More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_1217 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_1217  Galactose 1-dehydrogenase  100 
 
 		 308 aa  632  1e-180  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.262624  decreased coverage  0.00000117945 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1072  Galactose 1-dehydrogenase  95.13 
 
 		 308 aa  603  9.999999999999999e-173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.524055  decreased coverage  0.00000279105 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0768  galactose 1-dehydrogenase  79.55 
 
 		 308 aa  516  1.0000000000000001e-145  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0771142 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3077  galactose 1-dehydrogenase  60.71 
 
 		 323 aa  389  1e-107  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.212276 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1420  galactose 1-dehydrogenase  59.93 
 
 		 311 aa  381  1e-105  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1330  galactose 1-dehydrogenase  61.89 
 
 		 308 aa  380  1e-104  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0301596 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0941  D-galactose 1-dehydrogenase, putative  58.69 
 
 		 311 aa  373  1e-102  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.287726  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2134  galactose 1-dehydrogenase  58.44 
 
 		 308 aa  371  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0883  putative D-galactose 1-dehydrogenase  58.69 
 
 		 341 aa  374  1e-102  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1017  galactose 1-dehydrogenase  58.44 
 
 		 308 aa  370  1e-101  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3971  galactose 1-dehydrogenase  57.38 
 
 		 310 aa  364  1e-100  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0549531  normal  0.657914 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4587  galactose 1-dehydrogenase  58.55 
 
 		 309 aa  364  1e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00120434 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4216  galactose 1-dehydrogenase  57.65 
 
 		 309 aa  363  3e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.552547  normal  0.714025 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5217  D-galactose 1-dehydrogenase  58.22 
 
 		 309 aa  362  4e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5642  galactose 1-dehydrogenase  58.22 
 
 		 309 aa  362  4e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00221401  normal  0.105539 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5477  galactose 1-dehydrogenase  57.1 
 
 		 309 aa  358  5e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0273658 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2597  Galactose 1-dehydrogenase  58.17 
 
 		 312 aa  358  6e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.730979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0843  galactose 1-dehydrogenase  55.26 
 
 		 310 aa  356  1.9999999999999998e-97  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4922  galactose 1-dehydrogenase  56.77 
 
 		 309 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.486884 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0043  L-arabinose 1-dehydrogenase (NADP+)  57.1 
 
 		 309 aa  354  1e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3007  Galactose 1-dehydrogenase  58.03 
 
 		 312 aa  353  2e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3205  galactose 1-dehydrogenase  56.77 
 
 		 309 aa  352  5e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.143629 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3616  galactose 1-dehydrogenase  55.95 
 
 		 318 aa  352  5e-96  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04345  galactose 1-dehydrogenase  54.79 
 
 		 311 aa  350  1e-95  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1629  dehydrogenase  57.1 
 
 		 309 aa  350  2e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0358495  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3910  dehydrogenase  50.5 
 
 		 315 aa  327  1.0000000000000001e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.715875  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4245  galactose 1-dehydrogenase  53.11 
 
 		 303 aa  307  2.0000000000000002e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.358266 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4782  D-galactose 1-dehydrogenase  47.73 
 
 		 308 aa  306  3e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.144052  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4331  D-galactose 1-dehydrogenase  48.38 
 
 		 308 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4632  galactose 1-dehydrogenase  52.48 
 
 		 313 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0523811 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0745  D-galactose 1-dehydrogenase  42.81 
 
 		 306 aa  249  3e-65  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2159  oxidoreductase domain-containing protein  30 
 
 		 351 aa  80.9  0.00000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.473931 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0406  oxidoreductase domain protein  26.67 
 
 		 340 aa  75.9  0.0000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1365  oxidoreductase domain-containing protein  29.27 
 
 		 355 aa  75.5  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05780  predicted dehydrogenase  26.42 
 
 		 404 aa  74.7  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17291  putative oxidoreductase  32.11 
 
 		 369 aa  73.6  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1736  oxidoreductase domain protein  35.77 
 
 		 333 aa  72.8  0.000000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5222  oxidoreductase domain protein  29.56 
 
 		 358 aa  70.9  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.465619 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5485  oxidoreductase domain protein  30.19 
 
 		 358 aa  70.9  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.863826  normal  0.176545 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4541  oxidoreductase domain protein  24.7 
 
 		 373 aa  70.1  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1960  gfo/idh/mocA family protein  27.18 
 
 		 351 aa  70.5  0.00000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.430175  normal  0.910454 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3572  oxidoreductase domain-containing protein  27.8 
 
 		 359 aa  70.1  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1807  gfo/idh/mocA family protein  27.18 
 
 		 347 aa  70.1  0.00000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0795  putative oxidoreductase  26.3 
 
 		 355 aa  69.3  0.00000000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.463333  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09791  putative oxidoreductase  30.36 
 
 		 373 aa  69.3  0.00000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.678537  normal  0.0468377 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2924  oxidoreductase domain-containing protein  31.54 
 
 		 354 aa  68.6  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02190  conserved hypothetical protein  29.05 
 
 		 367 aa  67.8  0.0000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1447  oxidoreductase domain protein  26.6 
 
 		 310 aa  68.2  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0737599 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0202  oxidoreductase domain-containing protein  27.18 
 
 		 359 aa  67.8  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0898  oxidoreductase domain-containing protein  25.97 
 
 		 353 aa  67.8  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.503756 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0208  oxidoreductase domain-containing protein  27.18 
 
 		 359 aa  67.8  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2154  oxidoreductase domain protein  24.34 
 
 		 347 aa  67.4  0.0000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273291  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3383  oxidoreductase domain protein  27.98 
 
 		 342 aa  67.4  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01292  predicted oxidoreductase, NADH-binding  26.67 
 
 		 351 aa  67  0.0000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2331  oxidoreductase domain protein  26.67 
 
 		 351 aa  67  0.0000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.318532  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1430  gfo/idh/mocA family protein  26.67 
 
 		 351 aa  67  0.0000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0706  putative oxidoreductase  25.85 
 
 		 331 aa  66.6  0.0000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00559097  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2310  oxidoreductase domain-containing protein  26.67 
 
 		 351 aa  67  0.0000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01303  hypothetical protein  26.67 
 
 		 351 aa  67  0.0000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  27.08 
 
 		 362 aa  66.6  0.0000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4981  oxidoreductase-like  26.7 
 
 		 337 aa  66.6  0.0000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.888288 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31670  predicted dehydrogenase  24.25 
 
 		 353 aa  66.2  0.0000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1525  gfo/idh/mocA family protein  27.92 
 
 		 351 aa  66.2  0.0000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1858  putative oxidoreductase  29.59 
 
 		 360 aa  65.9  0.0000000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.371104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2621  oxidoreductase domain protein  27.62 
 
 		 370 aa  65.9  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000494817  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1780  oxidoreductase domain-containing protein  34.62 
 
 		 360 aa  65.5  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3165  oxidoreductase-like  26.28 
 
 		 322 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.856956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3495  oxidoreductase domain protein  27.62 
 
 		 370 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1241  oxidoreductase domain protein  30.56 
 
 		 375 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.101149 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4698  oxidoreductase domain protein  24.84 
 
 		 331 aa  64.3  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.489828  normal  0.94732 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1013  oxidoreductase domain-containing protein  32.64 
 
 		 337 aa  64.7  0.000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3840  oxidoreductase domain protein  27.53 
 
 		 321 aa  63.9  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0183731  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2393  inositol 2-dehydrogenase  32.95 
 
 		 338 aa  63.9  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4326  oxidoreductase domain-containing protein  29.2 
 
 		 357 aa  63.9  0.000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.737288 
 
 
-
 
NC_006687  CNE05360  conserved hypothetical protein  29.33 
 
 		 368 aa  63.2  0.000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.895679  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1047  oxidoreductase domain protein  28.85 
 
 		 374 aa  63.5  0.000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0050  oxidoreductase domain-containing protein  30.92 
 
 		 362 aa  63.2  0.000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2332  oxidoreductase, NAD-binding  27.64 
 
 		 341 aa  62.8  0.000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.155666  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2511  NAD-binding oxidoreductase  27.64 
 
 		 341 aa  62.8  0.000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0084  oxidoreductase domain-containing protein  28.27 
 
 		 370 aa  63.2  0.000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2608  putative oxidoreductase  31.49 
 
 		 328 aa  62.8  0.000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00170971 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1608  oxidoreductase-like  24.79 
 
 		 332 aa  62.4  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0546  oxidoreductase domain protein  25.9 
 
 		 327 aa  62.4  0.000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.881948  normal  0.774462 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0137  oxidoreductase domain protein  27.47 
 
 		 377 aa  62.4  0.000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5584  oxidoreductase  29.38 
 
 		 356 aa  62  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0916209  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2251  oxidoreductase  26.83 
 
 		 341 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00205292  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0892  oxidoreductase domain protein  26.94 
 
 		 373 aa  61.2  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.359898  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2927  putative dehydrogenase  30.94 
 
 		 337 aa  61.2  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.311728  hitchhiker  0.00000297483 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04302  oxidoreductase YvaA  34.51 
 
 		 350 aa  61.6  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4956  oxidoreductase domain protein  32.52 
 
 		 344 aa  61.2  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0199  oxidoreductase domain protein  32.09 
 
 		 326 aa  61.6  0.00000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000155644  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0203  oxidoreductase domain-containing protein  25 
 
 		 346 aa  61.2  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0209  oxidoreductase domain-containing protein  25 
 
 		 346 aa  61.2  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1542  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28.64 
 
 		 318 aa  60.8  0.00000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2295  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  26.83 
 
 		 341 aa  60.5  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000710088  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0189  putative oxidoreductase  26.01 
 
 		 366 aa  60.5  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.329829  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  26.32 
 
 		 347 aa  60.8  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2743  oxidoreductase-like  31.94 
 
 		 374 aa  60.5  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.147197  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1619  oxidoreductase-like  22.69 
 
 		 332 aa  60.8  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01970  predicted dehydrogenase  26.79 
 
 		 323 aa  60.1  0.00000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.395105 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>