126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1495 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_1495  TadE family protein  100 
 
 
160 aa  319  9.000000000000001e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0542  TadE family protein  37.93 
 
 
157 aa  95.1  3e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0422176  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1165  TadE family protein  39.04 
 
 
143 aa  94.7  4e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0463265  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1749  Flp pilus assembly protein TadG  40.52 
 
 
151 aa  85.9  2e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3935  TadE family protein  36.3 
 
 
142 aa  84.7  5e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0926444  normal  0.0826596 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3428  TadE family protein  36.3 
 
 
142 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.059057  normal  0.388912 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5858  TadE family protein  39.47 
 
 
153 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0252169  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1164  TadE family protein  34.75 
 
 
135 aa  80.5  0.000000000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.167453  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2050  TadE-like protein  35.37 
 
 
142 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0057795  normal  0.0460537 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2452  hypothetical protein  35.37 
 
 
142 aa  77.8  0.00000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2049  hypothetical protein  34.93 
 
 
142 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0163426  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1673  hypothetical protein  34.93 
 
 
142 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0329  TadE-like protein  34.93 
 
 
142 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.455203  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1880  TadE family protein  34.93 
 
 
142 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.717439  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1892  TadE family protein  34.93 
 
 
142 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0832  hypothetical protein  34.93 
 
 
142 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.384957  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0798  hypothetical protein  32.34 
 
 
156 aa  68.2  0.00000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0658  hypothetical protein  53.7 
 
 
140 aa  65.5  0.0000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0921771 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0649  putative transmembrane protein  36.03 
 
 
144 aa  63.9  0.0000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.695052  normal  0.246018 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3005  TadE family protein  44.12 
 
 
140 aa  62.4  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3970  TadE family protein  41.89 
 
 
134 aa  61.6  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.043722  normal  0.677829 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0607  TadE-like  32.59 
 
 
140 aa  58.5  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0129695  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2320  TadE family protein  33.99 
 
 
144 aa  56.6  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2112  TadE family protein  29.87 
 
 
137 aa  55.8  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4440  TadE family protein  31.03 
 
 
126 aa  55.1  0.0000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0344205 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3426  TadE family protein  32.89 
 
 
132 aa  55.1  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0764833  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1734  TadE family protein  33.33 
 
 
167 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0104166  hitchhiker  0.0000124491 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2917  TadE family protein  43.86 
 
 
136 aa  54.3  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.354094  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5407  TadE-like  35.2 
 
 
154 aa  53.9  0.0000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2544  hypothetical protein  44.64 
 
 
155 aa  53.9  0.0000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.307641  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1939  hypothetical protein  44.64 
 
 
155 aa  53.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0225925  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2356  TadE-like  32.24 
 
 
145 aa  53.5  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2829  TadE-like  50 
 
 
136 aa  53.1  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.891584  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1780  TadE family protein  44.64 
 
 
155 aa  53.5  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0115  hypothetical protein  44.64 
 
 
155 aa  53.5  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.583483  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1766  TadE family protein  44.64 
 
 
155 aa  53.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.586094  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1787  TadE family protein  44.64 
 
 
155 aa  53.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.972115  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1050  TadE family protein  44.64 
 
 
155 aa  53.5  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.10258  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2051  TadE family protein  41.82 
 
 
138 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2369  hypothetical protein  27.91 
 
 
163 aa  52  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00453138  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1023  TadE family protein  28.67 
 
 
135 aa  52  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5124  TadE family protein  35.43 
 
 
141 aa  52  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0349202 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1401  TadE family protein  31.03 
 
 
156 aa  51.6  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0415098  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1441  TadE family protein  41.82 
 
 
168 aa  52  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.810829  normal  0.348575 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1644  TadE-like protein  29.25 
 
 
160 aa  51.2  0.000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000291587  normal  0.422269 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2732  TadE family protein  32.32 
 
 
162 aa  51.2  0.000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4659  Flp pilus assembly protein TadG  42.86 
 
 
164 aa  50.8  0.000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000790558  hitchhiker  0.00303362 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0138  TadE family protein  51.02 
 
 
135 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4196  TadE family protein  31.74 
 
 
177 aa  48.9  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.394929  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2653  TadE-like  41.51 
 
 
148 aa  48.5  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2800  putative transmembrane protein  42 
 
 
165 aa  48.1  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.338207 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1039  TadE-like  44.23 
 
 
164 aa  48.5  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000150805  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5495  TadE-like  27.67 
 
 
177 aa  48.5  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0437869  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1519  TadE family protein  44.23 
 
 
164 aa  48.5  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000188684  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6781  TadE family protein  27.67 
 
 
177 aa  48.5  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0179995  normal  0.123574 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1495  TadE family protein  44.23 
 
 
164 aa  48.5  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000514648  hitchhiker  0.0000117146 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5494  TadE-like  43.1 
 
 
147 aa  48.1  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0094498  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6780  TadE family protein  43.1 
 
 
147 aa  48.1  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0136653  normal  0.216151 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2368  hypothetical protein  43.14 
 
 
152 aa  48.1  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.274749  normal  0.12275 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6368  TadE family protein  43.1 
 
 
147 aa  48.1  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.455628  normal  0.902056 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6369  TadE family protein  27.67 
 
 
177 aa  48.1  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.944894 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0585  TadE family protein  37.74 
 
 
148 aa  48.1  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.786226 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0797  TadE-like  40.38 
 
 
147 aa  47.8  0.00006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.160626  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7197  TadE-like protein  39.71 
 
 
147 aa  47.8  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0163564  normal  0.273639 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6295  TadE family protein  28.3 
 
 
177 aa  47  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2929  TadE family protein  47.73 
 
 
129 aa  46.6  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.197954  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2979  TadE family protein  35.35 
 
 
185 aa  47  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.565084  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2635  TadE family protein  40.74 
 
 
148 aa  47  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.857387 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5999  TadE family protein  28.3 
 
 
177 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.835378  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0306  Flp pilus assembly protein TadG  29.09 
 
 
186 aa  45.8  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2271  hypothetical protein  39.62 
 
 
180 aa  46.2  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.58997  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3515  TadE-like  45.76 
 
 
181 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2705  TadE family protein  40.74 
 
 
154 aa  45.8  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3944  TadE family protein  45.65 
 
 
170 aa  45.8  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000125282  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1651  TadE family protein  40 
 
 
165 aa  46.2  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.257032  normal  0.635162 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1789  TadE-like  41.54 
 
 
181 aa  45.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.513248 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3652  putative tight adherence (TadE/G) protein  42.31 
 
 
153 aa  45.8  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4120  TadE family protein  39.29 
 
 
145 aa  45.8  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2479  TadE family protein  25.5 
 
 
132 aa  45.8  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000134172 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1313  hypothetical protein  40.82 
 
 
722 aa  45.1  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2369  hypothetical protein  43.48 
 
 
165 aa  45.1  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.266179  normal  0.186835 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2328  TadE family protein  29.73 
 
 
165 aa  45.1  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2707  hypothetical protein  29.73 
 
 
161 aa  45.1  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0242246  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7198  TadE-like protein  29.63 
 
 
177 aa  44.7  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0214815  normal  0.436422 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2064  TadE family protein  34.44 
 
 
180 aa  44.7  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.221684  normal  0.769574 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1856  TadE family protein  36.36 
 
 
138 aa  44.7  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0164908  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0396  TadE-like  42.59 
 
 
189 aa  44.3  0.0006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.385276  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6296  TadE family protein  39.66 
 
 
147 aa  44.7  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1024  TadE family protein  32.47 
 
 
145 aa  44.7  0.0006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2319  TadE family protein  33.67 
 
 
158 aa  44.7  0.0006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.208671 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2272  hypothetical protein  40.35 
 
 
153 aa  44.3  0.0007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.292747  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4138  TadE family protein  29.35 
 
 
143 aa  44.3  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1314  hypothetical protein  40.35 
 
 
153 aa  43.9  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0638  TadE-like  27.61 
 
 
146 aa  44.3  0.0008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3088  TadE family protein  40.82 
 
 
180 aa  44.3  0.0008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3089  TadE-like protein  40.35 
 
 
153 aa  44.3  0.0008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2964  TadE-like protein  40.35 
 
 
153 aa  43.9  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4700  TadE family protein  25 
 
 
128 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0721548  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1525  hypothetical protein  40.74 
 
 
174 aa  44.3  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.815078 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3707  TadE-like  38.3 
 
 
176 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>