142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_0877 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_0877  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  100 
 
 		 180 aa  362  2e-99  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000011507  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3421  OstA-like protein  54.34 
 
 		 200 aa  182  2.0000000000000003e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  4.44027e-25  normal  0.738624 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0086  OstA-like protein  52.6 
 
 		 190 aa  165  2.9999999999999998e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.100502  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0140  OstA-like protein  50 
 
 		 176 aa  154  5.0000000000000005e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0328  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  45.83 
 
 		 225 aa  139  3e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.331017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0767  OstA-like family protein  45.62 
 
 		 221 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0488  OstA-like protein  45.68 
 
 		 221 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.298829  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0074  hypothetical protein  45.62 
 
 		 221 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1516  hypothetical protein  45.62 
 
 		 221 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0583  hypothetical protein  45.62 
 
 		 221 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0599  hypothetical protein  45.62 
 
 		 221 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2944  hypothetical protein  45.62 
 
 		 221 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4487  OstA-like protein  40.7 
 
 		 205 aa  131  3.9999999999999996e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.149914 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0598  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  43.26 
 
 		 223 aa  131  6e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0397055 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0535  OstA-like family protein  44.3 
 
 		 177 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.872333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4120  hypothetical protein  42.13 
 
 		 223 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3708  OstA family protein  44.89 
 
 		 214 aa  128  4.0000000000000003e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.14713 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0417  OstA family protein  44 
 
 		 216 aa  125  2.0000000000000002e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.694981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2175  OstA-like protein  43.98 
 
 		 221 aa  124  6e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2849  OstA family protein  43.98 
 
 		 221 aa  124  6e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.258721  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2789  OstA family protein  43.98 
 
 		 221 aa  124  6e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.156758  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2707  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  43.98 
 
 		 221 aa  124  6e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0137528 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0335  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  43.27 
 
 		 227 aa  124  8.000000000000001e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.109601  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2800  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  43.37 
 
 		 221 aa  123  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.29652 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0526  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  43.37 
 
 		 221 aa  122  4e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6119  OstA-like protein  42.77 
 
 		 221 aa  121  5e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.578391  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0776  OstA-like protein  43.67 
 
 		 213 aa  121  5e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.896639  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0150  OstA-like protein  42.04 
 
 		 209 aa  121  6e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.478454  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0410  putative signal peptide protein  40.99 
 
 		 191 aa  116  1.9999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0160024 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0357  OstA-like protein  39.24 
 
 		 213 aa  115  3.9999999999999997e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0464  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  39.62 
 
 		 239 aa  115  3.9999999999999997e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.150432  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0576  OstA family protein  43.56 
 
 		 217 aa  115  5e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0265  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  39.74 
 
 		 195 aa  114  6.9999999999999995e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0292  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  39.74 
 
 		 195 aa  114  7.999999999999999e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0305  OstA-like protein  38.65 
 
 		 214 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0346  OstA family protein  43.27 
 
 		 227 aa  110  9e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0672  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  38.64 
 
 		 228 aa  94.7  7e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.640265  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12810  LPS transport protein LptA  35.4 
 
 		 184 aa  92.4  3e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1910  OstA family protein  32.16 
 
 		 190 aa  92  4e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1615  OstA family protein  30.17 
 
 		 190 aa  91.7  5e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0872  OstA family protein  36.31 
 
 		 181 aa  90.5  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0206259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4227  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  40.94 
 
 		 211 aa  90.5  1e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.289947 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2791  OstA-like protein  37.36 
 
 		 275 aa  87  1e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.127705  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0954  hypothetical protein  36.05 
 
 		 174 aa  85.5  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0993  cell envelope biogenesis YhbN  36.05 
 
 		 174 aa  85.5  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0961  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  35.37 
 
 		 174 aa  84  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4261  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  34.87 
 
 		 174 aa  82.4  0.000000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4145  OstA-like protein  33.12 
 
 		 182 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0859  OstA-like protein  32.54 
 
 		 181 aa  79.7  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.492596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2107  hypothetical protein  35.43 
 
 		 179 aa  79  0.00000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4451  ostA family protein  33.33 
 
 		 182 aa  79  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.953915  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57920  hypothetical protein  32.16 
 
 		 175 aa  78.6  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0743  hypothetical protein  32.56 
 
 		 177 aa  75.1  0.0000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0171086  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3655  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  35.34 
 
 		 202 aa  72.4  0.000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5033  hypothetical protein  30.41 
 
 		 175 aa  72.4  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0234887  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4365  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  34.09 
 
 		 179 aa  72.8  0.000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.201613  normal  0.154984 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0507  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  36.03 
 
 		 185 aa  72  0.000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3570  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  36.03 
 
 		 185 aa  72  0.000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4522  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  36.03 
 
 		 185 aa  72  0.000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.599849  normal  0.710923 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3393  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  36.03 
 
 		 185 aa  72  0.000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3688  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  36.03 
 
 		 185 aa  72  0.000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0500  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  36.03 
 
 		 185 aa  72  0.000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.850542  normal  0.391623 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3496  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  36.03 
 
 		 185 aa  72  0.000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0753  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  32.4 
 
 		 194 aa  70.9  0.000000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.703312  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2228  OstA family protein  35.71 
 
 		 175 aa  69.7  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03065  predicted transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  35.29 
 
 		 185 aa  68.9  0.00000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000332715  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03016  hypothetical protein  35.29 
 
 		 185 aa  68.9  0.00000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000479332  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3615  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  31.43 
 
 		 184 aa  68.2  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.190854 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3508  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  31.43 
 
 		 184 aa  68.2  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3510  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  31.43 
 
 		 184 aa  68.2  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3579  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  31.43 
 
 		 184 aa  68.2  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3677  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  31.43 
 
 		 184 aa  68.2  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.148558 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1175  hypothetical protein  29.09 
 
 		 172 aa  67.8  0.00000000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3177  alpha amylase domain-containing protein  32.2 
 
 		 179 aa  67  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3813  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  33.83 
 
 		 189 aa  65.9  0.0000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.277414  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0728  OstA-like protein  29.78 
 
 		 180 aa  65.5  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03191  OstA-like protein  28.74 
 
 		 184 aa  64.3  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3666  OstA family protein  30.99 
 
 		 184 aa  63.2  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000733032  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0688  cell envelope biogenesis YhbN  30.99 
 
 		 184 aa  63.2  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00274419  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0718  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  30.99 
 
 		 184 aa  63.2  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.460129 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2124  OstA family protein  34.62 
 
 		 175 aa  62  0.000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0709  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  30.41 
 
 		 184 aa  61.6  0.000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.686411  normal  0.0194673 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0283  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  30.41 
 
 		 190 aa  61.2  0.000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.24235  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0674  OstA family protein  31.48 
 
 		 183 aa  60.8  0.000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.20726  normal  0.0960529 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1281  OstA-like protein  34.59 
 
 		 169 aa  60.5  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000052201 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2224  OstA-like protein  27.22 
 
 		 174 aa  60.5  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2713  OstA family protein  29.28 
 
 		 188 aa  60.5  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3636  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  31.21 
 
 		 157 aa  60.8  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.34297  normal  0.130415 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2416  cell envelope biogenesis YhbN  27.33 
 
 		 175 aa  60.8  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.972183  normal  0.0334942 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0276  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  29.73 
 
 		 190 aa  60.1  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0311412  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3347  OstA family protein  30.86 
 
 		 183 aa  59.3  0.00000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00730418  normal  0.133661 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3375  OstA family protein  29.7 
 
 		 193 aa  59.3  0.00000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.25365  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0500  hypothetical protein  27.06 
 
 		 166 aa  58.9  0.00000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.108043  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0717  OstA family protein  31.18 
 
 		 184 aa  58.5  0.00000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.184609  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0675  OstA family protein  30.25 
 
 		 183 aa  57.8  0.00000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.155422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1489  OstA-like protein  29.2 
 
 		 189 aa  57.4  0.0000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0428752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0925  OstA-like protein  29.93 
 
 		 189 aa  57  0.0000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0728  OstA family protein  31.93 
 
 		 217 aa  56.6  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.201644 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2974  OstA family protein  31.89 
 
 		 169 aa  55.8  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000275423  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2890  OstA family protein  31.25 
 
 		 173 aa  55.5  0.0000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.745795  normal  0.143441 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>