More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aasi_0806 on replicon NC_010830
Organism: Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_1311  preprotein translocase subunit SecA  47.28 
 
 
1024 aa  911    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0074  preprotein translocase subunit SecA  38.89 
 
 
968 aa  658    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5004  preprotein translocase subunit SecA  51.87 
 
 
1114 aa  1135    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2050  preprotein translocase subunit SecA  38.1 
 
 
897 aa  655    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0121176  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0514  preprotein translocase subunit SecA  52.71 
 
 
1113 aa  1142    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00876385 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0806  preprotein translocase subunit SecA  100 
 
 
1116 aa  2288    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.211513 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7284  preprotein translocase, SecA subunit  56.17 
 
 
1118 aa  1181    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.884849  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4938  preprotein translocase, SecA subunit  54.7 
 
 
1130 aa  1265    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000192031  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0997  preprotein translocase subunit SecA  46.04 
 
 
1031 aa  913    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.407169 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3555  preprotein translocase subunit SecA  55.85 
 
 
1114 aa  1289    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1274  preprotein translocase subunit SecA  45.76 
 
 
1029 aa  903    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.128332  normal  0.146053 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1088  preprotein translocase subunit SecA  46.96 
 
 
1024 aa  917    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.442494  normal  0.368084 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1018  preprotein translocase subunit SecA  46.26 
 
 
1017 aa  917    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00760005  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0951  preprotein translocase subunit SecA  37.7 
 
 
899 aa  657    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000263053  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0465  preprotein translocase subunit SecA  52.62 
 
 
1120 aa  1145    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1206  preprotein translocase subunit SecA  51.78 
 
 
1027 aa  864    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.944412  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2177  preprotein translocase, SecA subunit  41.26 
 
 
1117 aa  806    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2104  preprotein translocase, SecA subunit  41.38 
 
 
848 aa  664    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000251511  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1677  preprotein translocase, SecA subunit  47.29 
 
 
1004 aa  724    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.243336  normal  0.336231 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0128  preprotein translocase subunit SecA  54.4 
 
 
1118 aa  1252    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0813165 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09101  translocase  51.38 
 
 
1117 aa  1139    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0369  preprotein translocase, SecA subunit  46.56 
 
 
1136 aa  941    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0271  preprotein translocase, SecA subunit  55.07 
 
 
1102 aa  1178    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.838205  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1266  preprotein translocase subunit SecA  46.74 
 
 
1022 aa  892    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2490  preprotein translocase subunit SecA  37.33 
 
 
899 aa  630  1e-179  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0185814  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4974  preprotein translocase subunit SecA  37.27 
 
 
916 aa  628  1e-178  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57220  preprotein translocase subunit SecA  37.46 
 
 
916 aa  626  1e-178  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0938  preprotein translocase subunit SecA  39.86 
 
 
884 aa  624  1e-177  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1202  preprotein translocase, SecA subunit  39.28 
 
 
840 aa  624  1e-177  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.592039  normal  0.254631 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0611  preprotein translocase subunit SecA  37.11 
 
 
910 aa  616  1e-175  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.26873  normal  0.632332 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1072  preprotein translocase subunit SecA  43.44 
 
 
868 aa  615  9.999999999999999e-175  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0016593  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0856  preprotein translocase subunit SecA  37.18 
 
 
917 aa  614  9.999999999999999e-175  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0137755  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1165  preprotein translocase subunit SecA  37.98 
 
 
862 aa  613  9.999999999999999e-175  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1020  preprotein translocase subunit SecA  41.74 
 
 
862 aa  610  1e-173  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0966  preprotein translocase subunit SecA  38 
 
 
862 aa  611  1e-173  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00335629  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04358  preprotein translocase subunit SecA  37.64 
 
 
912 aa  608  9.999999999999999e-173  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0525  preprotein translocase subunit SecA  37.63 
 
 
863 aa  607  9.999999999999999e-173  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4211  preprotein translocase subunit SecA  37.59 
 
 
908 aa  594  1e-168  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1249  preprotein translocase, SecA subunit  39.19 
 
 
904 aa  594  1e-168  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13340  preprotein translocase subunit SecA  36.86 
 
 
915 aa  595  1e-168  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0256  preprotein translocase, SecA subunit  42.19 
 
 
858 aa  590  1e-167  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000954938  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0646  preprotein translocase, SecA subunit  40 
 
 
881 aa  590  1e-167  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0362  preprotein translocase subunit SecA  36.68 
 
 
908 aa  585  1.0000000000000001e-165  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0221508  unclonable  0.0000124471 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1388  preprotein translocase, SecA subunit  41.76 
 
 
859 aa  580  1e-164  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0576  preprotein translocase subunit SecA  41.65 
 
 
855 aa  579  1e-164  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.116184  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3607  preprotein translocase, SecA subunit  37 
 
 
890 aa  576  1.0000000000000001e-163  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3079  preprotein translocase subunit SecA  36.74 
 
 
934 aa  577  1.0000000000000001e-163  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1859  preprotein translocase subunit SecA  41.44 
 
 
869 aa  578  1.0000000000000001e-163  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0385967  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0931  preprotein translocase subunit SecA  37.79 
 
 
939 aa  578  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.667374  normal  0.20776 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0409  preprotein translocase subunit SecA  36.84 
 
 
908 aa  575  1.0000000000000001e-162  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000766764  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3193  preprotein translocase, SecA subunit  36.36 
 
 
992 aa  574  1.0000000000000001e-162  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.22203 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0421  preprotein translocase subunit SecA  36.84 
 
 
908 aa  575  1.0000000000000001e-162  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00112281  unclonable  0.00000862629 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0410  preprotein translocase subunit SecA  36.88 
 
 
908 aa  575  1.0000000000000001e-162  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000668842  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2714  preprotein translocase subunit SecA  36.77 
 
 
934 aa  574  1.0000000000000001e-162  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0657  preprotein translocase, SecA subunit  35.77 
 
 
1024 aa  575  1.0000000000000001e-162  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0383257  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0435  preprotein translocase subunit SecA  36.88 
 
 
911 aa  575  1.0000000000000001e-162  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000241961  hitchhiker  0.0000000033715 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3803  preprotein translocase subunit SecA  36.66 
 
 
907 aa  570  1e-161  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000517033  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0779  preprotein translocase, SecA subunit  35.31 
 
 
925 aa  570  1e-161  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.54499  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1958  preprotein translocase subunit SecA  35.02 
 
 
916 aa  567  1e-160  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3118  preprotein translocase subunit SecA  35.72 
 
 
930 aa  566  1e-160  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.224374  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3796  preprotein translocase subunit SecA  36.72 
 
 
906 aa  566  1.0000000000000001e-159  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000547853  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2970  preprotein translocase subunit SecA  35.3 
 
 
924 aa  562  1e-158  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0589  preprotein translocase, SecA subunit  36.13 
 
 
910 aa  557  1e-157  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0760479  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4599  preprotein translocase, SecA subunit  38.44 
 
 
970 aa  558  1e-157  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.723013  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1457  preprotein translocase subunit SecA  36.41 
 
 
912 aa  559  1e-157  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.34304  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0863  preprotein translocase subunit SecA  37.03 
 
 
824 aa  555  1e-156  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0619112  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1214  preprotein translocase subunit SecA  38.12 
 
 
871 aa  550  1e-155  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000480114  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2834  preprotein translocase subunit SecA  34.23 
 
 
934 aa  549  1e-154  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.745089 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1241  preprotein translocase subunit SecA  37.9 
 
 
871 aa  546  1e-154  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00118655  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1999  preprotein translocase, SecA subunit  38.52 
 
 
920 aa  546  1e-154  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.974197  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2911  preprotein translocase subunit SecA  34.34 
 
 
921 aa  548  1e-154  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.507728  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1155  preprotein translocase, SecA subunit  37.28 
 
 
906 aa  546  1e-154  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0110227  normal  0.328192 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2246  preprotein translocase subunit SecA  46.27 
 
 
939 aa  545  1e-153  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0823  preprotein translocase, SecA subunit  34.55 
 
 
1010 aa  545  1e-153  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.449407 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1058  preprotein translocase subunit SecA  38.98 
 
 
869 aa  545  1e-153  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.981267 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0796  preprotein translocase subunit SecA  35.22 
 
 
917 aa  544  1e-153  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.392281  normal  0.48861 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0828  preprotein translocase subunit SecA  34.94 
 
 
921 aa  540  9.999999999999999e-153  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0777  preprotein translocase subunit SecA  35.22 
 
 
933 aa  541  9.999999999999999e-153  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.648887  normal  0.618411 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0759  preprotein translocase subunit SecA  35.15 
 
 
917 aa  541  9.999999999999999e-153  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4232  preprotein translocase subunit SecA  35.61 
 
 
930 aa  538  1e-151  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.41363  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0990  preprotein translocase subunit SecA  38.59 
 
 
898 aa  529  1e-148  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1420  protein translocase subunit SecA  36.15 
 
 
935 aa  504  1e-141  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0249781 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0738  preprotein translocase subunit SecA  37.08 
 
 
921 aa  501  1e-140  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.687802  normal  0.0603491 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2855  protein translocase subunit secA  34.37 
 
 
993 aa  496  1e-139  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0152  preprotein translocase subunit SecA  35.85 
 
 
899 aa  482  1e-134  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2553  preprotein translocase, SecA subunit  49.35 
 
 
796 aa  476  1e-132  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4747  preprotein translocase, SecA subunit  42.57 
 
 
834 aa  471  1.0000000000000001e-131  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000758665  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2218  protein translocase subunit secA  43.47 
 
 
886 aa  470  1.0000000000000001e-131  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000196185  hitchhiker  0.00000000170911 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2483  preprotein translocase, SecA subunit  42.97 
 
 
859 aa  465  1e-129  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2080  preprotein translocase subunit SecA  41.8 
 
 
903 aa  464  1e-129  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.240841  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf154  preprotein translocase subunit SecA  35.41 
 
 
866 aa  463  1e-129  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0466  preprotein translocase subunit SecA  41.62 
 
 
888 aa  461  9.999999999999999e-129  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0229  preprotein translocase subunit SecA  40.57 
 
 
896 aa  459  9.999999999999999e-129  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0140186  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16440  preprotein translocase, SecA subunit  42.81 
 
 
845 aa  459  9.999999999999999e-129  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000273245  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1082  preprotein translocase subunit SecA  43.27 
 
 
864 aa  459  1e-127  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3078  preprotein translocase subunit SecA  41.18 
 
 
873 aa  459  1e-127  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000716555  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0238  hypothetical protein  45.91 
 
 
830 aa  457  1e-127  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0889025  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2156  preprotein translocase subunit SecA  41.1 
 
 
833 aa  457  1e-127  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3008  preprotein translocase subunit SecA  41.81 
 
 
837 aa  453  1.0000000000000001e-126  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000288137  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0780  preprotein translocase, SecA subunit  38.16 
 
 
944 aa  450  1e-125  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.358011  normal  0.32086 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>