151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_2713 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008740  Maqu_2713  OstA family protein  100 
 
 		 188 aa  382  1e-105  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5033  hypothetical protein  40.48 
 
 		 175 aa  108  6e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0234887  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57920  hypothetical protein  39.29 
 
 		 175 aa  104  6e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2791  OstA-like protein  37.25 
 
 		 275 aa  91.7  5e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.127705  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0728  OstA-like protein  35.14 
 
 		 180 aa  90.9  1e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12810  LPS transport protein LptA  35.44 
 
 		 184 aa  90.5  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0872  OstA family protein  35.76 
 
 		 181 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0206259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4145  OstA-like protein  36.24 
 
 		 182 aa  84.7  6e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0859  OstA-like protein  31.93 
 
 		 181 aa  84  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.492596  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4451  ostA family protein  34.48 
 
 		 182 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.953915  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2224  OstA-like protein  39.22 
 
 		 174 aa  83.6  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0086  OstA-like protein  30.39 
 
 		 190 aa  79  0.00000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.100502  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3177  alpha amylase domain-containing protein  32.37 
 
 		 179 aa  79  0.00000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0140  OstA-like protein  29.59 
 
 		 176 aa  79  0.00000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0954  hypothetical protein  32.89 
 
 		 174 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0368  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  35.97 
 
 		 174 aa  76.6  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.166234 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4261  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  32.68 
 
 		 174 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0961  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  32.89 
 
 		 174 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0993  cell envelope biogenesis YhbN  32.89 
 
 		 174 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0925  OstA-like protein  32.35 
 
 		 189 aa  72.8  0.000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1489  OstA-like protein  31.36 
 
 		 189 aa  72.4  0.000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0428752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3421  OstA-like protein  27.96 
 
 		 200 aa  71.6  0.000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  4.44027e-25  normal  0.738624 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3655  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  31.21 
 
 		 202 aa  71.2  0.000000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3813  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  30.64 
 
 		 189 aa  70.5  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.277414  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0743  hypothetical protein  29.81 
 
 		 177 aa  69.7  0.00000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0171086  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0974  OstA-like protein  27.4 
 
 		 180 aa  68.6  0.00000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2107  hypothetical protein  29.65 
 
 		 179 aa  68.6  0.00000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0753  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  29.1 
 
 		 194 aa  68.6  0.00000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.703312  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0276  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  30.48 
 
 		 190 aa  67.8  0.00000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0311412  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0206  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  28.93 
 
 		 179 aa  65.5  0.0000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0500  hypothetical protein  26.58 
 
 		 166 aa  65.1  0.0000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.108043  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4238  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  30.32 
 
 		 196 aa  64.7  0.0000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000789736 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0535  OstA-like family protein  30.5 
 
 		 177 aa  64.7  0.0000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.872333  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3508  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  27.59 
 
 		 184 aa  63.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3579  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  27.59 
 
 		 184 aa  63.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3510  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  27.59 
 
 		 184 aa  63.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3677  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  27.59 
 
 		 184 aa  63.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.148558 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3615  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  27.59 
 
 		 184 aa  63.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.190854 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0507  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  28.49 
 
 		 185 aa  63.5  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0500  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  28.49 
 
 		 185 aa  63.5  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.850542  normal  0.391623 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4522  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  28.49 
 
 		 185 aa  63.5  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.599849  normal  0.710923 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3570  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  28.49 
 
 		 185 aa  63.5  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3496  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  28.49 
 
 		 185 aa  63.5  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0825  cell envelope biogenesis YhbN  30.34 
 
 		 157 aa  63.2  0.000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3393  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  28.49 
 
 		 185 aa  63.5  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3688  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  28.49 
 
 		 185 aa  63.5  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0283  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  30.59 
 
 		 190 aa  63.5  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.24235  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002405  LptA protein  28.67 
 
 		 164 aa  61.6  0.000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.122787  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0150  OstA-like protein  28.66 
 
 		 209 aa  61.6  0.000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.478454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03191  OstA-like protein  30.65 
 
 		 184 aa  61.2  0.000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03065  predicted transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  27.91 
 
 		 185 aa  60.5  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000332715  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03016  hypothetical protein  27.91 
 
 		 185 aa  60.5  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000479332  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0675  OstA family protein  27.37 
 
 		 183 aa  60.5  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.155422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0674  OstA family protein  27.93 
 
 		 183 aa  60.8  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.20726  normal  0.0960529 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0194  cell envelope biogenesis YhbN  33.07 
 
 		 197 aa  60.8  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.106383  normal  0.827244 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4487  OstA-like protein  29.05 
 
 		 205 aa  60.1  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.149914 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3347  OstA family protein  27.37 
 
 		 183 aa  59.7  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00730418  normal  0.133661 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3666  OstA family protein  29.38 
 
 		 184 aa  60.1  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000733032  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0688  cell envelope biogenesis YhbN  29.38 
 
 		 184 aa  60.1  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00274419  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03662  hypothetical protein  27.27 
 
 		 164 aa  60.1  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0718  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  29.38 
 
 		 184 aa  60.1  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.460129 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3086  OstA-like protein  28.74 
 
 		 184 aa  59.3  0.00000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.431766  normal  0.101166 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3636  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  31.69 
 
 		 157 aa  59.3  0.00000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.34297  normal  0.130415 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0709  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  28.75 
 
 		 184 aa  58.5  0.00000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.686411  normal  0.0194673 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0598  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  28.07 
 
 		 223 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0397055 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2606  OstA family protein  30.77 
 
 		 161 aa  58.2  0.00000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.664042 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0328  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  29.87 
 
 		 225 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.331017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4120  hypothetical protein  26.78 
 
 		 223 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0767  OstA-like family protein  30.97 
 
 		 221 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0877  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  29.88 
 
 		 180 aa  56.2  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000011507  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0074  hypothetical protein  30.97 
 
 		 221 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1516  hypothetical protein  30.97 
 
 		 221 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0583  hypothetical protein  30.97 
 
 		 221 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0599  hypothetical protein  30.97 
 
 		 221 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2944  hypothetical protein  30.97 
 
 		 221 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2416  cell envelope biogenesis YhbN  27.98 
 
 		 175 aa  57  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.972183  normal  0.0334942 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0717  OstA family protein  27.78 
 
 		 184 aa  55.8  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.184609  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0049  OstA family protein  27.22 
 
 		 221 aa  55.5  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.162045  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3959  hypothetical protein  28.4 
 
 		 183 aa  55.1  0.0000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0488  OstA-like protein  30.52 
 
 		 221 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.298829  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0899  hypothetical protein  26.67 
 
 		 169 aa  53.9  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0868  hypothetical protein  26.67 
 
 		 169 aa  53.9  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2228  OstA family protein  37.89 
 
 		 175 aa  54.3  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0728  OstA family protein  28.99 
 
 		 217 aa  54.3  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.201644 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0760  hypothetical protein  27.87 
 
 		 171 aa  53.5  0.000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.879513  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1205  cell envelope biogenesis protein YhbN  27.87 
 
 		 171 aa  53.5  0.000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0491  OstA-like protein  28.99 
 
 		 184 aa  53.1  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.148147  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0066  OstA family protein  28.02 
 
 		 230 aa  53.1  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.297106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4365  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  27.33 
 
 		 179 aa  52.4  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.201613  normal  0.154984 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0152  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  26.6 
 
 		 175 aa  51.6  0.000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.301086  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0176  OstA-like protein  26.25 
 
 		 221 aa  51.2  0.000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.435721  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00058  organic solvent tolerance protein precursor  33.33 
 
 		 784 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.0000114767  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3545  Organic solvent tolerance protein  33.33 
 
 		 784 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000267581  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0048  organic solvent tolerance protein  33.33 
 
 		 784 aa  50.8  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000576585  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0417  OstA family protein  26.29 
 
 		 216 aa  50.4  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.694981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0058  organic solvent tolerance protein  33.33 
 
 		 785 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000119427  normal  0.365449 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00057  hypothetical protein  33.33 
 
 		 784 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.0000200577  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3601  organic solvent tolerance protein  33.33 
 
 		 784 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000724307  hitchhiker  0.00000564634 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0060  organic solvent tolerance protein  33.33 
 
 		 784 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000118129  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0058  organic solvent tolerance protein  33.33 
 
 		 784 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000825468  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>