More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2090 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_2090  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 261 aa  535  1e-151  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00753492 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2693  helix-turn-helix domain-containing protein  51.39 
 
 		 261 aa  237  2e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.129803  normal  0.168058 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0560  AraC family transcriptional regulator  50.58 
 
 		 281 aa  236  3e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000376127 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6995  AraC/XylS family transcriptional regulator  48.16 
 
 		 255 aa  217  1e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00467693 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4119  transcriptional regulator, AraC family  45.28 
 
 		 262 aa  195  6e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.840918  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6385  transcriptional regulator, AraC family  41.08 
 
 		 256 aa  162  5.0000000000000005e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00774423 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6374  transcriptional regulator, AraC family  41.28 
 
 		 255 aa  156  3e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.169212 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4104  transcriptional regulator, AraC family  38.82 
 
 		 250 aa  152  5e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6355  transcriptional regulator, AraC family  39.75 
 
 		 265 aa  146  4.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0247335 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2180  helix-turn-helix domain-containing protein  37.87 
 
 		 281 aa  137  2e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.971115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0874  AraC family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 296 aa  129  5.0000000000000004e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0872  AraC family transcriptional regulator  34.77 
 
 		 292 aa  127  2.0000000000000002e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12670  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  35.52 
 
 		 250 aa  108  7.000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2175  AraC family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 281 aa  103  4e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0644092  normal  0.0265794 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0600  helix-turn-helix domain-containing protein  31.56 
 
 		 297 aa  102  7e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2057  helix-turn-helix domain-containing protein  40.13 
 
 		 291 aa  102  8e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1650  AraC family transcriptional regulator  41.58 
 
 		 316 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2634  AraC family transcriptional regulator  39.05 
 
 		 204 aa  93.2  4e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2707  transcriptional regulator, AraC family  47.92 
 
 		 150 aa  91.7  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.766259  normal  0.0137536 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0315  transcriptional regulator, AraC family  42 
 
 		 168 aa  90.5  3e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4617  transcriptional regulator, AraC family  43.56 
 
 		 296 aa  87.8  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.107807 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2899  helix-turn-helix domain-containing protein  43.12 
 
 		 140 aa  87.4  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.555623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3129  AraC family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 299 aa  87  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0584  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  45.83 
 
 		 164 aa  86.7  4e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0610  helix-turn-helix domain-containing protein  38 
 
 		 305 aa  86.7  4e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3628  transcriptional regulator, AraC family  39.36 
 
 		 156 aa  86.3  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2736  AraC family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 154 aa  86.3  5e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.66637 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3335  AraC family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 150 aa  85.9  7e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.602589  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3397  AraC family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 150 aa  85.9  7e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.287817 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3612  helix-turn-helix domain-containing protein  42.2 
 
 		 144 aa  85.5  7e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.812981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3346  AraC family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 150 aa  85.9  7e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.143712  normal  0.196941 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2914  methylphosphotriester-DNA alkyltransferase  36.27 
 
 		 198 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.431589  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2469  AraC family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 361 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3221  transcriptional regulator, AraC family  36.27 
 
 		 198 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3232  transcriptional regulator, AraC family  41.84 
 
 		 296 aa  84.3  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0599312  hitchhiker  0.0000105754 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2157  two component AraC family transcriptional regulator  35 
 
 		 250 aa  84  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0322408 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5964  transcriptional regulator, AraC family  37.5 
 
 		 134 aa  83.6  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.194078  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6041  transcriptional regulator, AraC family  40.59 
 
 		 303 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2703  transcription activator, effector binding  40.95 
 
 		 326 aa  82.8  0.000000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.268178 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2642  transcriptional regulator, AraC family  35.29 
 
 		 198 aa  82.4  0.000000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000194016 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4744  transcriptional regulator, AraC family  41.84 
 
 		 157 aa  81.6  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.235772  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2274  AraC family transcriptional regulator  40.59 
 
 		 307 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.348217  normal  0.470943 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3740  helix-turn-helix domain-containing protein  39.18 
 
 		 301 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.436963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5952  AraC family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 142 aa  79.3  0.00000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.149338 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6955  transcriptional regulator, AraC family  37.25 
 
 		 346 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.737934  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2058  transcriptional regulator, AraC family  30.3 
 
 		 286 aa  79  0.00000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4258  AraC family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 327 aa  79  0.00000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2986  transcriptional regulator, AraC family  40.82 
 
 		 148 aa  79  0.00000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4820  AraC family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 274 aa  78.2  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1399  transcriptional regulator, AraC family  42 
 
 		 158 aa  77.8  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3042  putative transcriptional regulator, AraC family, isolated domain protein  41.84 
 
 		 141 aa  78.6  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.319564  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2987  transcriptional regulator fragment  35.79 
 
 		 111 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.1494  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2463  transcriptional regulator, AraC family  36.79 
 
 		 162 aa  77.8  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.400735  normal  0.926275 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5215  helix-turn-helix domain-containing protein  34.34 
 
 		 331 aa  77.4  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1284  AraC family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 168 aa  76.6  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0659  AraC family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 290 aa  77  0.0000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0693  transposon Tn10 TetD protein  36.36 
 
 		 113 aa  76.6  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.808673  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0634  transposon Tn10 TetD protein  36.36 
 
 		 113 aa  76.6  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0774  AraC family transcriptional regulator  42 
 
 		 278 aa  77  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000960474 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0192  AraC family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 299 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0179  AraC family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 299 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0147136  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0191  AraC family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 299 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2020  transcriptional regulator, AraC family  38.46 
 
 		 143 aa  76.3  0.0000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.206011  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0211  transcriptional regulator, AraC family  34.58 
 
 		 299 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0937  transcriptional regulator, AraC family  33.66 
 
 		 291 aa  76.3  0.0000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.440102  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6338  transcriptional regulator, AraC family  41.24 
 
 		 145 aa  75.9  0.0000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2197  AraC family transcriptional regulator  41.05 
 
 		 314 aa  75.9  0.0000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0216  transcriptional regulator, AraC family  33.64 
 
 		 299 aa  75.9  0.0000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0182  AraC family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 299 aa  75.9  0.0000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1493  methylated-DNA--protein-cysteine methyltransferase  37.76 
 
 		 276 aa  75.5  0.0000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000302117  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3902  AraC family transcriptional regulator  42.73 
 
 		 154 aa  75.5  0.0000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0209  AraC family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 238 aa  75.5  0.0000000000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2326  transcriptional regulator, AraC family  39.18 
 
 		 295 aa  75.5  0.0000000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0937352 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2499  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  38.61 
 
 		 156 aa  75.1  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.401459  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1583  two component AraC family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 533 aa  75.1  0.000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.160886  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4716  transcriptional regulator, AraC family  37.76 
 
 		 341 aa  75.1  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.777825 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2327  transcriptional regulator  36.27 
 
 		 316 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.223293  normal  0.02817 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0620  transposon Tn10 TetD protein  35.35 
 
 		 113 aa  73.9  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5494  transcriptional regulator, AraC family  38.78 
 
 		 144 aa  73.9  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00194637  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3526  transcriptional regulator, AraC family  23.53 
 
 		 266 aa  73.9  0.000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0204519  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3702  transcriptional regulator, AraC type  28.77 
 
 		 308 aa  74.7  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0011  transcriptional regulator, AraC family  32.11 
 
 		 285 aa  74.3  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000871788  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0176  AraC family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 299 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3053  transcriptional regulator, AraC family  33.01 
 
 		 296 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2003  AraC family transcriptional regulator  42 
 
 		 342 aa  74.7  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0833293 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3159  AraC family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 296 aa  73.9  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2691  DNA-O6-methylguanine--protein-cysteine S-methyltransferase / transcriptional regulator Ada  35.64 
 
 		 297 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0739  transposon Tn10 TetD protein  35.35 
 
 		 113 aa  73.9  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.899902  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1111  transcriptional regulator, AraC family  34.69 
 
 		 312 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0677  transposon Tn10 TetD protein  35.35 
 
 		 113 aa  73.9  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.198694  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42360  transcriptional regulator, AraC family  34.02 
 
 		 318 aa  73.9  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4236  AraC family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 285 aa  73.6  0.000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.457979 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6795  transcriptional regulator, AraC family  34.69 
 
 		 306 aa  73.6  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.312804  hitchhiker  0.00000309577 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06300  methylphosphotriester-DNA alkyltransferase  28.71 
 
 		 302 aa  73.6  0.000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0102  two component transcriptional regulator, AraC family  28.7 
 
 		 519 aa  73.6  0.000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2426  transcriptional regulator, AraC family  31.73 
 
 		 326 aa  73.2  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.971153  normal  0.0916341 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1250  AraC family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 263 aa  73.2  0.000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3161  AraC family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 277 aa  73.2  0.000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2917  transcriptional regulator, AraC family  29.13 
 
 		 118 aa  73.2  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.932782  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3869  AraC family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 304 aa  72.8  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>