295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1172 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1172  electron transport protein SCO1/SenC  100 
 
 		 283 aa  570  1.0000000000000001e-162  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1801  electron transport protein SCO1/SenC  43.01 
 
 		 291 aa  191  1e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.53156 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3047  electron transport protein SCO1/SenC  36.43 
 
 		 282 aa  187  2e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2077  electron transport protein SCO1/SenC  30.48 
 
 		 296 aa  120  1.9999999999999998e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0831544  normal  0.489667 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0048  electron transport protein SCO1/SenC  37.22 
 
 		 208 aa  103  2e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0514  electron transport protein SCO1/SenC  32.41 
 
 		 219 aa  82  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0931  electron transport protein SCO1/SenC  33.78 
 
 		 248 aa  80.1  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5990  electron transport protein SCO1/SenC  31.36 
 
 		 240 aa  79.7  0.00000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0318  SCO1/SenC family protein/methylamine utilization protein MauG, putative  34.5 
 
 		 626 aa  79.3  0.00000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1479  electron transport protein SCO1/SenC  32.52 
 
 		 196 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2737  electron transport protein SCO1/SenC  33.79 
 
 		 193 aa  77.4  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.032026  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0663  electron transport protein SCO1/SenC  32.81 
 
 		 197 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000146035  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2969  electron transport protein SCO1/SenC  34.01 
 
 		 241 aa  76.6  0.0000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000412315 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0131  electron transport protein SCO1/SenC  30.2 
 
 		 210 aa  75.5  0.0000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.801805  normal  0.912872 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0126  electron transport protein SCO1/SenC  30.87 
 
 		 210 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.12558  normal  0.034967 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2583  electron transport protein SCO1/SenC  28.08 
 
 		 190 aa  74.7  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2865  electron transport protein SCO1/SenC  32.52 
 
 		 217 aa  74.7  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0177907 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2710  electron transport protein SCO1/SenC  38.3 
 
 		 205 aa  74.3  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00930  Electron transport protein SCO1/SenC  33.78 
 
 		 211 aa  74.7  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.330102  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2002  electron transport protein SCO1/SenC  31.01 
 
 		 363 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446377 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2665  electron transport protein SCO1/SenC  33.33 
 
 		 204 aa  73.6  0.000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00000706149  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3890  electron transport protein SCO1/SenC  31.9 
 
 		 228 aa  73.2  0.000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0111  electron transport protein SCO1/SenC  29.53 
 
 		 210 aa  72.8  0.000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00321796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0128  electron transport protein SCO1/SenC  29.53 
 
 		 210 aa  72.4  0.000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1521  electron transport protein SCO1/SenC  29.93 
 
 		 202 aa  70.9  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2969  electron transport protein SCO1/SenC  34.21 
 
 		 208 aa  70.9  0.00000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000121806  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1572  electron transport protein SCO1/SenC  37.5 
 
 		 250 aa  70.1  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.304694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1663  electron transport protein SCO1/SenC  29.38 
 
 		 228 aa  69.3  0.00000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1948  electron transport protein SCO1/SenC  34.04 
 
 		 248 aa  69.3  0.00000000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3183  electron transport protein SCO1/SenC  30.32 
 
 		 327 aa  68.9  0.00000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.106344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2533  electron transport protein SCO1/SenC  30.32 
 
 		 327 aa  68.9  0.00000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2666  electron transport protein SCO1/SenC  30.32 
 
 		 327 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.239586  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0582  electron transport protein SCO1/SenC  32.19 
 
 		 206 aa  68.2  0.0000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0041  hypothetical protein  28.64 
 
 		 276 aa  67.4  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00194765 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0151  electron transport protein SCO1/SenC  29.94 
 
 		 210 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1650  electron transport protein SCO1/SenC  27.54 
 
 		 194 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000270735  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0216  protein of unknown function DUF420  34.29 
 
 		 444 aa  67  0.0000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.614446  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1264  hypothetical protein  35.9 
 
 		 230 aa  67.4  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2459  SCO1/SenC family protein  30.91 
 
 		 221 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.471351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2109  SCO1/SenC family protein  33.58 
 
 		 204 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2014  SCO1/SenC family protein  33.58 
 
 		 204 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0132018  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2450  electron transport protein SCO1/SenC  30.91 
 
 		 221 aa  66.2  0.0000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0486605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1751  SCO1/SenC family protein  30.18 
 
 		 218 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.132366  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1588  electron transport protein SCO1/SenC  28.77 
 
 		 188 aa  65.9  0.0000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000473469  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2416  electron transport protein SCO1/SenC  28.04 
 
 		 199 aa  65.5  0.0000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.516349  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3093  SCO1/SenC family lipoprotein  27.54 
 
 		 195 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000903349  decreased coverage  9.893850000000001e-24 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0595  SCO1/SenC family protein  32.85 
 
 		 204 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2817  SCO1/SenC family protein  29.59 
 
 		 219 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.172118  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3487  electron transport protein SCO1/SenC  30.91 
 
 		 221 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.108073  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0564  SCO1/SenC family protein  29.59 
 
 		 232 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0753  SCO1/SenC family protein  32.85 
 
 		 204 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0614736  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2758  SCO1/SenC family protein  29.59 
 
 		 219 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1660  SCO1/SenC family protein  32.85 
 
 		 204 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0522  SCO1/SenC family protein  32.85 
 
 		 204 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1768  SCO1/SenC family protein  29.59 
 
 		 232 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2836  SCO1/SenC family protein  29.59 
 
 		 232 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.683043  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2445  SCO1/SenC family protein  29.59 
 
 		 232 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4695  hypothetical protein  31.1 
 
 		 235 aa  64.7  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0489031  normal  0.712544 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0705  SCO1/SenC family protein  32.85 
 
 		 204 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2231  SCO1/SenC family lipoprotein  27.54 
 
 		 195 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00820303  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2284  electron transport protein SCO1/SenC  30.91 
 
 		 221 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.882124 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2292  putative transmembrane protein  42.22 
 
 		 207 aa  63.9  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.765986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0879  SCO1/SenC family protein  32.85 
 
 		 209 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1125  electron transport protein SCO1/SenC  36.3 
 
 		 247 aa  63.9  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.195458  normal  0.850064 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2278  lipoprotein  27.54 
 
 		 195 aa  63.5  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000821147  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1038  electron transport protein SCO1/SenC  30.23 
 
 		 217 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.303988 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2093  lipoprotein  27.54 
 
 		 195 aa  63.2  0.000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0265968  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2033  cytochrome c oxidase Cu(A) center assembly protein  27.54 
 
 		 195 aa  63.2  0.000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000016443  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1844  electron transport protein SCO1/SenC  31.72 
 
 		 185 aa  63.2  0.000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000125528  decreased coverage  0.00834843 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2274  SCO1/SenC family lipoprotein  27.54 
 
 		 195 aa  63.2  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.19701e-47 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2249  lipoprotein  27.54 
 
 		 195 aa  63.2  0.000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00171522  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2149  electron transport protein SCO1/SenC  30.41 
 
 		 275 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.430899  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0188  electron transport protein SCO1/SenC  30.52 
 
 		 203 aa  62.8  0.000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.929961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1577  electron transport protein SCO1/SenC  29.59 
 
 		 200 aa  62.4  0.000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1978  hypothetical protein  34.55 
 
 		 208 aa  62.8  0.000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.572357 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2072  electron transport protein SCO1/SenC  28.68 
 
 		 195 aa  62.8  0.000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0311949  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5562  electron transport protein SCO1/SenC  27.1 
 
 		 210 aa  62.8  0.000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.608638 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2031  cytochrome c oxidase Cu(A) center assembly protein  26.81 
 
 		 195 aa  62.4  0.000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0152904  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1225  electron transport protein SCO1/SenC  31.85 
 
 		 245 aa  62.4  0.000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3488  electron transport protein SCO1/SenC  36.13 
 
 		 218 aa  62  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03040  signal peptide protein  30.08 
 
 		 194 aa  61.6  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0471511 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1398  SCO1/SenC family protein  28.77 
 
 		 193 aa  60.8  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0070  electron transport protein SCO1/SenC  25.68 
 
 		 211 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0248  hypothetical protein  26.52 
 
 		 274 aa  60.8  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000174158  hitchhiker  0.00180581 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2359  SCO1/SenC family lipoprotein  26.81 
 
 		 195 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000369081  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3891  electron transport protein SCO1/SenC  36.84 
 
 		 222 aa  61.2  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0677  electron transport protein SCO1/SenC  30.99 
 
 		 211 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.606062  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1156  electron transport protein SCO1/SenC  30.99 
 
 		 211 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1132  electron transport protein SCO1/SenC  30.99 
 
 		 211 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.323541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0045  GGDEF  28.47 
 
 		 219 aa  60.8  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.986314 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2283  electron transport protein SCO1/SenC  35.29 
 
 		 218 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.897597  normal  0.85963 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1034  electron transport protein SCO1/SenC  29.65 
 
 		 217 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.240451  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0532  electron transport protein SCO1/SenC  23.16 
 
 		 210 aa  60.1  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2627  electron transport protein SCO1/SenC  33.33 
 
 		 425 aa  60.5  0.00000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2918  electron transport protein SCO1/SenC  28.77 
 
 		 213 aa  59.7  0.00000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00907715  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4298  electron transport protein SCO1/SenC  30.47 
 
 		 356 aa  59.7  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.576554  normal  0.116198 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4124  hypothetical protein  35 
 
 		 214 aa  59.7  0.00000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0218  hypothetical protein  24.85 
 
 		 278 aa  58.9  0.00000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.540785  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4268  electron transport protein SCO1/SenC  29.82 
 
 		 226 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5259  Sco1/SenC family protein  27.03 
 
 		 210 aa  58.9  0.00000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>