More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_1132 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_2447  ABC transporter related  82.09 
 
 
533 aa  824    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3903  ABC transporter related  77.09 
 
 
511 aa  783    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1005  ABC transporter, ATPase subunit  68.96 
 
 
512 aa  647    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1063  ABC transporter-related protein  68.75 
 
 
512 aa  644    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.83963  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3166  ABC transporter related  72.54 
 
 
508 aa  674    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.539119  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1483  ABC transporter related  76.51 
 
 
514 aa  735    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0560385 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2135  ABC transporter related  80.67 
 
 
533 aa  785    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.597134  normal  0.305125 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3173  ABC transporter related  68.4 
 
 
512 aa  651    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.590502  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1066  ABC transporter related  68.54 
 
 
512 aa  644    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1132  ABC transporter-related protein  100 
 
 
504 aa  1009    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.709072 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1036  ABC transporter related  75.42 
 
 
524 aa  719    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0725845  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3101  ABC transporter related  81.89 
 
 
533 aa  823    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5003  ABC transporter related  74.64 
 
 
527 aa  698    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0803  putative sugar ATP binding ABC transporter protein  71.97 
 
 
509 aa  684    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3457  ABC transporter-related protein  70.38 
 
 
519 aa  694    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.244648 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1976  ABC transporter related  65.63 
 
 
516 aa  609  1e-173  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2173  sugar ATP binding ABC transporter protein  66.32 
 
 
508 aa  608  9.999999999999999e-173  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.83271  normal  0.995047 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2498  ABC transporter related  64.69 
 
 
524 aa  604  1.0000000000000001e-171  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2376  ABC transporter related  64.6 
 
 
504 aa  603  1.0000000000000001e-171  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.390986  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0797  ABC transporter-related protein  64.14 
 
 
537 aa  590  1e-167  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.655156 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1291  ABC transporter related  60.21 
 
 
539 aa  565  1e-160  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1357  ABC transporter related  62.11 
 
 
531 aa  561  1e-158  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2321  ABC transporter related  59.58 
 
 
533 aa  558  1e-157  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.640938 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1938  ABC transporter, fused ATPase subunits  59.58 
 
 
533 aa  557  1e-157  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.633087  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0838  ABC transporter related protein  59.34 
 
 
516 aa  556  1e-157  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.624607  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5874  ABC transporter related  56.88 
 
 
511 aa  519  1e-146  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0769  ABC transporter, ATP-binding protein  55.49 
 
 
517 aa  507  9.999999999999999e-143  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1905  ABC transporter component  55.58 
 
 
530 aa  507  9.999999999999999e-143  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0673  ABC transporter  54.77 
 
 
517 aa  503  1e-141  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.918882  normal  0.379725 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2990  ABC transporter related  54.53 
 
 
513 aa  496  1e-139  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0926218 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0681  ABC transporter-like  54.02 
 
 
516 aa  495  1e-139  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000167048  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1926  ABC transporter related  50.2 
 
 
517 aa  490  1e-137  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.748491 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3632  ABC transporter related  52.04 
 
 
520 aa  485  1e-136  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0570  ABC transporter, ATP-binding protein  52.05 
 
 
520 aa  480  1e-134  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01670  putative ATP-binding component of ABC transporter  53.61 
 
 
523 aa  477  1e-133  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000256924  normal  0.788807 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1716  ABC transporter related  50.72 
 
 
522 aa  473  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0213  ABC transporter ATP-binding protein  52.99 
 
 
523 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0557881  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0533  ABC transporter, ATP-binding protein  52.11 
 
 
567 aa  465  9.999999999999999e-131  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0496  ABC transporter related  52.65 
 
 
506 aa  463  1e-129  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0969653 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1900  ABC transporter related  49.22 
 
 
522 aa  462  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.948331  normal  0.18813 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2961  ABC transporter ATP binding protein  52.26 
 
 
511 aa  459  9.999999999999999e-129  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.143665 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3557  ABC transporter ATPase  53.24 
 
 
507 aa  456  1e-127  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.419368  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3240  ABC transporter related  53.44 
 
 
507 aa  457  1e-127  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0754333  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1693  ABC transporter related  50.21 
 
 
522 aa  454  1.0000000000000001e-126  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.132943  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2060  putative ABC transporter ATP-binding protein  51.03 
 
 
522 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.31936 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2145  ABC transporter related  52.42 
 
 
546 aa  451  1e-125  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0106398  normal  0.534424 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3945  hypothetical protein  53.33 
 
 
506 aa  448  1.0000000000000001e-124  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.136005  normal  0.317773 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0934  ABC transporter related  50.93 
 
 
505 aa  443  1e-123  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0331703  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2166  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  49.46 
 
 
532 aa  444  1e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5055  ABC transporter related  49.69 
 
 
521 aa  443  1e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1698  ABC transporter related  51.02 
 
 
535 aa  443  1e-123  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.508023  normal  0.0695334 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4466  ABC transporter related  53.93 
 
 
506 aa  442  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.130142 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1418  ABC transporter related  48.67 
 
 
544 aa  440  9.999999999999999e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.069949  normal  0.112153 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6464  ABC transporter related  53.42 
 
 
506 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.51387  normal  0.933482 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2017  ABC transporter related  50.61 
 
 
534 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.460503  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1120  ABC transporter related  50.73 
 
 
534 aa  435  1e-121  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1763  ABC transporter related  50.31 
 
 
504 aa  431  1e-119  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.267477  normal  0.301135 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1121  ABC transporter related  49.48 
 
 
539 aa  425  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0474016  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1781  ABC transporter related  43.06 
 
 
503 aa  373  1e-102  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000368661  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1831  ABC transporter, ATP-binding protein  39.26 
 
 
511 aa  363  3e-99  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.567476  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1551  sugar ABC transporter ATP-binding protein  39.67 
 
 
511 aa  363  4e-99  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.048612  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1668  ABC transporter-like protein  43.8 
 
 
529 aa  355  1e-96  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0834819  normal  0.0616705 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0402  ABC transporter related  41.77 
 
 
509 aa  352  7e-96  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.351513  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2258  ABC transporter related  38.68 
 
 
514 aa  352  7e-96  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0334051  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1952  ABC transporter related  41.55 
 
 
505 aa  350  2e-95  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00677494 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3051  ABC transporter related  42.51 
 
 
511 aa  350  2e-95  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04900  ATPase component of uncharacterized ABC-type transporter  45.38 
 
 
532 aa  349  7e-95  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3268  ABC transporter related  38.01 
 
 
520 aa  348  2e-94  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00516012  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0844  ABC transporter related  40 
 
 
507 aa  347  3e-94  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2069  ABC transporter related protein  40.12 
 
 
508 aa  347  3e-94  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0821  ABC transporter related  40 
 
 
507 aa  347  3e-94  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0959  ABC transporter related protein  37.7 
 
 
511 aa  347  3e-94  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1949  ABC transporter, ATP-binding protein  39.92 
 
 
507 aa  346  5e-94  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.740579  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1313  ABC transporter related  43.74 
 
 
534 aa  346  5e-94  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.765078  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6453  ABC transporter related  43.48 
 
 
514 aa  346  5e-94  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3238  ABC transporter related protein  42.74 
 
 
532 aa  346  7e-94  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.083946  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3642  sugar ABC transporter ATP-binding protein  39.43 
 
 
508 aa  345  8e-94  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3176  ABC transporter related  43.3 
 
 
517 aa  345  1e-93  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.111078  normal  0.67189 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1353  ABC transporter related protein  42.07 
 
 
516 aa  345  1e-93  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.241589  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1457  ABC transporter-like protein  43.21 
 
 
498 aa  344  2e-93  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0017  ABC transporter related  38.07 
 
 
507 aa  344  2e-93  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3550  ABC transporter, ATP-binding protein  39.31 
 
 
510 aa  343  5.999999999999999e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0119888  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1947  ribose import ATP-binding protein  40.7 
 
 
514 aa  342  7e-93  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0632394  hitchhiker  0.000243405 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3532  ABC transporter, ATP-binding protein  39.31 
 
 
510 aa  342  8e-93  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.664818  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3926  sugar ABC transporter ATP-binding protein  39.31 
 
 
510 aa  342  8e-93  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0557636  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1791  ABC transporter related protein  43.06 
 
 
501 aa  342  1e-92  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0245717  normal  0.194339 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3825  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  39.1 
 
 
510 aa  341  2e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.37688  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3889  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  39.31 
 
 
510 aa  341  2e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.228489  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3803  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  39.1 
 
 
510 aa  340  2e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000201894 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3838  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  39.1 
 
 
510 aa  341  2e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00178952  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4147  ABC transporter related  42.43 
 
 
524 aa  341  2e-92  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2768  ABC transporter related  37.85 
 
 
510 aa  341  2e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05400  nucleoside ABC transporter ATP-binding protein  42.83 
 
 
517 aa  340  2e-92  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08780  ABC transporter related  39.47 
 
 
513 aa  340  2.9999999999999998e-92  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000334619  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07930  nucleoside ABC transporter ATP-binding protein  42.67 
 
 
534 aa  340  2.9999999999999998e-92  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0756  ABC transporter related  36.07 
 
 
509 aa  340  4e-92  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4402  ABC transporter related protein  43.83 
 
 
524 aa  338  9.999999999999999e-92  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1177  ABC transporter related  39.3 
 
 
509 aa  338  1.9999999999999998e-91  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0073  ABC-type uncharacterized transport systems, ATPase component  39.27 
 
 
518 aa  338  1.9999999999999998e-91  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0677  ABC transporter-like protein  42.65 
 
 
503 aa  337  2.9999999999999997e-91  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.366203 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>