More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3162 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3162  ABC transporter related  100 
 
 		 324 aa  641    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0228051 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3387  ABC transporter related  86.96 
 
 		 324 aa  551  1e-156  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.962121  normal  0.0912472 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4302  ABC transporter related protein  68.4 
 
 		 312 aa  411  1e-114  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3144  ABC transporter related  65.12 
 
 		 304 aa  375  1e-103  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000906796  normal  0.0406724 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0144  ABC transporter related protein  60.9 
 
 		 300 aa  329  5.0000000000000004e-89  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.113236 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7156  ABC transporter related protein  59.07 
 
 		 281 aa  303  2.0000000000000002e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.023596 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33070  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  52.6 
 
 		 286 aa  273  3e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.468184  normal  0.320706 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4397  ABC transporter related protein  52.58 
 
 		 301 aa  264  1e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.355124  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7343  ABC transporter related  51.21 
 
 		 284 aa  247  2e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00991324 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0349  ABC transporter related protein  49.82 
 
 		 301 aa  244  9.999999999999999e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.172507  normal  0.855348 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1687  ABC transporter, ATP-binding protein  48.03 
 
 		 280 aa  241  1e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0910  ABC transporter-like protein  50.18 
 
 		 284 aa  238  9e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0609  ABC transporter related protein  50.88 
 
 		 301 aa  237  2e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4004  ABC transporter related  48.26 
 
 		 282 aa  232  7.000000000000001e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0853449  hitchhiker  0.000219352 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1027  ABC transporter related protein  52.08 
 
 		 317 aa  232  8.000000000000001e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.87943  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2680  ABC transporter related protein  51.21 
 
 		 297 aa  231  1e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3622  ABC transporter related  47.57 
 
 		 290 aa  231  1e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3171  ABC transporter related  52.69 
 
 		 294 aa  228  1e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0428846 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0510  ABC transporter related  48.59 
 
 		 276 aa  223  3e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29910  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  48.82 
 
 		 313 aa  220  1.9999999999999999e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.880888  normal  0.697642 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0672  ABC transporter related  48.81 
 
 		 289 aa  213  2.9999999999999995e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0422494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4559  ABC transporter related protein  42.66 
 
 		 285 aa  204  1e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.995467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2380  ABC transporter related protein  47.27 
 
 		 338 aa  191  2e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.719921  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21980  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  46.85 
 
 		 304 aa  188  1e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.110747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1549  ABC transporter related  38.85 
 
 		 319 aa  186  5e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.819341  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3680  ABC transporter related  47.35 
 
 		 319 aa  186  6e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.764168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2220  ABC transporter related protein  46.64 
 
 		 308 aa  185  8e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000054865  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2251  ABC transporter related  43.41 
 
 		 308 aa  184  1.0000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000349445 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1138  ABC transporter related  45.06 
 
 		 311 aa  184  2.0000000000000003e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.129025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5162  ABC transporter related  38.83 
 
 		 312 aa  182  7e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.91236  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1989  ABC-type multidrug transport system ATPase componen  47.48 
 
 		 309 aa  180  2e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11486  antibiotic ABC transporter ATP-binding protein  45.38 
 
 		 313 aa  180  2e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.576168  normal  0.635651 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16100  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  44.87 
 
 		 308 aa  180  2.9999999999999997e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.252835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2730  ABC transporter-related protein  46.43 
 
 		 309 aa  180  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.110102 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1355  ABC transporter related protein  45.63 
 
 		 299 aa  178  1e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.79712  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0151  ABC transporter related  35.44 
 
 		 283 aa  178  1e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0187  ABC transporter related  40.2 
 
 		 299 aa  177  2e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.852326  normal  0.850223 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2469  ABC transporter related  45.5 
 
 		 310 aa  177  2e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.182364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2433  ABC transporter related  45.5 
 
 		 310 aa  177  3e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.555917  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2478  ABC transporter related  45.5 
 
 		 310 aa  177  3e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1974  ABC transporter-like protein  46.64 
 
 		 308 aa  176  4e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.495936 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5991  ABC transporter, ATP-binding protein  45.29 
 
 		 302 aa  176  7e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171427  normal  0.144114 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2270  ABC transporter related  46.03 
 
 		 314 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0194765  normal  0.0896073 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2512  ABC transporter related protein  42.69 
 
 		 310 aa  174  1.9999999999999998e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0284  ABC transporter, ATPase subunit  35.69 
 
 		 310 aa  174  2.9999999999999996e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2965  ABC transporter related protein  44.93 
 
 		 313 aa  173  3.9999999999999995e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0278  ABC transporter related  34.08 
 
 		 308 aa  172  5.999999999999999e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.833844  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3802  ABC transporter related  39.6 
 
 		 330 aa  172  7.999999999999999e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.550833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0172  ABC transporter related  46.98 
 
 		 322 aa  172  9e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2609  ABC transporter related protein  38.18 
 
 		 303 aa  171  1e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000416385  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1655  ABC transporter related  47.2 
 
 		 374 aa  171  1e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.334849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2960  ABC transporter related protein  41.48 
 
 		 314 aa  171  1e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00870565  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0554  ABC transporter related  35.93 
 
 		 305 aa  171  1e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.31573  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2080  ABC transporter related  44.91 
 
 		 388 aa  171  2e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.669128 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1668  ABC transporter related protein  45.82 
 
 		 329 aa  169  5e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0326508  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0482  ABC transporter related  42.74 
 
 		 322 aa  169  6e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0540  ABC transporter related  35.59 
 
 		 301 aa  169  7e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5037  ABC transporter, ATP-binding protein  39.91 
 
 		 300 aa  169  8e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0794  ABC transporter, ATP-binding protein  34.42 
 
 		 305 aa  168  1e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00734303  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5534  ABC transporter, ATP-binding protein  37.08 
 
 		 300 aa  168  1e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5447  ABC transporter, ATP-binding protein  39.91 
 
 		 300 aa  168  1e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5131  ABC transporter related protein  37.21 
 
 		 301 aa  168  1e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.135595  normal  0.223967 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2398  ABC transporter related protein  39.22 
 
 		 300 aa  168  1e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000133291  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1191  ABC transporter related protein  39.68 
 
 		 333 aa  168  1e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2101  ABC transporter related  45.5 
 
 		 322 aa  167  2e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2545  ABC transporter related  43.75 
 
 		 315 aa  167  2e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.107905  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0191  ABC transporter related  37.86 
 
 		 305 aa  167  2e-40  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.668087  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5153  ABC transporter related  36.33 
 
 		 300 aa  166  4e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2919  ABC transporter related  45.93 
 
 		 334 aa  166  4e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.748186  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5485  ABC transporter, ATP-binding protein  36.25 
 
 		 300 aa  166  5e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5053  ABC transporter, ATP-binding protein  39.46 
 
 		 300 aa  166  5e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5478  ABC transporter, ATP-binding protein  36.67 
 
 		 300 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4203  ABC transporter related  39.14 
 
 		 741 aa  166  5.9999999999999996e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.746448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1167  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  31.89 
 
 		 324 aa  166  6.9999999999999995e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4231  ABC transporter related  33.33 
 
 		 304 aa  165  8e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0095  ABC transporter related  33.44 
 
 		 310 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000602484  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3573  ABC transporter related  37.38 
 
 		 326 aa  164  2.0000000000000002e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0525989  normal  0.645045 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5600  ABC transporter ATP-binding protein  38.16 
 
 		 300 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1585  ABC transporter related  41.06 
 
 		 321 aa  164  2.0000000000000002e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.719287  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_700  ABC transporter, ATP-binding protein  33.44 
 
 		 305 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.365383  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14590  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  43.23 
 
 		 331 aa  163  3e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.294178  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3480  ABC transporter-like protein  41.81 
 
 		 319 aa  163  4.0000000000000004e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3874  ABC transporter-related protein  38.16 
 
 		 300 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.987197  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5474  ABC transporter, ATP-binding protein  36.25 
 
 		 300 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.960642  hitchhiker  0.00000000406318 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03830  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  37.39 
 
 		 347 aa  162  6e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.112396  normal  0.109015 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0720  ABC transporter related  33.88 
 
 		 305 aa  162  9e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00029064  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5630  ABC transporter related protein  45.11 
 
 		 302 aa  162  1e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.694537  normal  0.578056 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1638  ABC transporter related protein  40.27 
 
 		 299 aa  161  1e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.374187  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0274  ABC transporter related protein  39.41 
 
 		 303 aa  160  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4128  ABC transporter related protein  37.95 
 
 		 313 aa  160  2e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.927584  hitchhiker  0.00834769 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4255  ABC transporter related  36.25 
 
 		 312 aa  160  2e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1036  ABC transporter related protein  38.67 
 
 		 246 aa  160  3e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.749247  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3320  ABC transporter related protein  42.86 
 
 		 331 aa  159  4e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3299  ABC transporter related protein  45.29 
 
 		 342 aa  160  4e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1149  ABC transporter related  31.41 
 
 		 324 aa  159  4e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.283923  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1723  ABC transporter-like protein  37.17 
 
 		 295 aa  159  7e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.14632  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04710  ATP-binding ABC transporter family nodulation protein NodI  43.23 
 
 		 328 aa  159  7e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.427122  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1843  ABC transporter related  43.13 
 
 		 322 aa  158  9e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000163971 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3067  ABC transporter related  35.17 
 
 		 254 aa  158  1e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0713  ABC transporter related  33.33 
 
 		 295 aa  158  1e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>