191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_2144 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_2144  nuclease (SNase-like)  100 
 
 		 162 aa  328  1e-89  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.149778  normal  0.293408 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0290  SNase-like nuclease  44.3 
 
 		 227 aa  133  9e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03631  hypothetical protein  40.67 
 
 		 155 aa  118  3.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2245  nuclease (SNase domain protein)  40.13 
 
 		 183 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.184004  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2395  nuclease (SNase domain protein)  42.61 
 
 		 179 aa  108  3e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.82521e-33 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2046  nuclease (SNase-like)  37.59 
 
 		 233 aa  107  5e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.879712  normal  0.484882 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0447  nuclease (SNase-like)  37.27 
 
 		 157 aa  105  2e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0276095  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0371  nuclease (SNase domain protein)  43.12 
 
 		 171 aa  103  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.079056  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3744  nuclease  38.29 
 
 		 183 aa  100  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000150292  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2407  nuclease (SNase domain protein)  45.45 
 
 		 158 aa  99  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000492982 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1593  nuclease-like protein  44.53 
 
 		 196 aa  97.1  8e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1199  nuclease, putative  41.45 
 
 		 187 aa  97.1  9e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.000552466  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0068  nuclease  40.38 
 
 		 169 aa  97.1  9e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3662  nuclease (SNase domain protein)  42.68 
 
 		 175 aa  97.1  9e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.808999  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3663  nuclease  36.63 
 
 		 187 aa  95.5  3e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000641477  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2932  nuclease  39.35 
 
 		 244 aa  95.1  4e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000967854  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3653  nuclease (SNase domain protein)  38.3 
 
 		 171 aa  94.7  5e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3707  nuclease (SNase domain protein)  38.3 
 
 		 171 aa  94.7  5e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.112464  normal  0.156975 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2575  nuclease  35.58 
 
 		 232 aa  94.4  6e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.0000000542657  unclonable  0.0000125169 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1380  nuclease (SNase domain protein)  40.28 
 
 		 238 aa  94.4  7e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0309494  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3053  SNase-like nuclease  36.11 
 
 		 180 aa  93.2  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.1276200000000001e-18  normal  0.298628 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1147  nuclease (SNase-like)  40.58 
 
 		 206 aa  92.8  2e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0321179  normal  0.686873 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0021  nuclease domain-containing protein  37.06 
 
 		 175 aa  92.8  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0439144  hitchhiker  0.0000334812 
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0011  protein ParB  40 
 
 		 166 aa  91.3  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0966  nuclease  36.2 
 
 		 185 aa  87.8  5e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0797979  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2526  SNase-like nuclease  34.36 
 
 		 171 aa  87  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0971838  normal  0.0202736 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2942  prophage MuMc02, nuclease, putative  37.58 
 
 		 216 aa  84.7  5e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.375298  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2003  nuclease (SNase-like)  38.67 
 
 		 227 aa  81.6  0.000000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0376173  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1637  nuclease (SNase domain protein)  34.38 
 
 		 192 aa  81.3  0.000000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000037358  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0051  ATP-dependent hsl protease ATP-binding subunit HslU  35.77 
 
 		 148 aa  81.6  0.000000000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.176892  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1464  micrococcal nuclease  44.62 
 
 		 150 aa  80.9  0.000000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.895174  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0563  thermonuclease family protein (Snase-like)  31.88 
 
 		 174 aa  80.9  0.000000000000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2776  nuclease (SNase-like)  34.66 
 
 		 186 aa  79  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1572  hypothetical protein  36.42 
 
 		 156 aa  78.2  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0428303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0845  nuclease (SNase domain protein)  32.68 
 
 		 153 aa  78.2  0.00000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311247  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2377  SNase-like nuclease  36.36 
 
 		 185 aa  78.2  0.00000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0106322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0084  nuclease homolog  36.13 
 
 		 153 aa  77.8  0.00000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.381949  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4496  nuclease  33.77 
 
 		 187 aa  77.4  0.00000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.783898  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0006  nuclease homolog  35.29 
 
 		 153 aa  76.3  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00328656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1190  nuclease  29.88 
 
 		 166 aa  76.3  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0870678  normal  0.0174729 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1682  nuclease (SNase-like)  41.18 
 
 		 153 aa  75.5  0.0000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0199869  normal  0.0644244 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25810  nuclease  41.09 
 
 		 169 aa  75.5  0.0000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.823432  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3683  nuclease  35.62 
 
 		 153 aa  75.5  0.0000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0805  nuclease (SNase-like)  29.8 
 
 		 165 aa  74.3  0.0000000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0998  thermonuclease family protein  28.39 
 
 		 175 aa  73.9  0.0000000000008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.580638  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1627  nuclease (SNase domain protein)  33.33 
 
 		 221 aa  73.9  0.0000000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.839518  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1061  thermonuclease family protein  28.39 
 
 		 175 aa  73.6  0.000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.374796  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2364  nuclease (SNase domain protein)  40.6 
 
 		 171 aa  73.6  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000986149  hitchhiker  0.0000256205 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0811  thermonuclease family protein  27.74 
 
 		 175 aa  73.2  0.000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.392245  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0779  nuclease (SNase domain protein)  36.88 
 
 		 169 aa  72.8  0.000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0693  thermonuclease family protein  35.9 
 
 		 199 aa  73.2  0.000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.739462  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1039  nuclease (SNase domain protein)  35.66 
 
 		 161 aa  72.4  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0952  nuclease (SNase-like)  38.81 
 
 		 157 aa  72  0.000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2235  nuclease (SNase domain protein)  30.99 
 
 		 193 aa  72  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.197015 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0143  putative nuclease  38.93 
 
 		 193 aa  71.6  0.000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  unclonable  0.000000000478675  hitchhiker  0.000499621 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47870  SNase-like protein  34.62 
 
 		 225 aa  71.6  0.000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1359  nuclease (SNase domain protein)  36.81 
 
 		 191 aa  71.6  0.000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.104697  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1456  nuclease (SNase domain protein)  32.35 
 
 		 184 aa  71.2  0.000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0135  nuclease (SNase-like)  32.77 
 
 		 142 aa  70.5  0.000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000156916  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08950  nuclease  42.65 
 
 		 208 aa  69.3  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.870151  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2340  nuclease (SNase domain protein)  34.19 
 
 		 162 aa  69.7  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0193  nuclease  36.92 
 
 		 182 aa  68.9  0.00000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2501  nuclease  36.2 
 
 		 205 aa  68.6  0.00000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.080015  normal  0.0413796 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0156  nuclease (SNase-like)  35.26 
 
 		 228 aa  67.4  0.00000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0216151  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2800  nuclease  37.11 
 
 		 194 aa  66.6  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0144279 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2515  nuclease (SNase domain protein)  35.07 
 
 		 221 aa  67  0.0000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.893874 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0576  Excalibur domain protein  37.23 
 
 		 212 aa  66.2  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.00000012089  unclonable  0.00000255125 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1985  nuclease (SNase domain protein)  31.47 
 
 		 193 aa  66.2  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.242918  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19010  nuclease  31.25 
 
 		 167 aa  65.1  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.461402  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0658  nuclease (SNase domain protein)  32.3 
 
 		 171 aa  65.9  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.688137  normal  0.0991066 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1554  nuclease (SNase-like)  35.5 
 
 		 202 aa  65.5  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00761  hypothetical protein  37.3 
 
 		 155 aa  65.5  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.489486 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2219  nuclease (SNase domain protein)  32.95 
 
 		 205 aa  64.7  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9903  succinoglycan biosynthesis protein  32.14 
 
 		 168 aa  64.3  0.0000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0111  nuclease  35.58 
 
 		 227 aa  63.9  0.0000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0052  protein ParB  34.32 
 
 		 164 aa  63.5  0.000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0810303  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0317  nuclease (SNase domain protein)  35.58 
 
 		 227 aa  63.9  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.183306  normal  0.136686 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0982  nuclease (SNase-like)  27.59 
 
 		 249 aa  61.2  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000000000101814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1306  nuclease (SNase-like)  34.15 
 
 		 175 aa  61.2  0.000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3634  nuclease (SNase domain protein)  38.39 
 
 		 382 aa  61.2  0.000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.322659 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41180  nuclease  32.85 
 
 		 138 aa  61.2  0.000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.804446  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1584  nuclease (SNase domain protein)  35.07 
 
 		 134 aa  60.8  0.000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.231891  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2100  nuclease (SNase-like)  41.38 
 
 		 192 aa  60.5  0.000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1467  Excalibur domain-containing protein  36.7 
 
 		 259 aa  60.5  0.000000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06071  micrococcal nuclease  35 
 
 		 185 aa  60.1  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.312315  normal  0.542138 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15970  micrococcal nuclease-like nuclease  31.45 
 
 		 388 aa  59.3  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.339667  normal  0.0582928 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0782  nuclease (SNase-like)  36.36 
 
 		 242 aa  58.9  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.180998  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0133  nuclease  33.59 
 
 		 231 aa  58.2  0.00000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.247387 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0755  nuclease (SNase-like)  30.38 
 
 		 166 aa  58.2  0.00000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0912  Micrococcal nuclease (thermonuclease)  37.68 
 
 		 190 aa  57.8  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.967698 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0891  thermonuclease precursor family protein  33.68 
 
 		 178 aa  57.4  0.00000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000025104  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6820  nuclease (SNase domain protein)  31.01 
 
 		 226 aa  56.6  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0330594  normal  0.398913 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2185  nuclease (SNase-like)  36.43 
 
 		 226 aa  55.8  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0103  thermonuclease  29.5 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.244407  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0065  nuclease  35 
 
 		 227 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0538  nuclease  31.9 
 
 		 266 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0816  micrococcal nuclease  26.95 
 
 		 228 aa  55.8  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000405887  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0832  micrococcal nuclease  26.95 
 
 		 228 aa  55.8  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000140573  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0569  nuclease  26.4 
 
 		 192 aa  56.2  0.0000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1412  thermonuclease  27.56 
 
 		 190 aa  55.5  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000099778  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>