More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0076 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0076  ABC-type branched-chain amino acid transport systems ATPase component  100 
 
 		 248 aa  485  1e-136  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0040  ABC transporter related protein  76.95 
 
 		 246 aa  367  1e-101  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0383102  normal  0.0961042 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7910  ABC transporter related  68.12 
 
 		 275 aa  293  2e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3912  ABC transporter related  64.1 
 
 		 240 aa  280  1e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.478382  normal  0.0640135 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0419  ABC transporter-like protein  59.91 
 
 		 240 aa  264  8e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4268  ABC transporter related  45.45 
 
 		 234 aa  202  4e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4106  ABC transporter related  45.45 
 
 		 234 aa  201  7e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1570  ABC transporter related  47.19 
 
 		 232 aa  201  7e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.687597 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4479  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP binding protein  46.98 
 
 		 234 aa  198  7e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00225011  hitchhiker  0.00953157 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1984  ABC transporter related  48.31 
 
 		 249 aa  198  7.999999999999999e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.778034  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4568  ABC transporter related  45.89 
 
 		 232 aa  195  6e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.272221  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1576  ABC transporter related  45.89 
 
 		 231 aa  194  9e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.422459 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0197  ABC transporter related  45.73 
 
 		 234 aa  193  3e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3827  ABC transporter related  46.46 
 
 		 237 aa  191  7e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4904  ABC transporter related  46.46 
 
 		 237 aa  191  7e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3165  ABC transporter related  46.96 
 
 		 241 aa  191  8e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.317931  normal  0.242045 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3409  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  40.69 
 
 		 233 aa  191  9e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000345208 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2528  ABC transporter related  51.89 
 
 		 232 aa  190  1e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.53065 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0175  ABC transporter related  42.51 
 
 		 259 aa  188  5.999999999999999e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.154822  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6571  ABC transporter related  44.98 
 
 		 233 aa  188  7e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.177691  normal  0.0408481 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1803  ABC transporter related  39.83 
 
 		 233 aa  188  7e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.113261  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1933  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  40.26 
 
 		 233 aa  188  8e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0157  ABC transporter related  42.11 
 
 		 259 aa  187  1e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0222  ABC transporter related  45.61 
 
 		 243 aa  187  1e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2175  ABC transporter related protein  43.23 
 
 		 232 aa  187  2e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.549091  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4171  ABC transporter related  46.72 
 
 		 231 aa  186  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5724  ABC transporter related  44.54 
 
 		 233 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6088  ABC transporter related  44.54 
 
 		 233 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.89804  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1768  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  38.53 
 
 		 233 aa  186  3e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2553  ABC transporter related  46.9 
 
 		 249 aa  186  4e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.980288 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1853  ABC transporter-related protein  44.26 
 
 		 235 aa  186  4e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2033  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  38.96 
 
 		 233 aa  185  5e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0482987  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2012  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  38.96 
 
 		 233 aa  185  6e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4058  ABC transporter related  45.26 
 
 		 240 aa  185  6e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.170291  normal  0.158013 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1969  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  38.53 
 
 		 233 aa  184  8e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000310973 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6570  ABC transporter related  44.93 
 
 		 233 aa  184  8e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0192562  normal  0.0138442 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2420  ABC transporter related  42.92 
 
 		 242 aa  184  1.0000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4206  ABC transporter related  45.26 
 
 		 240 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2866  ABC transporter related  44.44 
 
 		 233 aa  183  2.0000000000000003e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.699047 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1794  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  38.1 
 
 		 233 aa  182  3e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.32694  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1751  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  38.1 
 
 		 233 aa  182  3e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.612214  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1934  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  38.1 
 
 		 233 aa  182  3e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1372  ABC transporter related  45.26 
 
 		 240 aa  183  3e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1715  ABC transporter related  42.42 
 
 		 234 aa  182  3e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0199922  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0615  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  43.97 
 
 		 231 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1754  amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  42.68 
 
 		 239 aa  182  6e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.395881  normal  0.658202 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2063  ABC transporter related  46.9 
 
 		 241 aa  182  6e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.773711  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0655  ABC transporter related  42.61 
 
 		 231 aa  181  7e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.139364 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0661  ABC transporter related  42.61 
 
 		 231 aa  181  7e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.579097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1177  ABC transporter related  45.37 
 
 		 236 aa  181  8.000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.496575  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1585  ABC transporter related  45.53 
 
 		 237 aa  180  2e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.230089  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0025  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  43.04 
 
 		 238 aa  180  2e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2929  ABC transporter related  44.59 
 
 		 230 aa  180  2e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0028  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.19 
 
 		 238 aa  179  2.9999999999999997e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1450  ABC transporter related  41 
 
 		 239 aa  179  4e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0957848  hitchhiker  0.000807382 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2562  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  44.05 
 
 		 233 aa  179  4e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3462  ABC transporter related  46.72 
 
 		 235 aa  179  4.999999999999999e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2236  ABC transporter related  39.91 
 
 		 234 aa  178  7e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0732075  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1491  ABC transporter related  41 
 
 		 239 aa  178  7e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.318894  normal  0.254571 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1577  ABC transporter related  45.06 
 
 		 238 aa  178  7e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.787524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2306  ABC transporter related protein  40.68 
 
 		 236 aa  178  8e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0329  ABC transporter related  45.04 
 
 		 243 aa  178  9e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3803  ABC transporter related  42.24 
 
 		 234 aa  177  1e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.373546  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0858  ABC transporter related  47.01 
 
 		 230 aa  177  1e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.269038  normal  0.152569 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3456  ABC transporter related  42.17 
 
 		 236 aa  176  2e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2855  ABC transporter related protein  44.83 
 
 		 245 aa  177  2e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000134885  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3245  ABC transporter related  42.92 
 
 		 246 aa  176  2e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0694781  normal  0.303257 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1048  ABC transporter related  42.61 
 
 		 236 aa  177  2e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0403  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  38.7 
 
 		 231 aa  177  2e-43  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2552  ABC transporter-related protein  44.26 
 
 		 237 aa  176  4e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4884  ABC transporter related  44.4 
 
 		 240 aa  176  4e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0761  ABC transporter related  45.13 
 
 		 237 aa  175  5e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3312  ABC transporter related  40.26 
 
 		 231 aa  175  5e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.000555614  hitchhiker  0.00984182 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1858  ABC transporter-related protein  41.63 
 
 		 237 aa  176  5e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.115149 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2518  ABC transporter related  41.45 
 
 		 248 aa  175  6e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.778502  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1473  ABC transporter-like protein  43.64 
 
 		 238 aa  175  6e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1672  ABC transporter related  41.18 
 
 		 239 aa  175  7e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4448  ABC transporter related  43.5 
 
 		 244 aa  175  7e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.186426  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6727  ABC transporter related  43.1 
 
 		 233 aa  175  8e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8051  ABC transporter related  43.5 
 
 		 244 aa  174  8e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.215177  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5821  ABC transporter related  43.1 
 
 		 233 aa  174  8e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.602049  normal  0.151305 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7684  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.83 
 
 		 240 aa  174  9e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.887024  normal  0.712178 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4754  ABC transporter-related protein  44.93 
 
 		 234 aa  174  9e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2926  ABC transporter related  40.26 
 
 		 231 aa  174  9.999999999999999e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.103898  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1673  ABC transporter related  42.17 
 
 		 251 aa  174  9.999999999999999e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.646828  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0408  ABC transporter-like protein  47.11 
 
 		 237 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.314132  normal  0.281925 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5955  ABC transporter related  41.28 
 
 		 247 aa  173  1.9999999999999998e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0145925  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1774  putative amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  42.55 
 
 		 236 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.328885  normal  0.085306 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3592  ABC transporter-related protein  41.3 
 
 		 239 aa  173  1.9999999999999998e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2313  ABC transporter related  42.73 
 
 		 236 aa  173  1.9999999999999998e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5998  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.61 
 
 		 235 aa  173  2.9999999999999996e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.355908  normal  0.0594228 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0572  ABC transporter related  39.24 
 
 		 239 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000129058  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2021  ABC transporter related  38.96 
 
 		 231 aa  172  3.9999999999999995e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0684522  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3166  ABC transporter related  41.38 
 
 		 248 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.633767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1473  ABC transporter related  40.85 
 
 		 236 aa  172  3.9999999999999995e-42  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1400  ABC transporter related  42.26 
 
 		 239 aa  172  3.9999999999999995e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.656641  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0050  ABC transporter related  41.81 
 
 		 232 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.906419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0856  ABC transporter related  43.4 
 
 		 233 aa  172  3.9999999999999995e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3007  ABC transporter-related protein  41.53 
 
 		 258 aa  172  3.9999999999999995e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0515162  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2387  ABC transporter related  38.53 
 
 		 231 aa  172  5e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0332278  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>