More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0482 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_0482  hypothetical protein  100 
 
 		 337 aa  694    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2795  hypothetical protein  66.17 
 
 		 341 aa  466  9.999999999999999e-131  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.687935  normal  0.0471733 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3428  hypothetical protein  64.69 
 
 		 337 aa  457  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.10884 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1853  hypothetical protein  67.28 
 
 		 337 aa  457  1e-127  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2026  hypothetical protein  64.46 
 
 		 337 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0845932  normal  0.461256 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2229  hypothetical protein  66.67 
 
 		 349 aa  448  1e-125  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4493  hypothetical protein  65.47 
 
 		 341 aa  442  1e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.39846  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3051  hypothetical protein  50.81 
 
 		 345 aa  360  2e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.244764  normal  0.28827 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5629  periplasmic tricarboxylate binding receptor (TctC)  50.3 
 
 		 333 aa  359  4e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.699687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5726  hypothetical protein  49.55 
 
 		 328 aa  347  2e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00555624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4224  hypothetical protein  42.07 
 
 		 328 aa  260  2e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.190974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36130  hypothetical protein  39.12 
 
 		 365 aa  259  4e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000443052 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3098  hypothetical protein  40.12 
 
 		 329 aa  259  5.0000000000000005e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.49783  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3081  hypothetical protein  38.06 
 
 		 337 aa  257  2e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.165969  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1220  hypothetical protein  38.28 
 
 		 328 aa  228  1e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.216947  normal  0.506898 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1971  hypothetical protein  32.25 
 
 		 336 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.803745  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0241  twin-arginine translocation pathway signal  29.84 
 
 		 332 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.862974  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4211  periplasmic binding protein  29.39 
 
 		 324 aa  138  1e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00352553 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03721  conserved hypothetical protein  29.09 
 
 		 324 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03670  hypothetical protein  29.09 
 
 		 324 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0336  hypothetical protein  28.82 
 
 		 330 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2078  hypothetical protein  29.17 
 
 		 341 aa  134  3e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000784829  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1719  hypothetical protein  27 
 
 		 326 aa  131  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0711752  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0982  hypothetical protein  26.93 
 
 		 326 aa  127  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3196  hypothetical protein  28.62 
 
 		 334 aa  125  7e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0435858  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3300  hypothetical protein  27.8 
 
 		 326 aa  125  9e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.659933  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0833  hypothetical protein  28 
 
 		 315 aa  125  1e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000608571  normal  0.346803 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3516  hypothetical protein  28.05 
 
 		 318 aa  124  2e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000184229  normal  0.0629404 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3545  hypothetical protein  27.72 
 
 		 350 aa  122  9e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.874099  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5327  hypothetical protein  27.33 
 
 		 322 aa  121  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3429  hypothetical protein  28.15 
 
 		 322 aa  119  7.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.196979  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0308  hypothetical protein  29.47 
 
 		 313 aa  118  9.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.897477 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3549  hypothetical protein  28.15 
 
 		 322 aa  118  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2792  hypothetical protein  27.18 
 
 		 346 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1825  hypothetical protein  27.96 
 
 		 346 aa  117  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1452  hypothetical protein  27.57 
 
 		 323 aa  116  3.9999999999999997e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.526573 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37830  hypothetical protein  27.87 
 
 		 374 aa  116  6e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.116398 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1717  hypothetical protein  29.39 
 
 		 330 aa  115  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0861  hypothetical protein  26.37 
 
 		 322 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0726  hypothetical protein  25.82 
 
 		 329 aa  114  3e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3010  hypothetical protein  28.52 
 
 		 319 aa  113  4.0000000000000004e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.770654  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1457  hypothetical protein  30.5 
 
 		 325 aa  113  5e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6185  hypothetical protein  26.64 
 
 		 328 aa  112  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3336  hypothetical protein  28.81 
 
 		 314 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0828946 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3342  hypothetical protein  25.49 
 
 		 326 aa  111  1.0000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.019229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1353  hypothetical protein  27.76 
 
 		 325 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0759073  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3636  hypothetical protein  28.81 
 
 		 314 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0998  hypothetical protein  27.48 
 
 		 333 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0872  hypothetical protein  26.05 
 
 		 322 aa  110  3e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0855  hypothetical protein  26.05 
 
 		 322 aa  110  3e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.769055  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1058  hypothetical protein  28.14 
 
 		 326 aa  109  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1799  hypothetical protein  26.92 
 
 		 330 aa  109  7.000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.841157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0183  hypothetical protein  28.92 
 
 		 333 aa  109  8.000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.248413 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0298  hypothetical protein  28.68 
 
 		 323 aa  108  1e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3931  hypothetical protein  27.16 
 
 		 320 aa  108  1e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3600  hypothetical protein  25.78 
 
 		 308 aa  107  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.434769  normal  0.0605544 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0734  hypothetical protein  24.1 
 
 		 322 aa  108  2e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0775704  decreased coverage  0.00137039 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1453  hypothetical protein  26.81 
 
 		 329 aa  108  2e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.321026  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2824  hypothetical protein  24.76 
 
 		 321 aa  108  2e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0750754 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05850  hypothetical protein  27.61 
 
 		 325 aa  107  4e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4047  extra-cytoplasmic solute receptor  26.95 
 
 		 329 aa  107  4e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364236  normal  0.64466 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2849  hypothetical protein  26.46 
 
 		 340 aa  106  5e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.225811  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4766  hypothetical protein  27.65 
 
 		 326 aa  106  7e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.137729  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1363  hypothetical protein  26.43 
 
 		 325 aa  106  7e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2897  hypothetical protein  28.47 
 
 		 325 aa  105  9e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2741  hypothetical protein  26.6 
 
 		 321 aa  105  1e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0278237  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4232  TctC protein, putative  26.65 
 
 		 325 aa  105  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0478  hypothetical protein  29.49 
 
 		 325 aa  104  2e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.606939  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1418  tricarboxylate transport protein TctC, putative  27.01 
 
 		 326 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.930091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1252  hypothetical protein  25.9 
 
 		 334 aa  104  3e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.336107  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0395  hypothetical protein  25.83 
 
 		 319 aa  104  3e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.172909  normal  0.115036 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1636  TctC protein  24.76 
 
 		 321 aa  103  4e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.777278  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3134  hypothetical protein  25.94 
 
 		 311 aa  103  4e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0701575  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3966  hypothetical protein  25.77 
 
 		 325 aa  103  5e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.846302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2224  hypothetical protein  23.15 
 
 		 332 aa  103  5e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.198093  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3894  hypothetical protein  26.73 
 
 		 321 aa  102  6e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0107663  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4303  hypothetical protein  27.33 
 
 		 326 aa  103  6e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.644034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6110  hypothetical protein  27.14 
 
 		 314 aa  102  8e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.749833  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1325  hypothetical protein  28.85 
 
 		 330 aa  102  9e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3440  hypothetical protein  25 
 
 		 324 aa  102  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000394825  normal  0.952417 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2774  hypothetical protein  27.78 
 
 		 333 aa  101  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.555634  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2047  tricarboxylic transporter, periplasmic ligand binding protein, TctC  23.44 
 
 		 332 aa  102  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.334258  normal  0.421066 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54540  hypothetical protein  28.72 
 
 		 327 aa  102  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000174239  normal  0.0908275 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3313  hypothetical protein  26.25 
 
 		 314 aa  102  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.159753  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2221  hypothetical protein  28.9 
 
 		 335 aa  102  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0950  hypothetical protein  26.3 
 
 		 323 aa  101  2e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5733  hypothetical protein  27.78 
 
 		 341 aa  101  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.558781 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0066  hypothetical protein  25.34 
 
 		 345 aa  101  2e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.909485 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49490  Uncharacterized protein family UPF0065  26.56 
 
 		 325 aa  100  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00178438  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4393  hypothetical protein  27.01 
 
 		 326 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.620266 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4284  hypothetical protein  26.98 
 
 		 335 aa  100  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1042  hypothetical protein  27.3 
 
 		 329 aa  100  3e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3704  hypothetical protein  27.04 
 
 		 328 aa  100  4e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0871  putative lipoprotein  25.34 
 
 		 348 aa  100  5e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  30.15 
 
 		 328 aa  100  5e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2192  hypothetical protein  23.8 
 
 		 328 aa  99.8  6e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2581  hypothetical protein  25.64 
 
 		 323 aa  99.8  6e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003384  putative tricarboxylic transport TctC  25.37 
 
 		 323 aa  99.4  8e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_1420  TRAP-T family transporter periplasmic binding protein  27.48 
 
 		 314 aa  99  9e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  27.33 
 
 		 328 aa  98.6  1e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>