More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_1457 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_1457  OmpA/MotB domain-containing protein  100 
 
 		 289 aa  608  1e-173  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.298949  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2539  OmpA/MotB domain-containing protein  73.7 
 
 		 290 aa  468  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000053368  normal  0.84389 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2374  OmpA/MotB domain-containing protein  72.66 
 
 		 290 aa  461  1e-129  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000819929  normal  0.351915 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2446  OmpA/MotB domain-containing protein  73.01 
 
 		 290 aa  462  1e-129  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000191416  normal  0.274146 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1779  OmpA/MotB domain-containing protein  73.01 
 
 		 289 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000149804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1601  OmpA/MotB domain-containing protein  71.97 
 
 		 289 aa  458  9.999999999999999e-129  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000019607  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1398  OmpA/MotB  70.24 
 
 		 289 aa  458  9.999999999999999e-129  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000824208  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2544  OmpA/MotB domain protein  73.01 
 
 		 289 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000320218  hitchhiker  0.000000131905 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1736  OmpA/MotB domain-containing protein  73.01 
 
 		 289 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000267219  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1740  OmpA/MotB domain-containing protein  73.01 
 
 		 289 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000240538  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1521  OmpA/MotB domain-containing protein  69.18 
 
 		 286 aa  425  1e-118  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.227378  normal  0.710419 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1851  OmpA/MotB domain-containing protein  65.74 
 
 		 297 aa  421  1e-117  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000146772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2738  OmpA/MotB domain-containing protein  66.44 
 
 		 289 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00376202  hitchhiker  0.000469935 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2092  OmpA/MotB  68.17 
 
 		 289 aa  414  9.999999999999999e-116  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000014464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2570  OmpA/MotB domain-containing protein  67.52 
 
 		 289 aa  408  1e-113  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000124837  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3471  sodium-type flagellar protein MotY  48.78 
 
 		 291 aa  301  8.000000000000001e-81  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02741  sodium-type flagellar protein MotY  47.54 
 
 		 290 aa  297  1e-79  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1400  OmpA/MotB  45.1 
 
 		 287 aa  286  2e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000117865  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002940  sodium-type flagellar protein MotY precursor  41.64 
 
 		 293 aa  239  4e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000866037  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02990  hypothetical protein  42.2 
 
 		 293 aa  238  1e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0529  sodium-type flagellar protein MotY  40.86 
 
 		 294 aa  236  5.0000000000000005e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000708227  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1863  sodium-type flagellar protein MotY precursor  41.03 
 
 		 292 aa  232  5e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2753.2  sodium-type flagellar protein MotY  76.03 
 
 		 122 aa  205  8e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1532  OmpA/MotB domain-containing protein  34.02 
 
 		 296 aa  164  1.0000000000000001e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.975631  normal  0.253081 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1621  outer membrane protein  29.41 
 
 		 321 aa  138  1e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0517761  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18720  OmpA family membrane protein  28.68 
 
 		 321 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.746177  normal  0.130207 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2504  OmpA/MotB domain-containing protein  30.31 
 
 		 309 aa  133  3.9999999999999996e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3034  hypothetical protein  28.22 
 
 		 294 aa  132  7.999999999999999e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2427  putative outer membrane protein  32.65 
 
 		 322 aa  130  3e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.831688 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1393  OmpA/MotB domain-containing protein  27.78 
 
 		 315 aa  130  3e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.567288 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2892  hypothetical protein  27.53 
 
 		 294 aa  128  1.0000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3893  OmpA/MotB  27.46 
 
 		 300 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.369181 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4518  OmpA/MotB  28.84 
 
 		 302 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00739094 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4156  sodium-type flagellar protein MotY, putative  28.69 
 
 		 301 aa  110  3e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.37097  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1128  OmpA/MotB domain-containing protein  26.5 
 
 		 313 aa  109  6e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1087  OmpA family outer membrane protein  26.5 
 
 		 317 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.763305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4325  OmpA/MotB domain-containing protein  27.11 
 
 		 308 aa  105  7e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1116  OmpA/MotB domain-containing protein  27.21 
 
 		 324 aa  105  8e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0080  hypothetical protein  27.4 
 
 		 304 aa  97.4  3e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.580583  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001183  putative sodium-type flagellar protein MotY precursor  26.41 
 
 		 339 aa  94  3e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3567  OmpA/MotB domain-containing protein  27.51 
 
 		 295 aa  89.7  5e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0086  OmpA/MotB domain-containing protein  25.78 
 
 		 303 aa  88.2  1e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2453  sodium-type flagellar protein MotY, putative  23.08 
 
 		 280 aa  79.7  0.00000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.230815  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1455  OmpA/MotB domain-containing protein  23.56 
 
 		 324 aa  77.8  0.0000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.935476  normal  0.139769 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04970  hypothetical protein  23.96 
 
 		 350 aa  73.9  0.000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1446  outer membrane protein  38.3 
 
 		 261 aa  72.4  0.000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16630  putative outer membrane protein, OmpA  38.3 
 
 		 261 aa  72.4  0.000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0638477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1561  OmpA family outer membrane protein  42.11 
 
 		 641 aa  71.2  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.322672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0019  OmpA/MotB domain-containing protein  33.96 
 
 		 510 aa  69.7  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0746655  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3744  OmpA/MotB domain protein  34.13 
 
 		 679 aa  70.1  0.00000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000811796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01273  hypothetical protein  40.66 
 
 		 318 aa  68.6  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2789  OmpA/MotB domain-containing protein  44.16 
 
 		 210 aa  68.6  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.000000026968  hitchhiker  0.00127263 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3747  OmpA/MotB family outer membrane protein  34.31 
 
 		 542 aa  68.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598443  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06262  hypothetical protein  40.21 
 
 		 334 aa  68.2  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1578  OmpA/MotB  45.12 
 
 		 363 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.00000000110923  unclonable  0.000000219993 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1796  OmpA/MotB  42.86 
 
 		 214 aa  67.8  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0221039  unclonable  0.00000303101 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000499  outer membrane protein A precursor  40.21 
 
 		 330 aa  68.2  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000000410155  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  36.79 
 
 		 294 aa  67.8  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0815  putative lipoprotein  36.94 
 
 		 223 aa  67.8  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0746  V-type H(+)-translocating pyrophosphatase  35.78 
 
 		 890 aa  67  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.34227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1196  OmpA/MotB domain-containing protein  34.69 
 
 		 459 aa  67  0.0000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0995  OmpA/MotB domain protein  41.38 
 
 		 229 aa  66.6  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0151074  decreased coverage  0.0000793596 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1325  hypothetical protein  32.99 
 
 		 656 aa  66.6  0.0000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.532479 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3118  OmpA/MotB domain-containing protein  41.56 
 
 		 242 aa  66.2  0.0000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0113937 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0924  OmpA/MotB domain-containing protein  47.83 
 
 		 356 aa  66.2  0.0000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1570  OmpA/MotB domain-containing protein  33.33 
 
 		 498 aa  66.2  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00583575 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1999  OmpA/MotB  35.96 
 
 		 271 aa  66.2  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.411511  normal  0.0868919 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1489  OmpA/MotB domain protein  46.48 
 
 		 229 aa  66.2  0.0000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00664745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003729  outer membrane protein  40.23 
 
 		 222 aa  66.2  0.0000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.113552  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4718  OmpA/MotB domain-containing protein  43.24 
 
 		 219 aa  65.9  0.0000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790715 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4073  OmpA/MotB domain-containing protein  36.54 
 
 		 319 aa  65.9  0.0000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.68736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  37.76 
 
 		 296 aa  65.9  0.0000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3804  OmpA/MotB domain protein  32.35 
 
 		 543 aa  65.9  0.0000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1121  OmpA/MotB domain protein  35.51 
 
 		 230 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.372182  hitchhiker  0.00000554839 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0163  OmpA/MotB domain protein  38.64 
 
 		 223 aa  65.5  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0244  outer membrane protein  33.9 
 
 		 331 aa  65.5  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.930623 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2463  OmpA/MotB domain-containing protein  42.67 
 
 		 218 aa  65.1  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.249955 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4295  OmpA/MotB domain-containing protein  35.51 
 
 		 230 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.331314  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1397  OmpA/MotB domain protein  42.67 
 
 		 218 aa  65.1  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1157  OmpA/MotB domain-containing protein  35.51 
 
 		 230 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.239161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3888  OmpA/MotB domain protein  35.16 
 
 		 544 aa  65.1  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.457406  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48650  OmpA/MotB family protein  35.96 
 
 		 261 aa  65.1  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1122  OmpA/MotB domain protein  38.14 
 
 		 264 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0205488  hitchhiker  0.00000560377 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3984  ompA family protein  32.71 
 
 		 278 aa  64.3  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.25861  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  39.58 
 
 		 321 aa  64.7  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4113  OmpA/MotB  35.96 
 
 		 270 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.264738 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1638  OmpA/MotB domain protein  37.25 
 
 		 229 aa  64.3  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0310  Type I secretion outer membrane protein, TolC  43.42 
 
 		 607 aa  64.3  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3279  OmpA/MotB domain-containing protein  41.89 
 
 		 219 aa  64.7  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.209932  normal  0.606856 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1599  outer membrane fibronectin-binding protein  35.85 
 
 		 333 aa  64.3  0.000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  unclonable  0.00000000197596  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1621  OmpA/MotB domain protein  40.26 
 
 		 217 aa  64.7  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1671  OmpA/MotB domain-containing protein  33.98 
 
 		 229 aa  64.3  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1338  OmpA family protein  34.31 
 
 		 229 aa  63.9  0.000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3363  OmpA/MotB domain-containing protein  33.33 
 
 		 261 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004183  outer membrane protein A precursor  37.36 
 
 		 320 aa  63.9  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1731  OmpA/MotB domain protein  38.64 
 
 		 623 aa  63.9  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1782  OmpA/MotB domain-containing protein  35.92 
 
 		 288 aa  63.5  0.000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000133592  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0913  outer membrane fibronectin-binding protein  38.37 
 
 		 337 aa  63.5  0.000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2546  OmpA/MotB domain-containing protein  37.23 
 
 		 209 aa  63.2  0.000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.031779 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2166  outer membrane protein  32.52 
 
 		 224 aa  63.5  0.000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000706819  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>