More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_3687 on replicon NC_008607
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008607  Ppro_3687  lipoprotein signal peptidase  100 
 
 		 164 aa  335  1.9999999999999998e-91  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4314  lipoprotein signal peptidase  56.79 
 
 		 163 aa  183  1.0000000000000001e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00081258  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3756  lipoprotein signal peptidase  54.6 
 
 		 164 aa  182  2.0000000000000003e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0352  lipoprotein signal peptidase  53.9 
 
 		 162 aa  173  9e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.947194  normal  0.0144306 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3135  lipoprotein signal peptidase  55.56 
 
 		 160 aa  167  6e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.269423  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3597  lipoprotein signal peptidase  54.17 
 
 		 161 aa  167  7e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000941199  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0982  lipoprotein signal peptidase  51.39 
 
 		 162 aa  163  1.0000000000000001e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000103329  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2454  lipoprotein signal peptidase  44.81 
 
 		 161 aa  156  1e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.996956  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3649  lipoprotein signal peptidase  54.23 
 
 		 164 aa  151  4e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0184315  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3217  lipoprotein signal peptidase  47.06 
 
 		 163 aa  124  4.0000000000000003e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0386  lipoprotein signal peptidase  42.38 
 
 		 178 aa  122  3e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.000832352  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1239  lipoprotein signal peptidase  39.74 
 
 		 165 aa  116  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.261124  normal  0.0513456 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2254  signal peptidase II  43.38 
 
 		 158 aa  115  3e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0126401  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2555  lipoprotein signal peptidase  40.94 
 
 		 169 aa  114  6e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00974385 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03029  lipoprotein signal peptidase  43.8 
 
 		 182 aa  113  1.0000000000000001e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.810128  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1190  lipoprotein signal peptidase  42.38 
 
 		 160 aa  112  3e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0123  lipoprotein signal peptidase  42.14 
 
 		 153 aa  110  7.000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0839092  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1183  signal peptidase II  40.69 
 
 		 180 aa  110  8.000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2276  lipoprotein signal peptidase  38.51 
 
 		 154 aa  108  3e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11790  lipoprotein signal peptidase  40.28 
 
 		 167 aa  107  7.000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1835  lipoprotein signal peptidase  36.54 
 
 		 157 aa  107  1e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.672257  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0710  lipoprotein signal peptidase  42.45 
 
 		 152 aa  105  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000108511 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5199  lipoprotein signal peptidase  40.14 
 
 		 169 aa  106  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.864833  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0555  lipoprotein signal peptidase  42.45 
 
 		 152 aa  105  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.803857  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60360  lipoprotein signal peptidase  40.14 
 
 		 169 aa  105  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000409977 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0265  lipoprotein signal peptidase  36.42 
 
 		 166 aa  105  3e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0465894 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1409  lipoprotein signal peptidase  42.45 
 
 		 170 aa  103  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4851  lipoprotein signal peptidase  38.3 
 
 		 170 aa  103  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.589527 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1893  lipoprotein signal peptidase  40.56 
 
 		 202 aa  103  1e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0711  lipoprotein signal peptidase  37.5 
 
 		 168 aa  102  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.395122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3270  lipoprotein signal peptidase  36.36 
 
 		 173 aa  102  2e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4558  lipoprotein signal peptidase  39.29 
 
 		 171 aa  102  3e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.21418  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0604  lipoprotein signal peptidase  38.3 
 
 		 176 aa  101  5e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.975545  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1459  lipoprotein signal peptidase  41.61 
 
 		 163 aa  101  5e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.419525 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2231  lipoprotein signal peptidase  42.25 
 
 		 189 aa  101  5e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1814  lipoprotein signal peptidase  38.89 
 
 		 358 aa  101  5e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.344803 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0645  lipoprotein signal peptidase  38.3 
 
 		 171 aa  101  5e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.11552 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1100  lipoprotein signal peptidase  38.19 
 
 		 170 aa  101  5e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.955311  normal  0.240164 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0954  lipoprotein signal peptidase  38.1 
 
 		 169 aa  101  5e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.30324 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3177  lipoprotein signal peptidase  36.3 
 
 		 164 aa  100  6e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0650  lipoprotein signal peptidase  38.57 
 
 		 171 aa  100  9e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.177868 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0549  lipoprotein signal peptidase  36.99 
 
 		 170 aa  100  9e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.380101  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1741  lipoprotein signal peptidase  41.91 
 
 		 162 aa  99.8  1e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1858  signal peptidase II  41.91 
 
 		 157 aa  100  1e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3047  signal peptidase II  40.97 
 
 		 164 aa  100  1e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.242579  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0807  lipoprotein signal peptidase  35.42 
 
 		 173 aa  99  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1195  lipoprotein signal peptidase  36.99 
 
 		 176 aa  99.4  2e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0349853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2143  signal peptidase II  33.77 
 
 		 156 aa  99.4  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1292  lipoprotein signal peptidase  35.48 
 
 		 176 aa  99.4  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2655  lipoprotein signal peptidase  41.73 
 
 		 160 aa  99  2e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1431  lipoprotein signal peptidase  41.67 
 
 		 169 aa  99  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2722  lipoprotein signal peptidase  39.01 
 
 		 182 aa  99  2e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.214135  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0925  lipoprotein signal peptidase  39.26 
 
 		 168 aa  99.8  2e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3531  lipoprotein signal peptidase  36.69 
 
 		 170 aa  98.6  3e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2565  lipoprotein signal peptidase  39.73 
 
 		 150 aa  98.6  3e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.958403 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0863  lipoprotein signal peptidase  38.85 
 
 		 173 aa  98.6  3e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4229  lipoprotein signal peptidase  40.69 
 
 		 168 aa  98.6  3e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.266217  hitchhiker  0.00107188 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2146  signal peptidase II  39.46 
 
 		 159 aa  98.6  3e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0487  lipoprotein signal peptidase  36.02 
 
 		 178 aa  98.2  4e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3274  lipoprotein signal peptidase  38.82 
 
 		 171 aa  98.2  5e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00894133  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0480  lipoprotein signal peptidase  39.07 
 
 		 159 aa  98.2  5e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1084  lipoprotein signal peptidase  36.62 
 
 		 170 aa  97.8  5e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2956  lipoprotein signal peptidase  36.69 
 
 		 170 aa  97.8  5e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0330316  normal  0.232232 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3038  lipoprotein signal peptidase  36.69 
 
 		 170 aa  97.8  5e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0554582  normal  0.30778 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2889  lipoprotein signal peptidase  36.43 
 
 		 170 aa  97.8  5e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0332011  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3135  lipoprotein signal peptidase  36.69 
 
 		 170 aa  97.8  5e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5353  lipoprotein signal peptidase  39.33 
 
 		 357 aa  97.4  6e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00779044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09320  lipoprotein signal peptidase  36.36 
 
 		 145 aa  97.4  7e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00061275  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3045  lipoprotein signal peptidase  37.5 
 
 		 159 aa  97.4  8e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.141498 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1860  signal peptidase II  40 
 
 		 174 aa  97.4  8e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3203  lipoprotein signal peptidase  42.66 
 
 		 154 aa  96.7  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1117  lipoprotein signal peptidase  37.59 
 
 		 165 aa  96.7  1e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.149841  normal  0.0706096 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1323  lipoprotein signal peptidase  40.14 
 
 		 152 aa  96.7  1e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1352  lipoprotein signal peptidase  36.49 
 
 		 235 aa  96.7  1e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.136242  normal  0.167028 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0509  lipoprotein signal peptidase  36.11 
 
 		 163 aa  95.9  2e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0573  lipoprotein signal peptidase  39.31 
 
 		 166 aa  96.3  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00741417 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1040  lipoprotein signal peptidase  37.67 
 
 		 155 aa  96.3  2e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000244755  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1243  signal peptidase II  40.13 
 
 		 364 aa  95.5  3e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2146  lipoprotein signal peptidase  39.6 
 
 		 167 aa  95.5  3e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.669133  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0196  lipoprotein signal peptidase  42.34 
 
 		 170 aa  95.5  3e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2630  peptidase A8, signal peptidase II  38.03 
 
 		 166 aa  95.5  3e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.946096 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0472  lipoprotein signal peptidase  39.33 
 
 		 170 aa  95.5  3e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0222  lipoprotein signal peptidase  42.34 
 
 		 170 aa  95.5  3e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2327  lipoprotein signal peptidase  39.47 
 
 		 170 aa  95.5  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1105  lipoprotein signal peptidase  39.33 
 
 		 170 aa  95.5  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1119  lipoprotein signal peptidase  41.67 
 
 		 173 aa  95.5  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2904  lipoprotein signal peptidase  39.33 
 
 		 170 aa  95.5  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.353036  normal  0.916389 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1606  lipoprotein signal peptidase  39.33 
 
 		 170 aa  95.5  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.322844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2910  lipoprotein signal peptidase  39.33 
 
 		 170 aa  95.5  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0390  lipoprotein signal peptidase  39.33 
 
 		 170 aa  95.5  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.259079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0884  lipoprotein signal peptidase  39.33 
 
 		 170 aa  95.5  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.978547 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3473  lipoprotein signal peptidase  42.34 
 
 		 170 aa  95.5  3e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.911066  normal  0.126226 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0889  lipoprotein signal peptidase  39.47 
 
 		 170 aa  95.5  3e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1671  lipoprotein signal peptidase  36.11 
 
 		 165 aa  95.5  3e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4493  lipoprotein signal peptidase  42.76 
 
 		 180 aa  94.7  4e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.124328  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0588  lipoprotein signal peptidase  36.05 
 
 		 168 aa  94.7  5e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.510976  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2459  lipoprotein signal peptidase  38.46 
 
 		 173 aa  94.4  7e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.417163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1060  lipoprotein signal peptidase  35.97 
 
 		 171 aa  94.4  7e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.189146  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1034  lipoprotein signal peptidase  37.93 
 
 		 166 aa  94  8e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2659  lipoprotein signal peptidase  37.93 
 
 		 166 aa  94  8e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.261426  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>