More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3921 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_3921  multidrug efflux protein NorA  100 
 
 		 444 aa  840    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0451131  decreased coverage  0.00764846 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6069  multidrug efflux protein NorA  39.18 
 
 		 462 aa  202  7e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0755  MATE efflux family protein  34.5 
 
 		 456 aa  195  1e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0124459  normal  0.621342 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2515  MATE efflux family protein  31.12 
 
 		 442 aa  192  1e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0355  putative multidrug resistance protein NorM  32.95 
 
 		 471 aa  189  8e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.277827  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69890  multidrug efflux protein NorA  38.44 
 
 		 488 aa  189  8e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0339  multidrug resistance protein NorM, putative  32.95 
 
 		 471 aa  188  2e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0255  multidrug efflux protein NorA  36.88 
 
 		 461 aa  188  2e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1494  MATE efflux family protein  36.1 
 
 		 451 aa  187  4e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0440  MATE efflux family protein  33.41 
 
 		 470 aa  187  4e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.589921  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5517  multidrug efflux protein NorA  37.39 
 
 		 464 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0650  MATE efflux family protein  35.35 
 
 		 458 aa  182  8.000000000000001e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1298  MATE efflux family protein  34.01 
 
 		 467 aa  181  2.9999999999999997e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1019  MATE efflux family protein  36.51 
 
 		 474 aa  179  8e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0073  multidrug efflux protein NorA  34.25 
 
 		 460 aa  178  2e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1736  MATE efflux family protein  34.45 
 
 		 472 aa  176  6e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.282832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1709  MATE efflux family protein  34.4 
 
 		 470 aa  176  7e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.578822 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1935  MATE efflux family protein  32.73 
 
 		 460 aa  176  9e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.18016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0014  putative multidrug resistance protein norM  36.36 
 
 		 460 aa  175  9.999999999999999e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0115  multidrug resistance protein NorM, putative  34.25 
 
 		 460 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2579  multidrug efflux protein  31.75 
 
 		 457 aa  172  1e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.966509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1750  multidrug efflux protein  31.75 
 
 		 457 aa  172  1e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000919244  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1856  multidrug efflux protein  31.75 
 
 		 457 aa  172  1e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.372072  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6519  MATE efflux family protein  32.94 
 
 		 466 aa  172  1e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.510371  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3112  multidrug efflux protein  31.75 
 
 		 465 aa  172  2e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5262  multidrug efflux protein NorA  34.6 
 
 		 462 aa  171  3e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00407645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0033  MATE efflux family protein  35.75 
 
 		 463 aa  171  3e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0259659  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0764  MATE family efflux pump NorM  35.6 
 
 		 451 aa  170  4e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1699  MATE efflux family protein  32.44 
 
 		 462 aa  170  4e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.4571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0643  MATE efflux family protein  34.72 
 
 		 477 aa  170  4e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.26876 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3141  MATE efflux family protein  32.73 
 
 		 472 aa  170  5e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.565795  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2423  MATE efflux family protein  35.6 
 
 		 451 aa  169  7e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0441886  normal  0.25868 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2521  multi anti extrusion protein MatE  32.35 
 
 		 490 aa  169  1e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.200402 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1930  MATE efflux family protein  33.33 
 
 		 460 aa  166  5.9999999999999996e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.135248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0664  MATE efflux family protein  34.39 
 
 		 472 aa  166  9e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.253686 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1686  multidrug resistance protein NorM, putative  35.1 
 
 		 464 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.712622  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09173  MATE efflux family protein  27.65 
 
 		 457 aa  164  3e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4462  MATE efflux family protein  35.33 
 
 		 470 aa  164  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5314  multidrug efflux protein NorA  34.78 
 
 		 462 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.133881 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0697  multi anti extrusion protein MatE  35.86 
 
 		 468 aa  163  6e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.596572  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0411  MATE efflux family protein  35.23 
 
 		 453 aa  162  1e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2939  multidrug resistance protein  34.72 
 
 		 468 aa  162  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000251457  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1263  MATE efflux family protein  35.01 
 
 		 467 aa  162  1e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0813234  normal  0.914064 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2824  Na+-driven multidrug efflux pump  34.72 
 
 		 468 aa  161  2e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.338684  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7238  MATE efflux family protein  31.28 
 
 		 450 aa  161  2e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.866766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1382  multidrug efflux protein  29.22 
 
 		 460 aa  161  2e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.13512  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4308  MATE efflux family protein  35.81 
 
 		 470 aa  161  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.462877 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0502  multidrug resistance protein NorM, putative  34.72 
 
 		 468 aa  161  3e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00841305  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2885  multidrug efflux pump NorM  34.72 
 
 		 468 aa  161  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.132426  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1835  multidrug efflux pump NorM  34.72 
 
 		 468 aa  161  3e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.143849  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2511  multidrug efflux pump NorM  34.72 
 
 		 468 aa  161  3e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0112614  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2770  multidrug efflux pump NorM  34.72 
 
 		 468 aa  161  3e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00327808  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0676  MATE efflux family protein  33.94 
 
 		 472 aa  160  5e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.441843  normal  0.0136882 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0953  MATE efflux family protein  33.71 
 
 		 450 aa  158  2e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5172  multidrug efflux protein NorA  34.6 
 
 		 462 aa  157  3e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.204458 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1783  multidrug efflux protein  29.74 
 
 		 457 aa  157  4e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00383484 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2675  multidrug efflux protein  30.37 
 
 		 457 aa  155  9e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01634  multidrug efflux protein NorM  31.66 
 
 		 457 aa  155  2e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.900215  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1743  multidrug efflux protein  31.66 
 
 		 457 aa  155  2e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000609014  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1966  multidrug efflux protein  31.66 
 
 		 457 aa  155  2e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000267108 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2189  multidrug efflux protein  30.54 
 
 		 458 aa  155  2e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00321419  hitchhiker  0.00000631963 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01624  hypothetical protein  31.66 
 
 		 457 aa  155  2e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1977  MATE efflux family protein  31.44 
 
 		 457 aa  153  5e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000001739  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1534  multidrug efflux protein  31.44 
 
 		 457 aa  153  5e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00445038  hitchhiker  0.00117159 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2943  MATE efflux family protein  33.05 
 
 		 470 aa  153  5e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0208  multidrug efflux protein NorA  35.04 
 
 		 462 aa  153  5e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0521775 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2376  multidrug efflux protein  31.44 
 
 		 457 aa  153  5e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000568736  normal  0.0171948 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2391  multidrug efflux protein  30.66 
 
 		 457 aa  153  5e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.346064  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2967  MATE efflux family protein  32.35 
 
 		 467 aa  153  5e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0284207 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1861  multidrug efflux protein  31.44 
 
 		 457 aa  153  5.9999999999999996e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000216071  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1877  multidrug efflux protein  31.44 
 
 		 457 aa  153  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000154294  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1712  multidrug efflux protein  30.59 
 
 		 457 aa  152  1e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2156  MATE efflux family protein  27.88 
 
 		 451 aa  150  4e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.540946 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1041  multi anti extrusion protein MatE  32.52 
 
 		 470 aa  150  6e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2708  MATE efflux family protein  31.78 
 
 		 467 aa  150  6e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5025  MATE efflux family protein  26.7 
 
 		 461 aa  149  8e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.274377  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1680  multidrug efflux protein  29.38 
 
 		 457 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4204  multi anti extrusion protein MatE  31.54 
 
 		 462 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0638116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1146  MATE efflux family protein  36.4 
 
 		 469 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.890459  normal  0.943452 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2346  MATE efflux family protein  27.06 
 
 		 460 aa  147  5e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00458496 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0797  MATE efflux family protein  31.9 
 
 		 463 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.158372 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3887  multi anti extrusion protein MatE  29.49 
 
 		 466 aa  146  9e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0845713 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003524  multidrug efflux protein NorM  31.08 
 
 		 456 aa  146  9e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1558  multidrug efflux protein  30.77 
 
 		 457 aa  145  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.554893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1918  multidrug efflux protein  30.77 
 
 		 457 aa  145  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00462926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1749  multidrug efflux protein  30.77 
 
 		 457 aa  145  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000000456858  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1535  multidrug efflux protein  30.77 
 
 		 457 aa  145  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.153308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0454  MATE efflux family protein  31.98 
 
 		 477 aa  144  2e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1521  multidrug efflux protein  30.77 
 
 		 457 aa  145  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0251273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3583  MATE efflux family protein  32.64 
 
 		 438 aa  144  4e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.662735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0971  MATE efflux family protein  30.87 
 
 		 462 aa  142  9e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.500099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0612  MATE efflux family protein  30.8 
 
 		 462 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1050  MATE efflux family protein  30.8 
 
 		 462 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.456746 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1091  MATE efflux family protein  30.8 
 
 		 462 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.427191  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02236  multidrug efflux protein  30.11 
 
 		 456 aa  142  1.9999999999999998e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0967  MATE efflux family protein  31.1 
 
 		 462 aa  140  6e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.932307  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0723  multidrug resistance protein  26.09 
 
 		 454 aa  139  1e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2226  MATE efflux family protein  27.77 
 
 		 459 aa  139  1e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00326481  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1907  MATE efflux family protein  29.57 
 
 		 457 aa  138  2e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0742597  normal  0.100602 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29880  Multidrug efflux protein  33.79 
 
 		 459 aa  138  2e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.613777  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>