More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_2224 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013205  Aaci_2224  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  100 
 
 		 202 aa  423  1e-118  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724185  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0862  isopropylmalate isomerase small subunit  61.22 
 
 		 197 aa  255  3e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2590  isopropylmalate isomerase small subunit  56.63 
 
 		 197 aa  241  7.999999999999999e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000283256  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1229  isopropylmalate isomerase small subunit  56.86 
 
 		 218 aa  232  3e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.975059  normal  0.103885 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1811  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  55.88 
 
 		 240 aa  231  5e-60  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.382373  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3469  isopropylmalate isomerase small subunit  56.99 
 
 		 201 aa  228  3e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.068645  normal  0.363086 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1718  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  55.39 
 
 		 216 aa  227  1e-58  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1935  isopropylmalate isomerase small subunit  56.44 
 
 		 216 aa  226  2e-58  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.217033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3568  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  55.33 
 
 		 203 aa  223  1e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3817  isopropylmalate isomerase small subunit  55.44 
 
 		 201 aa  223  1e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1541  isopropylmalate isomerase small subunit  53.77 
 
 		 215 aa  223  1e-57  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.466229  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1564  isopropylmalate isomerase small subunit  55.88 
 
 		 215 aa  222  2e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.126411  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4547  isopropylmalate isomerase small subunit  54.64 
 
 		 201 aa  220  9e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.258236  normal  0.011903 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1704  isopropylmalate isomerase small subunit  54.11 
 
 		 214 aa  220  9e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.045793  hitchhiker  0.00210823 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1484  isopropylmalate isomerase small subunit  54.11 
 
 		 215 aa  220  9.999999999999999e-57  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1670  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  52.55 
 
 		 204 aa  220  9.999999999999999e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00715412  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2064  isopropylmalate isomerase small subunit  57.07 
 
 		 212 aa  219  1.9999999999999999e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.851734  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3232  isopropylmalate isomerase small subunit  54.68 
 
 		 216 aa  219  1.9999999999999999e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0869271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0338  isopropylmalate isomerase small subunit  53.54 
 
 		 201 aa  219  1.9999999999999999e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00370617  normal  0.442563 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2585  isopropylmalate isomerase small subunit  54.68 
 
 		 216 aa  219  1.9999999999999999e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1412  isopropylmalate isomerase small subunit  54.5 
 
 		 216 aa  218  5e-56  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162707  normal  0.547785 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0862  isopropylmalate isomerase small subunit  53.5 
 
 		 201 aa  218  5e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0766  isopropylmalate isomerase small subunit  54.19 
 
 		 215 aa  218  5e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1573  isopropylmalate isomerase small subunit  54.5 
 
 		 216 aa  218  5e-56  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.292006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2521  isopropylmalate isomerase small subunit  53.5 
 
 		 201 aa  218  5e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0588786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0083  isopropylmalate isomerase small subunit  54 
 
 		 201 aa  217  7.999999999999999e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.384389  normal  0.18722 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3585  isopropylmalate isomerase small subunit  53.33 
 
 		 201 aa  217  7.999999999999999e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2522  isopropylmalate isomerase small subunit  53.5 
 
 		 201 aa  217  7.999999999999999e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.68534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0371  isopropylmalate isomerase small subunit  53.33 
 
 		 201 aa  217  8.999999999999998e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4233  isopropylmalate isomerase small subunit  53.09 
 
 		 201 aa  216  1e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3825  isopropylmalate isomerase small subunit  54.36 
 
 		 201 aa  217  1e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2163  isopropylmalate isomerase small subunit  53.69 
 
 		 216 aa  216  1e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.242476 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0474  isopropylmalate isomerase small subunit  53.37 
 
 		 201 aa  216  1e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2722  isopropylmalate isomerase small subunit  54.41 
 
 		 215 aa  217  1e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0158135  normal  0.102803 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0591  isopropylmalate isomerase small subunit  56.19 
 
 		 200 aa  216  2.9999999999999998e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1246  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  53.92 
 
 		 212 aa  216  2.9999999999999998e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23760  isopropylmalate isomerase small subunit  52.66 
 
 		 212 aa  215  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0177244 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1780  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  52.83 
 
 		 213 aa  215  4e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.972609  hitchhiker  0.00157972 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3758  isopropylmalate isomerase small subunit  53.09 
 
 		 201 aa  215  4e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.113881 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1919  isopropylmalate isomerase small subunit  56 
 
 		 212 aa  214  5e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1676  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  52.22 
 
 		 215 aa  214  7e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1013  isopropylmalate isomerase small subunit  54.9 
 
 		 214 aa  214  7e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1820  isopropylmalate isomerase small subunit  53.69 
 
 		 216 aa  214  7e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.656478  normal  0.647684 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3408  isopropylmalate isomerase small subunit  53.57 
 
 		 200 aa  214  7e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02612  isopropylmalate isomerase small subunit  54.11 
 
 		 215 aa  214  7e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1989  isopropylmalate isomerase small subunit  53.2 
 
 		 216 aa  214  8e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.108393  normal  0.122057 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3538  isopropylmalate isomerase small subunit  53.57 
 
 		 200 aa  214  8e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2939  isopropylmalate isomerase small subunit  53.57 
 
 		 200 aa  214  8e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1921  isopropylmalate isomerase small subunit  54.41 
 
 		 212 aa  214  8e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.691189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0742  isopropylmalate isomerase small subunit  53.06 
 
 		 200 aa  213  9.999999999999999e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.843634  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2731  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  50.72 
 
 		 212 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.413417  normal  0.151931 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2013  isopropylmalate isomerase small subunit  52.17 
 
 		 212 aa  213  9.999999999999999e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0256303  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2144  isopropylmalate isomerase small subunit  53.2 
 
 		 216 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.536498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0388  isopropylmalate isomerase small subunit  52.85 
 
 		 201 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0400  isopropylmalate isomerase small subunit  52.85 
 
 		 201 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000488217 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2452  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  54.9 
 
 		 215 aa  213  1.9999999999999998e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.162518  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2092  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  54.19 
 
 		 216 aa  212  1.9999999999999998e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0181351  normal  0.809899 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0414  isopropylmalate isomerase small subunit  52.85 
 
 		 201 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000110574 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1421  isopropylmalate isomerase small subunit  52.71 
 
 		 216 aa  212  2.9999999999999995e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1055  isopropylmalate isomerase small subunit  52.22 
 
 		 215 aa  212  2.9999999999999995e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.206266 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0159  isopropylmalate isomerase small subunit  52.5 
 
 		 201 aa  212  3.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.949563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0396  isopropylmalate isomerase small subunit  53.61 
 
 		 201 aa  212  3.9999999999999995e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000184497 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0423  3-isopropylmalate dehydratase small subunit  52.36 
 
 		 194 aa  211  3.9999999999999995e-54  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0497347 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4274  isopropylmalate isomerase small subunit  51.42 
 
 		 212 aa  211  4.9999999999999996e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.123411  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34270  3-isopropylmalate dehydratase small subunit , LeuD  53.43 
 
 		 215 aa  211  5.999999999999999e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2085  isopropylmalate isomerase small subunit  52.71 
 
 		 215 aa  211  7e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4368  isopropylmalate isomerase small subunit  53.43 
 
 		 217 aa  211  7.999999999999999e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0351  isopropylmalate isomerase small subunit  53.12 
 
 		 200 aa  211  7.999999999999999e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.289741 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0629  isopropylmalate isomerase small subunit  54.4 
 
 		 200 aa  210  9e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0216  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  53.4 
 
 		 201 aa  210  1e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.247072  normal  0.136168 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3888  isopropylmalate isomerase small subunit  54.45 
 
 		 193 aa  210  1e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1456  isopropylmalate isomerase small subunit  54.45 
 
 		 193 aa  210  1e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3798  isopropylmalate isomerase small subunit  51.76 
 
 		 200 aa  210  1e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2068  isopropylmalate isomerase small subunit  54.12 
 
 		 200 aa  210  1e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0234  isopropylmalate isomerase small subunit  51.28 
 
 		 201 aa  209  2e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3069  isopropylmalate isomerase small subunit  52.31 
 
 		 212 aa  209  2e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1048  isopropylmalate isomerase small subunit  51.23 
 
 		 216 aa  209  2e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3281  isopropylmalate isomerase small subunit  52.24 
 
 		 207 aa  209  2e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.186191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0389  isopropylmalate isomerase small subunit  52.33 
 
 		 201 aa  209  2e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2473  isopropylmalate isomerase small subunit  51.72 
 
 		 216 aa  209  3e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0929979  normal  0.412419 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3610  isopropylmalate isomerase small subunit  51.26 
 
 		 200 aa  208  3e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.607492  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1222  isopropylmalate isomerase small subunit  54.15 
 
 		 217 aa  209  3e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.489719  normal  0.012692 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2312  isopropylmalate isomerase small subunit  51.47 
 
 		 216 aa  208  4e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.845153  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1984  isopropylmalate isomerase small subunit  51.69 
 
 		 213 aa  208  5e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.238956  normal  0.0387343 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4358  isopropylmalate isomerase small subunit  51.5 
 
 		 201 aa  208  5e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4628  isopropylmalate isomerase small subunit  51.69 
 
 		 216 aa  208  5e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1562  isopropylmalate isomerase small subunit  53.93 
 
 		 193 aa  207  6e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1287  isopropylmalate isomerase small subunit  53.93 
 
 		 193 aa  207  9e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1986  isopropylmalate isomerase small subunit  51.69 
 
 		 214 aa  207  1e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.373676  hitchhiker  0.00883462 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3773  isopropylmalate isomerase small subunit  51.69 
 
 		 214 aa  206  1e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1890  isopropylmalate isomerase small subunit  51.66 
 
 		 214 aa  207  1e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.125264  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0796  isopropylmalate isomerase small subunit  52.94 
 
 		 214 aa  207  1e-52  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.030547  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0342  isopropylmalate isomerase small subunit  51.83 
 
 		 201 aa  207  1e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0230  isopropylmalate isomerase small subunit  51.83 
 
 		 201 aa  207  1e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00838951 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2888  isopropylmalate isomerase small subunit  52.68 
 
 		 217 aa  207  1e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.175281  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6848  isopropylmalate isomerase small subunit  51.96 
 
 		 217 aa  207  1e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0246289  normal  0.577423 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5237  isopropylmalate isomerase small subunit  52.71 
 
 		 217 aa  206  2e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.597573 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1382  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  52.28 
 
 		 215 aa  206  2e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.758839  normal  0.419844 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3028  isopropylmalate isomerase small subunit  51 
 
 		 201 aa  206  2e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.295047 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0498  isopropylmalate isomerase small subunit  51.83 
 
 		 201 aa  206  3e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.701221  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>