More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_0005 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009486  Tpet_0005  carbohydrate kinase, YjeF related protein  100 
 
 		 498 aa  996    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0005  carbohydrate kinase, YjeF related protein  98.59 
 
 		 500 aa  981    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1793  carbohydrate kinase, YjeF related protein  44.77 
 
 		 501 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1011  carbohydrate kinase, YjeF related protein  45.14 
 
 		 504 aa  408  1.0000000000000001e-112  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.311341  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2696  carbohydrate kinase, YjeF related protein  41.75 
 
 		 515 aa  365  1e-99  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.590974  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2168  hypothetical protein  41.31 
 
 		 530 aa  347  2e-94  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00013257  decreased coverage  0.0000197316 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1884  hypothetical protein  38.95 
 
 		 517 aa  344  2e-93  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1759  carbohydrate kinase, YjeF related protein  42.08 
 
 		 530 aa  340  4e-92  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2259  carbohydrate kinase, YjeF related protein  40.31 
 
 		 525 aa  339  5.9999999999999996e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.997976  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0350  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.86 
 
 		 524 aa  339  7e-92  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3771  carbohydrate kinase, YjeF related protein  39.65 
 
 		 519 aa  338  9e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0302209  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0962  carbohydrate kinase, YjeF related protein  39.73 
 
 		 510 aa  332  1e-89  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2867  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.99 
 
 		 517 aa  327  3e-88  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1647  carbohydrate kinase, YjeF related protein  40.46 
 
 		 524 aa  326  5e-88  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0299074  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3022  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.51 
 
 		 520 aa  322  8e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0471  carbohydrate kinase, YjeF related protein  39.81 
 
 		 532 aa  317  3e-85  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1883  hypothetical protein  37.55 
 
 		 514 aa  316  6e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00817146  hitchhiker  0.000000287535 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1261  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.64 
 
 		 514 aa  315  9e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.169741  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2528  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.86 
 
 		 524 aa  313  3.9999999999999997e-84  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0697576  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1905  carbohydrate kinase, YjeF related protein  39.15 
 
 		 511 aa  311  2e-83  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0197843  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2321  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.99 
 
 		 521 aa  311  2e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000017421  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1364  carbohydrate kinase, YjeF related protein  40.72 
 
 		 490 aa  310  5e-83  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1954  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.79 
 
 		 509 aa  308  2.0000000000000002e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0698225  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0561  sugar kinase domain-containing protein  35.48 
 
 		 524 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000100236  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01670  carbohydrate kinase, YjeF related protein  39.42 
 
 		 513 aa  302  8.000000000000001e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3823  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.97 
 
 		 492 aa  301  2e-80  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0288  carbohydrate kinase family protein  35.94 
 
 		 499 aa  301  2e-80  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0775  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.4 
 
 		 533 aa  300  4e-80  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00360184  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2927  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.16 
 
 		 516 aa  298  1e-79  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.449906  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2168  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.88 
 
 		 521 aa  296  7e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1341  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.58 
 
 		 521 aa  294  3e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1802  YjeF family protein  36.58 
 
 		 519 aa  286  9e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0891524  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0500  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.35 
 
 		 524 aa  286  9e-76  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1617  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.16 
 
 		 514 aa  285  1.0000000000000001e-75  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.865669  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0283  carbohydrate kinase family protein  34.5 
 
 		 499 aa  285  1.0000000000000001e-75  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0304  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.59 
 
 		 533 aa  284  2.0000000000000002e-75  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.734599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0461  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.71 
 
 		 528 aa  280  5e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.729395  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3307  carbohydrate kinase, YjeF related protein  39.17 
 
 		 519 aa  276  9e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2333  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.38 
 
 		 506 aa  272  1e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3282  hypothetical protein  37.14 
 
 		 522 aa  265  1e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.172995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1702  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.33 
 
 		 516 aa  263  4.999999999999999e-69  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.214184  normal  0.051973 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1519  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.36 
 
 		 556 aa  258  1e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.025545 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0904  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.4 
 
 		 515 aa  257  3e-67  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3410  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.05 
 
 		 556 aa  256  5e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.802721  normal  0.621844 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0339  hypothetical protein  33.13 
 
 		 498 aa  256  9e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00480998  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1850  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.83 
 
 		 518 aa  255  1.0000000000000001e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.114808  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00644  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.26 
 
 		 499 aa  252  1e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06226  sugar kinase  34.57 
 
 		 512 aa  251  2e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3545  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.28 
 
 		 492 aa  251  2e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1126  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.29 
 
 		 504 aa  249  7e-65  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.000000000609405  decreased coverage  0.000000000191646 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1934  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.5 
 
 		 514 aa  247  3e-64  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000050145 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11168  putative YjeF-related sugar kinase  34.39 
 
 		 511 aa  246  4.9999999999999997e-64  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.291128  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0561  carbohydrate kinase, YjeF-related protein  35.76 
 
 		 492 aa  246  8e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0026662  normal  0.240164 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0951  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.33 
 
 		 479 aa  244  1.9999999999999999e-63  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.431816 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1401  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.9 
 
 		 507 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.324731  normal  0.9044 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3285  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.21 
 
 		 499 aa  244  3e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00260957  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1520  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.33 
 
 		 501 aa  244  3.9999999999999997e-63  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000211008 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3715  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.05 
 
 		 494 aa  243  7e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3772  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.85 
 
 		 494 aa  242  1e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00405966  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0802  YjeF-related protein-like protein  35.23 
 
 		 507 aa  242  1e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0592  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.95 
 
 		 499 aa  242  1e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000415893 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3605  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.03 
 
 		 533 aa  240  5e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.329001  hitchhiker  0.000690649 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0593  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.08 
 
 		 499 aa  240  5e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.320661  hitchhiker  0.00000405423 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3898  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.64 
 
 		 494 aa  239  5.999999999999999e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000196302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0553  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.85 
 
 		 494 aa  239  5.999999999999999e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000595011  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0598  yjeF protein  34.75 
 
 		 499 aa  239  8e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_369  carbohydrate kinase  35.06 
 
 		 512 aa  238  1e-61  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000136231  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1817  hypothetical protein  32.73 
 
 		 490 aa  238  2e-61  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3437  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.68 
 
 		 499 aa  237  3e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.446111  normal  0.221498 
 
 
-
 
NC_002936  DET0427  carbohydrate kinase family protein  33.4 
 
 		 512 aa  237  4e-61  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00841365  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0404  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.89 
 
 		 512 aa  236  8e-61  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0534144  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000472  YjeF protein  32.88 
 
 		 513 aa  235  1.0000000000000001e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3804  hypothetical protein  33.41 
 
 		 504 aa  234  2.0000000000000002e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000026757  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3063  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.69 
 
 		 508 aa  234  2.0000000000000002e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.099293  normal  0.0195061 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1065  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.85 
 
 		 487 aa  234  2.0000000000000002e-60  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1640  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.9 
 
 		 542 aa  233  5e-60  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0283025 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0704  hypothetical protein  33.19 
 
 		 504 aa  233  5e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000056197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3658  hypothetical protein  33.19 
 
 		 504 aa  233  8.000000000000001e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000233957  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4181  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.72 
 
 		 567 aa  231  2e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1301  YjeF-related protein  36.59 
 
 		 436 aa  231  2e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3030  YjeF protein  34.95 
 
 		 496 aa  231  2e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0792  carbohydrate kinase, YjeF-related protein  35.07 
 
 		 492 aa  229  6e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0035803 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0573  sugar kinase  33.72 
 
 		 499 aa  229  9e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.387859 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3243  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.59 
 
 		 502 aa  227  4e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3237  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.61 
 
 		 546 aa  226  6e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.271613 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1091  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.87 
 
 		 462 aa  226  9e-58  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.214114  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1191  sugar kinase  33.81 
 
 		 486 aa  225  1e-57  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.298101  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1229  putative carbohydrate kinase  33.6 
 
 		 488 aa  224  3e-57  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2672  ribosomal protein S15  33.73 
 
 		 500 aa  224  3e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0723  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.66 
 
 		 511 aa  223  7e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.191783  normal  0.257286 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7408  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.46 
 
 		 501 aa  222  9.999999999999999e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117304  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2331  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.1 
 
 		 511 aa  221  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0892  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.04 
 
 		 490 aa  216  5e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.177662  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2384  hypothetical protein  34.24 
 
 		 522 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0826  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.07 
 
 		 483 aa  214  2.9999999999999995e-54  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3726  hypothetical protein  33.2 
 
 		 514 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.10556  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0426  hypothetical protein  32.63 
 
 		 462 aa  214  3.9999999999999995e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.00000000379244  hitchhiker  0.000000929429 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5678  hypothetical protein  32.94 
 
 		 502 aa  214  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1880  YjeF-related protein  33.66 
 
 		 481 aa  213  5.999999999999999e-54  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.523049  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4947  YjeF-related protein  32.02 
 
 		 496 aa  213  7.999999999999999e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>