More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_2541 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_2541  HflK protein  100 
 
 
362 aa  735    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2800  HflK protein  94.98 
 
 
360 aa  606  9.999999999999999e-173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.182223  normal  0.400207 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2018  HflK protein  68.22 
 
 
362 aa  462  1e-129  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2818  HFLK protein  68.71 
 
 
383 aa  452  1.0000000000000001e-126  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.44638  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1794  HflK protein  60.24 
 
 
383 aa  412  1e-114  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.301305  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1353  band 7 protein:stomatin  58.73 
 
 
384 aa  408  1e-113  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.792313  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1397  hflK protein  58.13 
 
 
382 aa  402  1e-111  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1749  HflK protein  56.89 
 
 
376 aa  393  1e-108  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.254466  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1664  HflK protein  42.15 
 
 
385 aa  280  4e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0743516 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0924  HflK protein  42.19 
 
 
380 aa  271  2e-71  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2728  HflK protein  40.27 
 
 
385 aa  266  2.9999999999999995e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4005  HflK protein  40.53 
 
 
383 aa  264  2e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.906349  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3262  HflK protein  39.75 
 
 
383 aa  259  4e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.264682  normal  0.260183 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3352  HflK protein  39.38 
 
 
389 aa  255  9e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.154635 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0885  HflK protein  40.29 
 
 
394 aa  249  5e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.240559 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3670  HflK protein  40.05 
 
 
399 aa  249  5e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.119308  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2038  HflK protein  39.52 
 
 
390 aa  246  6.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.989603  normal  0.793303 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1956  HflK protein  39.94 
 
 
387 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.733622  normal  0.100531 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0357  HflK protein  39.36 
 
 
393 aa  242  9e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.24266  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2001  HflK protein  39.36 
 
 
393 aa  241  1e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.610891  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2736  Protein HflK  37.72 
 
 
382 aa  238  1e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.12799  normal  0.0330194 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2203  HflK  38.87 
 
 
407 aa  237  3e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2349  HflK  39.22 
 
 
382 aa  233  3e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.384267  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0604  HflK protein  37.01 
 
 
368 aa  231  1e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0450848 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0603  HflK  37.43 
 
 
395 aa  230  3e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.425074 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2665  heat shock protein HslU  36.11 
 
 
386 aa  230  3e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.288159  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1090  HflK protein  39.2 
 
 
405 aa  229  8e-59  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3173  HflK protein  39.1 
 
 
394 aa  228  2e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2978  HflK  36.39 
 
 
436 aa  226  5.0000000000000005e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.750881  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6097  protease activity modulator HflK  39.41 
 
 
379 aa  226  5.0000000000000005e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1730  HflK protein  37.66 
 
 
389 aa  226  6e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000348315 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4940  hflK protein  36.21 
 
 
395 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0574  HflK  35.69 
 
 
400 aa  220  3e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.872643 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3383  HflK protein  36.46 
 
 
433 aa  219  5e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1431  HflK protein  35.68 
 
 
471 aa  217  2e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.936066 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2674  HflK protein  41.2 
 
 
388 aa  216  5e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0162976 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2630  HflK protein  36.36 
 
 
414 aa  214  9.999999999999999e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.587706  unclonable  0.00000000000633953 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1177  HflK protein  34.63 
 
 
451 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.621922 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1097  HflK protein  34.63 
 
 
451 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0899  HflK protein  39.17 
 
 
393 aa  213  4.9999999999999996e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0975444  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0445  HflK protein  36.06 
 
 
399 aa  211  2e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.713082  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1573  HflK protein  35.34 
 
 
367 aa  211  2e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000427817  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2458  HflK protein  38.35 
 
 
398 aa  211  2e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0761893 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2099  HflK protein  35.84 
 
 
447 aa  209  9e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.080069 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0673  HflK protein  36.45 
 
 
498 aa  208  1e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5012  HflK protein  34.27 
 
 
464 aa  207  2e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.967957  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1066  HflK protein  33.42 
 
 
477 aa  207  2e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.544735  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0263  HflK protein  37.1 
 
 
360 aa  207  3e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0537  HflK protein  36.11 
 
 
418 aa  206  4e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.141396  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1284  HflK protein  32.52 
 
 
503 aa  206  5e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2767  HflK protein  35.36 
 
 
394 aa  206  6e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.397323  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1413  HflK protein  34.51 
 
 
465 aa  205  8e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.843638  hitchhiker  0.0000076277 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0575  HflK protein  35.51 
 
 
459 aa  204  1e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.289879  hitchhiker  0.000000000363385 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0637  HflK protein  35.93 
 
 
389 aa  205  1e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0128609 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1089  HflK protein  37.76 
 
 
386 aa  204  2e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0604271 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0866  HflK protein  37.82 
 
 
387 aa  204  2e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0134837  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4892  HflK protein  37.43 
 
 
405 aa  203  3e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.42676  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0664  HflK protein  34.95 
 
 
395 aa  203  3e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.119349  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4768  HflK protein  37.43 
 
 
393 aa  203  3e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4944  HflK protein  37.43 
 
 
393 aa  203  3e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00499727 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2946  HflK protein  39.65 
 
 
359 aa  202  5e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2194  HflK protein  34.17 
 
 
456 aa  202  7e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0701  HflK protein  37.24 
 
 
389 aa  202  9e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.704502  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0525  HflK  35.28 
 
 
389 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.325556  normal  0.48129 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1158  HflK protein  33.15 
 
 
475 aa  202  9.999999999999999e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65280  protease subunit HflK  35.2 
 
 
400 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0494  HflK protein  36.5 
 
 
420 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0869387  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2279  HflK protein  39.06 
 
 
378 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2079  HflK  35.33 
 
 
457 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2601  HflK protein  33.06 
 
 
474 aa  201  1.9999999999999998e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.373557  normal  0.662751 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1879  HflK protein  32.97 
 
 
471 aa  201  1.9999999999999998e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.239775  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1989  hypothetical protein  34.74 
 
 
435 aa  200  3e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.757808  normal  0.0447269 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07560  membrane bound protease regulator HflK  39.52 
 
 
351 aa  200  3e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4683  HflK protein  36.59 
 
 
393 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2780  HflK protein  37.32 
 
 
379 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.224376 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5671  protease subunit HflK  34.92 
 
 
399 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2241  ftsH protease activity modulator HflK  34.51 
 
 
445 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.753349  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3384  HflK protein  38.01 
 
 
359 aa  197  3e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.16512  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0831  hflK protein  32.19 
 
 
344 aa  197  3e-49  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.604081  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0073  HflK protein  32.72 
 
 
452 aa  197  3e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.715541  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0560  HflK protein  33.7 
 
 
379 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000508673  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2588  HflK-like protein  34.75 
 
 
413 aa  196  4.0000000000000005e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0268051  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1601  FtsH protease activity modulator HflK  33.42 
 
 
460 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.559516  normal  0.13244 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2885  HflK protein  37.61 
 
 
382 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0843  HflK  33.62 
 
 
355 aa  196  5.000000000000001e-49  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2658  HflK protein  37.61 
 
 
382 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.832603 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2534  HflK protein  33.69 
 
 
466 aa  196  6e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0683686  hitchhiker  0.0000321559 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1587  HflK protein  35.44 
 
 
391 aa  196  7e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  unclonable  0.000000287062 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1099  HflK protein  34.24 
 
 
437 aa  196  8.000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1338  ftsH protease activity modulator HflK  34.24 
 
 
437 aa  196  8.000000000000001e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.123813  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1827  HflK protein  34.24 
 
 
437 aa  196  8.000000000000001e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0069  ftsH protease activity modulator HflK  34.24 
 
 
449 aa  195  9e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.255254  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0605  hflK protein  33.7 
 
 
381 aa  195  1e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3309  HflK protein  33.62 
 
 
386 aa  195  1e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2347  ftsH protease activity modulator HflK  34.24 
 
 
442 aa  194  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2220  HflK protein  34.24 
 
 
454 aa  194  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3708  HflK protein  33.7 
 
 
379 aa  193  3e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000788714  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3765  HflK protein  33.7 
 
 
379 aa  193  3e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000022736  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3891  HflK protein  33.7 
 
 
379 aa  193  3e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000465537  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2182  HflK protein  33.97 
 
 
454 aa  193  4e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>