221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3275 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_3275  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 229 aa  455  1e-127  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.672112  normal  0.145248 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17370  hypothetical protein  40.23 
 
 		 275 aa  142  3e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.457096  normal  0.0989396 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3512  AraC family transcriptional regulator  41.75 
 
 		 292 aa  122  4e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0827399 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2688  helix-turn-helix domain-containing protein  41.79 
 
 		 221 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.977146  normal  0.242396 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2898  AraC family transcriptional regulator  41.58 
 
 		 221 aa  119  3e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3491  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  40.34 
 
 		 248 aa  114  1.0000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.873447  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2350  transcriptional regulator, AraC family  40.72 
 
 		 263 aa  112  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0397043 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1076  transcriptional regulator, AraC family  38.56 
 
 		 231 aa  112  7.000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1932  AraC family transcriptional regulator  37.13 
 
 		 236 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2108  transcriptional regulator, AraC family  38.71 
 
 		 263 aa  107  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0188933 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3318  Helix-turn-helix, AraC domain protein  33.77 
 
 		 239 aa  100  1e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4320  AraC family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 255 aa  99.8  3e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.400643  normal  0.300736 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4542  Helix-turn-helix, AraC domain protein  35.65 
 
 		 265 aa  96.3  4e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1733  helix-turn-helix domain-containing protein  34.63 
 
 		 305 aa  91.7  8e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0271524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5306  transcriptional regulator, AraC family  38.39 
 
 		 244 aa  90.5  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0145  transcriptional regulator, AraC family  38.35 
 
 		 255 aa  87.4  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.818844  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0111  AraC family transcriptional regulator  32.6 
 
 		 274 aa  84.7  9e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6449  AraC family transcriptional regulator  34.6 
 
 		 239 aa  82.4  0.000000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0160185 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3242  transcriptional regulator, AraC family  30.88 
 
 		 274 aa  81.6  0.00000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0676  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  27.9 
 
 		 260 aa  79  0.00000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.425757  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1190  AraC family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 271 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000541539 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0462  helix-turn-helix domain-containing protein  28.64 
 
 		 277 aa  74.7  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7339  AraC family transcriptional regulator  35.95 
 
 		 278 aa  72  0.000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.725809  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6692  transcriptional regulator, AraC family  24.64 
 
 		 260 aa  70.9  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0433  transcriptional regulator, AraC family  30.48 
 
 		 274 aa  69.3  0.00000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0509  Helix-turn-helix, AraC domain protein  35.93 
 
 		 265 aa  68.2  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.591495 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3504  transcriptional regulator, AraC family  29.55 
 
 		 281 aa  68.2  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2202  transcriptional regulator, AraC family  34.21 
 
 		 287 aa  65.5  0.0000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3383  AraC family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 271 aa  65.5  0.0000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.376352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1384  transcriptional regulator, AraC family  31.64 
 
 		 269 aa  65.1  0.0000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.976076 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1550  transcriptional regulator, AraC family  35.36 
 
 		 272 aa  65.1  0.0000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5221  AraC family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 297 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.343965  normal  0.936054 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6610  AraC family transcriptional regulator  31 
 
 		 277 aa  64.7  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5387  transcriptional regulator, AraC family  29.38 
 
 		 279 aa  64.3  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3282  transcriptional regulator, AraC family  29.55 
 
 		 271 aa  63.9  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0185565 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3571  transcriptional regulator, AraC family  29.53 
 
 		 269 aa  63.5  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0312904  normal  0.0352472 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4039  transcriptional regulator, AraC family  45.45 
 
 		 280 aa  62  0.000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0024992  normal  0.0177037 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4652  transcriptional regulator, AraC family  30.64 
 
 		 272 aa  61.6  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.629583  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4318  transcriptional regulator, AraC family  29.96 
 
 		 267 aa  60.8  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.642666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2715  putative regulatory protein  27.09 
 
 		 272 aa  60.1  0.00000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.241271  normal  0.389731 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1684  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  26.01 
 
 		 288 aa  60.1  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.465215  normal  0.801994 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1479  helix-turn-helix domain-containing protein  25.47 
 
 		 299 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0993365  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1671  Helix-turn-helix, AraC domain protein  34.16 
 
 		 261 aa  59.3  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0310  transcriptional regulator, AraC family  35.35 
 
 		 268 aa  59.7  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1833  helix-turn-helix domain-containing protein  25.11 
 
 		 274 aa  59.3  0.00000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0887778  normal  0.832681 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1425  AraC family transcriptional regulator  23.83 
 
 		 271 aa  59.3  0.00000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.333229  normal  0.212879 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0749  hypothetical protein  26.11 
 
 		 271 aa  58.9  0.00000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5791  transcriptional regulator, AraC family  28.31 
 
 		 253 aa  58.2  0.00000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1298  AraC family transcriptional regulator  23.91 
 
 		 251 aa  57.8  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00392823  normal  0.549276 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2830  AraC family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 264 aa  58.2  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1649  transcriptional regulator, AraC family  26.38 
 
 		 271 aa  58.2  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1835  helix-turn-helix domain-containing protein  22.82 
 
 		 277 aa  57.8  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.140482  normal  0.818318 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1643  transcriptional regulator, AraC family  28.11 
 
 		 259 aa  57  0.0000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6750  transcriptional regulator, AraC family  26.81 
 
 		 327 aa  57  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1287  helix-turn-helix domain-containing protein  25 
 
 		 272 aa  57.8  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0575  transcriptional regulator, AraC family  31.61 
 
 		 256 aa  56.6  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2289  transcriptional regulator, AraC family  45.83 
 
 		 278 aa  57  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2660  transcriptional regulator, AraC family  30.72 
 
 		 278 aa  57  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6058  transcriptional regulator, AraC family  31.47 
 
 		 291 aa  56.6  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7200  AraC family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 297 aa  57  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3797  AraC family transcriptional regulator  24.07 
 
 		 257 aa  56.2  0.0000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.101891 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1886  transcriptional regulator, AraC family  25.14 
 
 		 280 aa  55.8  0.0000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.979359  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1962  transcriptional regulator, AraC family  29.65 
 
 		 271 aa  55.8  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.17826 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1440  transcriptional regulator, AraC family  34.01 
 
 		 275 aa  56.2  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4151  transcriptional regulator, AraC family  29.15 
 
 		 252 aa  55.8  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0354643  normal  0.109267 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2970  transcriptional regulator, AraC family  33.71 
 
 		 276 aa  55.5  0.0000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.3117 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1656  transcriptional regulator, AraC family  31.93 
 
 		 273 aa  55.1  0.0000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0328818 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2942  AraC family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 309 aa  54.7  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1224  Helix-turn-helix, AraC domain protein  29.71 
 
 		 289 aa  53.9  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.276562  normal  0.797309 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2483  AraC family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 273 aa  53.9  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0579  transcriptional regulator, AraC family  32.47 
 
 		 257 aa  53.9  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0099  transcriptional regulator, AraC family  26.4 
 
 		 287 aa  53.9  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4393  transcriptional regulator, AraC family  30.86 
 
 		 246 aa  53.9  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.287242  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3502  transcriptional regulator, AraC family  25.99 
 
 		 278 aa  53.9  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0106  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  42.67 
 
 		 325 aa  53.5  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0383824  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0370  AraC family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 281 aa  53.5  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2409  AraC family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 285 aa  53.1  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1375  transcriptional regulator, AraC family  30.6 
 
 		 275 aa  53.1  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.372829  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5515  transcriptional regulator, AraC family  27.86 
 
 		 291 aa  53.1  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.184351  normal  0.0529906 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0546  AraC family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 257 aa  52.4  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.493534  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25000  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  30.26 
 
 		 263 aa  52.8  0.000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2318  AraC family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 278 aa  52.4  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0979  transcriptional regulator, AraC family  37 
 
 		 279 aa  52.4  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.560002  normal  0.0613388 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2672  transcriptional regulator, AraC family  25.7 
 
 		 273 aa  52.4  0.000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4467  helix-turn-helix domain-containing protein  31.64 
 
 		 252 aa  52  0.000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0353023 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3635  helix-turn-helix domain-containing protein  23.15 
 
 		 249 aa  52  0.000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000440298 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1287  AraC family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 260 aa  51.6  0.000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.400393 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4602  AraC family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 279 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0287774  normal  0.364439 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1187  transcriptional regulator, AraC-family  27.72 
 
 		 278 aa  50.4  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5257  transcriptional regulator, AraC family  29.47 
 
 		 289 aa  50.4  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5627  transcriptional regulator, AraC family  28.16 
 
 		 256 aa  50.8  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2573  AraC/XylS family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 270 aa  50.4  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0618  AraC family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 306 aa  50.1  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0105124  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1097  AraC family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 306 aa  50.1  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000000022105  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1056  AraC family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 306 aa  50.1  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000221071  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0825  AraC family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 289 aa  49.7  0.00004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0651  transcriptional regulator, AraC family  31.34 
 
 		 290 aa  49.7  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1692  AraC family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 351 aa  49.7  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000028699  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5120  transcriptional regulator, AraC family  22.73 
 
 		 275 aa  49.7  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.282168 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4210  AraC family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 299 aa  49.3  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000259018  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>