More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4013 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_4013  NLP/P60 protein  100 
 
 
236 aa  470  1.0000000000000001e-131  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2692  NLP/P60 protein  48.98 
 
 
162 aa  156  3e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3070  NLP/P60 protein  54.87 
 
 
306 aa  135  7.000000000000001e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00281193  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1029  putative secreted protein  53.1 
 
 
331 aa  125  4.0000000000000003e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.781321  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0570  NLP/P60 protein  48.74 
 
 
160 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3420  NLP/P60 protein  51.69 
 
 
342 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1030  NLP/P60 family secreted protein  49.58 
 
 
340 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.427961  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4480  NLP/P60 protein  46.61 
 
 
340 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1303  NLP/P60 protein  52.21 
 
 
319 aa  116  3e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0103745  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9152  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  49.15 
 
 
321 aa  115  5e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6205  NLP/P60 protein  52.59 
 
 
417 aa  114  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0502801 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8043  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  45.13 
 
 
210 aa  113  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.433259  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10740  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  52.48 
 
 
332 aa  112  4.0000000000000004e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3144  NLP/P60 protein  47.32 
 
 
334 aa  112  4.0000000000000004e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0327841  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0423  NLP/P60  50.86 
 
 
459 aa  109  3e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2686  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  50.94 
 
 
330 aa  109  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0377535  normal  0.257604 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1371  cell wall-associated hydrolase/invasion-associated protein  39.23 
 
 
273 aa  108  7.000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0971  NLP/P60 protein  48.21 
 
 
345 aa  107  2e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.230256 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5879  NLP/P60 protein  49.56 
 
 
333 aa  106  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.884921  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3453  NLP/P60 protein  41.36 
 
 
394 aa  106  3e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55181  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0586  NLP/P60 protein  42.5 
 
 
432 aa  106  4e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2283  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  39.47 
 
 
222 aa  105  5e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3145  NLP/P60 protein  45 
 
 
349 aa  105  8e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.120353  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9181  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  43.04 
 
 
531 aa  103  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4506  NLP/P60 protein  47.58 
 
 
501 aa  103  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.918319  normal  0.0864721 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0190  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  43.22 
 
 
235 aa  103  3e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4498  NLP/P60 protein  48.18 
 
 
398 aa  103  3e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.0701003 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4077  NLP/P60 protein  42.02 
 
 
308 aa  102  6e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0063374  normal  0.206509 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2273  NLP/P60 protein  43.36 
 
 
333 aa  101  9e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.543976  normal  0.489772 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2144  NLP/P60 protein  44.25 
 
 
374 aa  101  1e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5004  NLP/P60 protein  45.05 
 
 
347 aa  100  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.549544  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4086  NLP/P60 protein  46.28 
 
 
517 aa  100  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.296945 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8562  NLP/P60 protein  54.44 
 
 
373 aa  100  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0614213  hitchhiker  0.0073147 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4965  NLP/P60 protein  38.85 
 
 
208 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6095  NLP/P60 protein  50.59 
 
 
366 aa  99.4  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0901691 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0243  NLP/P60 protein  46.46 
 
 
323 aa  99.4  4e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3235  NLP/P60 protein  48.48 
 
 
446 aa  99.4  5e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.177919  hitchhiker  0.000140663 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1427  NLP/P60 protein  49.46 
 
 
301 aa  99.4  5e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.107588  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0060  NLP/P60 protein  45.92 
 
 
337 aa  99  6e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.306663  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4866  NLP/P60 protein  50 
 
 
350 aa  98.2  9e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2683  NLP/P60 protein  47.32 
 
 
348 aa  97.8  1e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.468332  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0751  NLP/P60 protein  35.48 
 
 
173 aa  97.4  1e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5092  NLP/P60 protein  38.22 
 
 
207 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1461  NLP/P60  43.24 
 
 
366 aa  97.1  2e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.495869  decreased coverage  0.00837381 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3579  NLP/P60 protein  48.39 
 
 
323 aa  97.1  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2139  NLP/P60 protein  52.81 
 
 
374 aa  96.3  3e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.606148  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3043  NLP/P60 protein  46.85 
 
 
274 aa  96.7  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.166608  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5317  NLP/P60  38.64 
 
 
205 aa  96.3  4e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.378858 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2683  NLP/P60 protein  36.3 
 
 
232 aa  95.9  5e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.65308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1380  NLP/P60 protein  47.37 
 
 
343 aa  95.1  9e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0479  NLP/P60  35.37 
 
 
225 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.972324  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1717  NLP/P60 protein  39.16 
 
 
324 aa  94.4  1e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00794283  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0230  NLP/P60 protein  42.5 
 
 
188 aa  94  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.382299 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5880  NLP/P60 protein  40.54 
 
 
315 aa  94  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.791829  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1543  NlpC/P60 family protein  40.15 
 
 
275 aa  93.6  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.179042 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1561  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  40.48 
 
 
337 aa  94  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.308616  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1828  lipoprotein, NLP/P60 family  43.2 
 
 
188 aa  93.6  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.996382  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3958  NLP/P60 protein  46.81 
 
 
323 aa  93.6  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.068937  normal  0.125379 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1504  NLP/P60 protein  43.2 
 
 
188 aa  93.6  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0399794  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0373  NLP/P60 protein  41.6 
 
 
208 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01625  predicted lipoprotein  40.15 
 
 
271 aa  93.2  3e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.712982  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1985  NLP/P60 protein  40.15 
 
 
271 aa  93.2  3e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.778309  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0480  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  48.39 
 
 
390 aa  93.6  3e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5142  NLP/P60 protein  36.31 
 
 
208 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0699781  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1974  NLP/P60 protein  40.15 
 
 
271 aa  93.2  3e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00117191 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2570  NlpC/P60 family lipoprotein  37.78 
 
 
283 aa  93.2  3e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.117101  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1868  NlpC/P60 family protein  40.15 
 
 
271 aa  93.2  3e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000206609  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1734  NlpC/P60 family protein  40.15 
 
 
271 aa  93.2  3e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.252215  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0980  NLP/P60 protein  40 
 
 
230 aa  93.2  3e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.475517  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1852  NlpC/P60 family protein  40.15 
 
 
271 aa  93.2  3e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000302623  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01615  hypothetical protein  40.15 
 
 
271 aa  93.2  3e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.749344  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2367  NlpC/P60 family protein  40.15 
 
 
271 aa  93.2  3e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00414236  normal  0.27776 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2585  NLP/P60 protein  37.31 
 
 
183 aa  92.8  4e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.364054  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1757  NlpC/P60 family lipoprotein  37.78 
 
 
283 aa  92.8  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000156191  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1864  NLP/P60 protein  37.78 
 
 
283 aa  92.8  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.617955  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3095  NLP/P60 protein  41.88 
 
 
452 aa  92.8  5e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.378956 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0889  NLP/P60 protein  37.82 
 
 
337 aa  92.4  5e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07310  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  42.72 
 
 
329 aa  92.4  5e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1003  NLP/P60 protein  42.74 
 
 
269 aa  92  7e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000166415  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5739  NLP/P60 protein  41.44 
 
 
367 aa  91.7  8e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8293  NLP/P60 protein  40.5 
 
 
374 aa  92  8e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.611397  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0694  NLP/P60 protein  40.59 
 
 
453 aa  91.7  9e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.427421 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2387  NLP/P60 protein  37.78 
 
 
283 aa  91.3  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.05451  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0285  NLP/P60  40.71 
 
 
368 aa  91.7  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0184  NLP/P60  46.79 
 
 
174 aa  91.3  1e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1792  NLP/P60 protein  40 
 
 
256 aa  91.7  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.851858  normal  0.0301658 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3124  NLP/P60 protein  43.52 
 
 
327 aa  91.3  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0606455  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3049  NLP/P60 protein  48.96 
 
 
347 aa  91.3  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6528  NLP/P60 protein  41.07 
 
 
392 aa  90.5  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.203343 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5044  NLP/P60 family protein  37.8 
 
 
226 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.982871  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2700  NLP/P60 protein  39.02 
 
 
188 aa  90.9  2e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000637216  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32150  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  43.81 
 
 
475 aa  90.9  2e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0191937  normal  0.997288 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3050  NLP/P60 protein  41.41 
 
 
227 aa  90.5  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3257  NLP/P60 protein  41.88 
 
 
269 aa  90.5  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2671  NLP/P60 protein  37.78 
 
 
283 aa  90.9  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.179494  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2684  NLP/P60 protein  42 
 
 
232 aa  90.9  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.708971  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1783  NLP/P60 protein  43.33 
 
 
317 aa  90.5  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.114987  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6766  NLP/P60 protein  50 
 
 
350 aa  90.9  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  36.75 
 
 
265 aa  90.5  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1787  NLP/P60 protein  41.88 
 
 
278 aa  89.7  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000149372  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>