48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1910 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1910  OstA family protein  100 
 
 		 190 aa  390  1e-108  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1615  OstA family protein  74.46 
 
 		 190 aa  277  8e-74  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0357  OstA-like protein  36.65 
 
 		 213 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0305  OstA-like protein  36.65 
 
 		 214 aa  105  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4120  hypothetical protein  32 
 
 		 223 aa  102  5e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0410  putative signal peptide protein  34.62 
 
 		 191 aa  100  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0160024 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0292  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  34.62 
 
 		 195 aa  100  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0265  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  34.62 
 
 		 195 aa  100  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0598  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  32 
 
 		 223 aa  100  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0397055 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0328  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  31.74 
 
 		 225 aa  95.5  4e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.331017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0776  OstA-like protein  33.12 
 
 		 213 aa  93.6  1e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.896639  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0488  OstA-like protein  33.12 
 
 		 221 aa  92.4  4e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.298829  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0583  hypothetical protein  32.3 
 
 		 221 aa  91.7  5e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0599  hypothetical protein  32.3 
 
 		 221 aa  91.7  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0074  hypothetical protein  32.3 
 
 		 221 aa  91.7  5e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2944  hypothetical protein  32.3 
 
 		 221 aa  91.7  5e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0767  OstA-like family protein  32.3 
 
 		 221 aa  91.7  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1516  hypothetical protein  32.3 
 
 		 221 aa  91.7  5e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4487  OstA-like protein  31.61 
 
 		 205 aa  90.9  9e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.149914 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0150  OstA-like protein  31.85 
 
 		 209 aa  90.5  1e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.478454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2707  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  35.4 
 
 		 221 aa  90.5  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0137528 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2789  OstA family protein  35.4 
 
 		 221 aa  90.9  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.156758  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2849  OstA family protein  35.4 
 
 		 221 aa  90.5  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.258721  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2175  OstA-like protein  35.4 
 
 		 221 aa  90.9  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2800  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  35.4 
 
 		 221 aa  90.9  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.29652 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0526  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  35.4 
 
 		 221 aa  90.1  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6119  OstA-like protein  35.4 
 
 		 221 aa  89.7  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.578391  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0417  OstA family protein  30.06 
 
 		 216 aa  89.4  3e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.694981  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3421  OstA-like protein  32.56 
 
 		 200 aa  88.6  5e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  4.44027e-25  normal  0.738624 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0140  OstA-like protein  31.07 
 
 		 176 aa  87.8  8e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0086  OstA-like protein  28.49 
 
 		 190 aa  86.3  2e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.100502  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0877  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  31.01 
 
 		 180 aa  83.6  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000011507  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0335  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  30.36 
 
 		 227 aa  83.6  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.109601  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0346  OstA family protein  29.93 
 
 		 227 aa  81.3  0.000000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3708  OstA family protein  29.87 
 
 		 214 aa  80.9  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.14713 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0464  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  28.3 
 
 		 239 aa  75.1  0.0000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.150432  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0672  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  31.47 
 
 		 228 aa  74.7  0.0000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.640265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0576  OstA family protein  28.87 
 
 		 217 aa  72.8  0.000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0535  OstA-like family protein  31.58 
 
 		 177 aa  70.1  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.872333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4227  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  26.56 
 
 		 211 aa  54.7  0.0000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.289947 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2228  OstA family protein  25.41 
 
 		 175 aa  42.7  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0961  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  23.72 
 
 		 174 aa  42.4  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0859  OstA-like protein  24.31 
 
 		 181 aa  42  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.492596  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03016  hypothetical protein  27.74 
 
 		 185 aa  42  0.006  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000479332  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03065  predicted transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  27.74 
 
 		 185 aa  42  0.006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000332715  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0993  cell envelope biogenesis YhbN  23.72 
 
 		 174 aa  42  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0954  hypothetical protein  23.72 
 
 		 174 aa  42  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0872  OstA family protein  24.5 
 
 		 181 aa  41.2  0.01  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0206259  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>