105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0622 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013926  Aboo_0622  PilT protein domain protein  100 
 
 
597 aa  1195    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0503  ATPase  46.38 
 
 
633 aa  518  1e-146  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1791  ATPase  46.89 
 
 
618 aa  512  1e-144  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00115762  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0301  ATPase  45.87 
 
 
629 aa  512  1e-144  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.070648  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0223  ATPase  45.23 
 
 
602 aa  496  1e-139  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1392  ATPase  44.06 
 
 
630 aa  494  9.999999999999999e-139  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1292  ATPase  44.84 
 
 
634 aa  494  9.999999999999999e-139  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0672  ATPase  43.95 
 
 
630 aa  490  1e-137  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.215241  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1247  ATPase  42.2 
 
 
651 aa  488  1e-136  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1284  ATPase  43.73 
 
 
630 aa  486  1e-136  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3490  ATPase  44.62 
 
 
640 aa  481  1e-134  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.622466  normal  0.276666 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0722  ATPase  43.62 
 
 
633 aa  475  1e-132  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0212836  normal  0.622935 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3514  PilT protein domain protein  42.18 
 
 
625 aa  473  1e-132  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1543  PilT protein domain protein  46.39 
 
 
631 aa  465  1e-129  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1054  ATPase  44.79 
 
 
605 aa  447  1.0000000000000001e-124  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0689  ATPase  38.41 
 
 
642 aa  437  1e-121  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00061638  normal  0.134413 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1923  ATPase  36.97 
 
 
658 aa  424  1e-117  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2922  ATPase  35.78 
 
 
655 aa  410  1e-113  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.779051  normal  0.431626 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2007  ATPase  36.97 
 
 
631 aa  410  1e-113  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00148189  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0536  ATPase  41.98 
 
 
530 aa  390  1e-107  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1405  ATPase  34.82 
 
 
671 aa  389  1e-107  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1639  Nucleotide binding protein PINc  45.22 
 
 
510 aa  377  1e-103  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.917649  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1101  ATPase  41.29 
 
 
517 aa  377  1e-103  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1925  ATPase  40.49 
 
 
506 aa  372  1e-102  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0298  ATPase  41.23 
 
 
521 aa  370  1e-101  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.350662  normal  0.0582555 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0407  ATPase  44.72 
 
 
520 aa  360  3e-98  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1721  ATPase  43.1 
 
 
518 aa  355  2e-96  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0370491  decreased coverage  0.0000123614 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1385  ATPase  40.33 
 
 
519 aa  352  7e-96  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.111858 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06193  flp pilus assembly ATPase CpaF  24.46 
 
 
423 aa  55.5  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0608  type II secretion system protein E  27.41 
 
 
423 aa  52.4  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2692  type II secretion system protein E  26.47 
 
 
462 aa  52.8  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0670  type II secretion system protein E  27.63 
 
 
466 aa  52.4  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.811515  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0898  type II secretion system protein E  27.63 
 
 
467 aa  52.8  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1659  type II secretion system protein E  27.74 
 
 
408 aa  52  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2324  type II secretion system protein E  25.88 
 
 
444 aa  50.8  0.00006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2702  tight adherence protein TadA  25.88 
 
 
444 aa  50.8  0.00006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.585164  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0599  type II/IV secretion system protein  25.53 
 
 
428 aa  50.8  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0260  type II/IV secretion system protein  25.53 
 
 
428 aa  50.8  0.00007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000662566  hitchhiker  0.0000000763288 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0682  type II secretion system protein E  25.53 
 
 
428 aa  50.8  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.667296  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3490  type II secretion system protein E  27.93 
 
 
478 aa  50.8  0.00007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.057514 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1783  type IV pilus biogenesis protein PilB, putative  28.89 
 
 
574 aa  49.7  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.989309  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2761  type II secretion system protein E  32.48 
 
 
416 aa  49.3  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.580196 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5001  P-type DNA transfer ATPase VirB11  28.57 
 
 
334 aa  49.3  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.547731  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0309  type II secretion system protein E  26.71 
 
 
455 aa  49.3  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1161  type II secretion system protein E  24.58 
 
 
469 aa  49.3  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2555  type II secretion system protein E  27.59 
 
 
464 aa  48.9  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.174933  normal  0.12963 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2160  type II secretion system protein E  31.01 
 
 
438 aa  48.5  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0397447  normal  0.0352451 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1408  type II secretion system protein E  28.57 
 
 
577 aa  48.5  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.22381  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1448  twitching motility protein  25.83 
 
 
358 aa  48.9  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.991053  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0174  PilT protein domain protein  28.8 
 
 
367 aa  48.5  0.0003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1477  PilT protein domain protein  29.6 
 
 
269 aa  47.8  0.0005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0506591  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2018  type II secretion system protein E  25.53 
 
 
445 aa  47.4  0.0007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0372  type II/IV secretion system protein, ATP binding domain  27.35 
 
 
428 aa  47.4  0.0007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00402347  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2825  type II secretion system protein E  24.32 
 
 
450 aa  46.6  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0856  type II secretion system protein E  31.33 
 
 
411 aa  47  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0383004  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0847  twitching motility protein  29.2 
 
 
370 aa  45.8  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.788432 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1522  type II secretion system protein E  29.66 
 
 
467 aa  46.2  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0726  type II secretion system protein E  26.72 
 
 
492 aa  46.2  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.50497  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0032  type II secretion system protein E  27.52 
 
 
404 aa  45.8  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7195  Flp pilus assembly protein ATPase CpaF  28.1 
 
 
455 aa  45.4  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.141277  normal  0.285879 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4400  type II secretion system protein E  32.09 
 
 
575 aa  45.4  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1322  type II secretion system protein E  27.34 
 
 
553 aa  45.1  0.003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0787535 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3009  type II secretion system protein E  25.98 
 
 
445 aa  45.1  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3656  type II/IV secretion system protein, ATPase domain-containing protein  24.86 
 
 
438 aa  45.1  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0439  type II secretion system protein E  28.26 
 
 
671 aa  45.1  0.004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20011  integral membrane protein  30.95 
 
 
389 aa  45.1  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.192672 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1451  type II secretion system protein E  26.12 
 
 
574 aa  45.1  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2045  type II secretion system protein E  29.41 
 
 
458 aa  45.1  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0948744  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0652  secretion ATPase protein  26.14 
 
 
453 aa  44.7  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.199713 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2271  hypothetical protein  22.92 
 
 
373 aa  44.7  0.005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2243  hypothetical protein  22.92 
 
 
373 aa  44.7  0.005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0799  type II secretion system protein E  27.97 
 
 
452 aa  44.7  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6298  type II secretion system protein E  26.56 
 
 
455 aa  44.7  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2420  type II secretion system protein E  26.35 
 
 
573 aa  44.7  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0072  type II secretion system protein E  27.97 
 
 
408 aa  44.7  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.928138  normal  0.608061 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3426  general secretory pathway protein E  25.49 
 
 
497 aa  44.7  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6002  type II secretion system protein E  26.56 
 
 
455 aa  44.7  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.661496  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5411  type II secretion system protein E  24.28 
 
 
440 aa  44.3  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0593921  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0795  type II secretion system protein  26.57 
 
 
472 aa  44.3  0.006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2354  type II secretion system protein E  26.32 
 
 
452 aa  44.3  0.006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2456  component of type IV pilus  29.41 
 
 
515 aa  44.3  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.080834  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1888  type IV pilus assembly protein  29.41 
 
 
523 aa  44.3  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.414931  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0082  type II secretion system protein E  25.12 
 
 
600 aa  44.3  0.006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.214348  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3966  type II secretion system protein E  25 
 
 
449 aa  44.3  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.406102 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3137  general secretory pathway protein E  25.49 
 
 
497 aa  44.7  0.006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3246  general secretory pathway protein GspE  25.49 
 
 
497 aa  44.3  0.006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.827332 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2044  component of type IV pilus  29.41 
 
 
521 aa  44.3  0.007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.101478  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1864  type II secretion system protein E  26.67 
 
 
573 aa  44.3  0.007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.468476 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1677  CpaF  29.41 
 
 
520 aa  44.3  0.007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.521474  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0333  CpaF  29.41 
 
 
520 aa  44.3  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0947071  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1876  type IV pilus assembly protein  29.41 
 
 
523 aa  44.3  0.007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.483104  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0828  CpaF  29.41 
 
 
520 aa  44.3  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.13968  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0173  type II secretion system protein E  26.36 
 
 
368 aa  44.3  0.007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.579319  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1300  general secretory pathway protein E  25.32 
 
 
498 aa  44.3  0.007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4845  type II secretion system protein E  26.62 
 
 
352 aa  43.9  0.009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0422  type II secretion system protein E  24.02 
 
 
508 aa  43.9  0.009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3321  ATP/GTP-binding motif-containing protein  26.62 
 
 
352 aa  43.9  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0079  PilT domain-containing protein  27.2 
 
 
370 aa  43.9  0.009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2859  general secretory pathway protein E  25.97 
 
 
498 aa  43.9  0.009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5492  type II secretion system protein E  27.27 
 
 
454 aa  43.5  0.01  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0157969  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>