More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH1_0042 on replicon NC_009632
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP2507  transposase B  100 
 
 
630 aa  1316  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4539  transposase B  70.75 
 
 
637 aa  964  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0042  phage integrase family protein  100 
 
 
630 aa  1316  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1346  Tn554, transposase B  100 
 
 
630 aa  1316  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1223  Tn554, transposase B  100 
 
 
630 aa  1316  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.559956  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1716  phage integrase family protein  100 
 
 
630 aa  1316  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0042  phage integrase family protein  100 
 
 
630 aa  1316  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1750  phage integrase family protein  100 
 
 
630 aa  1316  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00214495  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4149  integrase family protein  46.09 
 
 
498 aa  397  1e-109  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.353708 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1705  phage integrase family protein  31.11 
 
 
737 aa  249  8e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.602648  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5578  phage integrase  31.11 
 
 
721 aa  249  9e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5981  phage integrase family protein  31.11 
 
 
721 aa  249  9e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.259227 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06600  site-specific recombinase, integrase family  32.69 
 
 
491 aa  242  2e-62  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0101148  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20690  site-specific recombinase, integrase family  32.87 
 
 
426 aa  229  1e-58  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2146  phage integrase family protein  32.76 
 
 
663 aa  226  1e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0001  Tn554-related, transposase B  26.5 
 
 
684 aa  206  9e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.289716  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3148  Tn554-related, transposase B  26.5 
 
 
701 aa  206  1e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0987  Tn554-related, transposase B  27.55 
 
 
708 aa  197  6e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.376449  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1465  Tn554-related, transposase B  25.55 
 
 
675 aa  190  6e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  3.29851e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4644  phage integrase family protein  27.38 
 
 
637 aa  160  5e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0068  integrase family protein  28.75 
 
 
461 aa  135  2e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1114  phage integrase family protein  25.3 
 
 
637 aa  128  3e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0456  phage integrase family protein  23.67 
 
 
647 aa  117  5e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5498  phage integrase family protein  23.67 
 
 
647 aa  117  5e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0714023 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3588  phage integrase family protein  23.67 
 
 
647 aa  117  5e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00892563 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3615  integrase family protein  25.2 
 
 
638 aa  112  2e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00140934  normal  0.0339314 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5399  phage integrase family protein  32.79 
 
 
741 aa  109  1e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.558609 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5419  phage integrase family protein  32.79 
 
 
741 aa  109  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.244002 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0513  phage integrase family protein  32.79 
 
 
741 aa  109  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1238  integrase family protein  24.6 
 
 
617 aa  105  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.375916 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2521  integrase family protein  24.6 
 
 
617 aa  105  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  5.24212e-05  hitchhiker  0.00558917 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2584  integrase family protein  25.19 
 
 
608 aa  104  5e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2671  integrase family protein  25.19 
 
 
608 aa  104  5e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1427  phage integrase family protein  32.77 
 
 
739 aa  102  3e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4727  integrase family protein  25.19 
 
 
608 aa  102  3e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0479  phage integrase family protein  29.37 
 
 
724 aa  100  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3897  phage integrase family protein  29.37 
 
 
724 aa  100  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.567504 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5934  phage integrase family protein  29.37 
 
 
724 aa  100  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3903  phage integrase family protein  29.37 
 
 
724 aa  100  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3804  phage integrase family protein  27.3 
 
 
710 aa  92.8  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1935  phage integrase  27.3 
 
 
710 aa  92.8  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3969  phage integrase family protein  27.3 
 
 
710 aa  92.8  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2175  tyrosine recombinase XerD  26.18 
 
 
299 aa  86.7  1e-15  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3043  integrase family protein  28.36 
 
 
719 aa  83.6  1e-14  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00307933  hitchhiker  0.00706888 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3468  integrase family protein  28.36 
 
 
719 aa  83.6  1e-14  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00341973  normal  0.0358232 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1216  integrase family protein  28.36 
 
 
719 aa  83.6  1e-14  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.324318  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3741  integrase family protein  28.36 
 
 
719 aa  83.6  1e-14  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.207661  normal  0.164108 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3586  integrase family protein  28.36 
 
 
719 aa  83.6  1e-14  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.186678  hitchhiker  0.00677249 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3604  integrase family protein  28.36 
 
 
719 aa  83.6  1e-14  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0140825  normal  0.0766423 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3699  integrase family protein  28.36 
 
 
719 aa  83.6  1e-14  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0398005  normal  0.195076 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0116  Phage integrase, N-terminal SAM- like  29.28 
 
 
309 aa  82.4  2e-14  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0173  tyrosine recombinase XerD  28.14 
 
 
309 aa  79  2e-13  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.861385  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3062  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.34 
 
 
308 aa  77.8  5e-13  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2378  tyrosine recombinase XerD  24.75 
 
 
296 aa  76.6  1e-12  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.336575 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2567  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.08 
 
 
313 aa  76.6  1e-12  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.615759 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1189  integrase family protein  25 
 
 
297 aa  76.3  2e-12  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  2.03109e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3891  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.04 
 
 
317 aa  75.9  2e-12  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.125291  decreased coverage  0.00274094 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1283  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.15 
 
 
297 aa  74.7  4e-12  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0386  phage integrase family site specific recombinase  27.02 
 
 
400 aa  73.6  9e-12  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0401  integrase family protein  23.66 
 
 
310 aa  73.6  1e-11  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0069  integrase family protein  21.59 
 
 
517 aa  73.6  1e-11  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0401  integrase family protein  25.58 
 
 
304 aa  72.8  2e-11  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.966282 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0660  integrase family protein  30 
 
 
284 aa  72.4  2e-11  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2257  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.92 
 
 
299 aa  72  3e-11  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.977256  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0530  tyrosine recombinase XerD  25.66 
 
 
320 aa  71.6  4e-11  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.931339  normal  0.0955198 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3598  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.67 
 
 
317 aa  71.2  5e-11  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2105  tyrosine recombinase XerD  25.43 
 
 
297 aa  70.9  6e-11  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.179497  hitchhiker  0.00877552 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2483  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.49 
 
 
299 aa  71.2  6e-11  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  8.55714e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2276  tyrosine recombinase XerD  26 
 
 
301 aa  71.2  6e-11  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.235275  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0842  hypothetical protein  27.34 
 
 
290 aa  70.9  7e-11  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0393  tyrosine recombinase XerD  26.05 
 
 
319 aa  70.9  7e-11  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.543195  normal  0.555297 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1468  phage integrase family protein  25.86 
 
 
304 aa  70.9  7e-11  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0918  integrase  27.27 
 
 
307 aa  70.5  1e-10  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.0200604 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5304  site-specific recombinase, phage integrase family  22.7 
 
 
322 aa  70.1  1e-10  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1732  integrase/recombinase XerD  23.86 
 
 
308 aa  70.1  1e-10  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1611  tyrosine recombinase  26.06 
 
 
308 aa  69.3  2e-10  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.4794 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  27.53 
 
 
295 aa  69.3  2e-10  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1314  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.34 
 
 
299 aa  69.7  2e-10  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  1.9497e-06  unclonable  8.39468e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3929  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.34 
 
 
299 aa  69.7  2e-10  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0772  phage integrase  25.2 
 
 
304 aa  69.7  2e-10  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.672054 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0159  integrase family protein  27.17 
 
 
295 aa  68.6  3e-10  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2702  site-specific recombinase  26.43 
 
 
299 aa  68.9  3e-10  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0507  tyrosine recombinase XerD  26.77 
 
 
339 aa  68.6  3e-10  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0992  phage integrase family protein  28.29 
 
 
806 aa  68.6  3e-10  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2346  tyrosine recombinase XerC  25.33 
 
 
302 aa  68.6  3e-10  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.126195  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3715  integrase family protein  27.09 
 
 
298 aa  68.6  3e-10  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0488  tyrosine recombinase XerD  25.86 
 
 
319 aa  67.8  5e-10  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4056  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.25 
 
 
332 aa  67.8  6e-10  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.111498  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2860  tyrosine recombinase XerC subunit  25.36 
 
 
300 aa  67.4  7e-10  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3654  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.01 
 
 
301 aa  67  9e-10  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  4.89449e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5435  hypothetical protein  26.87 
 
 
352 aa  67.4  9e-10  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4524  Phage integrase  24.23 
 
 
310 aa  67  9e-10  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1178  tyrosine recombinase XerC subunit  26.28 
 
 
300 aa  67  1e-09  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1468  site-specific tyrosine recombinase XerD  27 
 
 
298 aa  67  1e-09  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.208903 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1279  phage integrase family protein  23.18 
 
 
323 aa  66.6  1e-09  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0644752  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1025  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.69 
 
 
298 aa  66.6  1e-09  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.899371  normal  0.6007 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4253  site-specific tyrosine recombinase XerD  27 
 
 
298 aa  67  1e-09  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7575  tyrosine recombinase XerD subunit  25.1 
 
 
308 aa  66.6  1e-09  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.440547  normal  0.271837 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3843  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.01 
 
 
299 aa  66.2  2e-09  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.27577e-62 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6957  integrase family protein  26.29 
 
 
292 aa  65.9  2e-09  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>