293 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5506 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5506  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 451 aa  903    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.307266  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3429  outer membrane efflux protein  52.37 
 
 		 442 aa  468  9.999999999999999e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.437271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2515  outer membrane protein  39.3 
 
 		 463 aa  331  2e-89  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1475  outer membrane efflux protein  40.24 
 
 		 449 aa  301  2e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.236212  normal  0.298581 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1143  outer membrane efflux protein  35.11 
 
 		 455 aa  253  5.000000000000001e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0286987  normal  0.128527 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2173  outer membrane efflux protein  33.55 
 
 		 448 aa  216  5.9999999999999996e-55  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4492  outer membrane efflux protein  30.43 
 
 		 455 aa  209  1e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.685781 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1266  outer membrane efflux protein  32.45 
 
 		 444 aa  204  3e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0610  outer membrane efflux protein  28.35 
 
 		 453 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3706  outer membrane efflux protein  30.48 
 
 		 447 aa  182  8.000000000000001e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4162  outer membrane efflux protein  28.38 
 
 		 443 aa  180  4.999999999999999e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000533026  normal  0.288124 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1967  outer membrane efflux protein  29.57 
 
 		 443 aa  176  5e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000399706  normal  0.35271 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3719  outer membrane efflux protein  28 
 
 		 444 aa  174  2.9999999999999996e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.633766  normal  0.0948534 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2807  outer membrane efflux protein/ immunoreative antigen  27.48 
 
 		 441 aa  161  2e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0042  outer membrane efflux protein  28.13 
 
 		 454 aa  161  3e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.293166 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2662  outer membrane efflux protein  28.7 
 
 		 445 aa  156  7e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01970  outer membrane efflux protein, putative  24.37 
 
 		 456 aa  151  3e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.154405  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2560  outer membrane efflux protein  26.51 
 
 		 438 aa  150  7e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2362  outer membrane efflux protein  26.39 
 
 		 446 aa  146  8.000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.451057 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1617  outer membrane efflux protein  24.88 
 
 		 467 aa  146  8.000000000000001e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1884  outer membrane efflux protein  23.81 
 
 		 483 aa  144  4e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0837  outer membrane efflux protein  24.65 
 
 		 462 aa  142  9.999999999999999e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0954  outer membrane efflux protein  23.64 
 
 		 463 aa  141  3e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0627  outer membrane efflux protein, putative  25.23 
 
 		 470 aa  140  4.999999999999999e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.173588  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2819  outer membrane efflux protein  28.38 
 
 		 438 aa  139  1e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0833  outer membrane efflux protein  25 
 
 		 496 aa  137  5e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0733  outer membrane efflux protein, putative  23.49 
 
 		 463 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2647  outer membrane efflux protein  27.04 
 
 		 445 aa  127  3e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.910769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0881  outer membrane efflux protein  23.24 
 
 		 535 aa  114  3e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.705042  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0120  outer membrane efflux protein  23.97 
 
 		 448 aa  105  2e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000165447  hitchhiker  0.000000000000561163 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0831  outer membrane efflux protein  24.72 
 
 		 419 aa  99.8  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4543  outer membrane efflux protein  23.24 
 
 		 430 aa  99  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.781416  normal  0.876595 
 
 
-
 
NC_002950  PG0538  outer membrane efflux protein  23.03 
 
 		 462 aa  96.7  8e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2629  outer membrane efflux protein  23.35 
 
 		 421 aa  96.3  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.111539  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0224  outer membrane efflux protein  25.6 
 
 		 419 aa  95.5  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000720591  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1606  outer membrane efflux protein  23.39 
 
 		 421 aa  95.1  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3409  outer membrane efflux protein  25.77 
 
 		 419 aa  94  5e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000155286  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1841  Outer membrane protein-like protein  22.6 
 
 		 438 aa  92.8  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  25.76 
 
 		 1496 aa  90.5  5e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5578  outer membrane efflux protein  23.18 
 
 		 451 aa  88.6  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.46516 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1177  outer membrane efflux protein  23.29 
 
 		 427 aa  86.7  8e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3465  Outer membrane efflux protein  22.12 
 
 		 441 aa  84.7  0.000000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1749  outer membrane efflux protein  22.15 
 
 		 458 aa  82.4  0.00000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1990  outer membrane efflux protein  21.89 
 
 		 471 aa  82.8  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.154832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3710  outer membrane efflux protein  23.65 
 
 		 419 aa  83.2  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0063  outer membrane efflux protein  24.71 
 
 		 408 aa  80.9  0.00000000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0180654  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3801  outer membrane efflux protein  22.71 
 
 		 449 aa  80.5  0.00000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233057 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0162  outer membrane efflux protein  23.96 
 
 		 433 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0961  Outer membrane protein-like  24.91 
 
 		 491 aa  77.4  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0234127  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1633  outer membrane efflux protein  25.16 
 
 		 420 aa  77  0.0000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.159543  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1482  outer membrane efflux protein  22.89 
 
 		 426 aa  76.3  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.979092  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0096  outer membrane efflux protein  20.26 
 
 		 441 aa  74.3  0.000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4260  outer membrane efflux protein  23.5 
 
 		 438 aa  73.6  0.000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1376  Outer membrane efflux protein  24.64 
 
 		 435 aa  72.8  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.109779  hitchhiker  0.00244241 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2517  Outer membrane efflux protein  23.03 
 
 		 455 aa  72.8  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0940003  normal  0.677218 
 
 
-
 
NC_002950  PG0094  outer membrane efflux protein, putative  24.34 
 
 		 501 aa  72  0.00000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0379352 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1384  outer membrane efflux protein  22.07 
 
 		 435 aa  72.4  0.00000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.642492  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5078  outer membrane efflux protein  23.38 
 
 		 635 aa  69.7  0.00000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.851054  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3626  outer membrane efflux protein  24.09 
 
 		 627 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0887926  normal  0.306741 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2724  outer membrane efflux protein  21.75 
 
 		 440 aa  69.3  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.190068  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2154  outer membrane protein CyaE, putative  24.07 
 
 		 453 aa  68.9  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0768  outer membrane channel protein  22.71 
 
 		 435 aa  68.2  0.0000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000309945  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0242  outer membrane efflux protein  22.27 
 
 		 444 aa  67.8  0.0000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.231209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0814  outer membrane efflux protein  20.92 
 
 		 460 aa  67.4  0.0000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3236  outer membrane channel protein  21.83 
 
 		 435 aa  66.6  0.0000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000456355  hitchhiker  0.0000511139 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0753  outer membrane channel protein  21.83 
 
 		 435 aa  66.6  0.0000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000555232  normal  0.0190145 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0575  type I secretion outer membrane protein, TolC family  21.11 
 
 		 444 aa  66.2  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0729  type I secretion outer membrane protein, TolC family  21.11 
 
 		 444 aa  66.2  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000668163 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1761  hypothetical protein  25.07 
 
 		 576 aa  66.2  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2630  Type I secretion outer membrane protein, TolC  20.81 
 
 		 489 aa  65.9  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  22.69 
 
 		 1470 aa  65.9  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4088  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  24.41 
 
 		 489 aa  65.1  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.947344  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4182  outer membrane efflux protein  23.61 
 
 		 431 aa  64.7  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.256436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1353  outer membrane efflux protein  21.38 
 
 		 451 aa  64.7  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.678572  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0849  outer membrane efflux protein  21.25 
 
 		 417 aa  64.7  0.000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000450472  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2001  LipD protein, putative  22.37 
 
 		 445 aa  64.3  0.000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.538795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0725  outer membrane channel protein  21.53 
 
 		 435 aa  64.3  0.000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000245313  hitchhiker  0.000963429 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5330  outer membrane efflux protein  23.94 
 
 		 429 aa  64.3  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.757466 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2704  outer membrane efflux protein  22.67 
 
 		 423 aa  63.9  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0066  outer membrane efflux protein  21.48 
 
 		 443 aa  63.5  0.000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1015  Outer membrane efflux protein  20.75 
 
 		 731 aa  63.5  0.000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0127212 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3904  outer membrane channel protein  21.76 
 
 		 435 aa  62  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0781  outer membrane channel protein  20.65 
 
 		 435 aa  61.6  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000184345  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1015  outer membrane protein  21.64 
 
 		 488 aa  62  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.22355e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2692  outer membrane efflux protein  24.2 
 
 		 442 aa  62.4  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.922433  normal  0.254416 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03690  outer membrane channel precursor protein  20.34 
 
 		 462 aa  62.4  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000344286  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3578  outer membrane channel protein  20.65 
 
 		 435 aa  61.6  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000408694  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0813  outer membrane channel protein  20.65 
 
 		 435 aa  61.6  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000621601  normal  0.257824 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0806  outer membrane channel protein  20.65 
 
 		 435 aa  62.4  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000113836  hitchhiker  0.0000000000882186 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3126  outer membrane efflux protein  24.41 
 
 		 444 aa  62.4  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2534  Type I secretion outer membrane protein, TolC  21.41 
 
 		 468 aa  61.6  0.00000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2013  outer membrane channel protein  23.01 
 
 		 438 aa  61.2  0.00000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000158125  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2298  outer membrane efflux protein  21.66 
 
 		 525 aa  61.2  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5561  outer membrane efflux protein  23.18 
 
 		 431 aa  61.2  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2365  outer membrane efflux protein  21.88 
 
 		 482 aa  60.8  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.316372 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0384  outer membrane efflux protein  25.23 
 
 		 444 aa  60.8  0.00000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.895564  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4505  outer membrane efflux protein  22.93 
 
 		 972 aa  60.8  0.00000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.300614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3853  outer membrane efflux protein  21.04 
 
 		 447 aa  60.5  0.00000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3937  outer membrane efflux protein  21.26 
 
 		 447 aa  60.5  0.00000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00157367 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3332  outer membrane channel protein  19.56 
 
 		 431 aa  60.1  0.00000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0563453  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>