More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1677 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_1677  hypothetical protein  100 
 
 		 146 aa  291  2e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.884231 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4745  hypothetical protein  47.68 
 
 		 151 aa  137  7e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.829975  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4438  UspA domain protein  49.34 
 
 		 151 aa  131  3.9999999999999996e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4571  UspA domain protein  49.34 
 
 		 151 aa  131  3.9999999999999996e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0406402  normal  0.225072 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1504  hypothetical protein  48 
 
 		 151 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0179  hypothetical protein  46.71 
 
 		 151 aa  127  5.0000000000000004e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.096278 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1164  hypothetical protein  46.05 
 
 		 153 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3346  hypothetical protein  41.78 
 
 		 156 aa  107  6e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0885774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3201  hypothetical protein  41.89 
 
 		 156 aa  106  9.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.308557  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5552  UspA domain-containing protein  38.51 
 
 		 150 aa  97.8  4e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0358862  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5582  UspA domain protein  39.87 
 
 		 158 aa  95.1  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.285651  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3792  UspA domain protein  36.84 
 
 		 151 aa  93.6  9e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4869  UspA domain protein  36.84 
 
 		 151 aa  93.6  9e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0991837 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4395  universal stress protein UspA  33.33 
 
 		 164 aa  91.3  4e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.124166  normal  0.25513 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2036  universal stress protein (Usp)  38.1 
 
 		 155 aa  90.5  6e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.502569 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5580  UspA domain protein  38.36 
 
 		 168 aa  89.7  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.88885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0442  universal stress protein  36.24 
 
 		 200 aa  89  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5567  UspA domain protein  36.73 
 
 		 152 aa  89  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2829  UspA domain protein  35.71 
 
 		 169 aa  88.6  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0510043  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02117  hypothetical protein  35.95 
 
 		 151 aa  87.8  5e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4451  universal stress protein UspA  35.57 
 
 		 161 aa  87.4  6e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.15852  normal  0.144884 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1134  UspA domain-containing protein  40.13 
 
 		 167 aa  87  7e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0170  universal stress protein  36.91 
 
 		 200 aa  87  9e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0144  universal stress protein  36.91 
 
 		 156 aa  86.7  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2628  universal stress family protein  36.91 
 
 		 156 aa  86.7  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2771  universal stress protein  36.91 
 
 		 156 aa  86.7  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.778243  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1035  universal stress protein  36.91 
 
 		 156 aa  86.7  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.883979  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0916  hypothetical protein  36 
 
 		 173 aa  86.7  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1315  universal stress protein  36.91 
 
 		 156 aa  86.7  1e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4517  universal stress protein  42.28 
 
 		 150 aa  86.3  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0300457  normal  0.0239481 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5869  UspA domain-containing protein  34.67 
 
 		 148 aa  85.5  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.135871  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0228  UspA domain protein  37.75 
 
 		 144 aa  85.9  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.115538 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0904  hypothetical protein  34.9 
 
 		 157 aa  85.9  2e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.381712  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  39.04 
 
 		 180 aa  84.7  4e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3137  universal stress protein  34.25 
 
 		 155 aa  84.7  4e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5296  UspA domain-containing protein  34.93 
 
 		 158 aa  84.3  5e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4485  UspA domain-containing protein  34.93 
 
 		 155 aa  84.3  5e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5121  hypothetical protein  34.93 
 
 		 155 aa  84.3  5e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5738  UspA domain-containing protein  34.93 
 
 		 155 aa  84.3  5e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.192477 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3827  putative universal stress protein  33.78 
 
 		 187 aa  83.6  7e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5551  UspA domain protein  39.19 
 
 		 165 aa  83.6  8e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.883405 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1213  hypothetical protein  35.81 
 
 		 151 aa  82.8  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.166995  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0788  UspA domain-containing protein  35.53 
 
 		 147 aa  83.2  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.523142 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1136  UspA domain-containing protein  36.77 
 
 		 148 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4281  UspA domain-containing protein  36 
 
 		 156 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0794331 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1853  universal stress protein  35.62 
 
 		 168 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.499137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3813  UspA domain-containing protein  35.33 
 
 		 156 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.175974  normal  0.56362 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  38.67 
 
 		 158 aa  82  0.000000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1567  universal stress protein  34.93 
 
 		 164 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.84315  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6944  universal stress protein  36.73 
 
 		 157 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00046035  normal  0.534087 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4298  hypothetical protein  33.78 
 
 		 155 aa  80.5  0.000000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2306  UspA domain-containing protein  33.55 
 
 		 155 aa  80.1  0.000000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  35.62 
 
 		 156 aa  80.1  0.000000000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0038  universal stress protein  33.56 
 
 		 155 aa  79.3  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.283622  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0032  universal stress protein  33.56 
 
 		 155 aa  79.3  0.00000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4273  UspA domain protein  35.14 
 
 		 155 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.664066 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1811  hypothetical protein  34.44 
 
 		 151 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  36.18 
 
 		 159 aa  79.7  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1185  universal stress protein  33.56 
 
 		 155 aa  79.3  0.00000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0118  UspA domain-containing protein  37.33 
 
 		 144 aa  79.3  0.00000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.385941 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0052  universal stress protein  33.56 
 
 		 155 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1925  UspA domain-containing protein  33.56 
 
 		 144 aa  79.3  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0038  universal stress family protein  33.56 
 
 		 155 aa  79.3  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.98264  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1206  hypothetical protein  34.46 
 
 		 154 aa  80.1  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.670905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1465  universal stress protein  33.56 
 
 		 155 aa  79.3  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21220  hypothetical protein  34.44 
 
 		 151 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  36.24 
 
 		 143 aa  80.1  0.00000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3150  UspA domain-containing protein  33.56 
 
 		 155 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0036  universal stress protein  33.56 
 
 		 155 aa  78.6  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1859  putative universal stress protein  32.89 
 
 		 157 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5009  UspA domain-containing protein  33.56 
 
 		 156 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2826  UspA domain protein  35.86 
 
 		 286 aa  78.6  0.00000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.232825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6185  UspA domain-containing protein  37.09 
 
 		 157 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.552133  normal  0.212632 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5899  UspA domain-containing protein  38.36 
 
 		 167 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.642554  normal  0.144749 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  36.91 
 
 		 155 aa  77.8  0.00000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0184  hypothetical protein  37.66 
 
 		 166 aa  77.4  0.00000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.101223 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0982  UspA domain protein  38.1 
 
 		 140 aa  77.8  0.00000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00474456  normal  0.0330842 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4283  UspA domain-containing protein  35.1 
 
 		 163 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.126296 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2298  UspA domain-containing protein  33.12 
 
 		 164 aa  77.4  0.00000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.178234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5818  UspA domain-containing protein  39.86 
 
 		 153 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0832063 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2109  UspA domain-containing protein  38.3 
 
 		 128 aa  77.4  0.00000000000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3815  UspA domain-containing protein  34.44 
 
 		 167 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.911542  normal  0.55924 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6198  UspA domain-containing protein  35.53 
 
 		 156 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.227044  normal  0.53809 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2886  UspA domain-containing protein  35.71 
 
 		 148 aa  76.6  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0844522  normal  0.787665 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2815  UspA domain protein  34.87 
 
 		 147 aa  76.3  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0183337  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1117  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 		 156 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.656052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2577  UspA domain protein  37.06 
 
 		 148 aa  76.3  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.987812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6467  UspA domain-containing protein  35.53 
 
 		 159 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.276818 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7012  UspA domain-containing protein  34.01 
 
 		 156 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.305575  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0848  hypothetical protein  36.2 
 
 		 142 aa  76.3  0.0000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.957853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1926  hypothetical protein  36.18 
 
 		 147 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0607  putative universal stress-related protein  31.13 
 
 		 155 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.135512 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4434  UspA domain-containing protein  32.43 
 
 		 158 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.947422 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  37.93 
 
 		 144 aa  75.9  0.0000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1156  universal stress family protein  33.77 
 
 		 201 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5381  UspA domain-containing protein  34.64 
 
 		 162 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.122478 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2198  hypothetical protein  34.67 
 
 		 145 aa  75.5  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.76051  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0309  hypothetical protein  32 
 
 		 142 aa  75.9  0.0000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7052  UspA domain-containing protein  35.37 
 
 		 159 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6388  UspA domain-containing protein  35.37 
 
 		 159 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.686835  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>