More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0559 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_0559  ABC efflux pump, inner membrane subunit  100 
 
 
386 aa  783    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00044398  normal  0.112783 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0187  hypothetical protein  31.55 
 
 
364 aa  191  2e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.427109 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1340  ABC transporter, permease protein  24.24 
 
 
386 aa  94.7  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0918  hypothetical protein  24.01 
 
 
389 aa  94.4  3e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0847  hypothetical protein  23.95 
 
 
855 aa  91.7  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0677  ABC transporter, permease protein, putative  25 
 
 
387 aa  88.2  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.297561  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1553  hypothetical protein  24.18 
 
 
386 aa  88.2  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1372  protein of unknown function DUF214  27.74 
 
 
378 aa  87.4  4e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.669142  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1376  hypothetical protein  26.89 
 
 
386 aa  86.7  6e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1958  protein of unknown function DUF214  29.96 
 
 
413 aa  85.1  0.000000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.8831  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2168  protein of unknown function DUF214  22.47 
 
 
386 aa  84.3  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3643  hypothetical protein  23.2 
 
 
386 aa  84.3  0.000000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3466  hypothetical protein  23.99 
 
 
399 aa  83.6  0.000000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0545  protein of unknown function DUF214  25.69 
 
 
386 aa  83.6  0.000000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1025  protein of unknown function DUF214  26.42 
 
 
397 aa  82.8  0.000000000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.347391 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2974  hypothetical protein  24.77 
 
 
411 aa  82  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2646  ABC transporter, permease component  23.55 
 
 
374 aa  82.8  0.00000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0082  hypothetical protein  23.2 
 
 
386 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2006  hypothetical protein  25.12 
 
 
395 aa  82.4  0.00000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.151013  normal  0.929725 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2054  protein of unknown function DUF214  23.21 
 
 
386 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.01978e-17 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1178  hypothetical protein  23.36 
 
 
847 aa  81.6  0.00000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.883962  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3715  protein of unknown function DUF214  23.43 
 
 
852 aa  81.3  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713812  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0889  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  22.47 
 
 
411 aa  81.3  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0748  ABC transporter permease/ATP-binding protein  30 
 
 
664 aa  80.1  0.00000000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1942  protein of unknown function DUF214  28.8 
 
 
443 aa  79.3  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003048  ABC-type antimicrobial peptide transport system permease component  24.23 
 
 
400 aa  77.4  0.0000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1371  protein of unknown function DUF214  27.01 
 
 
386 aa  77  0.0000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.381039  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3762  protein of unknown function DUF214  36.02 
 
 
452 aa  76.6  0.0000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1894  protein of unknown function DUF214  24.01 
 
 
385 aa  76.6  0.0000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1780  protein of unknown function DUF214  39.84 
 
 
413 aa  76.6  0.0000000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4455  protein of unknown function DUF214  30.64 
 
 
395 aa  76.3  0.0000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0109  protein of unknown function DUF214  24.7 
 
 
419 aa  76.3  0.0000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0971  hypothetical protein  21.55 
 
 
397 aa  75.5  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0827102  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0721  ABC efflux pump, inner membrane subunit  26 
 
 
410 aa  76.3  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1636  protein of unknown function DUF214  27.57 
 
 
421 aa  75.1  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3445  hypothetical protein  27.09 
 
 
389 aa  75.5  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000000235465  normal  0.187048 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2195  hypothetical protein  22.42 
 
 
389 aa  75.1  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.264463 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3743  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  23.13 
 
 
410 aa  74.7  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.14534  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1574  hypothetical protein  23.51 
 
 
789 aa  73.9  0.000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1564  hypothetical protein  23.82 
 
 
397 aa  73.9  0.000000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0059  hypothetical protein  25.75 
 
 
397 aa  73.2  0.000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0200  hypothetical protein  24.81 
 
 
391 aa  73.2  0.000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1604  hypothetical protein  26.85 
 
 
443 aa  73.2  0.000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0322  hypothetical protein  25.87 
 
 
393 aa  73.2  0.000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.549176 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1724  protein of unknown function DUF214  23.88 
 
 
406 aa  72.4  0.00000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000472644  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3129  protein of unknown function DUF214  30 
 
 
406 aa  72.4  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0833  ABC transporter related  25 
 
 
667 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.337791  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3170  ABC transporter related  25 
 
 
647 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.018636  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4105  protein of unknown function DUF214  23.65 
 
 
403 aa  72.8  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0276302 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1721  protein of unknown function DUF214  23.63 
 
 
406 aa  71.6  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1658  hypothetical protein  21.3 
 
 
397 aa  71.6  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4848  hypothetical protein  30.42 
 
 
413 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0956312  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2096  hypothetical protein  24.88 
 
 
464 aa  71.6  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6251  hypothetical protein  25.82 
 
 
789 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.424729  normal  0.803143 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0049  hypothetical protein  21.53 
 
 
397 aa  71.6  0.00000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3463  hypothetical protein  24.75 
 
 
402 aa  71.2  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0790  putative ABC transporter permease protein  23.54 
 
 
371 aa  70.9  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.119405 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2932  hypothetical protein  33.8 
 
 
390 aa  71.2  0.00000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000965565  normal  0.65467 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0722  ABC efflux pump, inner membrane subunit  23.79 
 
 
420 aa  71.2  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2758  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.16 
 
 
415 aa  71.2  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4377  ABC efflux pump, inner membrane subunit  39.02 
 
 
411 aa  71.2  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0682  ABC transporter, permease protein  29.17 
 
 
404 aa  70.5  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.834808  normal  0.683549 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0410  hypothetical protein  20.25 
 
 
397 aa  70.9  0.00000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.534862  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2215  protein of unknown function DUF214  40.46 
 
 
402 aa  70.9  0.00000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.556165  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1886  hypothetical protein  34.96 
 
 
821 aa  70.5  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0637904 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4939  protein of unknown function DUF214  23.4 
 
 
406 aa  70.5  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.485903  normal  0.767822 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0255  hypothetical protein  20.55 
 
 
397 aa  70.1  0.00000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2385  hypothetical protein  25.41 
 
 
387 aa  70.1  0.00000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00156944  normal  0.95956 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3519  protein of unknown function DUF214  27.09 
 
 
416 aa  69.7  0.00000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.225235  normal  0.132299 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1366  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  23.31 
 
 
408 aa  69.7  0.00000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.217764  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2926  hypothetical protein  30.81 
 
 
394 aa  69.7  0.00000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.019889  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00555  ABC transporter efflux protein  28.1 
 
 
417 aa  69.3  0.00000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.29728  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1135  hypothetical protein  20.71 
 
 
397 aa  69.7  0.00000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.68227  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0940  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  23.1 
 
 
415 aa  69.7  0.00000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3535  ABC transporter related  24.75 
 
 
682 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000291917  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1437  ABC transporter  25.81 
 
 
409 aa  69.3  0.0000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.51547  normal  0.142373 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0999  protein of unknown function DUF214  24.38 
 
 
417 aa  69.3  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000110671 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2440  protein of unknown function DUF214  27.74 
 
 
416 aa  69.3  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.652514  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4376  ABC efflux pump, inner membrane subunit  37.6 
 
 
437 aa  69.3  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7898  protein of unknown function DUF214  29.35 
 
 
853 aa  69.3  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0494  hypothetical protein  24.56 
 
 
399 aa  68.9  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.355429  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08461  putative ABC transporter  25.31 
 
 
409 aa  68.9  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.825972  hitchhiker  0.00227994 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0826  ABC transporter related  24.75 
 
 
682 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.018784  hitchhiker  0.00000000432999 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0800  protein of unknown function DUF214  24.1 
 
 
848 aa  68.6  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1870  protein of unknown function DUF214  25.97 
 
 
398 aa  68.6  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4227  hypothetical protein  22.35 
 
 
408 aa  68.9  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.405326  normal  0.650749 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0198  hypothetical protein  25.67 
 
 
411 aa  68.2  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.146044  normal  0.294126 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0801  ABC transporter related  24.75 
 
 
667 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00129194  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1485  protein of unknown function DUF214  26.45 
 
 
417 aa  68.9  0.0000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.608649 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0456  protein of unknown function DUF214  23.1 
 
 
412 aa  68.2  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3777  hypothetical protein  26.24 
 
 
383 aa  68.6  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2994  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  23.66 
 
 
417 aa  67.8  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3916  hypothetical protein  34.62 
 
 
402 aa  67.8  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2927  protein of unknown function DUF214  42.02 
 
 
409 aa  67.8  0.0000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.58384  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3335  ABC transporter, permease protein  25.13 
 
 
463 aa  67.4  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.887003  normal  0.0261397 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1143  ABC transporter related  31.82 
 
 
653 aa  67.4  0.0000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.229831  normal  0.618242 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1388  hypothetical protein  23.46 
 
 
429 aa  67.4  0.0000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4481  hypothetical protein  26.04 
 
 
854 aa  67.4  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.180518  normal  0.201948 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0078  hypothetical protein  29.11 
 
 
404 aa  67  0.0000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000923125  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02570  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  27.78 
 
 
417 aa  67  0.0000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000358315  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>