More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_1457 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008345  Sfri_1457  OmpA/MotB domain-containing protein  100 
 
 
289 aa  608  1e-173  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.298949  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2539  OmpA/MotB domain-containing protein  73.7 
 
 
290 aa  468  1e-131  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  5.3368e-07  normal  0.84389 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2374  OmpA/MotB domain-containing protein  72.66 
 
 
290 aa  461  1e-129  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  8.19929e-09  normal  0.351915 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2446  OmpA/MotB domain-containing protein  73.01 
 
 
290 aa  462  1e-129  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  1.91416e-06  normal  0.274146 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1779  OmpA/MotB domain-containing protein  73.01 
 
 
289 aa  459  1e-128  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  1.49804e-07  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2544  OmpA/MotB domain protein  73.01 
 
 
289 aa  459  1e-128  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  3.20218e-09  hitchhiker  1.31905e-07 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1601  OmpA/MotB domain-containing protein  71.97 
 
 
289 aa  458  1e-128  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  1.9607e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1736  OmpA/MotB domain-containing protein  73.01 
 
 
289 aa  459  1e-128  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  2.67219e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1740  OmpA/MotB domain-containing protein  73.01 
 
 
289 aa  459  1e-128  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  2.40538e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1398  OmpA/MotB  70.24 
 
 
289 aa  458  1e-128  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000824208  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1521  OmpA/MotB domain-containing protein  69.18 
 
 
286 aa  425  1e-118  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.227378  normal  0.710419 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1851  OmpA/MotB domain-containing protein  65.74 
 
 
297 aa  421  1e-117  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  1.46772e-07  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2092  OmpA/MotB  68.17 
 
 
289 aa  414  1e-115  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  1.4464e-08  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2738  OmpA/MotB domain-containing protein  66.44 
 
 
289 aa  416  1e-115  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00376202  hitchhiker  0.000469935 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2570  OmpA/MotB domain-containing protein  67.52 
 
 
289 aa  408  1e-113  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  1.24837e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3471  sodium-type flagellar protein MotY  48.78 
 
 
291 aa  301  8e-81  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02741  sodium-type flagellar protein MotY  47.54 
 
 
290 aa  297  1e-79  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1400  OmpA/MotB  45.1 
 
 
287 aa  286  2e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000117865  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002940  sodium-type flagellar protein MotY precursor  41.64 
 
 
293 aa  239  4e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  8.66037e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02990  hypothetical protein  42.2 
 
 
293 aa  238  1e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0529  sodium-type flagellar protein MotY  40.86 
 
 
294 aa  236  5e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  7.08227e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1863  sodium-type flagellar protein MotY precursor  41.03 
 
 
292 aa  232  5e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2753.2  sodium-type flagellar protein MotY  76.03 
 
 
122 aa  205  8e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1532  OmpA/MotB domain-containing protein  34.02 
 
 
296 aa  164  1e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.975631  normal  0.253081 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1621  outer membrane protein  29.41 
 
 
321 aa  138  1e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0517761  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18720  OmpA family membrane protein  28.68 
 
 
321 aa  136  3e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.746177  normal  0.130207 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2504  OmpA/MotB domain-containing protein  30.31 
 
 
309 aa  133  4e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3034  hypothetical protein  28.22 
 
 
294 aa  132  8e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2427  putative outer membrane protein  32.65 
 
 
322 aa  130  3e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.831688 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1393  OmpA/MotB domain-containing protein  27.78 
 
 
315 aa  130  3e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.567288 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2892  hypothetical protein  27.53 
 
 
294 aa  128  1e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3893  OmpA/MotB  27.46 
 
 
300 aa  117  2e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.369181 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4518  OmpA/MotB  28.84 
 
 
302 aa  114  2e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00739094 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4156  sodium-type flagellar protein MotY, putative  28.69 
 
 
301 aa  110  3e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.37097  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1128  OmpA/MotB domain-containing protein  26.5 
 
 
313 aa  109  6e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1087  OmpA family outer membrane protein  26.5 
 
 
317 aa  108  9e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.763305  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4325  OmpA/MotB domain-containing protein  27.11 
 
 
308 aa  105  7e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1116  OmpA/MotB domain-containing protein  27.21 
 
 
324 aa  105  8e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0080  hypothetical protein  27.4 
 
 
304 aa  97.4  3e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.580583  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001183  putative sodium-type flagellar protein MotY precursor  26.41 
 
 
339 aa  94  3e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3567  OmpA/MotB domain-containing protein  27.51 
 
 
295 aa  89.7  5e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0086  OmpA/MotB domain-containing protein  25.78 
 
 
303 aa  88.2  1e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2453  sodium-type flagellar protein MotY, putative  23.08 
 
 
280 aa  79.7  5e-14  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.230815  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1455  OmpA/MotB domain-containing protein  23.56 
 
 
324 aa  77.8  2e-13  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.935476  normal  0.139769 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04970  hypothetical protein  23.96 
 
 
350 aa  73.9  3e-12  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16630  putative outer membrane protein, OmpA  38.3 
 
 
261 aa  72.4  8e-12  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0638477  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1446  outer membrane protein  38.3 
 
 
261 aa  72.4  8e-12  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1561  OmpA family outer membrane protein  42.11 
 
 
641 aa  71.2  2e-11  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.322672  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0019  OmpA/MotB domain-containing protein  33.96 
 
 
510 aa  69.7  5e-11  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0746655  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3744  OmpA/MotB domain protein  34.13 
 
 
679 aa  70.1  5e-11  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000811796  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2789  OmpA/MotB domain-containing protein  44.16 
 
 
210 aa  68.6  1e-10  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  2.6968e-08  hitchhiker  0.00127263 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01273  hypothetical protein  40.66 
 
 
318 aa  68.6  1e-10  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3747  OmpA/MotB family outer membrane protein  34.31 
 
 
542 aa  68.2  1e-10  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598443  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0815  putative lipoprotein  36.94 
 
 
223 aa  67.8  2e-10  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000499  outer membrane protein A precursor  40.21 
 
 
330 aa  68.2  2e-10  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  4.10155e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1578  OmpA/MotB  45.12 
 
 
363 aa  67.8  2e-10  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  1.10923e-09  unclonable  2.19993e-07 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06262  hypothetical protein  40.21 
 
 
334 aa  68.2  2e-10  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1796  OmpA/MotB  42.86 
 
 
214 aa  67.8  2e-10  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0221039  unclonable  3.03101e-06 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  36.79 
 
 
294 aa  67.8  2e-10  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1196  OmpA/MotB domain-containing protein  34.69 
 
 
459 aa  67  3e-10  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0746  V-type H(+)-translocating pyrophosphatase  35.78 
 
 
890 aa  67  3e-10  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.34227  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0995  OmpA/MotB domain protein  41.38 
 
 
229 aa  66.6  4e-10  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0151074  decreased coverage  7.93596e-05 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3118  OmpA/MotB domain-containing protein  41.56 
 
 
242 aa  66.2  5e-10  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0113937 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0924  OmpA/MotB domain-containing protein  47.83 
 
 
356 aa  66.2  5e-10  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1325  hypothetical protein  32.99 
 
 
656 aa  66.6  5e-10  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.532479 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003729  outer membrane protein  40.23 
 
 
222 aa  66.2  6e-10  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.113552  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1489  OmpA/MotB domain protein  46.48 
 
 
229 aa  66.2  6e-10  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00664745  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1999  OmpA/MotB  35.96 
 
 
271 aa  66.2  6e-10  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.411511  normal  0.0868919 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1570  OmpA/MotB domain-containing protein  33.33 
 
 
498 aa  66.2  6e-10  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00583575 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4073  OmpA/MotB domain-containing protein  36.54 
 
 
319 aa  65.9  7e-10  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.68736  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4718  OmpA/MotB domain-containing protein  43.24 
 
 
219 aa  65.9  7e-10  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.790715 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  37.76 
 
 
296 aa  65.9  8e-10  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3804  OmpA/MotB domain protein  32.35 
 
 
543 aa  65.9  8e-10  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48650  OmpA/MotB family protein  35.96 
 
 
261 aa  65.1  1e-09  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0244  outer membrane protein  33.9 
 
 
331 aa  65.5  1e-09  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.930623 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3888  OmpA/MotB domain protein  35.16 
 
 
544 aa  65.1  1e-09  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.457406  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0163  OmpA/MotB domain protein  38.64 
 
 
223 aa  65.5  1e-09  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1157  OmpA/MotB domain-containing protein  35.51 
 
 
230 aa  65.5  1e-09  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.239161  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1397  OmpA/MotB domain protein  42.67 
 
 
218 aa  65.1  1e-09  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1121  OmpA/MotB domain protein  35.51 
 
 
230 aa  65.5  1e-09  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.372182  hitchhiker  5.54839e-06 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2463  OmpA/MotB domain-containing protein  42.67 
 
 
218 aa  65.1  1e-09  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.249955 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4295  OmpA/MotB domain-containing protein  35.51 
 
 
230 aa  65.1  1e-09  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.331314  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1671  OmpA/MotB domain-containing protein  33.98 
 
 
229 aa  64.3  2e-09  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  39.58 
 
 
321 aa  64.7  2e-09  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3279  OmpA/MotB domain-containing protein  41.89 
 
 
219 aa  64.7  2e-09  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.209932  normal  0.606856 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1621  OmpA/MotB domain protein  40.26 
 
 
217 aa  64.7  2e-09  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1122  OmpA/MotB domain protein  38.14 
 
 
264 aa  64.7  2e-09  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0205488  hitchhiker  5.60377e-06 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0310  Type I secretion outer membrane protein, TolC  43.42 
 
 
607 aa  64.3  2e-09  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120997  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1638  OmpA/MotB domain protein  37.25 
 
 
229 aa  64.3  2e-09  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1599  outer membrane fibronectin-binding protein  35.85 
 
 
333 aa  64.3  2e-09  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  unclonable  1.97596e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3984  ompA family protein  32.71 
 
 
278 aa  64.3  2e-09  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.25861  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4113  OmpA/MotB  35.96 
 
 
270 aa  64.3  2e-09  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.264738 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1338  OmpA family protein  34.31 
 
 
229 aa  63.9  3e-09  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3363  OmpA/MotB domain-containing protein  33.33 
 
 
261 aa  63.9  3e-09  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004183  outer membrane protein A precursor  37.36 
 
 
320 aa  63.9  3e-09  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1731  OmpA/MotB domain protein  38.64 
 
 
623 aa  63.9  3e-09  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134193  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2546  OmpA/MotB domain-containing protein  37.23 
 
 
209 aa  63.2  4e-09  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.031779 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0913  outer membrane fibronectin-binding protein  38.37 
 
 
337 aa  63.5  4e-09  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1782  OmpA/MotB domain-containing protein  35.92 
 
 
288 aa  63.5  4e-09  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  1.33592e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2166  outer membrane protein  32.52 
 
 
224 aa  63.5  4e-09  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  7.06819e-09  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>