80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_3061 on replicon NC_013207
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013207  Aaci_3061  NHL repeat containing protein  100 
 
 
433 aa  879    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4391  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  44.3 
 
 
487 aa  340  2.9999999999999998e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.454131  normal  0.97386 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3063  NHL repeat containing protein  42.63 
 
 
488 aa  315  9.999999999999999e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.440395 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2816  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  38.57 
 
 
612 aa  266  5.999999999999999e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7910  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  32.32 
 
 
525 aa  197  3e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0157522  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1899  hypothetical protein  30.04 
 
 
428 aa  122  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.317595  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1618  hypothetical protein  29.28 
 
 
428 aa  118  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0613735  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10028  L-sorbosone dehydrogenase  27.88 
 
 
421 aa  73.2  0.000000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1002  NHL repeat-containing protein  28.53 
 
 
363 aa  71.2  0.00000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00465909 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3490  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  29.08 
 
 
371 aa  66.2  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1406  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  22.76 
 
 
587 aa  65.9  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.748943 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0193  L-sorbosone dehydrogenase, putative  29.76 
 
 
379 aa  65.1  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.435435  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0291  cytochrome c, class I  29.32 
 
 
546 aa  65.5  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.85938 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3326  glucose sorbosone dehydrogenase  24.16 
 
 
394 aa  64.7  0.000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2771  L-sorbosone dehydrogenase  30.04 
 
 
381 aa  64.3  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.069543  normal  0.0541194 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2488  glucose sorbosone dehydrogenase  25.41 
 
 
410 aa  64.3  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.583653  normal  0.172855 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2748  putative L-sorbosone dehydrogenase  25.45 
 
 
437 aa  64.3  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.970962  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0747  putative membrane-bound dehydrogenase oxidoreductase protein  30.21 
 
 
377 aa  63.5  0.000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5288  PEBP family protein  27.66 
 
 
617 aa  62.4  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0550  L-sorbosone dehydrogenase, putative  22.48 
 
 
388 aa  63.2  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.123721 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1108  putative membrane-bound dehydrogenase oxidoreductase protein  28.69 
 
 
371 aa  62.4  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0421  glucose sorbosone dehydrogenase  27.67 
 
 
363 aa  61.2  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000245782  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5064  NHL repeat-containing protein  23.25 
 
 
422 aa  61.2  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00409782  hitchhiker  0.00484678 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1510  L-sorbosone dehydrogenase  29.87 
 
 
384 aa  60.5  0.00000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.147388  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2541  putative membrane-bound dehydrogenase oxidoreductase protein  30.64 
 
 
391 aa  60.1  0.00000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3737  glucose/sorbosone dehydrogenase-like  26.55 
 
 
466 aa  57  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0932  putative membrane-bound dehydrogenase oxidoreductase protein  30.17 
 
 
357 aa  56.6  0.0000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0678662 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0780  L-sorbosone dehydrogenase, putative  27.83 
 
 
387 aa  55.8  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.695554  hitchhiker  0.00000105496 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0627  glucose sorbosone dehydrogenase  29.25 
 
 
411 aa  55.1  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.308519  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0783  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  28.51 
 
 
466 aa  55.1  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.194417 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0874  putative membrane-bound dehydrogenase oxidoreductase protein  31.03 
 
 
357 aa  55.1  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.159521  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0148  putative glucose/sorbosone dehydrogenase  25.61 
 
 
423 aa  54.7  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.392107 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2003  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  28.14 
 
 
436 aa  54.7  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.528812 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0781  L-sorbosone dehydrogenase  24.25 
 
 
473 aa  54.3  0.000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4189  L-sorbosone dehydrogenase, putative  22.75 
 
 
373 aa  53.9  0.000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.397112 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3122  L-sorbosone dehydrogenase  24.26 
 
 
418 aa  53.5  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2145  L-sorbosone dehydrogenase  22.51 
 
 
423 aa  52.8  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0907  cytochrome c class I  23.31 
 
 
621 aa  52.4  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.144396  normal  0.433634 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1015  NHL repeat-containing protein  28.68 
 
 
438 aa  52.4  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.542599  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0511  L-sorbosone dehydrogenase  23.64 
 
 
430 aa  52.4  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1406  L-sorbosone dehydrogenase  28.92 
 
 
448 aa  52  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.685553  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0535  NHL repeat-containing protein  26.4 
 
 
642 aa  52.4  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000386483  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3015  oxidoreductase, putative  29.53 
 
 
396 aa  51.2  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.754871  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1469  NHL repeat containing protein  27.89 
 
 
439 aa  51.6  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3094  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  29.2 
 
 
427 aa  51.2  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.379716 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2980  oxidoreductase, putative  25.21 
 
 
398 aa  50.8  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2392  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  24.58 
 
 
448 aa  50.8  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5070  NHL repeat containing protein  24.91 
 
 
417 aa  50.1  0.00007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2218  NHL repeat-containing protein  24.49 
 
 
430 aa  50.4  0.00007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.493276  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2815  hypothetical protein  28.99 
 
 
363 aa  50.1  0.00007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0422  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  26.74 
 
 
423 aa  49.3  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2048  L-sorbosone dehydrogenase, putative  25.79 
 
 
367 aa  49.7  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.228554  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2856  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  27.31 
 
 
420 aa  48.5  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.656611  normal  0.0673289 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2684  hypothetical protein  28.85 
 
 
363 aa  48.5  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0941  L-sorbosone dehydrogenase, putative  26.2 
 
 
361 aa  48.5  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0785845  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2920  L-sorbosone dehydrogenase  27.23 
 
 
448 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00641513  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3042  L-sorbosone dehydrogenase, putative  21.53 
 
 
391 aa  48.1  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1726  L-sorbosone dehydrogenase, putative  27.51 
 
 
362 aa  48.1  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.856742 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1973  L-sorbosone dehydrogenase  26.57 
 
 
436 aa  47.8  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.208265  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4522  glucose sorbosone dehydrogenase  30.41 
 
 
423 aa  47.4  0.0005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3274  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  23.53 
 
 
602 aa  46.6  0.0008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.603127  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2442  NHL repeat containing protein  24.91 
 
 
577 aa  46.6  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0106112  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0287  putative glucose/sorbosone dehydrogenase  28.51 
 
 
419 aa  46.6  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.473358 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3898  L-sorbosone dehydrogenase, putative  25 
 
 
391 aa  46.2  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1904  L-sorbosone dehydrogenase  30 
 
 
437 aa  46.2  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.883513  normal  0.169794 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0508  L-sorbosone dehydrogenase (SNDH)  26.02 
 
 
371 aa  46.2  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0760317  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0656  membrane-bound dehydrogenase domain protein  29.27 
 
 
1306 aa  46.2  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0724303 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1033  L-sorbosone dehydrogenase, putative  25.07 
 
 
403 aa  45.1  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.877554  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0889  L-sorbosone dehydrogenase, putative  25.07 
 
 
403 aa  45.1  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.167597 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2978  putative membrane-bound dehydrogenase  30.43 
 
 
394 aa  45.8  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0356498 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2082  putative sorbosone/glucose dehydrogenase  27.39 
 
 
419 aa  45.4  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0415  NHL repeat-containing protein  23.99 
 
 
416 aa  45.4  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.96309  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4560  glucose sorbosone dehydrogenase  25.45 
 
 
381 aa  44.7  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.321101  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5245  glucose/sorbosone dehydrogenases-like protein  23.68 
 
 
585 aa  44.3  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2766  glucose sorbosone dehydrogenase  30.85 
 
 
357 aa  44.7  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1723  L-sorbosone dehydrogenase  26.22 
 
 
435 aa  44.3  0.005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000227847 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3348  cytochrome c class I  24.26 
 
 
587 aa  43.5  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.123322  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1682  putative glucose/sorbosone dehydrogenase  28.57 
 
 
428 aa  43.5  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.334318 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1944  L-sorbosone dehydrogenase  26.3 
 
 
433 aa  43.5  0.008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.358319  normal  0.0404039 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2777  Kelch repeat-containing protein  20.64 
 
 
1762 aa  43.1  0.01  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>