More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3758 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_3758  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 299 aa  612  9.999999999999999e-175  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.297651  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0767  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.41 
 
 		 330 aa  239  4e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.415615 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1019  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.39 
 
 		 330 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0961773  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1704  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.54 
 
 		 327 aa  233  3e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1331  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.71 
 
 		 332 aa  229  3e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.261589  normal  0.281891 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5776  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.73 
 
 		 335 aa  227  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.171589  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20190  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.05 
 
 		 336 aa  224  2e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3972  short chain dehydrogenase  44.26 
 
 		 441 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.155927 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3170  putative Short-chain dehydrogenase/reductase  41.92 
 
 		 544 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0745281 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0510  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.93 
 
 		 355 aa  212  4.9999999999999996e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.453841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0481  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.18 
 
 		 328 aa  209  3e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2427  short chain dehydrogenase  44.41 
 
 		 442 aa  209  4e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.15313  normal  0.413243 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2986  short chain dehydrogenase  43.73 
 
 		 441 aa  206  3e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.889744  normal  0.40482 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3887  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.4 
 
 		 326 aa  206  4e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.248139  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2604  short chain dehydrogenase  43.73 
 
 		 441 aa  204  1e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.155527 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4061  short chain dehydrogenase  41.5 
 
 		 337 aa  200  1.9999999999999998e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5897  short chain dehydrogenase  39.79 
 
 		 328 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1361  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.61 
 
 		 334 aa  194  2e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0134131 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6867  short chain dehydrogenase  38.97 
 
 		 333 aa  193  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0149  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.18 
 
 		 326 aa  192  4e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3318  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.81 
 
 		 334 aa  192  6e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.496064  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3968  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.96 
 
 		 334 aa  192  8e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.223195 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4611  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.47 
 
 		 356 aa  189  2.9999999999999997e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.824493 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3988  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.46 
 
 		 404 aa  187  2e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.326194 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5078  short chain dehydrogenase  39.86 
 
 		 337 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5076  short chain dehydrogenase  36.39 
 
 		 339 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.5503 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0579  short chain dehydrogenase  35.03 
 
 		 336 aa  181  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5454  short chain dehydrogenase  39.78 
 
 		 342 aa  178  1e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00420602 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2360  short chain dehydrogenase  41.2 
 
 		 327 aa  177  2e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.113129  hitchhiker  0.00199253 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5638  short chain dehydrogenase  40.15 
 
 		 342 aa  176  5e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.731163  normal  0.168256 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6386  short chain dehydrogenase  40.15 
 
 		 342 aa  176  5e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.875817  normal  0.430331 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2990  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.43 
 
 		 336 aa  174  1.9999999999999998e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.753592 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1489  short chain dehydrogenase  38.13 
 
 		 296 aa  173  3.9999999999999995e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.18 
 
 		 336 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.945072  normal  0.131603 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0762  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.33 
 
 		 336 aa  172  5e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7667  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.81 
 
 		 332 aa  172  5.999999999999999e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.755346  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0370  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.01 
 
 		 369 aa  172  6.999999999999999e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1056  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.93 
 
 		 332 aa  172  9e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.843879 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1014  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.96 
 
 		 336 aa  172  9e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.264982  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6050  short chain dehydrogenase  39.78 
 
 		 342 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.057993 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6458  short chain dehydrogenase  39.78 
 
 		 342 aa  170  2e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.859122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1371  short chain dehydrogenase  39.78 
 
 		 342 aa  170  3e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.103888  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1418  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.02 
 
 		 334 aa  168  1e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000382267 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6955  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.93 
 
 		 332 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0416972 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3200  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.29 
 
 		 341 aa  166  5e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5141  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.31 
 
 		 337 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.460239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3507  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.18 
 
 		 355 aa  164  1.0000000000000001e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4204  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.05 
 
 		 326 aa  162  6e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.153025 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0021  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.28 
 
 		 332 aa  162  9e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.867274  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0161  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.57 
 
 		 333 aa  161  1e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.264514  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0343  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.82 
 
 		 314 aa  161  1e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6285  short chain dehydrogenase  38.35 
 
 		 327 aa  161  1e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.306501  hitchhiker  0.00902289 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0042  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.31 
 
 		 332 aa  160  2e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.15937  normal  0.0190305 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0022  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.93 
 
 		 332 aa  160  2e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.939722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1374  short chain dehydrogenase  41.56 
 
 		 343 aa  160  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.271507  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3155  short chain dehydrogenase  41.56 
 
 		 343 aa  160  3e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.652853  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3026  short chain dehydrogenase  41.56 
 
 		 343 aa  160  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.327343  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6571  short chain dehydrogenase  37.97 
 
 		 327 aa  159  4e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2859  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.97 
 
 		 293 aa  157  2e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.725607  normal  0.816114 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1975  short chain dehydrogenase  41.15 
 
 		 343 aa  157  3e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.509548  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0996  short chain dehydrogenase  41.15 
 
 		 343 aa  157  3e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.663659  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1284  short chain dehydrogenase  41.15 
 
 		 343 aa  157  3e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.524856  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2259  short chain dehydrogenase  41.15 
 
 		 343 aa  157  3e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.153923  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5503  short chain dehydrogenase  35.44 
 
 		 327 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.148603  normal  0.0783647 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2660  short chain dehydrogenase  34.15 
 
 		 336 aa  156  5.0000000000000005e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0943  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.71 
 
 		 293 aa  155  7e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2751  short chain dehydrogenase  33.8 
 
 		 336 aa  154  2e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.186259  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0271  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.77 
 
 		 295 aa  154  2e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.617433  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4281  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.97 
 
 		 333 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0472  short chain dehydrogenase  33.81 
 
 		 328 aa  152  5e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2751  short chain dehydrogenase  36.47 
 
 		 345 aa  150  2e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7242  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 		 334 aa  150  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.774727  normal  0.848233 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3408  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.76 
 
 		 330 aa  150  3e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3685  short chain dehydrogenase  33.85 
 
 		 346 aa  150  4e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0423  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.76 
 
 		 291 aa  149  5e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.389698  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0433  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.76 
 
 		 291 aa  149  5e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0648553 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0410  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.76 
 
 		 291 aa  149  5e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.526015 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0291  short chain dehydrogenase  31.88 
 
 		 334 aa  149  8e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0761  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.33 
 
 		 277 aa  145  6e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.416641 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0273  short chain dehydrogenase  32.31 
 
 		 334 aa  145  1e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.698832 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0016  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.08 
 
 		 260 aa  143  4e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2357  short chain dehydrogenase  34.27 
 
 		 325 aa  142  5e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.486705  decreased coverage  0.000279789 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0451  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.66 
 
 		 339 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4439  short chain dehydrogenase  32.38 
 
 		 336 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0197504  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4853  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.86 
 
 		 248 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.154391  normal  0.241568 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11068  oxidoreductase  38.03 
 
 		 301 aa  139  4.999999999999999e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.205536 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2186  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.06 
 
 		 248 aa  139  6e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0361624 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0044  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.32 
 
 		 264 aa  138  1e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.2 
 
 		 246 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3105  short chain dehydrogenase  32.06 
 
 		 325 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0188574  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1575  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.2 
 
 		 246 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6383  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.21 
 
 		 332 aa  136  5e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0488  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.95 
 
 		 261 aa  136  5e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5037  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.51 
 
 		 238 aa  136  5e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.293143  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5635  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.3 
 
 		 247 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4381  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.6 
 
 		 248 aa  135  6.0000000000000005e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.297747  hitchhiker  0.00314525 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3703  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.66 
 
 		 323 aa  135  8e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0208567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3453  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.83 
 
 		 267 aa  134  1.9999999999999998e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.282255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3688  short chain dehydrogenase  30.83 
 
 		 335 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000592094  normal  0.0665627 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0159  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.14 
 
 		 249 aa  133  3e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.410897  normal  0.168063 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>