More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4464 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_4464  geranylgeranyl reductase  100 
 
 		 423 aa  841    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.152921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4066  geranylgeranyl reductase  93.38 
 
 		 423 aa  792    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.449431  normal  0.299227 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1273  geranylgeranyl reductase  72.55 
 
 		 457 aa  627  1e-178  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0513601 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0537  geranylgeranyl reductase  71.5 
 
 		 434 aa  570  1e-161  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.118976 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8053  geranylgeranyl reductase  66.67 
 
 		 423 aa  560  1e-158  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.661392 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5052  geranylgeranyl reductase  64.54 
 
 		 434 aa  536  1e-151  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2696  geranylgeranyl reductase, plantal and  63.66 
 
 		 435 aa  533  1e-150  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0266  geranylgeranyl reductase  65.31 
 
 		 445 aa  528  1e-149  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.224418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6095  geranylgeranyl reductase  68.35 
 
 		 440 aa  525  1e-148  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0614228 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4420  geranylgeranyl reductase  64.75 
 
 		 418 aa  520  1e-146  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6683  geranylgeranyl reductase  63.64 
 
 		 426 aa  518  1.0000000000000001e-145  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00871957  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0279  geranylgeranyl reductase  63.16 
 
 		 424 aa  509  1e-143  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.615542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0583  geranylgeranyl reductase  63.31 
 
 		 425 aa  511  1e-143  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0973  geranylgeranyl reductase  62.03 
 
 		 430 aa  491  1e-137  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3230  geranylgeranyl reductase  59.95 
 
 		 431 aa  488  1e-136  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716202 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03150  geranylgeranyl reductase family protein  61.52 
 
 		 424 aa  476  1e-133  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.992088  normal  0.897834 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0648  geranylgeranyl reductase  57.38 
 
 		 430 aa  471  1e-132  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0626765  normal  0.0232794 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0468  geranylgeranyl reductase  55.48 
 
 		 431 aa  439  9.999999999999999e-123  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2717  geranylgeranyl reductase  56.43 
 
 		 443 aa  437  1e-121  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.593407 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07370  geranylgeranyl reductase family protein  54.46 
 
 		 431 aa  429  1e-119  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0284516 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4559  geranylgeranyl reductase  53.44 
 
 		 419 aa  418  9.999999999999999e-116  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2826  geranylgeranyl reductase  52.71 
 
 		 443 aa  407  1.0000000000000001e-112  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0858816 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3131  geranylgeranyl reductase  50.35 
 
 		 444 aa  395  1e-109  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17730  geranylgeranyl reductase family protein  45.64 
 
 		 466 aa  330  3e-89  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0362  geranylgeranyl reductase  35.94 
 
 		 436 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.495463  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4291  geranylgeranyl reductase  37.77 
 
 		 393 aa  209  7e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.464527 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2055  geranylgeranyl reductase  37.23 
 
 		 393 aa  205  1e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10571  oxidoreductase  36.98 
 
 		 408 aa  188  2e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.649109  normal  0.274108 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1826  geranylgeranyl reductase  35.69 
 
 		 393 aa  182  1e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.253785  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2279  geranylgeranyl reductase  38.78 
 
 		 413 aa  182  1e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1873  geranylgeranyl reductase  35.69 
 
 		 393 aa  182  1e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.700646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1807  geranylgeranyl reductase  35.41 
 
 		 393 aa  180  4.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.622254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0991  geranylgeranyl reductase  33.07 
 
 		 418 aa  179  8e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0770  geranylgeranyl reductase  34.11 
 
 		 400 aa  179  1e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0784  geranylgeranyl reductase  35.94 
 
 		 406 aa  179  1e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0765  geranylgeranyl reductase  35.94 
 
 		 406 aa  178  2e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.616022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5254  geranylgeranyl reductase  35.37 
 
 		 416 aa  177  4e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.609279 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1099  geranylgeranyl reductase  34.03 
 
 		 435 aa  166  1.0000000000000001e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.997696  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1294  geranylgeranyl reductase  39.88 
 
 		 420 aa  163  5.0000000000000005e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.730528  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0714  geranylgeranyl reductase  33.89 
 
 		 415 aa  158  2e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0948  geranylgeranyl reductase  33.99 
 
 		 417 aa  151  2e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.3862  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1087  electron transfer flavoprotein  29.38 
 
 		 384 aa  151  2e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.384904  normal  0.110599 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1343  geranylgeranyl reductase  32.98 
 
 		 411 aa  142  9.999999999999999e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.263408 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2269  geranylgeranyl reductase  33.33 
 
 		 398 aa  126  6e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0311  hypothetical protein  32.91 
 
 		 409 aa  125  1e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.172492  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3043  geranylgeranyl reductase  27.58 
 
 		 376 aa  122  9e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.483009 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0164  putative electron transfer oxidoreductase  34.77 
 
 		 420 aa  122  9e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.762503  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1407  geranylgeranyl reductase  30.2 
 
 		 398 aa  121  1.9999999999999998e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.426262  normal  0.248213 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2388  flavoprotein-containing dehydrogenase  34.52 
 
 		 414 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0523144  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1268  geranylgeranyl reductase  32.74 
 
 		 375 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0830  geranylgeranyl reductase  30.03 
 
 		 415 aa  117  5e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0390  monooxygenase FAD-binding  33.06 
 
 		 425 aa  116  6e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0398453 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5969  geranylgeranyl reductase  32.18 
 
 		 409 aa  116  6.9999999999999995e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.365894  normal  0.508891 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1602  hypothetical protein  28.57 
 
 		 387 aa  108  2e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0808  geranylgeranyl reductase  33.13 
 
 		 378 aa  108  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000424296 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2824  geranylgeranyl reductase  30.65 
 
 		 379 aa  108  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6208  monooxygenase FAD-binding protein  31.01 
 
 		 403 aa  104  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00171157  normal  0.384261 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0501  geranylgeranyl reductase  26.92 
 
 		 376 aa  103  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1161  geranylgeranyl reductase  34.74 
 
 		 429 aa  102  2e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0631  geranylgeranyl reductase  28.73 
 
 		 402 aa  100  3e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0660  geranylgeranyl reductase  31.97 
 
 		 406 aa  100  5e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0877902 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1375  geranylgeranyl reductase  27.45 
 
 		 390 aa  99.8  8e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.545102  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0369  geranylgeranyl reductase  28.41 
 
 		 408 aa  96.7  7e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0683691  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1308  geranylgeranyl reductase  28.49 
 
 		 406 aa  96.3  1e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1066  geranylgeranyl reductase  25.48 
 
 		 382 aa  94.4  3e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000111291  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0387  geranylgeranyl reductase  33.33 
 
 		 403 aa  94.7  3e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1462  geranylgeranyl reductase  32.05 
 
 		 384 aa  93.6  7e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.36043  normal  0.122675 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1134  geranylgeranyl reductase  27.22 
 
 		 389 aa  92.4  1e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.719323  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3185  monooxygenase FAD-binding protein  26.72 
 
 		 375 aa  92.4  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.388588  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0172  bacteriochlorophyll synthase  28.19 
 
 		 396 aa  92  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.935683 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0023  geranylgeranyl reductase  26.91 
 
 		 398 aa  91.3  3e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0578  geranylgeranyl reductase  27.61 
 
 		 395 aa  90.9  4e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0508  geranylgeranyl reductase  28.64 
 
 		 376 aa  90.5  5e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1250  geranylgeranyl reductase  26.65 
 
 		 390 aa  90.1  6e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.375977  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1307  geranylgeranyl reductase  27.55 
 
 		 391 aa  90.1  8e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.398981  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18731  NAD binding site  28.67 
 
 		 385 aa  89.4  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.413657 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1386  geranylgeranyl reductase  27.25 
 
 		 390 aa  88.6  2e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1494  oxidoreductase, FAD-binding, putative  27.65 
 
 		 455 aa  88.2  2e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0467837  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2702  geranylgeranyl reductase  30.97 
 
 		 401 aa  88.2  3e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1062  geranylgeranyl reductase  28.49 
 
 		 385 aa  87.8  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0133  geranylgeranyl reductase  31 
 
 		 368 aa  87.4  4e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2724  tryptophan halogenase  29.46 
 
 		 506 aa  87.4  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.656683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3184  tryptophan halogenase  29.71 
 
 		 441 aa  86.3  9e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.153347  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1347  geranylgeranyl reductase  29.92 
 
 		 453 aa  86.3  9e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0129504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3745  geranylgeranyl reductase  31.42 
 
 		 400 aa  86.3  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000410516 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3109  monooxygenase FAD-binding  26.52 
 
 		 444 aa  84.7  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3777  geranylgeranyl reductase  34.66 
 
 		 368 aa  84  0.000000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.218559 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0023  geranylgeranyl reductase  29.05 
 
 		 379 aa  84  0.000000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.086385  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0522  geranylgeranyl reductase  27.15 
 
 		 390 aa  84  0.000000000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1193  geranylgeranyl reductase  28.96 
 
 		 362 aa  83.6  0.000000000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0917874  hitchhiker  0.0000705466 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1376  dehydrogenase, flavoprotein containing  27.62 
 
 		 384 aa  83.2  0.000000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000125722  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1260  FAD dependent oxidoreductase  27.73 
 
 		 438 aa  82.8  0.000000000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3422  geranylgeranyl reductase  27.58 
 
 		 407 aa  82.4  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.351163 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2822  flavoprotein/dehydrogenase  25.66 
 
 		 413 aa  82.8  0.00000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3913  monooxygenase FAD-binding  26.41 
 
 		 416 aa  81.6  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.445041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0879  geranylgeranyl reductase  26.25 
 
 		 370 aa  81.6  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.917387  normal  0.163245 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0808  geranylgeranyl reductase  32.33 
 
 		 406 aa  82  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.967973  hitchhiker  0.000310699 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2315  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  27.86 
 
 		 436 aa  81.6  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0377746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1434  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  27.51 
 
 		 436 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000988984  normal  0.0161309 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0862  geranylgeranyl reductase  31.83 
 
 		 387 aa  80.5  0.00000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>