160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_2791 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_2791  OstA-like protein  100 
 
 		 275 aa  563  1e-160  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.127705  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0728  OstA-like protein  36.87 
 
 		 180 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12810  LPS transport protein LptA  40.4 
 
 		 184 aa  109  4.0000000000000004e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0872  OstA family protein  38.86 
 
 		 181 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0206259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57920  hypothetical protein  38.93 
 
 		 175 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5033  hypothetical protein  38.24 
 
 		 175 aa  106  4e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0234887  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0743  hypothetical protein  39.16 
 
 		 177 aa  104  2e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0171086  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4451  ostA family protein  34.46 
 
 		 182 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.953915  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4145  OstA-like protein  34.46 
 
 		 182 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0086  OstA-like protein  35.29 
 
 		 190 aa  91.7  1e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.100502  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3177  alpha amylase domain-containing protein  36.62 
 
 		 179 aa  91.3  1e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2713  OstA family protein  37.25 
 
 		 188 aa  91.7  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0825  cell envelope biogenesis YhbN  32.24 
 
 		 157 aa  87  3e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0535  OstA-like family protein  34.27 
 
 		 177 aa  86.7  4e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.872333  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0877  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  38.65 
 
 		 180 aa  86.3  5e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000011507  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0859  OstA-like protein  31.58 
 
 		 181 aa  82.4  0.000000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.492596  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0140  OstA-like protein  32.5 
 
 		 176 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4261  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  30.61 
 
 		 174 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0753  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  31.36 
 
 		 194 aa  78.6  0.0000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.703312  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1489  OstA-like protein  28.67 
 
 		 189 aa  77.8  0.0000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0428752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2124  OstA family protein  34.15 
 
 		 175 aa  77.8  0.0000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0974  OstA-like protein  31.07 
 
 		 180 aa  77  0.0000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2228  OstA family protein  35.34 
 
 		 175 aa  76.6  0.0000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1205  cell envelope biogenesis protein YhbN  33.33 
 
 		 171 aa  76.3  0.0000000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0760  hypothetical protein  33.33 
 
 		 171 aa  76.3  0.0000000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.879513  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0368  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  32.61 
 
 		 174 aa  76.3  0.0000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.166234 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3579  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  32.17 
 
 		 184 aa  76.3  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3615  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  32.17 
 
 		 184 aa  76.3  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.190854 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3677  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  32.17 
 
 		 184 aa  76.3  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.148558 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3510  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  32.17 
 
 		 184 aa  76.3  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3508  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  32.17 
 
 		 184 aa  76.3  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0925  OstA-like protein  30.41 
 
 		 189 aa  75.9  0.0000000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2224  OstA-like protein  30.92 
 
 		 174 aa  73.9  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3813  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  33.83 
 
 		 189 aa  73.6  0.000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.277414  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03191  OstA-like protein  30.39 
 
 		 184 aa  73.9  0.000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3655  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  30.83 
 
 		 202 aa  73.6  0.000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0954  hypothetical protein  29.37 
 
 		 174 aa  72.8  0.000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0961  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  29.37 
 
 		 174 aa  72.8  0.000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0993  cell envelope biogenesis YhbN  29.37 
 
 		 174 aa  72.8  0.000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2890  OstA family protein  31.74 
 
 		 173 aa  72.4  0.000000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.745795  normal  0.143441 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0507  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  30.77 
 
 		 185 aa  71.6  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0500  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  30.77 
 
 		 185 aa  71.6  0.00000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.850542  normal  0.391623 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4227  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  33.08 
 
 		 211 aa  71.6  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.289947 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3496  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  30.77 
 
 		 185 aa  71.6  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4522  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  30.77 
 
 		 185 aa  71.6  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.599849  normal  0.710923 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3570  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  30.77 
 
 		 185 aa  71.6  0.00000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3393  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  30.77 
 
 		 185 aa  71.6  0.00000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3688  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  30.77 
 
 		 185 aa  71.6  0.00000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0150  OstA-like protein  27.54 
 
 		 209 aa  68.6  0.00000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.478454  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03065  predicted transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  30.07 
 
 		 185 aa  68.2  0.0000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000332715  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03016  hypothetical protein  30.07 
 
 		 185 aa  68.2  0.0000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000479332  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0566  OstA-like protein  27.16 
 
 		 173 aa  67  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.256416  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1175  hypothetical protein  27.21 
 
 		 172 aa  67  0.0000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3636  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  33.05 
 
 		 157 aa  67.4  0.0000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.34297  normal  0.130415 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4487  OstA-like protein  28.95 
 
 		 205 aa  64.7  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.149914 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2416  cell envelope biogenesis YhbN  26.82 
 
 		 175 aa  65.1  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.972183  normal  0.0334942 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3614  cell envelope biogenesis YhbN  30.43 
 
 		 179 aa  63.9  0.000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0599225  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3708  OstA family protein  30.47 
 
 		 214 aa  62.4  0.000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.14713 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0410  putative signal peptide protein  29.38 
 
 		 191 aa  62  0.000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0160024 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4238  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  28.49 
 
 		 196 aa  62  0.000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000789736 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002405  LptA protein  27.83 
 
 		 164 aa  61.6  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.122787  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0328  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  28.96 
 
 		 225 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.331017  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0500  hypothetical protein  27.38 
 
 		 166 aa  62  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.108043  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1889  hypothetical protein  30.81 
 
 		 167 aa  61.2  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0598  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  26.21 
 
 		 223 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0397055 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0157  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  31.78 
 
 		 207 aa  60.5  0.00000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.503776 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0283  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  29.32 
 
 		 190 aa  60.5  0.00000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.24235  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3421  OstA-like protein  29.6 
 
 		 200 aa  59.7  0.00000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  4.44027e-25  normal  0.738624 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4541  OstA family protein  29.17 
 
 		 201 aa  59.3  0.00000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2107  hypothetical protein  26.42 
 
 		 179 aa  59.3  0.00000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0396  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  31.41 
 
 		 170 aa  59.3  0.00000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.110787  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0276  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  28.57 
 
 		 190 aa  58.9  0.00000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0311412  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0305  OstA-like protein  24.06 
 
 		 214 aa  58.2  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0709  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  26.92 
 
 		 184 aa  57.4  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.686411  normal  0.0194673 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0177  OstA-like protein  26.45 
 
 		 228 aa  57.4  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0249318  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0674  OstA family protein  28.28 
 
 		 183 aa  58.2  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.20726  normal  0.0960529 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3086  OstA-like protein  28.4 
 
 		 184 aa  57.8  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.431766  normal  0.101166 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0168  OstA family protein  28.57 
 
 		 216 aa  57.8  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0728  OstA family protein  27.72 
 
 		 217 aa  57.8  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.201644 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0488  OstA-like protein  27.43 
 
 		 221 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.298829  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0265  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  28.76 
 
 		 195 aa  57  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2800  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  25.54 
 
 		 221 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.29652 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0292  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  28.76 
 
 		 195 aa  56.6  0.0000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0767  OstA-like family protein  28.4 
 
 		 221 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6119  OstA-like protein  25.54 
 
 		 221 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.578391  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0074  hypothetical protein  28.4 
 
 		 221 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1516  hypothetical protein  28.4 
 
 		 221 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3666  OstA family protein  27.59 
 
 		 184 aa  56.2  0.0000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000733032  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0583  hypothetical protein  28.4 
 
 		 221 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0599  hypothetical protein  28.4 
 
 		 221 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2944  hypothetical protein  28.4 
 
 		 221 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0688  cell envelope biogenesis YhbN  27.59 
 
 		 184 aa  56.2  0.0000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00274419  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0718  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  27.59 
 
 		 184 aa  56.2  0.0000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.460129 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2175  OstA-like protein  25.54 
 
 		 221 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2789  OstA family protein  25.54 
 
 		 221 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.156758  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3347  OstA family protein  26.75 
 
 		 183 aa  55.8  0.0000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00730418  normal  0.133661 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03662  hypothetical protein  26.96 
 
 		 164 aa  55.8  0.0000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0046  OstA family protein  39.19 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.135443 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0672  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  24.32 
 
 		 228 aa  55.8  0.0000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.640265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2849  OstA family protein  25.54 
 
 		 221 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.258721  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>