102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_1589 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_2510  decaheme cytochrome c  64.38 
 
 
655 aa  833    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0178218  hitchhiker  0.000666167 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2578  decaheme cytochrome c  91.38 
 
 
650 aa  1244    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00427395  decreased coverage  0.00803379 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2637  decaheme cytochrome c  52.89 
 
 
653 aa  693    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2676  decaheme cytochrome c  92.46 
 
 
650 aa  1258    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000503474  normal  0.0214929 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1208  decaheme cytochrome c  65.71 
 
 
656 aa  919    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.474569  normal  0.550051 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1589  decaheme cytochrome c  100 
 
 
650 aa  1341    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000235795  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1478  decaheme cytochrome c  64.43 
 
 
663 aa  866    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000254716  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1578  decaheme cytochrome c  99.23 
 
 
650 aa  1333    Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000205402  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1525  decaheme cytochrome c  53.95 
 
 
660 aa  653    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.100516  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1612  decaheme cytochrome c  99.08 
 
 
650 aa  1331    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0130523  normal  0.2896 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2765  decaheme cytochrome c  99.38 
 
 
650 aa  1334    Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00105295  hitchhiker  0.000000731399 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3125  decaheme cytochrome c  50.36 
 
 
667 aa  620  1e-176  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00001045  hitchhiker  0.00000606277 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2525  decaheme cytochrome c  49.71 
 
 
656 aa  604  1.0000000000000001e-171  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000837992  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1778  decaheme cytochrome c  49.42 
 
 
671 aa  585  1e-166  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2698  decaheme cytochrome c  47.05 
 
 
671 aa  543  1e-153  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0681671  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1780  decaheme cytochrome c MtrF  33.33 
 
 
639 aa  333  7.000000000000001e-90  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2674  decaheme cytochrome c MtrF  34.32 
 
 
639 aa  332  1e-89  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0899912  normal  0.105553 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2508  decaheme cytochrome c MtrF  33.75 
 
 
639 aa  324  3e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00292179  decreased coverage  0.000509076 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2576  decaheme cytochrome c MtrF  33.54 
 
 
639 aa  323  8e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.134423  decreased coverage  0.00876105 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1211  decaheme cytochrome c MtrF  34.09 
 
 
639 aa  319  1e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1614  decaheme cytochrome c MtrF  32.78 
 
 
639 aa  315  1.9999999999999998e-84  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0474266  normal  0.168927 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1580  decaheme cytochrome c MtrF  32.63 
 
 
639 aa  314  2.9999999999999996e-84  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0766819  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2763  decaheme cytochrome c MtrF  33.13 
 
 
639 aa  313  6.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0120659  hitchhiker  0.0000444921 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1591  decaheme cytochrome c MtrF  32.28 
 
 
639 aa  309  1.0000000000000001e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000158979  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2694  decaheme cytochrome c MtrF  34.3 
 
 
640 aa  307  5.0000000000000004e-82  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2521  decaheme cytochrome c MtrF  34.05 
 
 
639 aa  297  4e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1528  decaheme cytochrome c MtrF  31.56 
 
 
646 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4048  hypothetical protein  27.5 
 
 
764 aa  193  9e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3466  hypothetical protein  33.51 
 
 
785 aa  172  1e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.724503 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2636  decaheme cytochrome c  26.33 
 
 
724 aa  138  3.0000000000000003e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1527  decaheme cytochrome c  23.79 
 
 
722 aa  128  3e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1209  decaheme cytochrome c  24.5 
 
 
729 aa  125  2e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00658895  normal  0.327868 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2524  decaheme cytochrome c  23.88 
 
 
725 aa  125  2e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000418395  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1579  decaheme cytochrome c  25.78 
 
 
730 aa  124  6e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00874065  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1590  decaheme cytochrome c  25.75 
 
 
730 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000452412  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2522  decaheme cytochrome c  25.29 
 
 
720 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1613  decaheme cytochrome c  25.61 
 
 
730 aa  120  7e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000196014  normal  0.166254 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2675  decaheme cytochrome c  25.65 
 
 
724 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000733685  normal  0.0455406 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1210  decaheme cytochrome c  24.35 
 
 
727 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.260087  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2509  decaheme cytochrome c  25.61 
 
 
731 aa  117  5e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000184393  hitchhiker  0.000632353 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2695  decaheme cytochrome c  23.22 
 
 
719 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.734788  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2292  hypothetical protein  28.05 
 
 
782 aa  114  6e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3124  decaheme cytochrome c  24.31 
 
 
741 aa  111  3e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00184772  hitchhiker  0.000042193 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2577  decaheme cytochrome c  24.42 
 
 
731 aa  111  5e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00883016  decreased coverage  0.00925289 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2697  decaheme cytochrome c  29.12 
 
 
745 aa  110  1e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0633196  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1779  decaheme cytochrome c  24.36 
 
 
735 aa  107  8e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0918  decaheme cytochrome c  23.96 
 
 
764 aa  105  2e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.613412  normal  0.552776 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1526  decaheme cytochrome c  27.45 
 
 
738 aa  105  2e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.324001  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3588  decaheme cytochrome c  23.97 
 
 
745 aa  105  2e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0875  hypothetical protein  27.09 
 
 
893 aa  101  3e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0421546 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3286  hypothetical protein  27.83 
 
 
714 aa  98.6  4e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.909593  hitchhiker  0.000000468411 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2613  decaheme cytochrome c  25.06 
 
 
762 aa  98.2  5e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000355284  hitchhiker  0.00000740819 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4079  hypothetical protein  25.98 
 
 
885 aa  95.9  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.299167  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2216  hypothetical protein  30.07 
 
 
898 aa  95.1  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.352223  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3371  hypothetical protein  26.67 
 
 
895 aa  94.7  4e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.94917  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1658  hypothetical protein  29.74 
 
 
898 aa  94.7  5e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.131846  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1731  multiheme cytochrome  29.74 
 
 
898 aa  93.2  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2680  decaheme cytochrome c  24.96 
 
 
762 aa  89  2e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.463028  unclonable  0.0000643351 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0998  decaheme cytochrome c  22.91 
 
 
766 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2787  decaheme cytochrome c  24.37 
 
 
762 aa  86.3  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0256712 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2299  hypothetical protein  25 
 
 
809 aa  86.3  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1478  decaheme cytochrome c  24.48 
 
 
761 aa  84  0.000000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.174618  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1479  hypothetical protein  22.94 
 
 
833 aa  83.6  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0424195  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1473  decaheme cytochrome c  23.72 
 
 
761 aa  83.2  0.00000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000262006  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2874  decaheme cytochrome c  24.39 
 
 
764 aa  82.4  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0594793  hitchhiker  0.00000891097 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4254  decaheme cytochrome c  24.71 
 
 
729 aa  82  0.00000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.353597  unclonable  0.0000000280036 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0913  decaheme cytochrome c  24.68 
 
 
770 aa  81.3  0.00000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.546873  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1509  decaheme cytochrome c  24.26 
 
 
764 aa  81.6  0.00000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.130709  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1421  hypothetical protein  24.28 
 
 
657 aa  77.4  0.0000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.515821 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1713  hypothetical protein  26.09 
 
 
945 aa  76.3  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.436521  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2696  hypothetical protein  20.32 
 
 
822 aa  76.3  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2228  decaheme cytochrome c  23.32 
 
 
755 aa  75.1  0.000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.236086  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1659  decaheme cytochrome c  23.96 
 
 
758 aa  74.7  0.000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3573  decaheme cytochrome c  27.4 
 
 
716 aa  74.3  0.000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3200  hypothetical protein  25.24 
 
 
820 aa  72.8  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0910  hypothetical protein  22.29 
 
 
731 aa  70.1  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.688824 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6275  decaheme c-type cytochrome, OmcA/MtrC family  28.88 
 
 
741 aa  67.8  0.0000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.772817 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3108  hypothetical protein  23.31 
 
 
788 aa  64.3  0.000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3098  hypothetical protein  22.11 
 
 
789 aa  63.5  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4080  hypothetical protein  27.42 
 
 
936 aa  62  0.00000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000183317  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3251  hypothetical protein  23.15 
 
 
788 aa  60.8  0.00000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1268  hypothetical protein  25.27 
 
 
789 aa  60.8  0.00000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.487663  hitchhiker  0.00130496 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0447  hypothetical protein  21.56 
 
 
612 aa  56.6  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.476837 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1380  decaheme cytochrome c  23.56 
 
 
765 aa  56.2  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1244  hypothetical protein  25.16 
 
 
742 aa  55.8  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0505071  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1187  hypothetical protein  21.46 
 
 
778 aa  55.5  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2379  hypothetical protein  30.66 
 
 
1111 aa  54.7  0.000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.49944  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2990  hypothetical protein  22.17 
 
 
680 aa  53.5  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2764  hypothetical protein  24.28 
 
 
843 aa  53.1  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.185672  hitchhiker  0.000000808171 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0963  hypothetical protein  27.7 
 
 
816 aa  52  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.830117  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0450  hypothetical protein  25.48 
 
 
687 aa  51.6  0.00004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4517  hypothetical protein  25.41 
 
 
642 aa  50.8  0.00008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.247929 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1345  multiheme cytochrome  24.84 
 
 
742 aa  49.7  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2523  hypothetical protein  26.6 
 
 
757 aa  48.5  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003776  decaheme cytochrome c MtrF  20.5 
 
 
754 aa  48.9  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1409  hypothetical protein  25.08 
 
 
696 aa  46.6  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2580  hypothetical protein  22.61 
 
 
677 aa  46.6  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2603  hypothetical protein  26.95 
 
 
742 aa  45.4  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.430741  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1356  hypothetical protein  25 
 
 
696 aa  45.1  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0734371 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2507  hypothetical protein  27.6 
 
 
700 aa  45.4  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.116766  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>