96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_36820 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_36820  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  100 
 
 		 217 aa  414  9.999999999999999e-116  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00403371  normal  0.543816 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2502  copper resistance protein CopC  38.92 
 
 		 226 aa  92.4  4e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.422344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3270  copper resistance protein CopC  37.56 
 
 		 225 aa  85.1  7e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0298  Cu resistance protein CopC  42.06 
 
 		 210 aa  83.2  0.000000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06090  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  46.36 
 
 		 233 aa  83.2  0.000000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11740  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  40.77 
 
 		 208 aa  80.1  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.245018  normal  0.434498 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4536  copper resistance protein CopC  38.58 
 
 		 189 aa  75.9  0.0000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.450196 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0566  copper resistance protein CopC  39.42 
 
 		 208 aa  75.9  0.0000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24410  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  41.9 
 
 		 214 aa  70.9  0.00000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0208823  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4442  copper resistance protein CopC  43.27 
 
 		 424 aa  70.1  0.00000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1028  copper resistance protein CopC  33.56 
 
 		 184 aa  68.6  0.00000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0204789 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3378  copper resistance protein CopC  34.45 
 
 		 284 aa  67  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0755618  hitchhiker  0.00467806 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4266  copper resistance protein CopC  37.82 
 
 		 203 aa  67  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0318139  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5140  copper resistance protein CopC  40.74 
 
 		 174 aa  66.6  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.184772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5431  copper resistance protein CopC  40.74 
 
 		 174 aa  66.6  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0656752  normal  0.870052 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5052  copper resistance protein CopC  40.74 
 
 		 174 aa  66.6  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681825  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0381  copper resistance protein CopC  39.42 
 
 		 211 aa  63.9  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2591  copper resistance protein CopC  28.21 
 
 		 196 aa  62.8  0.000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2636  cell wall anchor domain-containing protein  33.59 
 
 		 173 aa  62  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5782  copper resistance protein CopC  33.09 
 
 		 869 aa  61.6  0.000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2789  copper resistance protein CopC  27.15 
 
 		 197 aa  61.6  0.000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0441468  hitchhiker  0.000669635 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3973  copper resistance protein CopC  36.3 
 
 		 565 aa  61.2  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0455106  normal  0.334703 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3571  copper resistance protein CopC  36.3 
 
 		 564 aa  61.6  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.632207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4545  copper resistance protein CopC  35.45 
 
 		 241 aa  59.7  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6847  conserved hypothetical protein of Cu resistance protein CopC-like protein  33.04 
 
 		 188 aa  59.3  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0197  copper resistance protein CopC  39.18 
 
 		 244 aa  59.3  0.00000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2571  conserved hypothetical protein containing Cu resistance protein-like domain  31.52 
 
 		 199 aa  57.4  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.6378 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3575  copper resistance protein CopC  38.71 
 
 		 217 aa  57.8  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.310709  normal  0.0481479 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0468  copper resistance protein CopC  35.59 
 
 		 126 aa  56.2  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2472  copper resistance protein CopC  37.23 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0602  copper resistance protein CopC  39.51 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000550062 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1126  copper resistance protein CopC  36.63 
 
 		 560 aa  55.5  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1786  copper resistance D domain-containing protein  29.55 
 
 		 547 aa  53.5  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0445487  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1731  copper resistance protein  32.14 
 
 		 547 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.119991  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0041  copper resistance protein CopC  35.4 
 
 		 182 aa  53.1  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1726  copper resistance protein CopC  28.43 
 
 		 207 aa  53.1  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.889834  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1917  hypothetical protein  29.73 
 
 		 549 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0603122  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4567  copper resistance protein CopC  25.93 
 
 		 272 aa  53.1  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1753  copper resistance protein  30.97 
 
 		 544 aa  53.5  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00167581  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1243  copper resistance protein CopC  28.36 
 
 		 206 aa  53.1  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.565653  normal  0.0232634 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5659  copper resistance protein CopC  29.65 
 
 		 223 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.531469  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4174  copper resistance protein CopC  32.77 
 
 		 559 aa  52.8  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.960366 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2624  copper resistance protein CopC  34.86 
 
 		 546 aa  52.4  0.000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2018  hypothetical protein  28.12 
 
 		 549 aa  51.6  0.000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000046184  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1774  hypothetical protein  28.47 
 
 		 544 aa  50.8  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3065  copper resistance protein CopC  36.09 
 
 		 578 aa  51.2  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000363543  decreased coverage  0.00940115 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1127  copper resistance protein CopC  33.61 
 
 		 178 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.035308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5351  copper resistance protein CopC  29.88 
 
 		 226 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2794  copper resistance protein CopC  33.33 
 
 		 265 aa  51.2  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1912  hypothetical protein  28.47 
 
 		 544 aa  50.8  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0106079  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5210  copper resistance protein CopC  38.14 
 
 		 434 aa  50.4  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.192134  normal  0.695526 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0694  copper resistance protein CopC  31.71 
 
 		 121 aa  49.7  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.57317  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1997  hypothetical protein  28.57 
 
 		 544 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0259968  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3714  copper resistance protein CopC  29.5 
 
 		 226 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.119467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2321  copper resistance protein CopC  28.06 
 
 		 141 aa  49.3  0.00004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.539083  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2761  copper resistance protein CopC  28.06 
 
 		 141 aa  49.3  0.00004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.425917  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5386  copper resistance protein CopC  31.1 
 
 		 170 aa  48.9  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.370102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00600  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  26.87 
 
 		 197 aa  48.9  0.00006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.07291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0497  copper resistance protein CopC  33.33 
 
 		 120 aa  48.5  0.00007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1275  copper resistance protein CopC  35.56 
 
 		 605 aa  48.5  0.00007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.453103  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4398  copper resistance protein CopC  32.5 
 
 		 118 aa  48.1  0.00009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1742  copper resistance protein CopC  26.72 
 
 		 137 aa  47.8  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2276  copper resistance protein CopC  29.75 
 
 		 124 aa  47.4  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000193107 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3426  hypothetical protein  28.78 
 
 		 547 aa  47  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.270494  hitchhiker  0.000000170591 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3544  copper resistance protein CopC  27.59 
 
 		 149 aa  47  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0711776  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2340  copper resistance protein CopC  29.69 
 
 		 130 aa  47.4  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.273287  normal  0.896409 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19140  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  36.08 
 
 		 227 aa  46.6  0.0003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.196545  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4407  copper resistance protein CopC  32.58 
 
 		 121 aa  45.8  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.108836 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0419  copper resistance D domain-containing protein  32.52 
 
 		 576 aa  46.2  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.080355  normal  0.760489 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1971  copper resistance protein CopC  25.87 
 
 		 140 aa  45.4  0.0006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.520942  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1743  copper resistance protein CopC  27.2 
 
 		 116 aa  45.4  0.0006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.112709  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5304  copper resistance protein CopC  29.91 
 
 		 121 aa  45.4  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.949952  normal  0.102582 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1067  copper resistance protein CopC  35.78 
 
 		 593 aa  45.4  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2634  copper resistance protein CopC  27.59 
 
 		 173 aa  45.4  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4983  copper resistance protein CopC  29.91 
 
 		 121 aa  45.4  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.118695  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3384  copper resistance protein CopC  29.91 
 
 		 121 aa  45.4  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2807  copper resistance protein CopC  28.28 
 
 		 229 aa  45.1  0.0008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6630  copper resistance protein CopC  31.3 
 
 		 119 aa  44.7  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4979  hypothetical protein  33.65 
 
 		 198 aa  44.7  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4926  copper resistance protein CopC  31.46 
 
 		 121 aa  44.7  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4289  copper resistance protein CopC  25.87 
 
 		 140 aa  43.5  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.379862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0251  copper resistance protein CopC  25.87 
 
 		 140 aa  43.5  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1388  copper resistance protein CopC  26.17 
 
 		 132 aa  43.9  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1122  copper resistance protein CopC  31.07 
 
 		 607 aa  43.1  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.747822 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1501  copper resistance protein CopC  32.8 
 
 		 172 aa  43.1  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.456265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2633  copper resistance protein CopC  29.58 
 
 		 613 aa  43.5  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2223  copper resistance protein CopC  28.57 
 
 		 122 aa  42.7  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.213465 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5008  copper resistance protein CopC  27.43 
 
 		 513 aa  42.7  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6289  copper resistance protein CopC  25.86 
 
 		 124 aa  42.7  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.202962 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2054  copper resistance protein CopC  62.5 
 
 		 193 aa  42  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00250469  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0652  putative copper resistance protein, CopC  27.27 
 
 		 125 aa  42  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.369582  normal  0.652987 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2173  copper resistance protein CopC  33.71 
 
 		 130 aa  42  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1500  copper resistance protein CopC  27.59 
 
 		 590 aa  42  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2762  copper resistance protein CopC  27.84 
 
 		 126 aa  41.6  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2198  copper resistance D  28.16 
 
 		 519 aa  41.6  0.009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6114  copper resistance protein CopC  31.78 
 
 		 132 aa  41.6  0.01  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00881614  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>