More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ANIA_02704 on replicon BN001306
Organism: Aspergillus nidulans FGSC A4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001306  ANIA_02704  conserved hypothetical protein  100 
 
 		 674 aa  1385    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.530018 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1487  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.83 
 
 		 551 aa  258  2e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.354481  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1383  glucose-methanol-choline oxidoreductase  34.01 
 
 		 551 aa  258  3e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00471975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3164  choline dehydrogenase  33.64 
 
 		 551 aa  258  3e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.637341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0877  choline dehydrogenase  33.89 
 
 		 545 aa  255  2.0000000000000002e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.988222  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2042  L-sorbose dehydrogenase, FAD dependent, putative  33.7 
 
 		 544 aa  253  1e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0700873  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6778  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.98 
 
 		 539 aa  239  2e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.485614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3651  choline dehydrogenase  30.27 
 
 		 553 aa  236  7e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2190  choline dehydrogenase, a flavoprotein  31.27 
 
 		 541 aa  236  1.0000000000000001e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2644  choline dehydrogenase  30.69 
 
 		 574 aa  235  2.0000000000000002e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.3131  normal  0.995844 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1348  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.26 
 
 		 555 aa  233  9e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3434  GMC family oxidoreductase  31.17 
 
 		 539 aa  233  1e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3579  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.61 
 
 		 539 aa  232  1e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.000745521  normal  0.65455 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0082  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.03 
 
 		 578 aa  231  4e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.111773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2604  choline dehydrogenase  30.47 
 
 		 562 aa  229  1e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.142768 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3836  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.91 
 
 		 552 aa  229  1e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.669798  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04006  GMC oxidoreductase (Eurofung)  31.95 
 
 		 610 aa  228  2e-58  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.247886 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0804  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.3 
 
 		 540 aa  228  2e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.271201  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5064  choline dehydrogenase  30.73 
 
 		 565 aa  228  3e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.193049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4937  choline dehydrogenase  30.91 
 
 		 565 aa  227  4e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01161  hypothetical alcohol dehydrogenase  31.52 
 
 		 550 aa  227  5.0000000000000005e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5304  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.46 
 
 		 546 aa  227  5.0000000000000005e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0072  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.33 
 
 		 548 aa  227  6e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.010293  normal  0.0125106 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0056  GMC family oxidoreductase  31.2 
 
 		 550 aa  227  6e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000620913 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3754  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.55 
 
 		 552 aa  227  6e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3263  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.73 
 
 		 577 aa  226  7e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.713026  normal  0.534597 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3803  putative choline dehydrogenase lipoprotein oxidoreductase  32.31 
 
 		 548 aa  226  8e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0363471 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0100  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.55 
 
 		 561 aa  226  8e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0379  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.46 
 
 		 561 aa  226  1e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.547606 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0443  choline dehydrogenase  30.73 
 
 		 568 aa  226  1e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.300865  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3910  Choline dehydrogenase  31.5 
 
 		 531 aa  226  1e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4732  choline dehydrogenase  30.91 
 
 		 568 aa  226  1e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0606  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.04 
 
 		 563 aa  226  1e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0279119  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0401  choline dehydrogenase  30.59 
 
 		 563 aa  226  1e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.726855 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0072  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.69 
 
 		 548 aa  226  2e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000289824 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0075  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.18 
 
 		 548 aa  225  2e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0217236  hitchhiker  0.000000000166725 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5244  choline dehydrogenase  30.53 
 
 		 567 aa  225  2e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.80037  normal  0.0658003 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2378  Choline dehydrogenase  31.73 
 
 		 551 aa  225  2e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.448643  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2973  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.55 
 
 		 578 aa  225  2e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0082  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.55 
 
 		 578 aa  225  2e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3136  choline dehydrogenase  30.44 
 
 		 531 aa  224  3e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5115  choline dehydrogenase  30.73 
 
 		 565 aa  224  4e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.179508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0073  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.73 
 
 		 561 aa  224  4.9999999999999996e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0437  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.38 
 
 		 532 aa  223  6e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.253187  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3372  glucose-methanol-choline oxidoreductase:FAD dependent oxidoreductase:GMC oxidoreductase  31.22 
 
 		 539 aa  224  6e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8399  choline dehydrogenase  30.77 
 
 		 574 aa  224  6e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.553301  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0084  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.55 
 
 		 561 aa  223  6e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5947  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.73 
 
 		 550 aa  223  7e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2917  choline dehydrogenase  29.87 
 
 		 567 aa  223  7e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.80885  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2831  choline dehydrogenase  29.87 
 
 		 567 aa  223  7e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.121193  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4369  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.3 
 
 		 556 aa  223  8e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.535677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2727  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.53 
 
 		 525 aa  223  9e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0412228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1253  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.88 
 
 		 541 aa  223  9.999999999999999e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0882717  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3840  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.54 
 
 		 544 aa  223  9.999999999999999e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.397758  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2554  choline dehydrogenase  30.78 
 
 		 559 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0102453  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4865  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.6 
 
 		 539 aa  221  3e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.69396  normal  0.438414 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1514  choline dehydrogenase  30.13 
 
 		 560 aa  221  3e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0264792  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1543  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.43 
 
 		 530 aa  221  3.9999999999999997e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2890  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.44 
 
 		 534 aa  220  5e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.561362  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0553  choline dehydrogenase  30.42 
 
 		 566 aa  221  5e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4282  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.4 
 
 		 541 aa  221  5e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0936618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1515  choline dehydrogenase  29.87 
 
 		 555 aa  220  5e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.307618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16390  putative GMC-type oxidoreductase  32.37 
 
 		 557 aa  220  5e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0102  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.31 
 
 		 518 aa  220  6e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5650  Choline dehydrogenase  31 
 
 		 559 aa  220  7e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3373  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.97 
 
 		 553 aa  220  7e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5100  choline dehydrogenase  30.55 
 
 		 566 aa  219  1e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3744  choline dehydrogenase  31.95 
 
 		 554 aa  219  1e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0339169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5015  choline dehydrogenase, a flavoprotein  30.38 
 
 		 557 aa  219  1e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00654928  normal  0.219358 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3680  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.67 
 
 		 534 aa  219  1e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3268  choline dehydrogenase  30.55 
 
 		 566 aa  219  1e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.121076  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5182  choline dehydrogenase  30.55 
 
 		 566 aa  219  1e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.222705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2709  choline dehydrogenase  31.81 
 
 		 549 aa  218  2e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0481  choline dehydrogenase  30.35 
 
 		 565 aa  219  2e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1582  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.3 
 
 		 533 aa  218  2e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0016  GMC family oxidoreductase  30.49 
 
 		 571 aa  218  2e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3536  choline dehydrogenase  30.55 
 
 		 566 aa  218  2e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3245  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.88 
 
 		 541 aa  218  2.9999999999999998e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3595  putative glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.81 
 
 		 549 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2379  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.64 
 
 		 571 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4961  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.49 
 
 		 529 aa  218  2.9999999999999998e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2683  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.87 
 
 		 536 aa  218  4e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1592  choline dehydrogenase  30.42 
 
 		 561 aa  218  4e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.860333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2310  choline dehydrogenase  30.39 
 
 		 548 aa  217  5e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.568209  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5443  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.23 
 
 		 542 aa  217  5.9999999999999996e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.078996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0554  choline dehydrogenase  31.63 
 
 		 549 aa  217  7e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02642  choline dehydrogenase  28.42 
 
 		 552 aa  217  7e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3540  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.84 
 
 		 544 aa  216  8e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.200796 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0477  Choline dehydrogenase  31.28 
 
 		 531 aa  216  8e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3345  putative choline dehydrogenase lipoprotein oxidoreductase  31.02 
 
 		 544 aa  216  9e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3840  choline dehydrogenase  29.39 
 
 		 561 aa  216  9e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3916  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.31 
 
 		 570 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0377  choline dehydrogenase  30.42 
 
 		 565 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.119078  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3310  choline dehydrogenase  30.6 
 
 		 572 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.903723  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0698  putative glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.14 
 
 		 551 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.763915  decreased coverage  0.00316946 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2587  choline dehydrogenase  28.44 
 
 		 556 aa  216  9.999999999999999e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.676646  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1428  choline dehydrogenase  30.67 
 
 		 565 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.783226  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1614  glucose-methanol-choline oxidoreductase:GMC oxidoreductase  30.11 
 
 		 547 aa  216  1.9999999999999998e-54  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0468  choline dehydrogenase  30.67 
 
 		 565 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0179  choline dehydrogenase  30.67 
 
 		 565 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>