More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4062 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_4062  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  100 
 
 
524 aa  1019    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.286322 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3684  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  79.03 
 
 
518 aa  763    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.358044  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1904  HtrA2 peptidase  56.77 
 
 
423 aa  304  3.0000000000000004e-81  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.775402  normal  0.334422 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5142  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  51.82 
 
 
614 aa  273  5.000000000000001e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.309432  normal  0.441282 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3273  Trypsin-like protein serine protease typically periplasmic containing C-terminal PDZ domain-like protein  48.58 
 
 
485 aa  262  1e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7239  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  50 
 
 
569 aa  259  8e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.108633  normal  0.212332 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0353  trypsin-like serine protease  43.04 
 
 
583 aa  255  2.0000000000000002e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.326819  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0069  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  46.25 
 
 
579 aa  239  1e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1593  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  47.26 
 
 
512 aa  237  4e-61  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.421913  normal  0.822638 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5199  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  45.82 
 
 
640 aa  236  8e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.219359  normal  0.800514 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0620  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  47.26 
 
 
674 aa  233  5e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.5236  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4299  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  42.82 
 
 
440 aa  227  4e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.143756  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4385  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  42.82 
 
 
440 aa  227  4e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4679  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  43.73 
 
 
440 aa  226  6e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0383364 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1398  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  46.43 
 
 
349 aa  225  1e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.515072  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32730  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain protein  45.76 
 
 
443 aa  222  9.999999999999999e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.229019  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0886  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  45.37 
 
 
916 aa  219  7e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.421013 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0884  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  45.25 
 
 
417 aa  218  2e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.63894  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1889  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  44.35 
 
 
515 aa  216  8e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.271087 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3922  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  45.13 
 
 
423 aa  213  4.9999999999999996e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.155869  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0459  2-alkenal reductase  47.1 
 
 
584 aa  213  9e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1859  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  38.58 
 
 
544 aa  211  2e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.308507  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4842  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  41.51 
 
 
456 aa  211  2e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.369386 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3830  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  42.51 
 
 
515 aa  208  2e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.778945  normal  0.0341938 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21640  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain  44.13 
 
 
417 aa  207  3e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00345268  normal  0.0571371 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2743  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  37.15 
 
 
545 aa  207  4e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1008  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  44.95 
 
 
487 aa  207  4e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0715  protease Do  44.6 
 
 
500 aa  206  7e-52  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00445387  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11001  serine protease pepD  41.32 
 
 
464 aa  206  1e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000053367  normal  0.424973 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0813  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  40.78 
 
 
485 aa  205  2e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2158  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  46.69 
 
 
507 aa  204  3e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0489221  normal  0.0113989 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0658  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  46.81 
 
 
434 aa  203  5e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2005  protease Do  45.1 
 
 
475 aa  202  9.999999999999999e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3284  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  37.93 
 
 
420 aa  201  1.9999999999999998e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.71487  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1611  protease Do  43.21 
 
 
482 aa  201  3e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.4051  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24150  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain  46.28 
 
 
515 aa  199  9e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4901  HtrA2 peptidase  41.61 
 
 
407 aa  199  1.0000000000000001e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2013  peptidase S1C, Do  44.56 
 
 
480 aa  199  1.0000000000000001e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000140166  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0977  protease do  41.22 
 
 
471 aa  199  1.0000000000000001e-49  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3616  protease Do  40.85 
 
 
467 aa  198  2.0000000000000003e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0184725  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1014  peptidase S1C, Do  44.06 
 
 
476 aa  198  2.0000000000000003e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0497  protease DO  42.29 
 
 
472 aa  197  3e-49  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0231688  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1363  protease DO  41.94 
 
 
472 aa  197  4.0000000000000005e-49  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3992  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  39.17 
 
 
501 aa  197  5.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4066  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  39.17 
 
 
501 aa  197  5.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2812  serine protease  43.36 
 
 
528 aa  196  6e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.498431  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2476  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  42.46 
 
 
486 aa  196  8.000000000000001e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2919  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  43.79 
 
 
558 aa  196  8.000000000000001e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.101168  hitchhiker  0.00800528 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10940  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain protein  43.2 
 
 
539 aa  196  8.000000000000001e-49  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.0000345024  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2721  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  42.41 
 
 
545 aa  196  9e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.331753  normal  0.316507 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0758  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  42.24 
 
 
375 aa  196  9e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0147516  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25880  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain  43.08 
 
 
537 aa  196  1e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4006  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  36.58 
 
 
497 aa  196  1e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.503851  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0308  protease Do  43.21 
 
 
481 aa  194  2e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.582048 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1242  protease DO  41.58 
 
 
472 aa  195  2e-48  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000225025  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06450  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain protein  44.48 
 
 
517 aa  194  4e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2202  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  43.68 
 
 
497 aa  193  7e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.718376  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07340  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain  44.19 
 
 
552 aa  193  8e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.191801 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1398  protease Do  41.61 
 
 
496 aa  192  1e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1726  protease Do  45.23 
 
 
513 aa  192  1e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618401  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4295  protease Do  43.06 
 
 
466 aa  192  2e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000836052  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1186  HtrA2 peptidase  41.18 
 
 
597 aa  191  2.9999999999999997e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.934322  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4494  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  42.6 
 
 
496 aa  191  4e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.18457  normal  0.102663 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8413  Trypsin-like protein serine protease typically periplasmic containing C-terminal PDZ domain-like protein  41.28 
 
 
527 aa  190  5e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.595687  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2948  serine endoprotease  41.64 
 
 
478 aa  189  7e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1212  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  42.14 
 
 
471 aa  189  9e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.152583  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1070  2-alkenal reductase  40.28 
 
 
393 aa  189  1e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000016371  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0779  periplasmic serine protease DO; heat shock protein HtrA  42.86 
 
 
472 aa  189  1e-46  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1378  HtrA2 peptidase  44.72 
 
 
379 aa  189  1e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000042799 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0590  2-alkenal reductase  35.64 
 
 
453 aa  189  1e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000722472  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6606  HtrA2 peptidase  40.83 
 
 
393 aa  189  1e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.211294  normal  0.127864 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3140  hypothetical protein  42.01 
 
 
483 aa  188  2e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.673481  normal  0.234219 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11247  serine protease htrA  42.75 
 
 
528 aa  188  2e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.039312  hitchhiker  0.00292251 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0507  trypsin-like serine protease  41.25 
 
 
489 aa  187  3e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0228  protease Do  42.76 
 
 
457 aa  187  3e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1305  2-alkenal reductase  37.76 
 
 
389 aa  187  3e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0856  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  40 
 
 
475 aa  187  4e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0131628  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0850  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  40 
 
 
475 aa  187  4e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0867  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  40 
 
 
475 aa  187  4e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0833  protease DO  41.05 
 
 
497 aa  187  5e-46  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0653734  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0797  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  43.62 
 
 
512 aa  186  6e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0601  PDZ/DHR/GLGF  42.41 
 
 
361 aa  186  8e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.367147  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1102  protease Do  44.13 
 
 
469 aa  186  8e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.432426  normal  0.334771 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3622  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  43.67 
 
 
486 aa  186  9e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0344622  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1070  protease Do  43.06 
 
 
479 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2013  protease Do  43.92 
 
 
524 aa  186  1.0000000000000001e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.316391  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1101  PDZ/DHR/GLGF  41.64 
 
 
385 aa  186  1.0000000000000001e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.280141 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0837  protease Do  42.61 
 
 
476 aa  185  2.0000000000000003e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.134567  normal  0.708087 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0197  HtrA2 peptidase  41.78 
 
 
369 aa  185  2.0000000000000003e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3025  2-alkenal reductase  44.25 
 
 
413 aa  184  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0951822  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0641  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  40.7 
 
 
381 aa  185  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3888  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  39.6 
 
 
506 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3517  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  39.86 
 
 
404 aa  185  2.0000000000000003e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2895  2-alkenal reductase  37.58 
 
 
389 aa  185  2.0000000000000003e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.253415  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0905  protease Do  42.16 
 
 
502 aa  185  2.0000000000000003e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6224  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  54.15 
 
 
283 aa  185  2.0000000000000003e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.837533  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0494  peptidase S1C, Do  47.95 
 
 
506 aa  184  3e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0535  2-alkenal reductase  42.86 
 
 
469 aa  184  3e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.474663  normal  0.227386 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0703  2-alkenal reductase  36.96 
 
 
425 aa  184  3e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04311  trypsin-like serine protease  42.61 
 
 
362 aa  184  3e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>