79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1148 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_1148  RDD domain containing protein  100 
 
 		 185 aa  380  1e-105  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00101829  hitchhiker  0.000000000000525817 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0075  RDD domain-containing protein  56.68 
 
 		 185 aa  194  6e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0306278  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1788  RDD domain containing protein  35.68 
 
 		 187 aa  118  4.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0098202  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1706  RDD  41.01 
 
 		 170 aa  117  7.999999999999999e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.305495  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0170  RDD domain-containing protein  39.16 
 
 		 145 aa  109  2.0000000000000002e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.00000000534855  decreased coverage  0.00967799 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1364  RDD domain-containing protein  33.16 
 
 		 186 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000121263  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3590  RDD domain containing protein  42.66 
 
 		 310 aa  108  5e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0277  RDD domain containing protein  35.79 
 
 		 217 aa  104  6e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.666159  normal  0.0986894 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3583  MJ0042 family finger-like protein  38.41 
 
 		 295 aa  95.1  5e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.040814  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1223  RDD domain containing protein  34.66 
 
 		 202 aa  89.7  2e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2289  RDD domain-containing protein  33.17 
 
 		 202 aa  85.1  5e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0171  RDD domain-containing protein  38.69 
 
 		 140 aa  85.1  5e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000000652856  decreased coverage  0.0096302 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2609  serine/threonine protein kinase  32.89 
 
 		 415 aa  85.1  5e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.101255 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2416  hypothetical protein  32.24 
 
 		 270 aa  80.9  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3591  hypothetical protein  31.65 
 
 		 133 aa  80.5  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.157612  normal  0.0949488 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04050  RDD family protein  34.48 
 
 		 424 aa  80.1  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2608  RDD domain-containing protein  34.15 
 
 		 456 aa  75.1  0.0000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.107491 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1213  RDD  40.91 
 
 		 176 aa  71.6  0.000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0799296  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4623  RDD domain-containing protein  36.65 
 
 		 169 aa  71.6  0.000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.846019 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3457  RDD domain containing protein  28.17 
 
 		 205 aa  65.1  0.0000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.052067 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1340  serine/threonine protein kinase  34 
 
 		 536 aa  65.1  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.975368 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1422  RDD domain-containing protein  28.28 
 
 		 257 aa  63.2  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000176176  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2713  RDD domain containing protein  30.82 
 
 		 159 aa  61.6  0.000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0726  RDD domain containing protein  31.37 
 
 		 156 aa  59.3  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0891  RDD domain-containing protein  34.44 
 
 		 152 aa  58.9  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.98299 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3024  branched-chain amino acid aminotransferase I  33.12 
 
 		 167 aa  58.5  0.00000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000160975 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0643  RDD family protein  25.99 
 
 		 195 aa  57.8  0.0000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4968  YxaI  42.67 
 
 		 77 aa  56.6  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0396  RDD  40.54 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000005  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.476249  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1364  hypothetical protein  26.97 
 
 		 166 aa  53.5  0.000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.356558  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1701  RDD domain containing protein  26.67 
 
 		 162 aa  53.1  0.000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000482282  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0355  hypothetical protein  28.3 
 
 		 198 aa  52.4  0.000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8545  membrane protein/domain-like protein  27.54 
 
 		 175 aa  52  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1061  RDD domain containing protein  33.33 
 
 		 211 aa  52  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1910  hypothetical protein  26.86 
 
 		 179 aa  52  0.000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.278125  normal  0.807288 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0098  RDD domain containing protein  27.03 
 
 		 204 aa  52  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0628  hypothetical protein  29.93 
 
 		 154 aa  52  0.000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0572979  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1247  RDD domain containing protein  27.89 
 
 		 137 aa  51.2  0.000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1602  hypothetical protein  32.43 
 
 		 152 aa  49.7  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0678  RDD domain-containing protein  28.26 
 
 		 157 aa  48.5  0.00005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.416032  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2045  RDD domain-containing protein  34.74 
 
 		 167 aa  48.1  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.000733999  normal  0.318359 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2650  RDD  29.93 
 
 		 188 aa  47.4  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.54052 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0431  RDD domain-containing protein  31.47 
 
 		 151 aa  47.4  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2622  RDD  27.94 
 
 		 180 aa  47.8  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.72868  normal  0.883722 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2108  RDD protein  27.33 
 
 		 139 aa  46.6  0.0002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000599  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1157  RDD domain-containing protein  31.34 
 
 		 175 aa  46.6  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3418  RDD domain-containing protein  30.5 
 
 		 393 aa  46.6  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4396  RDD  26.12 
 
 		 162 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.327978 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0371  RDD domain containing protein  26.9 
 
 		 135 aa  46.2  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0712  RDD domain-containing protein  27.61 
 
 		 634 aa  46.2  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.226192 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1261  RDD domain containing protein  29.87 
 
 		 152 aa  46.2  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.295928 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1489  RDD domain containing protein  26.28 
 
 		 155 aa  45.8  0.0003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.126204  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1175  RDD domain-containing protein  30.23 
 
 		 166 aa  45.4  0.0004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1112  RDD domain containing protein  29.22 
 
 		 152 aa  45.8  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2659  hypothetical protein  25.55 
 
 		 185 aa  45.4  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.663395  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2987  RDD domain containing protein  25.55 
 
 		 175 aa  45.1  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0093  RDD domain containing protein  28.76 
 
 		 211 aa  45.1  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.173435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0399  RDD domain-containing protein  32.5 
 
 		 278 aa  44.7  0.0008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0177068 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0331  RDD family protein  21.3 
 
 		 163 aa  44.7  0.0008  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3468  FHA domain containing protein  62.5 
 
 		 544 aa  44.3  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.371082  normal  0.175493 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3276  serine/threonine kinase protein  60 
 
 		 475 aa  43.9  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.162967  normal  0.186689 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1509  hypothetical protein  28.33 
 
 		 375 aa  43.5  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0115  hypothetical protein  29.68 
 
 		 157 aa  43.1  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.539233  hitchhiker  0.000011217 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1021  RDD domain-containing protein  26.12 
 
 		 162 aa  43.5  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.579963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0989  RDD domain-containing protein  32.31 
 
 		 162 aa  42.7  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00320129  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0984  RDD domain containing protein  32.31 
 
 		 162 aa  42.7  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1449  RDD domain-containing protein  31.82 
 
 		 158 aa  42.7  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.413718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1145  hypothetical protein  29.89 
 
 		 166 aa  42.4  0.003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0512  hypothetical protein  50 
 
 		 289 aa  42.4  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.269332  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0141  RDD domain-containing protein  37.31 
 
 		 327 aa  42.4  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5436  RDD domain containing protein  40 
 
 		 214 aa  42  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.939168  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4234  RDD domain-containing protein  25.37 
 
 		 162 aa  42.4  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0769  RDD protein  24.85 
 
 		 163 aa  42  0.005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0105114  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14520  hypothetical protein  33.85 
 
 		 165 aa  42  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0806  RDD domain-containing protein  27.95 
 
 		 224 aa  41.6  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.138466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1844  protein kinase  56.67 
 
 		 485 aa  41.2  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4817  RDD domain containing protein  29.5 
 
 		 198 aa  41.2  0.008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3834  RDD domain containing protein  30 
 
 		 272 aa  41.2  0.008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0228507 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1683  RDD domain-containing protein  32.53 
 
 		 424 aa  41.2  0.01  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0350832  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>