain-containing protein  30.56 
 
 		 453 aa  226  9e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1557  Radical SAM domain protein  30.74 
 
 		 467 aa  220  5e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.344613  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1807  radical SAM family protein  30.71 
 
 		 465 aa  217  4e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0681457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3544  Elongator protein 3/MiaB/NifB  31.75 
 
 		 464 aa  217  5.9999999999999996e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2391  MoaA/NifB/PqqE family protein  30 
 
 		 455 aa  215  9.999999999999999e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.426665  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1818  Radical SAM domain protein  30 
 
 		 519 aa  209  1e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.630442  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2597  radical SAM domain-containing protein  29.19 
 
 		 523 aa  207  4e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.054698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1813  Radical SAM domain protein  29.11 
 
 		 442 aa  206  1e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13761  transferase  28.46 
 
 		 776 aa  205  2e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.881516  normal  0.437263 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2795  radical SAM domain-containing protein  27.22 
 
 		 530 aa  203  7e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.420815  hitchhiker  0.00106438 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0823  Radical SAM domain protein  29.75 
 
 		 463 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2134  radical SAM family Fe-S protein  28.77 
 
 		 479 aa  197  5.000000000000001e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.426592  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0301  radical SAM domain-containing protein  29.33 
 
 		 481 aa  194  5e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4048  radical SAM family Fe-S protein  26.49 
 
 		 486 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0254  hypothetical protein  29.96 
 
 		 471 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0356803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0409  radical SAM family protein  26.92 
 
 		 474 aa  179  1e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.343517 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1579  radical SAM domain-containing protein  34.66 
 
 		 543 aa  160  5e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.803741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0637  Radical SAM domain protein  29.52 
 
 		 588 aa  155  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.179441 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4615  radical SAM domain-containing protein  23.44 
 
 		 514 aa  129  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4236  radical SAM family protein  23.44 
 
 		 514 aa  129  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.767249  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4322  radical SAM domain-containing protein  23.44 
 
 		 514 aa  129  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.935784 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3844  radical SAM domain-containing protein  22.75 
 
 		 533 aa  114  6e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2609  Radical SAM domain protein  29.65 
 
 		 402 aa  81.6  0.00000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.342022  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  34.05 
 
 		 496 aa  78.2  0.0000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1322  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  26.48 
 
 		 317 aa  77.4  0.0000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.331504  normal  0.241678 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1099  radical SAM domain-containing protein  32.62 
 
 		 501 aa  77  0.0000000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1390  putative molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.23 
 
 		 296 aa  76.3  0.000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.212128  normal  0.415748 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1392  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.49 
 
 		 317 aa  72  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1793  metallo cofactor biosynthesis protein  28.95 
 
 		 399 aa  72  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.91522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3261  radical SAM family protein  27.8 
 
 		 379 aa  71.6  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0882  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.05 
 
 		 323 aa  71.6  0.00000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0349  radical SAM domain-containing protein  26.36 
 
 		 427 aa  70.9  0.00000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1991  radical SAM domain-containing protein  28.22 
 
 		 381 aa  70.9  0.00000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0387606  normal  0.206645 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2270  radical SAM domain-containing protein  27.75 
 
 		 345 aa  70.1  0.0000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.158683 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2110  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  23.95 
 
 		 356 aa  69.3  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.163596  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2575  Elongator protein 3/MiaB/NifB  32.67 
 
 		 394 aa  67.8  0.0000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1760  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  22.45 
 
 		 323 aa  68.2  0.0000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.7115  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2045  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  22.45 
 
 		 323 aa  67.8  0.0000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.990495  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2958  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.92 
 
 		 325 aa  67.8  0.0000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2352  Radical SAM domain protein  26.11 
 
 		 565 aa  67  0.0000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1581  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.76 
 
 		 341 aa  66.6  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1225  radical SAM domain-containing protein  29.03 
 
 		 395 aa  67  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2391  Radical SAM domain protein  30.27 
 
 		 397 aa  66.2  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3130  radical SAM domain-containing protein  27.06 
 
 		 404 aa  66.2  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0791  Radical SAM domain protein  29.14 
 
 		 415 aa  65.9  0.000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1203  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.45 
 
 		 308 aa  65.1  0.000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.31848  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0240  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26 
 
 		 330 aa  65.1  0.000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0876  radical SAM domain-containing protein  32.87 
 
 		 398 aa  65.5  0.000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0451643  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0739  radical SAM domain-containing protein  24.56 
 
 		 347 aa  65.1  0.000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3073  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.72 
 
 		 330 aa  65.5  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.342071  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0205  Radical SAM domain protein  28.04 
 
 		 340 aa  64.7  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0667932  normal  0.157312 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1926  radical SAM domain-containing protein  25.15 
 
 		 347 aa  64.7  0.000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.265306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2430  radical SAM domain-containing protein  25.65 
 
 		 347 aa  64.7  0.000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.943222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0071  Elongator protein 3/MiaB/NifB  29.66 
 
 		 399 aa  64.7  0.000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.180935  normal  0.590405 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0373  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  23.53 
 
 		 323 aa  64.3  0.000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04410  Radical SAM domain protein  29.56 
 
 		 450 aa  64.3  0.000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1711  Radical SAM domain protein  26.2 
 
 		 406 aa  64.3  0.000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.219592  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1906  radical SAM domain-containing protein  26.06 
 
 		 406 aa  64.3  0.000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.9961 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2076  Radical SAM domain protein  30.87 
 
 		 382 aa  63.5  0.000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3175  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.48 
 
 		 337 aa  63.9  0.000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0260  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.42 
 
 		 331 aa  63.5  0.000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.678678  normal  0.916365 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1255  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  29.14 
 
 		 319 aa  63.5  0.000000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1877  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.48 
 
 		 329 aa  63.2  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1348  Radical SAM domain protein  31.18 
 
 		 322 aa  63.2  0.00000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0892  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.32 
 
 		 326 aa  62.8  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1830  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  23.08 
 
 		 328 aa  63.2  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>