More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_0408 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4988  CheA signal transduction histidine kinase  54.35 
 
 		 1646 aa  897    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.4615  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3085  CheA signal transduction histidine kinase  47.96 
 
 		 2212 aa  655    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.284349 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5030  sensor histidine kinase/response regulator  59.94 
 
 		 1987 aa  1028    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3772  CheA signal transduction histidine kinase  42.49 
 
 		 2539 aa  1071    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0492  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  60.26 
 
 		 1992 aa  1025    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1813  putative hybrid two-component sensor and regulatory protein  42.59 
 
 		 2284 aa  704    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.409027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0126  CheA signal transduction histidine kinase  39.64 
 
 		 1758 aa  736    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5304  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  61.74 
 
 		 1971 aa  1051    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.266028 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0408  CheA signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 2423 aa  4804    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0476  CheA signal transduction histidine kinase  55.46 
 
 		 1629 aa  913    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01607  PilL protein  47.06 
 
 		 2301 aa  651    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.68194  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5038  CheA signal transduction histidine kinase  54.23 
 
 		 1647 aa  901    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2900  putative CheA signal transduction histidine kinase  59.19 
 
 		 1974 aa  721    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0513  response regulator  68.19 
 
 		 2458 aa  3073    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4862  CheA signal transduction histidine kinase  54.14 
 
 		 1646 aa  896    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00418474 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3629  putative CheA signal transduction histidine kinases  56.55 
 
 		 2336 aa  861    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2096  CheA signal transduction histidine kinases  44.65 
 
 		 2301 aa  754    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05390  ChpA  67.29 
 
 		 2476 aa  2141    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.812783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1020  putative CheA signal transduction histidine kinase  44.85 
 
 		 1725 aa  624  1e-177  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0896  CheA signal transduction histidine kinase  44.73 
 
 		 1725 aa  620  1e-176  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.720203  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0359  CheA signal transduction histidine kinases  52.62 
 
 		 1834 aa  621  1e-176  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.505566  normal  0.609353 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2396  CheA signal transduction histidine kinase  45.8 
 
 		 1832 aa  612  1e-173  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.412957 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2155  CheA signal transduction histidine kinase  40.41 
 
 		 1609 aa  604  1.0000000000000001e-171  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0616  CheA signal transduction histidine kinase  33.7 
 
 		 2009 aa  525  1e-147  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2548  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  39.97 
 
 		 1960 aa  521  1e-146  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.798517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3895  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  39.41 
 
 		 1866 aa  514  1e-144  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0518  CheA signal transduction histidine kinase  38.84 
 
 		 2175 aa  516  1e-144  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0672  putative composite two component regulatory (sensor histidine kinase and response regulator hybrid) transcription regulator protein  40.6 
 
 		 2048 aa  509  9.999999999999999e-143  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.843202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1375  CheA signal transduction histidine kinases  38.6 
 
 		 1888 aa  508  9.999999999999999e-143  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0905  CheA signal transduction histidine kinase  38.94 
 
 		 2164 aa  501  1e-140  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.384813 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2619  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  38.7 
 
 		 1956 aa  498  1e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3186  twitching motility protein  38.74 
 
 		 2092 aa  499  1e-139  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0988113  normal  0.323736 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3692  CheA signal transduction histidine kinase  39.82 
 
 		 1907 aa  495  9.999999999999999e-139  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2897  CheA signal transduction histidine kinase  38.73 
 
 		 2026 aa  497  9.999999999999999e-139  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.855039  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0673  CheA signal transduction histidine kinases  39.39 
 
 		 1989 aa  496  9.999999999999999e-139  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.765625  normal  0.432631 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3017  CheA signal transduction histidine kinases  38.46 
 
 		 1983 aa  491  1e-137  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0564  CheA signal transduction histidine kinase  40 
 
 		 2012 aa  491  1e-137  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.472069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3574  CheA signal transduction histidine kinases  38.64 
 
 		 2026 aa  494  1e-137  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.906934  normal  0.231875 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1246  CheA signal transduction histidine kinases  35.11 
 
 		 1643 aa  492  1e-137  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0708097  normal  0.755815 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3350  CheA signal transduction histidine kinases  38.21 
 
 		 1970 aa  493  1e-137  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1576  CheA signal transduction histidine kinase  39.06 
 
 		 2137 aa  479  1e-133  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.167147  normal  0.557453 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1140  CheA signal transduction histidine kinases  37 
 
 		 2070 aa  479  1e-133  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.607614 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3967  CheA signal transduction histidine kinase  43.27 
 
 		 2414 aa  474  1.0000000000000001e-131  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0139967 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4622  CheA signal transduction histidine kinase  35.09 
 
 		 2022 aa  456  1.0000000000000001e-126  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0505  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  33.48 
 
 		 2325 aa  342  7e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.806325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4695  putative CheA signal transduction histidine kinase  32.8 
 
 		 1127 aa  335  7.000000000000001e-90  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0859  CheA signal transduction histidine kinase  28.77 
 
 		 952 aa  327  1e-87  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.571784  normal  0.0418696 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3744  CheA signal transduction histidine kinase  33.38 
 
 		 1155 aa  326  3e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4949  CheA signal transduction histidine kinase  32.98 
 
 		 1616 aa  326  4e-87  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0519  putative CheA signal transduction histidine kinases  34.44 
 
 		 1029 aa  325  9.999999999999999e-87  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0310  chemotaxis protein CheA  29.58 
 
 		 769 aa  323  1.9999999999999998e-86  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.560249  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3779  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  30.41 
 
 		 1180 aa  323  1.9999999999999998e-86  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.274137 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0332  chemotaxis protein CheA  29.89 
 
 		 769 aa  322  3.9999999999999996e-86  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1687  chemotaxis protein CheA  29.26 
 
 		 769 aa  322  5e-86  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1530  CheA signal transduction histidine kinases  36.85 
 
 		 803 aa  322  5e-86  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1065  CheA signal transduction histidine kinase  32 
 
 		 1065 aa  321  1e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.47894  hitchhiker  0.00000140381 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1369  chemotaxis protein CheA  36.67 
 
 		 770 aa  320  2e-85  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1847  CheA signal transduction histidine kinase  31.59 
 
 		 934 aa  320  2e-85  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.379526 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0205  CheW domain protein  35.93 
 
 		 774 aa  320  3e-85  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00145615  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3559  putative CheA signal transduction histidine kinase  32.93 
 
 		 1098 aa  315  6.999999999999999e-84  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.989868 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1657  chemotaxis protein CheA  35.99 
 
 		 785 aa  313  2.9999999999999997e-83  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.153065  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2547  putative CheA signal transduction histidine kinase  32.78 
 
 		 1098 aa  311  1.0000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0331  chemotaxis histidine kinase  37.26 
 
 		 770 aa  311  1.0000000000000001e-82  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2792  CheA signal transduction histidine kinase  35.41 
 
 		 1012 aa  309  4.0000000000000004e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1580  putative response regulator of two-component system  35.17 
 
 		 783 aa  307  1.0000000000000001e-81  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4126  CheA signal transduction histidine kinase  36.42 
 
 		 755 aa  305  5.000000000000001e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.153494  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1427  CheA signal transduction histidine kinase  32.67 
 
 		 1078 aa  305  6.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.29605  normal  0.224222 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0062  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  30.47 
 
 		 974 aa  305  7.000000000000001e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.172563  normal  0.120258 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1056  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  35.32 
 
 		 764 aa  305  1e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.355241  normal  0.810589 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3244  putative CheA signal transduction histidine kinases  32.16 
 
 		 1197 aa  301  7e-80  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.11034  normal  0.765258 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2775  CheA signal transduction histidine kinase  32.09 
 
 		 1125 aa  298  6e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.74774  normal  0.345164 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1492  CheA signal transduction histidine kinase  35.86 
 
 		 762 aa  298  9e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0312687  normal  0.934055 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4230  CheA signal transduction histidine kinase  35.61 
 
 		 765 aa  297  2e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1433  putative chemotaxis sensor/effector fusion protein  31.72 
 
 		 764 aa  297  2e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.654463  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1097  CheA signal transduction histidine kinase  35.61 
 
 		 767 aa  297  2e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3342  CheA signal transduction histidine kinase  31.78 
 
 		 1137 aa  296  3e-78  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1834  CheA signal transduction histidine kinases  35.25 
 
 		 878 aa  296  3e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4602  CheA signal transduction histidine kinase  31.8 
 
 		 974 aa  293  2e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2405  CheA signal transduction histidine kinase  31.17 
 
 		 740 aa  293  4e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.588075  normal  0.188448 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1014  CheA signal transduction histidine kinase  27.69 
 
 		 928 aa  291  1e-76  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.186099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1307  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  36.26 
 
 		 789 aa  290  2e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.105152  hitchhiker  0.00575971 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2382  CheA signal transduction histidine kinase  30.37 
 
 		 679 aa  290  2e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0998  CheA signal transduction histidine kinase  33.44 
 
 		 783 aa  290  2e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.154879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0036  CheA signal transduction histidine kinase  30.37 
 
 		 742 aa  289  5e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1497  sensor histidine kinase/response regulator  35.69 
 
 		 793 aa  288  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16470  putative chemotaxis sensor/effector fusion protein  30.74 
 
 		 769 aa  286  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0944854  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4054  CheA signal transduction histidine kinase  29.91 
 
 		 989 aa  285  8.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.264346  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4348  CheA signal transduction histidine kinase  26.39 
 
 		 911 aa  285  8.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.485697 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0831  chemotaxis protein  32.96 
 
 		 752 aa  285  9e-75  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.203342  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0907  CheA signal transduction histidine kinase  29.95 
 
 		 911 aa  285  1e-74  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0908129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4288  CheA signal transduction histidine kinase  26.72 
 
 		 911 aa  283  2e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1836  CheA signal transduction histidine kinase  36.33 
 
 		 679 aa  284  2e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00846455 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3969  signal transduction histidine kinase (cheA)  29.36 
 
 		 768 aa  283  4e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00140745  normal  0.014071 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4206  CheA signal transduction histidine kinase  30 
 
 		 741 aa  283  4e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.351121  normal  0.245941 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5391  CheA signal transduction histidine kinase  29.38 
 
 		 760 aa  282  5e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.45011  normal  0.581829 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4016  CheA signal transduction histidine kinase  29.72 
 
 		 989 aa  281  8e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0416  CheA signal transduction histidine kinase  29.04 
 
 		 977 aa  277  1.0000000000000001e-72  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3200  CheA signal transduction histidine kinase  29.58 
 
 		 781 aa  277  2.0000000000000002e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.3357 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0725  CheA signal transduction histidine kinase  30.3 
 
 		 762 aa  275  8.000000000000001e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2780  CheA signal transduction histidine kinase  28.97 
 
 		 1736 aa  275  1e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>