More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp0127 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006368  lpp0127  hypothetical protein  100 
 
 		 402 aa  805    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0920  diguanylate phosphodiesterase  35.24 
 
 		 416 aa  275  7e-73  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.135015  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0322  putative signal transduction protein  38.06 
 
 		 403 aa  268  2e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0122  diguanylate phosphodiesterase  34.61 
 
 		 400 aa  262  8e-69  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000715595  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2312  diguanylate phosphodiesterase  35.82 
 
 		 423 aa  250  3e-65  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0860  diguanylate phosphodiesterase  32.01 
 
 		 397 aa  233  5e-60  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0828  diguanylate phosphodiesterase  32.02 
 
 		 413 aa  230  3e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.81779  normal  0.35188 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3594  diguanylate phosphodiesterase  33.91 
 
 		 402 aa  226  4e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00249356  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1998  diguanylate phosphodiesterase  31.77 
 
 		 404 aa  224  3e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3129  diguanylate phosphodiesterase  32.71 
 
 		 415 aa  218  1e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03533  EAL domain protein  31.84 
 
 		 408 aa  217  2.9999999999999998e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0111496  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0339  signal transduction protein  35.23 
 
 		 409 aa  210  4e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0012225  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002124  predicted signal transduction protein  32.98 
 
 		 407 aa  209  5e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1462  diguanylate phosphodiesterase  32.49 
 
 		 405 aa  208  1e-52  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2780  diguanylate phosphodiesterase  33.25 
 
 		 411 aa  207  2e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.948032  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3464  EAL domain-containing protein  32.42 
 
 		 406 aa  207  2e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.126352  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2343  diguanylate phosphodiesterase  32.01 
 
 		 431 aa  206  8e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00856181  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1652  diguanylate phosphodiesterase  33.68 
 
 		 406 aa  206  9e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2981  diguanylate phosphodiesterase  31.71 
 
 		 412 aa  205  1e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0150403  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00298  signal transduction protein  30.79 
 
 		 407 aa  205  1e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3130  diguanylate phosphodiesterase  33.42 
 
 		 413 aa  205  1e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1073  diguanylate phosphodiesterase  32.72 
 
 		 428 aa  204  2e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3234  diguanylate phosphodiesterase  31.84 
 
 		 408 aa  202  6e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.114779 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2417  diguanylate phosphodiesterase  30.19 
 
 		 411 aa  200  3e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000004717  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0413  diguanylate phosphodiesterase  31.74 
 
 		 397 aa  200  3e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000029399  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1598  diguanylate phosphodiesterase  33.75 
 
 		 411 aa  199  5e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2615  diguanylate phosphodiesterase  33.25 
 
 		 411 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4244  diguanylate phosphodiesterase  30.63 
 
 		 428 aa  198  2.0000000000000003e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3736  diguanylate phosphodiesterase  31.57 
 
 		 406 aa  197  3e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000203381 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1729  diguanylate phosphodiesterase  31.73 
 
 		 419 aa  196  6e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1938  diguanylate phosphodiesterase  31.56 
 
 		 422 aa  194  2e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.509602  normal  0.818289 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1720  diguanylate phosphodiesterase  31.83 
 
 		 412 aa  194  2e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2930  putative signaling protein  30.3 
 
 		 406 aa  194  2e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003840  predicted signal transduction protein  31.59 
 
 		 404 aa  194  3e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000123266  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0010  diguanylate phosphodiesterase  30.02 
 
 		 487 aa  192  7e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0508854 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2840  diguanylate phosphodiesterase  32.36 
 
 		 403 aa  192  8e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2383  hypothetical protein  29.52 
 
 		 408 aa  190  2.9999999999999997e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1612  diguanylate phosphodiesterase  32.03 
 
 		 410 aa  190  4e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0416985  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1442  hypothetical protein  28.82 
 
 		 404 aa  189  5e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000750338  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0347  diguanylate phosphodiesterase  34.23 
 
 		 400 aa  189  5.999999999999999e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.145586  normal  0.218991 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3947  diguanylate phosphodiesterase  31.48 
 
 		 413 aa  189  9e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.103414  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3300  EAL  28.82 
 
 		 417 aa  185  1.0000000000000001e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.220663 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1149  EAL domain-containing protein  30.02 
 
 		 411 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1888  diguanylate phosphodiesterase  30.19 
 
 		 400 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.61283  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2174  diguanylate phosphodiesterase  30.83 
 
 		 408 aa  184  3e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.120475  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2937  diguanylate phosphodiesterase  31.01 
 
 		 411 aa  183  6e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.64133  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1332  diguanylate phosphodiesterase  32.04 
 
 		 424 aa  178  1e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1693  EAL domain protein  30.67 
 
 		 410 aa  177  3e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03534  diguanylate phosphodiesterase  28.36 
 
 		 411 aa  177  3e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0852439  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1352  hypothetical protein  29.41 
 
 		 411 aa  172  1e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2098  diguanylate phosphodiesterase  29.17 
 
 		 405 aa  171  2e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2912  diguanylate phosphodiesterase  31.72 
 
 		 447 aa  170  5e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.776236 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1852  diguanylate phosphodiesterase  28.92 
 
 		 412 aa  166  8e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.12834  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1937  putative signaling protein  30.42 
 
 		 400 aa  166  9e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2451  diguanylate phosphodiesterase  30.81 
 
 		 423 aa  162  7e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.694346  normal  0.603659 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1571  diguanylate phosphodiesterase  32.79 
 
 		 445 aa  162  7e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.256124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1965  diguanylate phosphodiesterase  30.58 
 
 		 413 aa  162  1e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.616321  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1814  diguanylate phosphodiesterase  30.91 
 
 		 405 aa  159  9e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.877922  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1776  diguanylate phosphodiesterase  29.73 
 
 		 448 aa  159  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.265098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1316  diguanylate phosphodiesterase  26.52 
 
 		 419 aa  159  1e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1990  diguanylate phosphodiesterase  30.05 
 
 		 414 aa  157  3e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.973618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0991  diguanylate phosphodiesterase  27.87 
 
 		 423 aa  157  4e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0906  diguanylate phosphodiesterase  27.87 
 
 		 423 aa  156  5.0000000000000005e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.3977  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3785  diguanylate phosphodiesterase  27.48 
 
 		 444 aa  154  4e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.942548  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5114  diguanylate phosphodiesterase  27.14 
 
 		 464 aa  147  3e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.488167 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0573  hypothetical protein  29.85 
 
 		 379 aa  142  8e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0592  hypothetical protein  34.04 
 
 		 379 aa  140  3e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5115  diguanylate phosphodiesterase  25.67 
 
 		 429 aa  140  4.999999999999999e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.959026 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0990  diguanylate phosphodiesterase  26.37 
 
 		 431 aa  139  7.999999999999999e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0905  diguanylate phosphodiesterase  26.37 
 
 		 431 aa  139  1e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1315  diguanylate phosphodiesterase  27.18 
 
 		 449 aa  138  2e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1779  diguanylate phosphodiesterase  28.12 
 
 		 450 aa  134  3e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1719  diguanylate phosphodiesterase  27.56 
 
 		 448 aa  130  5.0000000000000004e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.189633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2882  putative signal transduction protein  26.53 
 
 		 397 aa  124  3e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.567941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1476  putative signal transduction protein  28.18 
 
 		 403 aa  123  6e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000542008  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1568  diguanylate phosphodiesterase  24.76 
 
 		 460 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2212  putative signal transduction protein  26.47 
 
 		 394 aa  119  9.999999999999999e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.566783 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3084  putative signal transduction protein  25.37 
 
 		 419 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1497  putative signal transduction protein  24.94 
 
 		 414 aa  112  9e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2915  diguanylate phosphodiesterase  26.54 
 
 		 458 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.555808 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2159  signal transduction protein  24.6 
 
 		 480 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.140137  normal  0.149553 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2226  diguanylate phosphodiesterase  32.65 
 
 		 242 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0863855  hitchhiker  0.00537893 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1268  diguanylate phosphodiesterase  25.08 
 
 		 407 aa  102  1e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.15473  normal  0.0747469 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4213  EAL  25.13 
 
 		 402 aa  101  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0056  signal transduction protein  24.09 
 
 		 444 aa  99.4  1e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.680301  normal  0.542378 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1384  putative signal transduction protein  22.93 
 
 		 463 aa  97.8  3e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2227  diguanylate phosphodiesterase  31.94 
 
 		 207 aa  94  4e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.118815  hitchhiker  0.00585618 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3725  putative signal transduction protein  29.96 
 
 		 378 aa  89.4  1e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31360  predicted signal transduction protein containing EAL and modified HD-GYP domains  24.29 
 
 		 418 aa  87  5e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.041924 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2907  signal transduction protein  26.83 
 
 		 439 aa  75.9  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0386149  normal  0.411691 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1201  putative signal transduction protein  26.2 
 
 		 406 aa  75.9  0.000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4155  putative signal transduction protein  27.8 
 
 		 438 aa  74.7  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.78127  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2044  putative signal transduction protein  21.98 
 
 		 398 aa  67.4  0.0000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0622  putative signal transduction protein  27.88 
 
 		 430 aa  66.2  0.0000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3839  putative signal transduction protein  24.75 
 
 		 403 aa  66.2  0.0000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3062  signal transduction protein  21.86 
 
 		 403 aa  63.5  0.000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0202013  normal  0.558987 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0842  signal transduction protein  28.96 
 
 		 389 aa  63.5  0.000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0117523 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0558  putative signal transduction protein  26.13 
 
 		 410 aa  63.2  0.000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.677666 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3112  putative signal transduction protein  26.29 
 
 		 413 aa  62.8  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3232  diguanylate phosphodiesterase  27.14 
 
 		 266 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.72536  normal  0.33635 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>