More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_2278 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_2278  OmpA/MotB domain-containing protein  100 
 
 		 264 aa  526  1e-149  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000182136  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2411  OmpA/MotB domain-containing protein  98.86 
 
 		 264 aa  523  1e-147  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00660043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2201  OmpA/MotB domain-containing protein  99.24 
 
 		 264 aa  523  1e-147  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.203533  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2194  OmpA family protein  79.55 
 
 		 269 aa  358  5e-98  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1876  OmpA/MotB domain-containing protein  70.61 
 
 		 276 aa  325  5e-88  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0190834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1828  OmpA/MotB domain-containing protein  70.25 
 
 		 276 aa  324  9e-88  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.124445  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1842  OmpA/MotB domain-containing protein  70.25 
 
 		 276 aa  323  2e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2449  OmpA/MotB domain protein  69.89 
 
 		 276 aa  321  6e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000186851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2517  OmpA/MotB domain-containing protein  46.21 
 
 		 249 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0742352  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1624  OmpA/MotB domain-containing protein  45.91 
 
 		 255 aa  211  1e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0548574  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2493  OmpA/MotB domain-containing protein  46 
 
 		 245 aa  209  4e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00791352  normal  0.694387 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2004  OmpA family protein  49.07 
 
 		 240 aa  207  1e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.200966 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1792  OmpA/MotB domain-containing protein  43.35 
 
 		 251 aa  204  1e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00059964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2123  OmpA/MotB domain-containing protein  44.02 
 
 		 238 aa  198  9e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0746803  normal  0.0463791 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3984  ompA family protein  34.86 
 
 		 278 aa  116  5e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.25861  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3921  OmpA/MotB  35.53 
 
 		 274 aa  104  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.36471  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2570  OmpA family protein  30.87 
 
 		 230 aa  95.1  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0120  OmpA/MotB domain protein  36.79 
 
 		 218 aa  80.5  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2617  OmpA family protein  30.32 
 
 		 225 aa  77  0.0000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.19379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3735  outer membrane protein  37.5 
 
 		 670 aa  76.6  0.0000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04077  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)protein  29.35 
 
 		 205 aa  76.3  0.0000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0753  outer membrane protein, OmpA family  35.65 
 
 		 222 aa  76.3  0.0000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1811  OmpA/MotB domain-containing protein  33.57 
 
 		 322 aa  75.5  0.0000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000000728339  normal  0.835393 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0753  OmpA domain-containing protein  33.62 
 
 		 464 aa  75.5  0.0000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.767935 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  31.47 
 
 		 296 aa  74.3  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1204  OmpA family protein  31.58 
 
 		 220 aa  74.7  0.000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5270  OmpA/MotB domain protein  28.45 
 
 		 464 aa  74.7  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3650  OmpA/MotB domain-containing protein  31.9 
 
 		 222 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1167  OmpA family protein  31.58 
 
 		 243 aa  74.3  0.000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.146962  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3363  OmpA/MotB domain-containing protein  31.82 
 
 		 261 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1995  OmpA/MotB domain-containing protein  34.31 
 
 		 388 aa  73.2  0.000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000205838  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2769  OmpA/MotB domain protein  36 
 
 		 215 aa  73.2  0.000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4115  OmpA/MotB domain-containing protein  31.03 
 
 		 262 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2821  OmpA/MotB domain-containing protein  33.33 
 
 		 236 aa  71.6  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.700022  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0631  OmpA/MotB  28.14 
 
 		 463 aa  71.6  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1016  OmpA/MotB domain protein  33.33 
 
 		 217 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000464743  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1502  OmpA/MotB domain protein  32.39 
 
 		 263 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0641332  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3134  OmpA/MotB  36.7 
 
 		 357 aa  71.2  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.08024  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1107  OmpA/MotB domain-containing protein  30.29 
 
 		 263 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3482  OmpA/MotB family outer membrane protein  33.33 
 
 		 217 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000110424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4652  OmpA/MotB domain-containing protein  28.08 
 
 		 217 aa  70.5  0.00000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1066  OmpA/MotB  32.33 
 
 		 264 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.207381 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4220  OmpA/MotB domain-containing protein  32.39 
 
 		 263 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.956448  normal  0.667838 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003729  outer membrane protein  33.05 
 
 		 222 aa  70.5  0.00000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.113552  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4257  OmpA/MotB  29.03 
 
 		 215 aa  70.1  0.00000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0772  OmpA/MotB  28.45 
 
 		 464 aa  69.7  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.226683 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1985  OmpA/MotB domain-containing protein  29.73 
 
 		 221 aa  69.7  0.00000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3975  OmpA/MotB domain protein  36.27 
 
 		 1026 aa  69.7  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0116692  normal  0.107099 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1164  ompA family protein  31.25 
 
 		 229 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.867796  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  27.54 
 
 		 537 aa  68.2  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2322  OmpA/MotB domain-containing protein  31.16 
 
 		 222 aa  67.4  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0351877 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0181  OmpA/MotB domain-containing protein  27.69 
 
 		 224 aa  67.4  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.235186 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0763  OmpA/MotB domain-containing protein  36.63 
 
 		 189 aa  67.4  0.0000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000067511  unclonable  1.30394e-19 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2436  outer membrane protein  30.28 
 
 		 320 aa  67.8  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3536  outer membrane protein  32.35 
 
 		 505 aa  67.8  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.624164 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41140  OmpA family protein  30.36 
 
 		 222 aa  67  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2141  outer membrane protein  32.08 
 
 		 510 aa  67  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.496848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2677  outer membrane protein  33.33 
 
 		 380 aa  67.4  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1005  OmpA/MotB  31.25 
 
 		 229 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.558785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1151  OmpA/MotB domain-containing protein  29.41 
 
 		 182 aa  66.6  0.0000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0745121  normal  0.85361 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0884  OmpA/MotB  27.59 
 
 		 464 aa  66.2  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.138624  normal  0.799439 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5036  ompA family protein  33.02 
 
 		 222 aa  66.2  0.0000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  31.82 
 
 		 240 aa  66.2  0.0000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3652  ompA family protein  29.14 
 
 		 310 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0672699  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3635  OmpA family domain-containing protein  29.14 
 
 		 310 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.837065  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3627  ompA family protein  29.14 
 
 		 310 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.574456  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53500  hypothetical protein  28.57 
 
 		 237 aa  65.9  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00118983 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2828  OmpA domain-containing protein  29.14 
 
 		 310 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4927  OmpA/MotB  27.59 
 
 		 464 aa  65.9  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.989181  normal  0.828832 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4687  hypothetical protein  28.57 
 
 		 237 aa  65.9  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.427745  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3149  ompA family protein  29.14 
 
 		 310 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0052  ompA family protein  29.14 
 
 		 310 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.757478  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1715  ompA family protein  29.14 
 
 		 310 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.706939  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1666  OmpA/MotB  27.97 
 
 		 214 aa  65.5  0.0000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.69899 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0163  OmpA/MotB domain protein  28.35 
 
 		 223 aa  65.5  0.0000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0606  OmpA/MotB domain-containing protein  33.64 
 
 		 227 aa  65.5  0.0000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0759282 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4333  porin  30.63 
 
 		 221 aa  65.5  0.0000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1275  OmpA/MotB domain protein  25 
 
 		 227 aa  65.1  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0265448  normal  0.247655 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1599  outer membrane fibronectin-binding protein  35.29 
 
 		 333 aa  65.1  0.000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  unclonable  0.00000000197596  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02060  hypothetical protein  36.36 
 
 		 219 aa  65.1  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0127  outer membrane protein  33.9 
 
 		 415 aa  65.1  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.017735  normal  0.0709429 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0815  putative lipoprotein  27.72 
 
 		 223 aa  65.1  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3825  OmpA/MotB domain-containing protein  27.07 
 
 		 729 aa  65.1  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.263673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1229  putative outer membrane protein  32.48 
 
 		 212 aa  65.1  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000815007  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3096  OmpA family protein  33.96 
 
 		 222 aa  65.1  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.625816  normal  0.135451 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  35.04 
 
 		 230 aa  65.1  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4921  OmpA/MotB domain protein  27.81 
 
 		 320 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.730269  normal  0.0282337 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2909  OmpA/MotB domain-containing protein  29.14 
 
 		 316 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1805  OmpA/OmpF family outer membrane protein  30.17 
 
 		 217 aa  64.3  0.000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16630  putative outer membrane protein, OmpA  29.87 
 
 		 261 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0638477  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0127  OmpA/MotB domain protein  34.62 
 
 		 364 aa  63.9  0.000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1446  outer membrane protein  29.87 
 
 		 261 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2166  outer membrane protein  29.82 
 
 		 224 aa  63.9  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000706819  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2956  OmpA domain-containing protein  28.48 
 
 		 311 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2146  OmpA/MotB domain-containing protein  29.63 
 
 		 218 aa  64.3  0.000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.47635  normal  0.386424 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3309  OmpA/MotB  32.43 
 
 		 226 aa  64.3  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2542  OmpA/MotB domain protein  34.48 
 
 		 704 aa  64.3  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0186796 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0217  outer membrane protein, porin F precursor  34.29 
 
 		 669 aa  64.7  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.440167 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1585  OmpA family outer membrane protein  28.37 
 
 		 517 aa  64.3  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.167386  normal  0.202036 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2341  hypothetical protein  27.09 
 
 		 225 aa  63.9  0.000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.616476  normal  0.556458 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>