More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1875 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1875  major facilitator transporter  100 
 
 		 459 aa  886    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.473892  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1326  major facilitator transporter  47.8 
 
 		 464 aa  361  2e-98  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.367254  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0532  major facilitator family transporter  42.34 
 
 		 436 aa  322  8e-87  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0462  major facilitator family transporter  42.12 
 
 		 436 aa  320  3e-86  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.450318  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2518  major facilitator transporter  41.16 
 
 		 437 aa  318  2e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4993  MFS family membrane efflux protein  42.09 
 
 		 526 aa  315  9.999999999999999e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.521864 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1856  major facilitator transporter  41.14 
 
 		 438 aa  314  1.9999999999999998e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3924  major facilitator superfamily transporter  41.14 
 
 		 438 aa  314  1.9999999999999998e-84  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.496152  normal  0.0457831 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1482  major facilitator superfamily MFS_1  38.77 
 
 		 451 aa  313  3.9999999999999997e-84  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000115751  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3564  major facilitator transporter  42.89 
 
 		 436 aa  313  5.999999999999999e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2413  major facilitator transporter  38.29 
 
 		 447 aa  310  4e-83  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000787137  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5212  major facilitator transporter  37.91 
 
 		 399 aa  295  1e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000114177  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5543  major facilitator family transporter  38.39 
 
 		 399 aa  294  2e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000723204  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1992  major facilitator transporter  45.27 
 
 		 436 aa  293  4e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.252047  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5409  major facilitator family transporter  37.44 
 
 		 399 aa  291  2e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000725853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4638  major facilitator superfamily MFS_1  35.2 
 
 		 451 aa  290  3e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000178504  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3374  major facilitator superfamily MFS_1  39.01 
 
 		 398 aa  290  5.0000000000000004e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000527195  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5115  major facilitator family transporter  37.59 
 
 		 399 aa  289  8e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000159613  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5547  major facilitator family transporter  37.91 
 
 		 399 aa  288  1e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000869498  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5271  major facilitator family transporter  37.91 
 
 		 399 aa  288  1e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000222558  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5098  major facilitator family transporter  37.91 
 
 		 399 aa  288  1e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.20566e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5599  major facilitator family transporter  37.68 
 
 		 399 aa  288  1e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000105464  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5513  major facilitator family transporter  37.91 
 
 		 399 aa  288  1e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5668  major facilitator family transporter  37.91 
 
 		 399 aa  288  1e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000480591  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3933  major facilitator transporter  36.49 
 
 		 399 aa  287  2.9999999999999996e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000233422  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5083  major facilitator transporter  45.41 
 
 		 437 aa  286  5.999999999999999e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.418338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3497  major facilitator superfamily MFS_1  38.53 
 
 		 398 aa  284  2.0000000000000002e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8056  major facilitator superfamily MFS_1  37.25 
 
 		 451 aa  282  8.000000000000001e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1523  major facilitator transporter  37.1 
 
 		 438 aa  271  2e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.295641  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2255  major facilitator superfamily MFS_1  40.24 
 
 		 473 aa  259  9e-68  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29790  sugar phosphate permease  38.17 
 
 		 485 aa  256  7e-67  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0670  general substrate transporter  33.19 
 
 		 459 aa  256  8e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4019  major facilitator superfamily MFS_1  42.11 
 
 		 435 aa  254  2.0000000000000002e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000381325  normal  0.201783 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0539  major facilitator transporter  34.68 
 
 		 473 aa  252  8.000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1377  major facilitator superfamily MFS_1  40.43 
 
 		 445 aa  249  7e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0090  major facilitator transporter  35.23 
 
 		 422 aa  249  1e-64  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000497214  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5172  major facilitator transporter  34.01 
 
 		 474 aa  248  1e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0809503 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3259  major facilitator transporter  33.78 
 
 		 474 aa  248  1e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.331503  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5109  major facilitator transporter  33.78 
 
 		 474 aa  249  1e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1266  major facilitator transporter  37.27 
 
 		 422 aa  248  2e-64  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.693096  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1189  major facilitator transporter  37.27 
 
 		 422 aa  248  2e-64  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00252456  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0897  major facilitator superfamily MFS_1  41.71 
 
 		 447 aa  247  4e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0894914  normal  0.147269 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1660  MFS family transporter  32.82 
 
 		 455 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19270  putative MFS transporter  33.41 
 
 		 455 aa  246  6.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.149627  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02027  metabolite transporter  33.19 
 
 		 476 aa  240  2.9999999999999997e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.158134 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1595  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  32.6 
 
 		 472 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4651  major facilitator superfamily MFS_1  34.8 
 
 		 470 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2088  major facilitator superfamily MFS_1  32.74 
 
 		 456 aa  239  1e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.565943 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5053  major facilitator superfamily MFS_1  32.6 
 
 		 472 aa  239  1e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.122247 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0379  major facilitator family transporter  33.63 
 
 		 478 aa  236  4e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3311  major facilitator transporter  32.53 
 
 		 474 aa  236  6e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.799238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1671  major facilitator transporter  37.77 
 
 		 381 aa  236  9e-61  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.0000914056 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1414  major facilitator transporter  36.08 
 
 		 424 aa  234  2.0000000000000002e-60  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0471  major facilitator family transporter  33.41 
 
 		 478 aa  233  5e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1431  major facilitator family transporter  33.41 
 
 		 478 aa  233  5e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.475934  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0177  major facilitator family transporter  33.41 
 
 		 478 aa  233  5e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1931  major facilitator superfamily permease  33.41 
 
 		 478 aa  233  6e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0979116  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1841  major facilitator family transporter  33.63 
 
 		 478 aa  233  8.000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0911  major facilitator family transporter  33.18 
 
 		 478 aa  231  2e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.577596  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0911  major facilitator superfamily permease  35.24 
 
 		 388 aa  231  2e-59  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000338401  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21330  sugar phosphate permease  37.96 
 
 		 477 aa  228  2e-58  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.428425  hitchhiker  0.00018034 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3533  major facilitator transporter  33.56 
 
 		 473 aa  226  7e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5178  major facilitator transporter  31.4 
 
 		 457 aa  226  7e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1543  major facilitator transporter  35 
 
 		 382 aa  224  2e-57  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0259552 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0245  putative permease  38.32 
 
 		 449 aa  224  2e-57  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0461827  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1561  major facilitator transporter  32.62 
 
 		 509 aa  223  6e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.141298  normal  0.174962 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1166  major facilitator superfamily MFS_1  33.84 
 
 		 450 aa  223  6e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000374507 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1683  major facilitator transporter  37.34 
 
 		 415 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.249309  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1414  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  32.97 
 
 		 468 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000198546  normal  0.095851 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2073  major facilitator superfamily transporter  32.82 
 
 		 467 aa  219  1e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0013865 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2900  major facilitator transporter  32.68 
 
 		 514 aa  216  7e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.473738  normal  0.0138886 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2078  major facilitator superfamily MFS_1  34.12 
 
 		 404 aa  216  9e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2754  major facilitator superfamily MFS_1  31.91 
 
 		 465 aa  213  9e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.182715  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1089  major facilitator transporter  33.26 
 
 		 450 aa  211  2e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.10347  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0547  major facilitator superfamily transporter  30.26 
 
 		 456 aa  210  5e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.392915  normal  0.285749 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1076  major facilitator transporter  35.01 
 
 		 382 aa  202  7e-51  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.197988  normal  0.0589295 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1972  major facilitator transporter  34.92 
 
 		 372 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.106436  hitchhiker  0.000000141049 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4040  major facilitator transporter  34.22 
 
 		 435 aa  197  3e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.248694  decreased coverage  0.0016848 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1181  major facilitator transporter  31.3 
 
 		 443 aa  194  2e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.383013  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04490  sugar phosphate permease  34.32 
 
 		 469 aa  194  3e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38010  MFS family transporter: sugar  31.22 
 
 		 576 aa  192  8e-48  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.286894 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3587  major facilitator transporter  30.87 
 
 		 445 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.472801 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04482  sugar transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G03500)  30.66 
 
 		 579 aa  189  5.999999999999999e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.289204 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4030  DNA-cytosine methyltransferase  32.44 
 
 		 455 aa  187  3e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2706  major facilitator transporter  30.75 
 
 		 440 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.728097  normal  0.300526 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2108  major facilitator superfamily transporter  29.68 
 
 		 454 aa  184  2.0000000000000003e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0152433  normal  0.3868 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2684  major facilitator transporter  30.42 
 
 		 442 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5470  major facilitator transporter  32.05 
 
 		 461 aa  183  6e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0819  major facilitator transporter  31.25 
 
 		 452 aa  182  1e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.138145  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0336  major facilitator transporter  31.25 
 
 		 452 aa  182  1e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1548  major facilitator superfamily MFS_1  34.2 
 
 		 380 aa  182  2e-44  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1257  major facilitator transporter  29.13 
 
 		 454 aa  181  2e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.281321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6268  major facilitator transporter  28.95 
 
 		 462 aa  181  2e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.492492 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2550  major facilitator transporter  30.17 
 
 		 442 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5972  major facilitator transporter  28.73 
 
 		 462 aa  180  4e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0914  major facilitator transporter  30.2 
 
 		 434 aa  180  4e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00481205  normal  0.205021 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0987  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  29.37 
 
 		 461 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.496425 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7161  major facilitator transporter  29.33 
 
 		 456 aa  180  5.999999999999999e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0788  major facilitator transporter  31.09 
 
 		 453 aa  179  8e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1895  major facilitator transporter  29.21 
 
 		 451 aa  179  9e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.004098  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>