111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5578 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_5578  transport-associated  100 
 
 		 217 aa  430  1e-119  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00026661  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0390  transport-associated  49.31 
 
 		 217 aa  209  3e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2300  transport-associated  50.7 
 
 		 217 aa  201  9e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.53534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1220  transport-associated protein  50.23 
 
 		 214 aa  191  7e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1200  transport-associated  50.23 
 
 		 217 aa  186  3e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.649848  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0204  hypothetical protein  43.78 
 
 		 219 aa  185  5e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1226  transport-associated protein  46.98 
 
 		 217 aa  185  5e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.528686  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6189  transport-associated  46.3 
 
 		 216 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.551844  normal  0.435123 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3328  transport-associated  44.81 
 
 		 217 aa  178  4.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.686073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5912  transport-associated protein  46.3 
 
 		 216 aa  178  5.999999999999999e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.203256  normal  0.355197 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7765  Smc22-1 ( osmotically inducible sensory protein)  42.33 
 
 		 217 aa  175  4e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.705157  normal  0.17558 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0139  transport-associated protein  47.66 
 
 		 223 aa  174  6e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7783  putative osmotically-inducible protein Y (precursor)  41.67 
 
 		 220 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.379132  normal  0.155349 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1108  transport-associated  47.22 
 
 		 216 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1870  periplasmic phospholipid binding protein  46.98 
 
 		 216 aa  171  7.999999999999999e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.388852  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2264  transport-associated  42.52 
 
 		 216 aa  171  9e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0189  hypothetical protein  43.66 
 
 		 215 aa  171  1e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.193269 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5932  transport-associated protein  44.19 
 
 		 216 aa  167  9e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2622  transport-associated  42.45 
 
 		 215 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0186  hypothetical protein  43.19 
 
 		 217 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.117611 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3808  transport-associated  42.13 
 
 		 216 aa  162  3e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4565  transport-associated  43.19 
 
 		 217 aa  162  4.0000000000000004e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.192769 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4429  transport-associated  45.58 
 
 		 215 aa  162  4.0000000000000004e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4432  transport-associated  43.19 
 
 		 217 aa  162  4.0000000000000004e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4562  transport-associated  45.58 
 
 		 215 aa  162  4.0000000000000004e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.266043 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1111  transport-associated  45.62 
 
 		 226 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.177622  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6897  transport-associated  40.28 
 
 		 217 aa  158  5e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.35821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0353  phospholipid binding protein  45.12 
 
 		 216 aa  158  6e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7784  putative osmotically inducible protein Y precursor  45.12 
 
 		 217 aa  156  3e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0602659  normal  0.220051 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4234  transport-associated  39.81 
 
 		 215 aa  154  1e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.855371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1491  transport-associated  42.92 
 
 		 216 aa  152  5e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5562  transport-associated  46.51 
 
 		 216 aa  152  5e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.221455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3859  transport-associated protein  43.38 
 
 		 216 aa  150  1e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.790334 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1909  transport-associated  42.52 
 
 		 215 aa  149  3e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.966808  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3634  transport-associated  42.59 
 
 		 228 aa  149  3e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000681524 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3604  hypothetical protein  38.68 
 
 		 215 aa  148  8e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.984998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0431  transport-associated  40.57 
 
 		 215 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.390186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5544  transport-associated  40 
 
 		 216 aa  146  3e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.078197  normal  0.764141 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1892  putative phophoslipid binding protein  40.47 
 
 		 216 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.953866 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1664  hypothetical protein  37.09 
 
 		 215 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0800901  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1899  periplasmic phospholipid binding protein  40.62 
 
 		 233 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.60597 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2881  transport-associated  41.71 
 
 		 216 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1101  transport-associated  39.07 
 
 		 216 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1868  transport-associated  40.64 
 
 		 216 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.882392  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0417  transport-associated  42.65 
 
 		 216 aa  136  2e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.421605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2606  transport-associated  43.13 
 
 		 216 aa  137  2e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0213477  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2613  transport-associated  39.62 
 
 		 214 aa  132  5e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.574258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4061  transport-associated  45.54 
 
 		 213 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.221026  normal  0.208315 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0425  transport-associated  37.74 
 
 		 214 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.379914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2456  transport-associated  36.15 
 
 		 215 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.262468  normal  0.570841 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3886  transport-associated  38.21 
 
 		 214 aa  124  1e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.121  normal  0.085803 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6133  transport-associated  42.86 
 
 		 178 aa  124  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0414  OsmY domain-containing protein  41.86 
 
 		 215 aa  122  4e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1063  OsmY domain-containing protein  40.47 
 
 		 215 aa  119  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2660  putative phospholipid-binding protein  40.47 
 
 		 237 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0140  putative phospholipid-binding protein  40.47 
 
 		 237 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0116  OsmY domain-containing protein  40.47 
 
 		 215 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.567152  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1280  OsmY domain-containing protein  40.47 
 
 		 215 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.84893  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2802  putative phospholipid-binding protein  40.47 
 
 		 215 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0155  OsmY domain-containing protein  43.32 
 
 		 216 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1324  OsmY domain-containing protein  43.32 
 
 		 216 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2759  putative phospholipid-binding protein  43.32 
 
 		 216 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2616  putative phospholipid-binding protein  43.32 
 
 		 216 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0180  OsmY domain-containing protein  43.32 
 
 		 216 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5879  transport-associated protein  36.41 
 
 		 215 aa  107  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6209  transport-associated  34.88 
 
 		 215 aa  103  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.716513 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0453  OsmY domain-containing protein  44.57 
 
 		 197 aa  98.2  7e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.584382  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1025  OsmY domain-containing protein  42.62 
 
 		 197 aa  97.4  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7774  hypothetical protein  30.96 
 
 		 203 aa  96.7  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.194796  normal  0.37862 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1151  transport-associated protein  38.4 
 
 		 141 aa  79.3  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6056  transport-associated  29.65 
 
 		 226 aa  78.2  0.00000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.822447  hitchhiker  0.00012166 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6692  transport-associated  27.31 
 
 		 543 aa  65.1  0.0000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3008  transport-associated  37.84 
 
 		 106 aa  60.8  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.845377  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2185  transport-associated  30.07 
 
 		 255 aa  60.5  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3503  periplasmic protein  31.58 
 
 		 204 aa  60.5  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0836  periplasmic protein  31.58 
 
 		 204 aa  60.1  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3632  periplasmic protein  31.58 
 
 		 204 aa  60.5  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0454  periplasmic protein  31.97 
 
 		 202 aa  59.7  0.00000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.390695  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2827  transport-associated  55 
 
 		 76 aa  58.9  0.00000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0761193  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0552  periplasmic protein  29.93 
 
 		 202 aa  57  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.783524  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2966  periplasmic or secreted lipoprotein OsmY  26.91 
 
 		 219 aa  53.5  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000230813  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0653  periplasmic protein  29.93 
 
 		 204 aa  53.9  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.335563 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2077  transport-associated  27.18 
 
 		 307 aa  53.5  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.735501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5271  transport-associated  42.65 
 
 		 86 aa  52.8  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.833634 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3585  periplasmic protein  28.57 
 
 		 218 aa  52  0.000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3809  transport-associated  42.65 
 
 		 108 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.810583  normal  0.967769 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3502  transport-associated  41.18 
 
 		 108 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.260556  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4917  periplasmic protein  32 
 
 		 205 aa  50.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.292031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4969  periplasmic protein  32 
 
 		 205 aa  50.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4815  periplasmic protein  32 
 
 		 205 aa  50.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4882  periplasmic protein  32 
 
 		 205 aa  50.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0715597  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4976  periplasmic protein  32 
 
 		 205 aa  50.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.163142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1784  transport-associated  25 
 
 		 275 aa  50.1  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0010501  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0826  transport-associated  28.63 
 
 		 245 aa  50.1  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0362569 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2437  CBS domain containing protein  28.57 
 
 		 628 aa  48.5  0.00007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00000875184  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4923  periplasmic protein  32 
 
 		 201 aa  48.1  0.00009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.497608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1214  transport-associated  37.5 
 
 		 315 aa  47.8  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0393886  normal  0.108337 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04251  periplasmic protein  32 
 
 		 201 aa  47  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.368391  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3623  transport-associated  32 
 
 		 201 aa  47  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4610  periplasmic protein  32 
 
 		 201 aa  47  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0762495  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>