More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_0365 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008578  Acel_0365  two component LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 199 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.210231  normal  0.243335 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0739  two component transcriptional regulator, LuxR family  53 
 
 		 204 aa  193  2e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.297506  normal  0.226729 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1011  two component transcriptional regulator, LuxR family  51 
 
 		 203 aa  182  3e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.109267 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1210  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.95 
 
 		 198 aa  154  7e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.292938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04700  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  49.49 
 
 		 198 aa  142  3e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.162406  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6539  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.99 
 
 		 198 aa  141  8e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.370011  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2586  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.86 
 
 		 223 aa  128  5.0000000000000004e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.646343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0516  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.85 
 
 		 231 aa  122  3e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1020  response regulator receiver  35.48 
 
 		 218 aa  118  6e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.648692  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1929  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.35 
 
 		 209 aa  116  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.142226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0975  two component LuxR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 222 aa  116  3e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0973  two component LuxR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 216 aa  113  2.0000000000000002e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.255067  normal  0.404517 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21820  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.54 
 
 		 211 aa  112  5e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3040  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.26 
 
 		 224 aa  110  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0154763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4485  two component LuxR family transcriptional regulator  32.55 
 
 		 213 aa  110  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.310872  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3262  two component LuxR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 222 aa  109  3e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.764026 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0199  response regulator receiver protein  36.06 
 
 		 213 aa  107  9.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33010  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  33.97 
 
 		 223 aa  107  1e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.163463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3421  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 223 aa  107  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0556432 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3331  response regulator receiver protein  34.93 
 
 		 227 aa  106  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.832029  normal  0.250763 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1984  two component LuxR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 220 aa  107  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.178457  normal  0.123783 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2325  two component transcriptional regulator, LuxR family  27.31 
 
 		 228 aa  106  3e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2533  response regulator receiver protein  35.24 
 
 		 220 aa  105  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.495874 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4449  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.29 
 
 		 253 aa  105  5e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1387  DNA-binding response regulator  32.35 
 
 		 214 aa  104  7e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00141106  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1355  two component LuxR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 230 aa  104  7e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5066  LuxR response regulator receiver  30.73 
 
 		 217 aa  104  8e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.822528  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1438  response regulator receiver  33.8 
 
 		 213 aa  104  8e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.494689  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2926  two component LuxR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 223 aa  103  1e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.380263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4479  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.68 
 
 		 224 aa  104  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.518456  normal  0.598935 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2613  two component LuxR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 207 aa  103  1e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1684  response regulator receiver protein  31.75 
 
 		 207 aa  104  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.966789 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2510  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.21 
 
 		 217 aa  103  2e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0967  DNA-binding response regulator  29.41 
 
 		 209 aa  103  2e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.598364  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3643  two component LuxR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 215 aa  103  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.516516  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7105  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.44 
 
 		 241 aa  102  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106023  normal  0.469545 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3745  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.33 
 
 		 235 aa  102  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.627677  normal  0.255424 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1760  two component LuxR family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 303 aa  102  4e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.887336 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3847  two component LuxR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 216 aa  102  4e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.118356  decreased coverage  0.00872558 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0322  DNA-binding response regulator  28.57 
 
 		 213 aa  102  5e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1030  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.55 
 
 		 212 aa  102  5e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0775  LuxR family two component transcriptional regulator  30.99 
 
 		 234 aa  102  5e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.336237 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0480  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.81 
 
 		 214 aa  101  7e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0806  two component LuxR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 216 aa  101  8e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8412  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.11 
 
 		 239 aa  101  9e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1384  LuxR family DNA-binding response regulator  29.27 
 
 		 207 aa  100  1e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000639089  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38420  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  31.9 
 
 		 226 aa  100  1e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1417  response regulator receiver protein  31.58 
 
 		 234 aa  100  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0224272 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2491  LuxR response regulator receiver  34.11 
 
 		 242 aa  99.8  2e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.470277  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2950  LuxR response regulator receiver  31.68 
 
 		 221 aa  99.8  2e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4871  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.67 
 
 		 222 aa  100  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.134443  normal  0.31614 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1198  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.18 
 
 		 225 aa  99.8  2e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.109916  normal  0.0247339 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0356  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.11 
 
 		 220 aa  99.4  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.165726  normal  0.0985551 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4675  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.7 
 
 		 218 aa  99.4  3e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.760252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7812  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.03 
 
 		 227 aa  99.8  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2003  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.17 
 
 		 219 aa  99.8  3e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.183245  hitchhiker  0.00373502 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1550  two component LuxR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 220 aa  99.4  3e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0857  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.38 
 
 		 219 aa  99.8  3e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0762303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1651  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.79 
 
 		 218 aa  99.8  3e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000163278  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3598  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.7 
 
 		 218 aa  99.4  3e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.329097  normal  0.731815 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0978  two component signal transduction response regulator  28.97 
 
 		 223 aa  99  4e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0402933  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3253  two component LuxR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 213 aa  99.4  4e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4778  two component LuxR family transcriptional regulator  33.52 
 
 		 208 aa  99  4e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000269792  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1951  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.26 
 
 		 226 aa  98.6  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0924411 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1910  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.68 
 
 		 218 aa  98.6  5e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6057  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.33 
 
 		 217 aa  99  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7843  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.04 
 
 		 231 aa  98.6  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.176081 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0102  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.75 
 
 		 221 aa  98.6  6e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0637251  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0692  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.5 
 
 		 213 aa  98.2  7e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4229  two component LuxR family transcriptional regulator  78.12 
 
 		 270 aa  98.2  7e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.104641 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4275  two component LuxR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 226 aa  98.2  7e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.798613  normal  0.287125 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3240  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.84 
 
 		 224 aa  98.2  8e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3839  regulatory protein, LuxR  79.37 
 
 		 268 aa  97.8  8e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13154  two component system transcriptional regulatory protein DevR  33.17 
 
 		 217 aa  98.2  8e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5540  DNA-binding response regulator  27.36 
 
 		 215 aa  97.8  9e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1400  two component signal transduction response regulator  30.19 
 
 		 214 aa  97.8  9e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3251  response regulator receiver protein  32.86 
 
 		 221 aa  97.8  9e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0793449  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0373  response regulator receiver  30.33 
 
 		 220 aa  97.1  1e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2087  two component LuxR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 217 aa  97.8  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.332036 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2302  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.57 
 
 		 226 aa  97.4  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0191252  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5644  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.6 
 
 		 225 aa  97.4  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.114252 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2042  two component LuxR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 208 aa  97.8  1e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2108  two component LuxR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 218 aa  97.4  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4132  response regulator receiver  34.86 
 
 		 235 aa  97.4  1e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.232221  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1769  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.17 
 
 		 219 aa  97.4  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.221401  normal  0.0578747 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0253  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.68 
 
 		 218 aa  97.4  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00210  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  30.37 
 
 		 221 aa  96.3  2e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.133182 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5091  response regulator  27.36 
 
 		 215 aa  96.7  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5108  response regulator  27.36 
 
 		 215 aa  96.7  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00235048  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1446  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.33 
 
 		 223 aa  96.7  2e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0765  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.17 
 
 		 222 aa  96.7  2e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5661  DNA-binding response regulator  27.36 
 
 		 215 aa  96.7  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0765  two component LuxR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 237 aa  96.7  2e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.272345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5506  DNA-binding response regulator  27.36 
 
 		 215 aa  96.7  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5202  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.23 
 
 		 225 aa  96.3  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.677169  normal  0.920773 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4744  response regulator receiver protein  31.28 
 
 		 209 aa  97.1  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.620464  normal  0.690137 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1346  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.68 
 
 		 236 aa  96.7  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.361751  hitchhiker  0.00000337078 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2171  two component LuxR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 218 aa  97.1  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0762379  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5619  response regulator receiver protein  35.68 
 
 		 226 aa  97.1  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0556461  normal  0.802866 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2656  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.33 
 
 		 226 aa  96.7  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.161573  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>