More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A9601_14551 on replicon NC_008816
Organism: Prochlorococcus marinus str. AS9601



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008816  A9601_14551  transketolase C-terminal subunit  100 
 
 		 304 aa  617  1e-176  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5637  transketolase subunit B  47.04 
 
 		 307 aa  293  2e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3397  Transketolase central region  33.11 
 
 		 298 aa  196  4.0000000000000005e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1058  transketolase subunit B  35.08 
 
 		 308 aa  192  4e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.847424 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0244  Transketolase central region  36.3 
 
 		 305 aa  186  6e-46  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.304733  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1589  transketolase family protein  34.44 
 
 		 288 aa  182  4.0000000000000006e-45  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0969  transketolase, central region  33.67 
 
 		 306 aa  179  5.999999999999999e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.86113  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2126  Transketolase domain protein  35 
 
 		 320 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.764032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1923  transketolase domain-containing protein  36 
 
 		 315 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2287  transketolase central region  31.95 
 
 		 305 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2254  Transketolase domain protein  33.89 
 
 		 318 aa  171  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.655402  normal  0.0447096 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6295  Transketolase central region  32.67 
 
 		 332 aa  171  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1130  transketolase central region  34.11 
 
 		 336 aa  171  2e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4744  Transketolase central region  35.74 
 
 		 311 aa  167  2.9999999999999998e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2032  Transketolase domain protein  33.78 
 
 		 318 aa  165  6.9999999999999995e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.262756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2444  transketolase subunit B  36.72 
 
 		 313 aa  166  6.9999999999999995e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0293  putative transketolase, C-terminal subunit  32.89 
 
 		 314 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0288  transketolase  32.89 
 
 		 314 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000211069  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2800  Transketolase central region  33.44 
 
 		 320 aa  163  3e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3129  transketolase domain-containing protein  33.11 
 
 		 322 aa  163  4.0000000000000004e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0492  transketolase, central region  32.78 
 
 		 312 aa  160  2e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3949  Transketolase domain protein  30.74 
 
 		 338 aa  157  2e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4663  transketolase central region  35.87 
 
 		 328 aa  157  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0244  transketolase-like protein  34.38 
 
 		 311 aa  156  5.0000000000000005e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0809  transketolase central region  31.91 
 
 		 592 aa  155  7e-37  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.32467  normal  0.55266 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1505  transketolase central region  34.3 
 
 		 314 aa  154  1e-36  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0385912  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2059  Transketolase central region  33.59 
 
 		 313 aa  154  1e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0237  transketolase subunit B  34.38 
 
 		 311 aa  155  1e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2213  transketolase subunit B  28.9 
 
 		 317 aa  154  2e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000528401  hitchhiker  0.000741425 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0365  transketolase central region  32.69 
 
 		 312 aa  154  2e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.556876  normal  0.0129681 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4221  transketolase subunit B  33.66 
 
 		 307 aa  153  4e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1381  Transketolase central region  34.72 
 
 		 306 aa  152  5.9999999999999996e-36  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00875  transketolase, C-terminal subunit  32.33 
 
 		 317 aa  151  1e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0471  transketolase subunit B  32.04 
 
 		 312 aa  150  2e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0285277  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0333  Transketolase central region  31.3 
 
 		 322 aa  150  3e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0552  transketolase subunit B  32.42 
 
 		 314 aa  150  3e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1895  transketolase, C-terminal subunit  31.02 
 
 		 318 aa  149  4e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00759771 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5275  transketolase, central region  29.8 
 
 		 335 aa  149  6e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.181452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2041  transketolase central region  33.99 
 
 		 330 aa  149  8e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.522483 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0265  Transketolase central region  28.81 
 
 		 310 aa  149  8e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00214892 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06530  deoxyxylulose-5-phosphate synthase  33.21 
 
 		 636 aa  148  9e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000553997  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1277  Transketolase central region  33.98 
 
 		 313 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2513  transketolase subunit B  28.62 
 
 		 322 aa  148  1.0000000000000001e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2718  transketolase subunit B  29.47 
 
 		 340 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0280  Transketolase central region  28.9 
 
 		 310 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.741894  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1554  transketolase central region  31.39 
 
 		 312 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0600642  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1878  transketolase subunit B  31.01 
 
 		 312 aa  147  2.0000000000000003e-34  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4991  transketolase central region  27.48 
 
 		 332 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.908463 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0173  Transketolase central region  30.92 
 
 		 313 aa  147  2.0000000000000003e-34  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2019  Transketolase central region  31.17 
 
 		 320 aa  147  2.0000000000000003e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.6126  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2935  Transketolase central region  30.56 
 
 		 317 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2367  Transketolase central region  28.48 
 
 		 339 aa  147  3e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.438048  normal  0.0327946 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1860  Transketolase central region  29.28 
 
 		 321 aa  147  3e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2092  transketolase central region  28.48 
 
 		 339 aa  147  3e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.147262 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2719  transketolase, C-terminal subunit  31.89 
 
 		 311 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2110  transketolase, central region  32.95 
 
 		 314 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.44874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0881  Transketolase central region  31.46 
 
 		 327 aa  146  5e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000876605  normal  0.0478781 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05490  transketolase subunit B  30.26 
 
 		 325 aa  145  6e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.948034 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0438  transketolase central region  31.27 
 
 		 312 aa  145  8.000000000000001e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0397028  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1146  Transketolase domain protein  31.94 
 
 		 319 aa  145  8.000000000000001e-34  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0261  Transketolase central region  28.15 
 
 		 339 aa  144  1e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.885505 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0883  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  34.1 
 
 		 635 aa  144  1e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000207097 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2842  transketolase subunit B  29.47 
 
 		 317 aa  145  1e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.837175  normal  0.299247 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0894  transketolase subunit B  31.56 
 
 		 314 aa  144  1e-33  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3362  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  34.1 
 
 		 635 aa  144  2e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2526  transketolase domain protein  28.71 
 
 		 317 aa  143  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.508569 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2581  transketolase domain-containing protein  28.71 
 
 		 317 aa  143  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.230809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6422  transketolase, central region  28.42 
 
 		 332 aa  143  4e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6657  transketolase, central region  28.42 
 
 		 332 aa  143  4e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2689  transketolase domain-containing protein  28.71 
 
 		 317 aa  143  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.423567 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1178  Transketolase central region  32.68 
 
 		 327 aa  143  4e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0058066  normal  0.0131189 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2569  transketolase domain protein  28.71 
 
 		 317 aa  142  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.126502  normal  0.742091 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6255  transketolase central region  28.06 
 
 		 332 aa  142  5e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.156319  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0183  Transketolase central region  31.33 
 
 		 320 aa  142  6e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2481  transketolase domain protein  28.71 
 
 		 317 aa  142  6e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.120495  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1527  Transketolase central region  31.91 
 
 		 319 aa  142  7e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3248  putative transketolase, C-terminal subunit  31.27 
 
 		 314 aa  142  8e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0874  Transketolase central region  33.07 
 
 		 326 aa  141  9.999999999999999e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3382  transketolase domain-containing protein  31.27 
 
 		 314 aa  141  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0300  transketolase central region  30.99 
 
 		 324 aa  141  9.999999999999999e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0477096 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6139  Transketolase central region  28.15 
 
 		 332 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.47666  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5659  Transketolase central region  33.64 
 
 		 333 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.252415  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4411  transketolase, central region  27.7 
 
 		 332 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0682016 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0407  transketolase central region  26.42 
 
 		 323 aa  141  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0194561  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1775  transketolase, central region  32.31 
 
 		 314 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3641  transketolase, central region  27.48 
 
 		 334 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.150786 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4778  transketolase subunit B  27.34 
 
 		 332 aa  140  3e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4930  transketolase central region  27.7 
 
 		 332 aa  140  3e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1540  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  33.55 
 
 		 620 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00810208  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1462  transketolase subunit B  27.48 
 
 		 332 aa  140  3.9999999999999997e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.304967 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0873  Transketolase central region  30.69 
 
 		 319 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.199119  hitchhiker  0.00317558 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0975  Transketolase central region  30.1 
 
 		 317 aa  139  4.999999999999999e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.127122  normal  0.063318 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1078  deoxyxylulose-5-phosphate synthase  31.58 
 
 		 635 aa  139  4.999999999999999e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0303047  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4275  transketolase central region  29.14 
 
 		 338 aa  138  8.999999999999999e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3269  transketolase subunit B  26.49 
 
 		 337 aa  138  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.444228 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2780  deoxyxylulose-5-phosphate synthase  31.85 
 
 		 646 aa  138  1e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.952948  normal  0.727475 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1192  transketolase-like  30.13 
 
 		 327 aa  138  1e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.101787  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1191  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  29.19 
 
 		 624 aa  138  1e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1997  Transketolase central region  32.69 
 
 		 321 aa  138  1e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00329881 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1170  transketolase subunit B  32.49 
 
 		 326 aa  138  1e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000103125  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>