288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_2325 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_2325  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 444 aa  887    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0032194  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0869  extracellular solute-binding protein family 1  52.13 
 
 		 436 aa  436  1e-121  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.293785 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2151  extracellular solute-binding protein family 1  52.51 
 
 		 466 aa  405  1e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1625  alpha-glucoside ABC transporter periplasmic- binding protein  49.13 
 
 		 442 aa  398  1e-109  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.234885  normal  0.190993 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2626  extracellular solute-binding protein family 1  49.11 
 
 		 455 aa  390  1e-107  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0491272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2936  extracellular solute-binding protein family 1  48.24 
 
 		 447 aa  369  1e-101  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.322365 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1180  extracellular solute-binding protein  36.7 
 
 		 485 aa  246  4.9999999999999997e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13200  extracellular solute-binding protein family 1  37.3 
 
 		 424 aa  238  1e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14550  extracellular solute-binding protein family 1  35.52 
 
 		 432 aa  225  1e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000299418  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2873  ABC alpha-glucoside transporter, perplasmic substrate-binding protein  35.71 
 
 		 450 aa  208  2e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.182804  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2910  ABC alpha-glucoside transporter extracellular solute-binding protein, family 1  33.95 
 
 		 452 aa  208  2e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.320115 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1147  extracellular solute-binding protein  34.39 
 
 		 544 aa  207  3e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1519  extracellular solute-binding protein  35.45 
 
 		 450 aa  206  5e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.846969  normal  0.200847 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0785  ABC transporter substrate binding protein (alpha-glucoside)  33.1 
 
 		 452 aa  206  9e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0292  extracellular solute-binding protein  34.3 
 
 		 452 aa  205  1e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3307  extracellular solute-binding protein  33.16 
 
 		 449 aa  204  2e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0444358  normal  0.775669 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2855  extracellular solute-binding protein  33.84 
 
 		 451 aa  202  7e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3716  extracellular solute-binding protein family 1  32.13 
 
 		 440 aa  202  9.999999999999999e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000472149 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0355  extracellular solute-binding protein family 1  33.08 
 
 		 453 aa  199  6e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.179225 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0387  extracellular solute-binding protein family 1  32.82 
 
 		 453 aa  196  6e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4345  extracellular solute-binding protein  32.63 
 
 		 450 aa  190  4e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.216447 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3967  extracellular solute-binding protein  32.3 
 
 		 448 aa  189  5.999999999999999e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0182057  normal  0.154584 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3587  extracellular solute-binding protein  32.48 
 
 		 447 aa  180  4.999999999999999e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.69287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1652  putative solute-binding protein 1 family  30.61 
 
 		 452 aa  179  5.999999999999999e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.182094  hitchhiker  0.00000465499 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7166  alpha-glucoside ABC transporter  32.51 
 
 		 451 aa  179  5.999999999999999e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0136035 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1946  extracellular solute-binding protein  30.95 
 
 		 449 aa  175  9.999999999999999e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26130  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  30.98 
 
 		 448 aa  174  2.9999999999999996e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0719829  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5152  extracellular solute-binding protein family 1  32.2 
 
 		 482 aa  170  5e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0267  extracellular solute-binding protein family 1  32.41 
 
 		 462 aa  168  2e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.39283  normal  0.349323 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2337  ABC-type glucosylglycerol transport system substrate-binding protein  30.46 
 
 		 448 aa  166  8e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.176838  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5758  extracellular solute-binding protein family 1  31.03 
 
 		 498 aa  161  3e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.576382  normal  0.192043 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3914  extracellular solute-binding protein  31.69 
 
 		 457 aa  161  3e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.313486  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3182  extracellular solute-binding protein family 1  33.33 
 
 		 464 aa  151  2e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.145583 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2534  extracellular solute-binding protein family 1  33 
 
 		 404 aa  149  8e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.478006  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0402  extracellular solute-binding protein family 1  28.47 
 
 		 447 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4648  extracellular solute-binding protein family 1  28.13 
 
 		 448 aa  146  8.000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000260895 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01750  carbohydrate-binding protein  27.88 
 
 		 457 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.110954  normal  0.899537 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5673  extracellular solute-binding protein family 1  29.2 
 
 		 435 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0285739  normal  0.0925972 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3237  extracellular solute-binding protein family 1  29.21 
 
 		 464 aa  132  2.0000000000000002e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5137  extracellular solute-binding protein  30.05 
 
 		 433 aa  116  6e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.319423  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3304  extracellular solute-binding protein family 1  28.12 
 
 		 431 aa  110  5e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2351  extracellular solute-binding protein  25.54 
 
 		 421 aa  108  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.576024  normal  0.167209 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20520  extracellular solute-binding protein family 1  28.22 
 
 		 417 aa  105  1e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.561553  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4880  extracellular solute-binding protein  27.48 
 
 		 412 aa  103  8e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3285  extracellular solute-binding protein  27.48 
 
 		 412 aa  103  8e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1010  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.32 
 
 		 380 aa  102  1e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.283496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6024  extracellular solute-binding protein  27.79 
 
 		 412 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4586  extracellular solute-binding protein family 1  25.43 
 
 		 417 aa  102  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.947174 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6324  extracellular solute-binding protein  27.55 
 
 		 412 aa  100  4e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5487  extracellular solute-binding protein  26.39 
 
 		 419 aa  100  5e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000866815 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4932  extracellular solute-binding protein  26.39 
 
 		 419 aa  99.8  8e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0556288 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3196  extracellular solute-binding protein  26.15 
 
 		 419 aa  97.8  3e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.461238  normal  0.154514 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4577  extracellular solute-binding protein  26.15 
 
 		 419 aa  97.8  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00216886 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5201  extracellular solute-binding protein  26.15 
 
 		 420 aa  97.4  5e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5658  extracellular solute-binding protein  26.15 
 
 		 420 aa  97.4  5e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0866592  normal  0.356633 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3155  extracellular solute-binding protein family 1  30.43 
 
 		 434 aa  94  5e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2572  extracellular solute-binding protein  22.82 
 
 		 414 aa  93.6  6e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1355  extracellular solute-binding protein  28.75 
 
 		 422 aa  89.4  1e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.120515 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0621  extracellular solute-binding protein  27.55 
 
 		 427 aa  88.2  3e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.178997  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2659  extracellular solute-binding protein family 1  26.45 
 
 		 495 aa  87.8  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0361435  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2008  ABC transporter extracellular solute-binding protein  27.04 
 
 		 408 aa  87.8  4e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.247518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1174  extracellular solute-binding protein  25.29 
 
 		 455 aa  84.3  0.000000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273661  normal  0.401546 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0626  extracellular solute-binding protein  26.04 
 
 		 408 aa  84.3  0.000000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000892518  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0818  extracellular solute-binding protein  30.23 
 
 		 415 aa  81.6  0.00000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2016  extracellular solute-binding protein  23.85 
 
 		 408 aa  82  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00148299  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1808  extracellular solute-binding protein family 1  28.64 
 
 		 414 aa  81.3  0.00000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0208  extracellular solute-binding protein family 1  28.07 
 
 		 454 aa  81.3  0.00000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7939  ABC transporter (substrate-binding protein)  25.07 
 
 		 428 aa  80.5  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.50295  normal  0.560439 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2234  extracellular solute-binding protein family 1  24.94 
 
 		 419 aa  79.3  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2306  extracellular solute-binding protein family 1  24.23 
 
 		 432 aa  78.6  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.432824  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1924  extracellular solute-binding protein  25.82 
 
 		 415 aa  78.2  0.0000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.121968  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0803  extracellular solute-binding protein  26.16 
 
 		 435 aa  78.2  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2391  extracellular solute-binding protein family 1  25.2 
 
 		 422 aa  77.4  0.0000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.436445  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3251  extracellular solute-binding protein family 1  26.61 
 
 		 427 aa  76.6  0.0000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.829082  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5736  ABC transporter, substrate-binding protein  27.55 
 
 		 410 aa  76.3  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.214535  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1126  extracellular solute-binding protein family 1  26.68 
 
 		 433 aa  76.3  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.162135  hitchhiker  0.000581091 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2950  extracellular solute-binding protein  29.87 
 
 		 435 aa  76.3  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.110397  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7922  extracellular solute-binding protein family 1  25.06 
 
 		 445 aa  75.5  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1588  extracellular solute-binding protein  27.48 
 
 		 452 aa  74.7  0.000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2345  extracellular solute-binding protein family 1  24.42 
 
 		 424 aa  73.2  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.822896  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2380  extracellular solute-binding protein family 1  26.61 
 
 		 415 aa  72.8  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2914  extracellular solute-binding protein family 1  26.98 
 
 		 440 aa  72.8  0.00000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0940  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 441 aa  72.8  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.558741 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3052  extracellular solute-binding protein family 1  29.37 
 
 		 427 aa  72.4  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.854825  normal  0.208902 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0972  extracellular solute-binding protein family 1  26.2 
 
 		 442 aa  71.2  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0353052 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2072  extracellular solute-binding protein family 1  25.57 
 
 		 431 aa  69.7  0.00000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.0000000238529  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4568  extracellular solute-binding protein family 1  30.97 
 
 		 410 aa  69.3  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.267408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1529  extracellular solute-binding protein  23.96 
 
 		 439 aa  69.3  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1874  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  27.96 
 
 		 427 aa  68.9  0.0000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0756635  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2342  extracellular solute-binding protein  25.32 
 
 		 477 aa  68.6  0.0000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.936887  normal  0.0125511 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6357  extracellular solute-binding protein family 1  29.65 
 
 		 410 aa  67.4  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11540  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.44 
 
 		 428 aa  67  0.0000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0159385 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0168  extracellular solute-binding protein family 1  26.85 
 
 		 412 aa  66.6  0.0000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2652  extracellular solute-binding protein family 1  23.15 
 
 		 424 aa  66.2  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.142803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3469  extracellular solute-binding protein family 1  24.03 
 
 		 446 aa  66.2  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0238  extracellular solute-binding protein family 1  22.81 
 
 		 423 aa  65.5  0.000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  26.76 
 
 		 422 aa  65.1  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29010  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  31.25 
 
 		 434 aa  64.7  0.000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0616  extracellular solute-binding protein family 1  24.95 
 
 		 432 aa  64.3  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2327  extracellular solute-binding protein family 1  22.51 
 
 		 424 aa  64.3  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.169538  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>