More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_0968 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013522  Taci_0968  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
383 aa  795    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0185207  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1751  FAD dependent oxidoreductase  47.77 
 
 
382 aa  372  1e-102  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.18751 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0274  FAD dependent oxidoreductase  48.36 
 
 
381 aa  365  1e-100  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1730  FAD dependent oxidoreductase  46.6 
 
 
382 aa  330  3e-89  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0595  FAD dependent oxidoreductase  41.49 
 
 
390 aa  305  9.000000000000001e-82  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.140462  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0086  FAD dependent oxidoreductase  38.62 
 
 
385 aa  270  2.9999999999999997e-71  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.024354  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0271  FAD dependent oxidoreductase  39.94 
 
 
373 aa  263  4.999999999999999e-69  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2479  FAD dependent oxidoreductase  37.3 
 
 
496 aa  258  8e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.113272  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1379  FAD dependent oxidoreductase  37.43 
 
 
500 aa  258  2e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.258536  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1475  FAD dependent oxidoreductase  37.43 
 
 
500 aa  257  2e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540838  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04340  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  35.49 
 
 
386 aa  242  1e-62  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.704442 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1388  FAD dependent oxidoreductase  35.28 
 
 
492 aa  241  2e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.569106  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3808  FAD dependent oxidoreductase  37.7 
 
 
385 aa  239  4e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.876353 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1073  FAD dependent oxidoreductase  37.92 
 
 
385 aa  239  5.999999999999999e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3120  FAD dependent oxidoreductase  34.46 
 
 
385 aa  228  1e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2308  FAD dependent oxidoreductase  34.32 
 
 
395 aa  228  1e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1938  FAD dependent oxidoreductase  34.08 
 
 
388 aa  218  1e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3532  FAD dependent oxidoreductase  35.22 
 
 
392 aa  212  9e-54  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3964  FAD dependent oxidoreductase  34.29 
 
 
378 aa  202  9.999999999999999e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2281  FAD dependent oxidoreductase  33.85 
 
 
385 aa  201  1.9999999999999998e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.405661  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0452  FAD dependent oxidoreductase  34.12 
 
 
413 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000226129  normal  0.63588 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3293  FAD dependent oxidoreductase  35.06 
 
 
385 aa  189  9e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4803  FAD dependent oxidoreductase  30.45 
 
 
399 aa  184  3e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.355272  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2290  FAD dependent oxidoreductase  31.4 
 
 
823 aa  183  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.407986 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0935  FAD dependent oxidoreductase  34.06 
 
 
376 aa  182  6e-45  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.311284  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5914  FAD dependent oxidoreductase  29.92 
 
 
413 aa  182  1e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4695  FAD dependent oxidoreductase  30.91 
 
 
394 aa  180  2.9999999999999997e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.518456 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1694  FAD dependent oxidoreductase  29.58 
 
 
412 aa  177  3e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4871  FAD dependent oxidoreductase  32.9 
 
 
825 aa  176  5e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.862382  normal  0.731807 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1351  FAD dependent oxidoreductase  30.61 
 
 
413 aa  175  9.999999999999999e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000108585  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4021  FAD dependent oxidoreductase  32.28 
 
 
816 aa  173  5.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1254  FAD dependent oxidoreductase  31.59 
 
 
799 aa  172  5.999999999999999e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0777915  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2104  FAD dependent oxidoreductase  28.2 
 
 
413 aa  172  1e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.508 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0512  sarcosine oxidase beta subunit family protein  28.68 
 
 
423 aa  171  2e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5264  FAD dependent oxidoreductase  30.93 
 
 
398 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.363597 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4350  FAD dependent oxidoreductase  31.33 
 
 
816 aa  170  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000248836 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3036  FAD dependent oxidoreductase  27.95 
 
 
394 aa  169  5e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.385806 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4985  FAD dependent oxidoreductase  30.93 
 
 
398 aa  170  5e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4896  FAD dependent oxidoreductase  30.93 
 
 
398 aa  170  5e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3472  FAD dependent oxidoreductase  28.06 
 
 
413 aa  168  1e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7805  FAD dependent oxidoreductase  27.03 
 
 
395 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.436057  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2183  sarcosine oxidase beta subunit family protein  27.68 
 
 
414 aa  167  2.9999999999999998e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.409819  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1985  FAD dependent oxidoreductase  29.57 
 
 
387 aa  166  4e-40  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.886969  normal  0.969169 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2494  FAD dependent oxidoreductase  28.53 
 
 
413 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.207468  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3393  sarcosine oxidase, beta subunit family  29.05 
 
 
417 aa  166  9e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0208125  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0161  FAD dependent oxidoreductase  28.16 
 
 
394 aa  165  1.0000000000000001e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4131  sarcosine oxidase beta subunit family protein  29.92 
 
 
416 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0445173  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4916  FAD dependent oxidoreductase  30.27 
 
 
815 aa  163  4.0000000000000004e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2117  sarcosine oxidase subunit beta  29.58 
 
 
417 aa  163  5.0000000000000005e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8584  sarcosine oxidase, beta subunit family  29.31 
 
 
417 aa  161  1e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.738598  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1296  FAD dependent oxidoreductase  29.23 
 
 
401 aa  161  2e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.43026  normal  0.445947 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4909  sarcosine oxidase beta subunit family protein  29.32 
 
 
416 aa  161  2e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.315195 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0926  FAD dependent oxidoreductase  30.57 
 
 
393 aa  161  2e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2452  sarcosine oxidase, beta subunit  27.22 
 
 
413 aa  160  3e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00527323  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0992  sarcosine oxidase beta subunit family protein  29.56 
 
 
417 aa  160  3e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.23749  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0591  sarcosine oxidase beta subunit family protein  29.89 
 
 
417 aa  160  3e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3661  sarcosine oxidase, beta subunit family  29.89 
 
 
417 aa  159  5e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.616865  normal  0.13922 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2686  putative sarcosine oxidase beta subunit  27.49 
 
 
415 aa  159  6e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0604356  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1344  sarcosine oxidase beta subunit family protein  27.49 
 
 
415 aa  159  6e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0947006  normal  0.025984 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3595  sarcosine oxidase, beta subunit family  28.98 
 
 
406 aa  159  8e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0301  sarcosine oxidase beta subunit family protein  29.63 
 
 
417 aa  159  9e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0229  sarcosine oxidase, beta subunit  28.53 
 
 
417 aa  159  1e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1877  sarcosine oxidase beta subunit family protein  26.96 
 
 
415 aa  159  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.294016  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3736  sarcosine oxidase beta subunit family protein  29.43 
 
 
417 aa  158  2e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.42969  normal  0.377029 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3704  sarcosine oxidase beta subunit family protein  28.98 
 
 
406 aa  158  2e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2644  FAD dependent oxidoreductase  29.18 
 
 
396 aa  157  2e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.875281  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2224  FAD dependent oxidoreductase  26.67 
 
 
413 aa  157  3e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.175364  normal  0.288847 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7233  sarcosine oxidase, beta subunit family  29.59 
 
 
416 aa  157  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0553602 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3866  FAD dependent oxidoreductase  30.55 
 
 
843 aa  157  3e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3358  sarcosine oxidase, beta subunit family  29.63 
 
 
417 aa  157  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2488  FAD dependent oxidoreductase  30.39 
 
 
806 aa  156  5.0000000000000005e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.255163  normal  0.0203493 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2752  sarcosine oxidase beta subunit family protein  29.48 
 
 
417 aa  156  6e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5048  sarcosine oxidase, beta subunit family  28.57 
 
 
414 aa  155  9e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.275422  normal  0.249273 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3289  sarcosine oxidase beta subunit family protein  29.02 
 
 
416 aa  155  1e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.96044 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2636  sarcosine oxidase, beta subunit family  28.42 
 
 
416 aa  153  4e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5513  FAD dependent oxidoreductase  30.41 
 
 
398 aa  153  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.225549 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2487  sarcosine oxidase beta subunit family protein  29.16 
 
 
417 aa  152  7e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2478  sarcosine oxidase, beta subunit  28.35 
 
 
416 aa  152  8e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4032  sarcosine oxidase, beta subunit  28.35 
 
 
416 aa  152  8e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3991  sarcosine oxidase, beta subunit family  28.61 
 
 
417 aa  152  8.999999999999999e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4031  sarcosine oxidase, beta subunit family  28.61 
 
 
417 aa  152  8.999999999999999e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.198896 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0222  FAD dependent oxidoreductase  29.32 
 
 
365 aa  152  1e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000376254  normal  0.0113396 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1426  FAD dependent oxidoreductase  29.69 
 
 
805 aa  152  1e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0785769 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5746  sarcosine oxidase beta subunit  28.07 
 
 
416 aa  151  2e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.267033  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1141  sarcosine oxidase beta subunit family protein  28.24 
 
 
416 aa  151  2e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.191022 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1600  sarcosine oxidase, beta subunit, heterotetrameric  28.85 
 
 
414 aa  151  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.323345  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0969  sarcosine oxidase beta subunit family protein  26.25 
 
 
431 aa  151  2e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0046  sarcosine oxidase subunit beta  28.02 
 
 
414 aa  150  3e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.570395 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6006  FAD dependent oxidoreductase  29.49 
 
 
386 aa  150  3e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4985  FAD dependent oxidoreductase  28.87 
 
 
831 aa  150  3e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0450258 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4833  FAD dependent oxidoreductase  32.98 
 
 
385 aa  150  3e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.866256 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1666  dehydrogenase  29.52 
 
 
831 aa  150  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0839495 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0998  sarcosine oxidase beta subunit family protein  28.91 
 
 
416 aa  150  4e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1577  sarcosine oxidase, beta subunit family  29.23 
 
 
416 aa  150  5e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2591  FAD dependent oxidoreductase  29.57 
 
 
826 aa  149  6e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5635  sarcosine oxidase, beta subunit family  27.76 
 
 
416 aa  149  8e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6204  sarcosine oxidase subunit beta  27.6 
 
 
416 aa  149  9e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.194283  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1654  sarcosine oxidase beta subunit family protein  28.97 
 
 
416 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.502295  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3333  sarcosine oxidase beta subunit family protein  28.3 
 
 
414 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.156184  normal  0.658032 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71470  sarcosine oxidase beta subunit  27.6 
 
 
416 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.115673  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>