171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_4174 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_4174  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 186 aa  372  1e-102  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.482122  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3885  MarR family transcriptional regulator  83.96 
 
 		 185 aa  300  6.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0480045  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4853  transcriptional regulator, MarR family  81.72 
 
 		 183 aa  286  1e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1387  MarR family transcriptional regulator  75.54 
 
 		 185 aa  267  5e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.207985  normal  0.461788 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3138  MarR family transcriptional regulator  75.41 
 
 		 182 aa  261  4e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2519  MarR family transcriptional regulator  77.44 
 
 		 169 aa  251  3e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.106367 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1738  MarR family transcriptional regulator  79.87 
 
 		 169 aa  243  9.999999999999999e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182936  normal  0.307444 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2557  MarR family transcriptional regulator  60.84 
 
 		 183 aa  191  7e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2244  MarR family transcriptional regulator  63.64 
 
 		 160 aa  169  2e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.402427  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2510  transcriptional regulator, MarR family  58.99 
 
 		 179 aa  169  3e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6016  MarR family transcriptional regulator  54.88 
 
 		 226 aa  168  4e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0276025 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2749  transcriptional regulator, MarR family  62.04 
 
 		 163 aa  165  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.399599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7271  transcriptional regulator, MarR family  60 
 
 		 184 aa  165  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2270  MarR family transcriptional regulator  56.55 
 
 		 172 aa  164  5.9999999999999996e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.689924  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2809  transcriptional regulator, MarR family  61.43 
 
 		 191 aa  163  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.716089 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2586  regulatory protein MarR  61.43 
 
 		 191 aa  163  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3012  transcriptional regulator, MarR family  62.88 
 
 		 163 aa  162  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2614  transcriptional regulator, MarR family  60 
 
 		 187 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.68039 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2141  MarR family transcriptional regulator  61.36 
 
 		 174 aa  161  5.0000000000000005e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.223544  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3163  transcriptional regulator MarR family  60 
 
 		 154 aa  157  6e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.165579  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1645  MarR family transcriptional regulator  55.64 
 
 		 173 aa  157  1e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1520  MarR family transcriptional regulator  54.96 
 
 		 179 aa  152  2e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.935208  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4070  MarR family transcriptional regulator  56.76 
 
 		 181 aa  152  2e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.650138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1470  MarR family transcriptional regulator  48.77 
 
 		 237 aa  152  2e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2224  MarR family transcriptional regulator  53.49 
 
 		 179 aa  123  2e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3300  transcriptional regulator  44.7 
 
 		 168 aa  120  9.999999999999999e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2800  MarR family transcriptional regulator  44.27 
 
 		 169 aa  118  4.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0093  MarR family transcriptional regulator  42.66 
 
 		 169 aa  117  9.999999999999999e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.560358 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1139  MarR family transcriptional regulator  44.27 
 
 		 169 aa  115  3e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.453374  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0851  MarR family transcriptional regulator  48.46 
 
 		 172 aa  115  3.9999999999999997e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.277928  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2925  MarR family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 170 aa  111  5e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.652436 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2787  MarR family transcriptional regulator  43.51 
 
 		 169 aa  100  9e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2601  MarR family transcriptional regulator  48.09 
 
 		 172 aa  98.6  5e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.62528 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3510  transcriptional regulator, MarR family  46.6 
 
 		 167 aa  98.6  5e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3578  transcriptional regulator, MarR family  46.6 
 
 		 167 aa  98.2  7e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3429  MarR family transcriptional regulator  44.66 
 
 		 152 aa  95.9  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.063999  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3286  transcriptional regulator, MarR family  43.17 
 
 		 183 aa  94.4  9e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4078  MarR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 175 aa  94  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.419804 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2241  transcriptional regulator, putative  38.89 
 
 		 148 aa  92  4e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2652  MarR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 151 aa  91.7  6e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2708  regulatory protein MarR  38.38 
 
 		 151 aa  91.7  6e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2518  MarR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 160 aa  90.5  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000237934  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43140  MarR family transcriptional regulator  41.6 
 
 		 158 aa  89.7  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00364645  normal  0.320995 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2292  MarR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 158 aa  89.4  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00249883  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3619  MarR family transcriptional regulator  42.73 
 
 		 157 aa  87.8  7e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1840  regulatory protein, MarR  37.86 
 
 		 156 aa  87.4  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.076526  normal  0.360744 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0046  MarR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 187 aa  87.4  1e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.283785 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1793  MarR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 160 aa  87.4  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.390587  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2441  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 		 160 aa  86.7  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0799382  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2312  MarR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 160 aa  85.9  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.986519  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2280  MarR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 160 aa  85.9  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0185424  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2233  MarR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 160 aa  85.9  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.476984  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2487  MarR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 160 aa  85.9  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.229452  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2894  transcriptional regulator, MarR family  35.45 
 
 		 160 aa  86.3  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000195714  normal  0.301041 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2508  transcriptional regulator, MarR family  32.8 
 
 		 160 aa  85.9  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.888447 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2582  transcriptional regulator, MarR family  32.8 
 
 		 160 aa  86.3  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000123065  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0772  MarR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 146 aa  84.7  7e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.22208 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3279  MarR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 148 aa  82.8  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.861844  normal  0.752327 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2672  MarR family transcriptional regulator  36.29 
 
 		 145 aa  82  0.000000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.273141  normal  0.798793 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1988  MarR family transcriptional regulator  39.52 
 
 		 147 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.27646  hitchhiker  0.00136525 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1712  MarR family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 147 aa  79.3  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.178238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2086  MarR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 155 aa  70.1  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.788837  hitchhiker  0.000000978102 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0488  MarR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 160 aa  60.1  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.123923  normal  0.124611 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7636  MarR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 159 aa  54.7  0.0000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.582154 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3246  MarR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 147 aa  53.5  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0312  MarR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 146 aa  53.5  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2138  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 157 aa  52.4  0.000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.14968  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0517  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 		 161 aa  52  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4630  MarR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 321 aa  50.8  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6026  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 325 aa  50.4  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4238  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 146 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4128  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 146 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.565602  normal  0.462864 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3391  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 146 aa  49.7  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.917296 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3730  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 		 151 aa  48.9  0.00004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0482  MarR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 162 aa  48.9  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.537817  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1757  MarR family transcriptional regulator  25.23 
 
 		 150 aa  48.1  0.00006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.888678  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1625  MarR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 156 aa  48.1  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3030  MarR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 150 aa  47.8  0.00009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.286737  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2951  MarR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 150 aa  47.8  0.00009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.316787  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1907  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 146 aa  47.8  0.00009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.663626 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3263  MarR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 150 aa  47.8  0.00009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1999  transcriptional regulator, MarR family  26.88 
 
 		 150 aa  47.8  0.00009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3281  transcriptional regulator, MarR family  26.88 
 
 		 150 aa  47.8  0.00009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3274  MarR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 150 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.154941  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3251  transcriptional regulator, MarR family  26.88 
 
 		 150 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2254  MarR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 144 aa  47  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4043  MarR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 326 aa  47.4  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.529285 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4501  MarR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 336 aa  47.4  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.795895  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0023  transcriptional regulator, TrmB  29.13 
 
 		 151 aa  47  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7562  MarR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 326 aa  46.6  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.774028 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0659  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 159 aa  46.6  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.51685 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0095  MarR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 142 aa  47  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3300  transcriptional regulator, MarR family  31.58 
 
 		 147 aa  47  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0324  transcriptional regulator, MarR family  27.94 
 
 		 150 aa  46.6  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.491291  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6596  transcriptional regulator, MarR family  28.41 
 
 		 140 aa  46.6  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000155903 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0098  MarR family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 186 aa  46.6  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6586  MarR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 326 aa  45.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.107316  normal  0.0388033 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6104  MarR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 326 aa  45.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0093  MarR family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 186 aa  46.2  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4464  MarR family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 143 aa  45.8  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>