More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2565 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_2565  lipoprotein signal peptidase  100 
 
 		 150 aa  301  2.0000000000000002e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.958403 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3217  lipoprotein signal peptidase  56.55 
 
 		 163 aa  147  3e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2276  lipoprotein signal peptidase  53.52 
 
 		 154 aa  146  9e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5199  lipoprotein signal peptidase  52.29 
 
 		 169 aa  138  3e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.864833  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4229  lipoprotein signal peptidase  47.68 
 
 		 168 aa  138  3e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.266217  hitchhiker  0.00107188 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60360  lipoprotein signal peptidase  52.29 
 
 		 169 aa  137  4.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000409977 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0482  lipoprotein signal peptidase  51.15 
 
 		 181 aa  136  7.999999999999999e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11790  lipoprotein signal peptidase  51.66 
 
 		 167 aa  130  7.999999999999999e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4851  lipoprotein signal peptidase  52 
 
 		 170 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.589527 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2655  lipoprotein signal peptidase  49.26 
 
 		 160 aa  129  1.0000000000000001e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0496  lipoprotein signal peptidase  46.36 
 
 		 172 aa  128  3e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0268765  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1183  signal peptidase II  42.76 
 
 		 180 aa  127  4.0000000000000003e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2555  lipoprotein signal peptidase  53.57 
 
 		 169 aa  127  4.0000000000000003e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00974385 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1292  lipoprotein signal peptidase  46 
 
 		 176 aa  125  1.0000000000000001e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0954  lipoprotein signal peptidase  50.33 
 
 		 169 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.30324 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3047  signal peptidase II  50.35 
 
 		 164 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.242579  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0807  lipoprotein signal peptidase  51.32 
 
 		 173 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2722  lipoprotein signal peptidase  45.26 
 
 		 182 aa  123  7e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.214135  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0604  lipoprotein signal peptidase  52.35 
 
 		 176 aa  123  8.000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.975545  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2254  signal peptidase II  47.01 
 
 		 158 aa  123  1e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0126401  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1835  lipoprotein signal peptidase  49.26 
 
 		 157 aa  122  1e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.672257  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0853  signal peptidase II  46.85 
 
 		 155 aa  122  1e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0645  lipoprotein signal peptidase  52.35 
 
 		 171 aa  123  1e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.11552 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0711  lipoprotein signal peptidase  51.32 
 
 		 168 aa  122  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.395122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0650  lipoprotein signal peptidase  52.7 
 
 		 171 aa  122  2e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.177868 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5845  lipoprotein signal peptidase  45.65 
 
 		 166 aa  121  3e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.469794  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1100  lipoprotein signal peptidase  45.45 
 
 		 170 aa  121  3e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.955311  normal  0.240164 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0769  lipoprotein signal peptidase  47.83 
 
 		 166 aa  121  3e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63005  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2231  lipoprotein signal peptidase  44.52 
 
 		 189 aa  121  4e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1352  lipoprotein signal peptidase  44 
 
 		 235 aa  120  6e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.136242  normal  0.167028 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2659  lipoprotein signal peptidase  47.83 
 
 		 166 aa  120  7e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.261426  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2243  lipoprotein signal peptidase  47.83 
 
 		 166 aa  120  7e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.551645  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3045  lipoprotein signal peptidase  46.38 
 
 		 159 aa  120  7e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.141498 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1121  lipoprotein signal peptidase  47.83 
 
 		 166 aa  120  7e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458352  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0970  lipoprotein signal peptidase  47.83 
 
 		 166 aa  120  7e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2113  lipoprotein signal peptidase  47.83 
 
 		 166 aa  120  7e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4558  lipoprotein signal peptidase  51.35 
 
 		 171 aa  120  7e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.21418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0966  lipoprotein signal peptidase  47.83 
 
 		 166 aa  120  7e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1034  lipoprotein signal peptidase  47.83 
 
 		 166 aa  120  7e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0782  lipoprotein signal peptidase  45.65 
 
 		 166 aa  120  8e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000363425 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2459  lipoprotein signal peptidase  47.86 
 
 		 173 aa  119  9.999999999999999e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.417163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2956  lipoprotein signal peptidase  45.93 
 
 		 170 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0330316  normal  0.232232 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3038  lipoprotein signal peptidase  45.93 
 
 		 170 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0554582  normal  0.30778 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3135  lipoprotein signal peptidase  45.93 
 
 		 170 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1780  lipoprotein signal peptidase  47.14 
 
 		 178 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.316682  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2431  lipoprotein signal peptidase  44.93 
 
 		 166 aa  118  3e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.470208  hitchhiker  0.00000000640597 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1060  lipoprotein signal peptidase  43.45 
 
 		 171 aa  118  3e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.189146  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1084  lipoprotein signal peptidase  43.45 
 
 		 170 aa  117  3.9999999999999996e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2338  lipoprotein signal peptidase  45.99 
 
 		 174 aa  117  3.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.18883 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0863  lipoprotein signal peptidase  49.3 
 
 		 173 aa  117  3.9999999999999996e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0573  lipoprotein signal peptidase  47.48 
 
 		 166 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00741417 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1902  lipoprotein signal peptidase  44.93 
 
 		 166 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2538  lipoprotein signal peptidase  44.93 
 
 		 166 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.544386  hitchhiker  0.00000408677 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2560  lipoprotein signal peptidase  44.2 
 
 		 166 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2513  lipoprotein signal peptidase  44.93 
 
 		 166 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142589  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2727  lipoprotein signal peptidase  45.26 
 
 		 174 aa  117  7e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.149763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2886  lipoprotein signal peptidase  45.65 
 
 		 178 aa  117  7e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0556168  normal  0.0525619 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2889  lipoprotein signal peptidase  41.38 
 
 		 170 aa  116  9e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0332011  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1893  lipoprotein signal peptidase  46.21 
 
 		 202 aa  116  9.999999999999999e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0806  lipoprotein signal peptidase  48.2 
 
 		 172 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.699045 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3531  lipoprotein signal peptidase  43.84 
 
 		 170 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2746  lipoprotein signal peptidase  44.93 
 
 		 176 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1858  signal peptidase II  45.1 
 
 		 157 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3160  lipoprotein signal peptidase  48.2 
 
 		 172 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.366988  normal  0.0125166 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3177  lipoprotein signal peptidase  43.38 
 
 		 164 aa  115  3e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1157  lipoprotein signal peptidase  45.52 
 
 		 171 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.355443 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1055  lipoprotein signal peptidase  44.78 
 
 		 171 aa  113  7.999999999999999e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1122  lipoprotein signal peptidase  44.78 
 
 		 171 aa  113  7.999999999999999e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3234  lipoprotein signal peptidase  44.78 
 
 		 171 aa  113  7.999999999999999e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1195  lipoprotein signal peptidase  41.78 
 
 		 176 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0349853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03029  lipoprotein signal peptidase  45.52 
 
 		 182 aa  112  2.0000000000000002e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.810128  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0549  lipoprotein signal peptidase  39.04 
 
 		 170 aa  110  5e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.380101  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1267  lipoprotein signal peptidase  42.03 
 
 		 170 aa  110  8.000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.131578  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0925  lipoprotein signal peptidase  45.52 
 
 		 168 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0509  lipoprotein signal peptidase  40.69 
 
 		 163 aa  108  3e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3451  lipoprotein signal peptidase  43.26 
 
 		 169 aa  108  3e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.10093  normal  0.187541 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1459  lipoprotein signal peptidase  42.75 
 
 		 163 aa  108  3e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.419525 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3400  lipoprotein signal peptidase  42.75 
 
 		 165 aa  108  3e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.256213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2736  lipoprotein signal peptidase  40.82 
 
 		 165 aa  108  3e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.396586  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1671  lipoprotein signal peptidase  41.79 
 
 		 165 aa  107  4.0000000000000004e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3230  lipoprotein signal peptidase  47.41 
 
 		 179 aa  107  5e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0969  lipoprotein signal peptidase  39.86 
 
 		 154 aa  107  6e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1431  lipoprotein signal peptidase  43.26 
 
 		 169 aa  106  8.000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05536  lipoprotein signal peptidase  45.26 
 
 		 166 aa  106  1e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.192233  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0588  lipoprotein signal peptidase  38.26 
 
 		 168 aa  106  1e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.510976  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1000  lipoprotein signal peptidase  39.13 
 
 		 154 aa  105  2e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1741  lipoprotein signal peptidase  40.88 
 
 		 162 aa  105  2e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1814  lipoprotein signal peptidase  43.38 
 
 		 358 aa  105  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.344803 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2110  lipoprotein signal peptidase  40.85 
 
 		 167 aa  105  3e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.670579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3274  lipoprotein signal peptidase  43.85 
 
 		 171 aa  105  3e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00894133  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0789  lipoprotein signal peptidase  37.58 
 
 		 169 aa  104  5e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.56712 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3587  lipoprotein signal peptidase  37.58 
 
 		 169 aa  104  5e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3459  lipoprotein signal peptidase  37.58 
 
 		 169 aa  103  6e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0475821  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1234  lipoprotein signal peptidase  42.47 
 
 		 170 aa  103  7e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1577  lipoprotein signal peptidase  48.09 
 
 		 167 aa  103  8e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1520  lipoprotein signal peptidase  48.09 
 
 		 167 aa  103  8e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0161435  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3270  lipoprotein signal peptidase  42.58 
 
 		 173 aa  103  9e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1126  lipoprotein signal peptidase  43.42 
 
 		 174 aa  102  1e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3850  lipoprotein signal peptidase  42.54 
 
 		 164 aa  102  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.777675  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1409  lipoprotein signal peptidase  41.73 
 
 		 170 aa  101  4e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>