More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_0595 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_0595  ATPase  100 
 
 
228 aa  463  9.999999999999999e-131  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0833962  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1767  ATPase  83.71 
 
 
248 aa  380  1e-104  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.132988  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1766  ATPase  73.99 
 
 
228 aa  347  9e-95  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.104306  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04881  ABC transporter ATP-binding protein  73.09 
 
 
235 aa  344  6e-94  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.134366  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04311  ABC transporter ATP-binding protein  71.75 
 
 
232 aa  344  8e-94  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06281  ABC transporter ATP-binding protein  75 
 
 
246 aa  340  9e-93  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0807317 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0433  ATPase  69.23 
 
 
228 aa  335  2.9999999999999997e-91  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.526748  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04581  ABC transporter ATP-binding protein  68.78 
 
 
228 aa  334  7.999999999999999e-91  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04891  ABC transporter ATP-binding protein  68.78 
 
 
228 aa  333  1e-90  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.324822  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04961  ABC transporter ATP-binding protein  69.68 
 
 
228 aa  332  3e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3266  ABC transporter related  66.67 
 
 
259 aa  310  1e-83  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2852  ABC transporter-like  63.96 
 
 
252 aa  295  4e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2827  ABC transporter-like protein protein  63.06 
 
 
254 aa  294  7e-79  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1414  ATPase  68.35 
 
 
241 aa  294  8e-79  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3116  ABC transporter related  63.55 
 
 
248 aa  292  2e-78  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3004  ABC transporter related  63.55 
 
 
248 aa  292  2e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4191  ABC transporter related  63.89 
 
 
252 aa  290  1e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.31684 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2860  ABC transporter-like  58.22 
 
 
224 aa  273  2.0000000000000002e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.496256  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1173  ABC transporter, ATP-binding protein  56.25 
 
 
233 aa  266  2e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1638  ABC transporter related  55.56 
 
 
244 aa  265  4e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0175  ABC transporter related  56.07 
 
 
226 aa  264  7e-70  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0570775  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2587  ABC transporter related  55.2 
 
 
230 aa  264  8e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000435089  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  55.09 
 
 
246 aa  263  2e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12888  ABC transporter, ATP-binding protein  54.63 
 
 
228 aa  261  6.999999999999999e-69  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.567138  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1667  ABC transporter related  53.51 
 
 
228 aa  261  8e-69  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1468  putative macrolide efflux ABC transporter, ATP-binding protein  59.62 
 
 
230 aa  261  8e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.877737 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3020  ABC transporter related  58.53 
 
 
233 aa  260  1e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0897255  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3629  ABC transporter related  55.45 
 
 
229 aa  259  2e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000379324  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0988  ATPase  55.05 
 
 
233 aa  259  2e-68  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.663944  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2354  ABC transporter related  53.95 
 
 
247 aa  259  2e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.266266  normal  0.0591431 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003050  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  53.15 
 
 
232 aa  259  2e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1533  ABC transporter related  54.3 
 
 
228 aa  259  2e-68  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02834  hypothetical protein  52.47 
 
 
239 aa  258  4e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1635  ABC transporter related  55.25 
 
 
229 aa  258  5.0000000000000005e-68  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2148  ABC transporter-like protein  56.19 
 
 
238 aa  258  5.0000000000000005e-68  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.021132  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0068  ABC transporter related protein  55.91 
 
 
248 aa  258  6e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1335  ATPase  56.22 
 
 
247 aa  258  7e-68  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3865  hypothetical protein  57.34 
 
 
233 aa  257  1e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.255505  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3059  ABC transporter-related protein  56.82 
 
 
253 aa  256  2e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.309908  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3324  ABC transporter, ATPase subunit  56.4 
 
 
255 aa  255  3e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3167  ABC transporter related  56.82 
 
 
253 aa  255  4e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.310354  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5001  ABC transporter related  53.64 
 
 
230 aa  255  4e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1572  ABC transporter related  55.61 
 
 
239 aa  254  7e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.633552  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1837  ABC transporter related  56.67 
 
 
228 aa  254  7e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000603885  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  52.02 
 
 
230 aa  254  8e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6888  ABC transporter related  54.63 
 
 
238 aa  253  2.0000000000000002e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.228229 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2740  putative macrolide efflux ABC transporter, ATP-binding protein  54.67 
 
 
228 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2202  ABC transporter related protein  54.91 
 
 
241 aa  252  3e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.87291  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1899  ABC transporter related  54.67 
 
 
228 aa  252  4.0000000000000004e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.676555  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3236  hypothetical protein  54.09 
 
 
650 aa  252  4.0000000000000004e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02550  ABC transporter related  53.42 
 
 
266 aa  251  5.000000000000001e-66  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00397831  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6963  ABC transporter related  57.14 
 
 
291 aa  251  7e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0488455  normal  0.63897 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0802  ABC transporter related protein  54.55 
 
 
233 aa  251  7e-66  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.61127  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3644  ABC transporter related  56.19 
 
 
253 aa  251  8.000000000000001e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.248417  normal  0.501538 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4308  ABC transporter related  55.51 
 
 
241 aa  251  9.000000000000001e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4155  ABC transporter, ATPase subunit  55.51 
 
 
241 aa  251  9.000000000000001e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5121  ABC transporter related protein  52.78 
 
 
240 aa  250  1e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2297  ABC transporter related  53.46 
 
 
225 aa  250  1e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3283  ABC transporter related  54.02 
 
 
666 aa  250  1e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.477638  normal  0.90811 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2025  ABC transporter related  55.61 
 
 
241 aa  250  1e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000164483 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4286  ABC transporter-related protein  55.07 
 
 
241 aa  249  2e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0781  ABC transporter related protein  56.42 
 
 
238 aa  249  2e-65  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000706757  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  52.53 
 
 
225 aa  249  2e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3524  ABC transporter related  55.35 
 
 
671 aa  250  2e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1720  ABC transporter related  54.21 
 
 
242 aa  249  2e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2919  ABC transporter related  51.58 
 
 
256 aa  249  3e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.388484 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3760  ABC transporter related  52.78 
 
 
236 aa  249  3e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.676355  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2927  ABC transporter related  54.21 
 
 
237 aa  248  4e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132114  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0009  ABC transporter related  55.66 
 
 
241 aa  249  4e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.788883  hitchhiker  0.00117724 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0466  ABC transporter related  50.93 
 
 
242 aa  248  4e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.492802  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0222  ABC transporter related  57.99 
 
 
247 aa  248  4e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.256244  hitchhiker  0.00918813 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1484  ABC transporter related  52.49 
 
 
236 aa  248  5e-65  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.789382 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2971  hypothetical protein  59.8 
 
 
236 aa  248  7e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.948797  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1451  ABC transporter related  60 
 
 
254 aa  248  7e-65  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.388057  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33760  putative ATP-binding/permease fusion ABC transporter  54.5 
 
 
663 aa  247  9e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.267667  hitchhiker  0.000629117 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1396  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  53.39 
 
 
646 aa  247  1e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0900334 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2577  ABC transporter related  50.91 
 
 
260 aa  247  1e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.993808  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0696  ABC transporter related protein  52.34 
 
 
229 aa  246  2e-64  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3270  ABC transporter-like protein  57.34 
 
 
248 aa  246  2e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.407136  normal  0.180128 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3722  transmembrane ATP-binding ABC transporter protein  52.73 
 
 
661 aa  246  2e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.197836  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8875  ABC transporter-related protein  57.47 
 
 
243 aa  246  2e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0534003  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1128  ABC transporter related  55.56 
 
 
241 aa  246  2e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1603  ABC transporter related  55.96 
 
 
225 aa  246  2e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2610  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  53.46 
 
 
649 aa  245  3e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1000  ABC transporter-related protein  51.36 
 
 
227 aa  246  3e-64  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00286652 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0211  ABC transporter related  57.4 
 
 
256 aa  245  3e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0366  ABC-type transport system, ATPase component PhnL  55.66 
 
 
245 aa  245  4.9999999999999997e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1813  ABC transporter related  56.56 
 
 
236 aa  245  4.9999999999999997e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0694  ABC transporter related  53.42 
 
 
230 aa  244  6e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00813244  hitchhiker  0.000136942 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2695  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  53.46 
 
 
649 aa  244  6e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1984  ABC transporter related protein  52.27 
 
 
228 aa  244  6.999999999999999e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2963  ABC transporter related  54.79 
 
 
251 aa  244  8e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00665747 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2870  putative ABC transporter ATP-binding protein/permease  54.05 
 
 
663 aa  244  9e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.876991  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0835  ABC transporter related  52.53 
 
 
235 aa  242  3.9999999999999997e-63  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1167  ABC transporter related  53.12 
 
 
235 aa  242  3.9999999999999997e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3374  ABC efflux transporter, ATPase subunit  59.3 
 
 
211 aa  242  3.9999999999999997e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3558  ABC transporter related  52.49 
 
 
653 aa  242  3.9999999999999997e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.906345  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2609  ABC transporter related  53.27 
 
 
226 aa  242  3.9999999999999997e-63  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4210  efflux ABC transporter ATP-binding protein  53.33 
 
 
654 aa  241  6e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.875938  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2038  ABC transporter related  54.63 
 
 
233 aa  241  6e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.376795  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>