More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6519 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_6519  MATE efflux family protein  100 
 
 		 466 aa  902    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.510371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2156  MATE efflux family protein  37.81 
 
 		 451 aa  300  4e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.540946 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7238  MATE efflux family protein  37.1 
 
 		 450 aa  282  1e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.866766  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09173  MATE efflux family protein  38.5 
 
 		 457 aa  280  4e-74  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0723  multidrug resistance protein  36.36 
 
 		 454 aa  264  3e-69  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5025  MATE efflux family protein  32.13 
 
 		 461 aa  254  3e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.274377  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1767  MATE efflux family protein  35.31 
 
 		 462 aa  247  3e-64  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1494  MATE efflux family protein  38.57 
 
 		 451 aa  245  9.999999999999999e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1930  MATE efflux family protein  35.2 
 
 		 460 aa  223  7e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.135248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2515  MATE efflux family protein  34.23 
 
 		 442 aa  222  9.999999999999999e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1736  MATE efflux family protein  37.61 
 
 		 472 aa  219  8.999999999999998e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.282832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0355  putative multidrug resistance protein NorM  34.51 
 
 		 471 aa  213  3.9999999999999995e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.277827  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0339  multidrug resistance protein NorM, putative  34.51 
 
 		 471 aa  213  5.999999999999999e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0440  MATE efflux family protein  33.77 
 
 		 470 aa  211  2e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.589921  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0255  multidrug efflux protein NorA  35.98 
 
 		 461 aa  210  5e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2943  MATE efflux family protein  34.84 
 
 		 470 aa  206  7e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1935  MATE efflux family protein  33.26 
 
 		 460 aa  205  2e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.18016  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1041  multi anti extrusion protein MatE  34.7 
 
 		 470 aa  204  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3112  multidrug efflux protein  33.7 
 
 		 465 aa  204  3e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2708  MATE efflux family protein  33.48 
 
 		 467 aa  202  9e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5314  multidrug efflux protein NorA  35.5 
 
 		 462 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.133881 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1263  MATE efflux family protein  34.73 
 
 		 467 aa  201  3e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0813234  normal  0.914064 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0454  MATE efflux family protein  34.51 
 
 		 477 aa  201  3e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1298  MATE efflux family protein  35.22 
 
 		 467 aa  200  5e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0014  putative multidrug resistance protein norM  36.42 
 
 		 460 aa  199  9e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2939  multidrug resistance protein  34.75 
 
 		 468 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000251457  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5517  multidrug efflux protein NorA  35.4 
 
 		 464 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0697  multi anti extrusion protein MatE  36.04 
 
 		 468 aa  197  3e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.596572  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1686  multidrug resistance protein NorM, putative  34.75 
 
 		 464 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.712622  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0612  MATE efflux family protein  34.23 
 
 		 462 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1050  MATE efflux family protein  34.23 
 
 		 462 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.456746 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1091  MATE efflux family protein  34.23 
 
 		 462 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.427191  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1709  MATE efflux family protein  33.1 
 
 		 470 aa  197  5.000000000000001e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.578822 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5262  multidrug efflux protein NorA  35.52 
 
 		 462 aa  195  1e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00407645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2824  Na+-driven multidrug efflux pump  34.53 
 
 		 468 aa  195  1e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.338684  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4308  MATE efflux family protein  36.85 
 
 		 470 aa  195  1e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.462877 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2967  MATE efflux family protein  33.04 
 
 		 467 aa  195  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0284207 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1835  multidrug efflux pump NorM  34.53 
 
 		 468 aa  195  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.143849  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2511  multidrug efflux pump NorM  34.53 
 
 		 468 aa  195  2e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0112614  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0502  multidrug resistance protein NorM, putative  34.53 
 
 		 468 aa  195  2e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00841305  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2770  multidrug efflux pump NorM  34.53 
 
 		 468 aa  195  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00327808  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2885  multidrug efflux pump NorM  34.53 
 
 		 468 aa  195  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.132426  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1019  MATE efflux family protein  34.97 
 
 		 474 aa  193  5e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2346  MATE efflux family protein  31.46 
 
 		 460 aa  193  5e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00458496 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5172  multidrug efflux protein NorA  35.52 
 
 		 462 aa  193  6e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.204458 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1146  MATE efflux family protein  35.63 
 
 		 469 aa  192  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.890459  normal  0.943452 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2212  MATE efflux family protein  34.39 
 
 		 462 aa  191  2e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.520618  normal  0.988059 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0797  MATE efflux family protein  35.11 
 
 		 463 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.158372 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0643  MATE efflux family protein  35.4 
 
 		 477 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.26876 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0650  MATE efflux family protein  33.62 
 
 		 458 aa  190  4e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0755  MATE efflux family protein  31.81 
 
 		 456 aa  189  5.999999999999999e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0124459  normal  0.621342 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4204  multi anti extrusion protein MatE  33.71 
 
 		 462 aa  189  9e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0638116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3141  MATE efflux family protein  32.82 
 
 		 472 aa  188  2e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.565795  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0967  MATE efflux family protein  34.38 
 
 		 462 aa  187  2e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.932307  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4462  MATE efflux family protein  35.87 
 
 		 470 aa  187  3e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0664  MATE efflux family protein  36.18 
 
 		 472 aa  186  6e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.253686 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0971  MATE efflux family protein  34.39 
 
 		 462 aa  186  7e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.500099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2403  MATE efflux family protein  32.64 
 
 		 475 aa  185  1.0000000000000001e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3583  MATE efflux family protein  31.14 
 
 		 438 aa  185  2.0000000000000003e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.662735  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0676  MATE efflux family protein  35.96 
 
 		 472 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.441843  normal  0.0136882 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02164  multidrug efflux protein NorA  31.07 
 
 		 457 aa  184  3e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.193678  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6069  multidrug efflux protein NorA  34.44 
 
 		 462 aa  179  7e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2494  MATE efflux family protein  32.77 
 
 		 458 aa  179  9e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.121522  hitchhiker  0.0012501 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1277  MATE efflux family protein  30.18 
 
 		 480 aa  179  1e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0208  multidrug efflux protein NorA  35.73 
 
 		 462 aa  179  1e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0521775 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2423  MATE efflux family protein  33.92 
 
 		 451 aa  177  3e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0441886  normal  0.25868 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0073  multidrug efflux protein NorA  32.96 
 
 		 460 aa  177  4e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0764  MATE family efflux pump NorM  33.92 
 
 		 451 aa  176  8e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1356  MATE efflux family protein  31.95 
 
 		 461 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2117  MATE efflux family protein  31.56 
 
 		 458 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0110658  normal  0.0465778 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0115  multidrug resistance protein NorM, putative  33.18 
 
 		 460 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0260  MATE efflux family protein  31.29 
 
 		 478 aa  174  3.9999999999999995e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2031  MATE efflux family protein  31.56 
 
 		 453 aa  172  7.999999999999999e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0411  MATE efflux family protein  33.33 
 
 		 453 aa  172  1e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1907  MATE efflux family protein  30.68 
 
 		 457 aa  172  1e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0742597  normal  0.100602 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1501  multidrug efflux protein  30.53 
 
 		 454 aa  171  3e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1382  multidrug efflux protein  29.41 
 
 		 460 aa  170  6e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.13512  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2247  Na+-driven multidrug efflux pump  32.18 
 
 		 464 aa  169  8e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1267  multidrug efflux protein  31.07 
 
 		 453 aa  169  1e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1472  multidrug efflux protein  30.24 
 
 		 453 aa  169  1e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1295  multidrug efflux protein  30.02 
 
 		 453 aa  168  2e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0578421  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1402  multidrug efflux protein  30.02 
 
 		 453 aa  168  2e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2036  MATE efflux family protein  29.67 
 
 		 464 aa  168  2e-40  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000288761  decreased coverage  0.0000000485587 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0953  MATE efflux family protein  31.36 
 
 		 450 aa  167  4e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2521  multi anti extrusion protein MatE  33.63 
 
 		 490 aa  166  9e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.200402 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1761  MATE efflux family protein  30.18 
 
 		 453 aa  166  9e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.129666  normal  0.0637882 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3887  multi anti extrusion protein MatE  30.09 
 
 		 466 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0845713 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2268  MATE efflux family protein  30.72 
 
 		 452 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.012169  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1269  multidrug efflux protein  30.23 
 
 		 453 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.801506  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3598  multidrug efflux protein  30.7 
 
 		 454 aa  164  4.0000000000000004e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1702  MATE efflux family protein  31.1 
 
 		 453 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.125502  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1856  multidrug efflux protein  32.93 
 
 		 455 aa  164  4.0000000000000004e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.30191  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1435  multidrug efflux protein  29.87 
 
 		 452 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.602082  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2909  multidrug efflux protein  30.37 
 
 		 449 aa  163  6e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000144905  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04042  multidrug efflux protein  28.94 
 
 		 441 aa  163  7e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69890  multidrug efflux protein NorA  35.07 
 
 		 488 aa  163  7e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3909  multidrug efflux protein  29.49 
 
 		 452 aa  163  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1783  multidrug efflux protein  29.84 
 
 		 457 aa  163  8.000000000000001e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00383484 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003524  multidrug efflux protein NorM  28.45 
 
 		 456 aa  162  1e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2538  MATE efflux family protein  30.58 
 
 		 454 aa  162  1e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>