More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0677 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007512  Plut_0677  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 85 aa  168  2e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00589237 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1890  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 120 aa  73.6  0.0000000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00515298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1136  helix-turn-helix domain-containing protein  42.65 
 
 		 77 aa  70.5  0.000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0889  XRE family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 81 aa  63.9  0.0000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1892  XRE family transcriptional regulator  49.18 
 
 		 390 aa  62.4  0.000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0261519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3995  XRE family transcriptional regulator  46.27 
 
 		 120 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00425  transcriptional regulator, XRE family protein  45 
 
 		 67 aa  60.8  0.000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0381282  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3445  XRE family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 76 aa  60.5  0.000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0664347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1180  XRE family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 81 aa  60.5  0.000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.133666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0684  XRE family transcriptional regulator  46.97 
 
 		 101 aa  60.1  0.00000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0300399  normal  0.200777 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0794  transcriptional regulator, XRE family  42.25 
 
 		 101 aa  59.7  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.382222 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0814  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 112 aa  59.3  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0751  helix-turn-helix domain-containing protein  48.33 
 
 		 69 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3920  transcriptional regulator, XRE family  40.98 
 
 		 72 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00000806628  normal  0.211868 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3871  transcriptional regulator, XRE family  40.98 
 
 		 72 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2016  transcriptional regulator, XRE family  43.28 
 
 		 93 aa  58.5  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0687  XRE family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 105 aa  58.5  0.00000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0236581  normal  0.500342 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0299  XRE family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 71 aa  58.5  0.00000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000289962  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0101  XRE family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 71 aa  58.5  0.00000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000391644  n/a   
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2524  transcriptional regulator, XRE family  44.07 
 
 		 76 aa  58.5  0.00000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000972778  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2326  hypothetical protein  40 
 
 		 87 aa  58.2  0.00000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1052  hypothetical protein  40 
 
 		 84 aa  58.2  0.00000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1555  DNA-binding protein  37.31 
 
 		 72 aa  57.8  0.00000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00000236293  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1500  transcriptional regulator, XRE family  45.16 
 
 		 81 aa  57.8  0.00000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4210  XRE family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 106 aa  57.8  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0378977 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0252  XRE family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 90 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7274  transcriptional regulator, XRE family  38.46 
 
 		 79 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.21577  normal  0.150525 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2116  hypothetical protein  40 
 
 		 86 aa  57  0.00000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_67  hypothetical protein  37.31 
 
 		 72 aa  57  0.00000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2009  transcriptional regulator, XRE family  41.89 
 
 		 93 aa  55.8  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.634386 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0107  transcriptional regulator, XRE family  39.74 
 
 		 93 aa  55.8  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.396345 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5293  XRE family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 81 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2812  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  40.91 
 
 		 338 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5565  XRE family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 81 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1986  transcriptional regulator, XRE family  27.63 
 
 		 101 aa  55.5  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0615547  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0459  transcriptional regulator, XRE family  42.62 
 
 		 81 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.995488  normal  0.299966 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6923  XRE family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 81 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.251007  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0002  type II restriction-modification system activator, putative  40 
 
 		 75 aa  54.7  0.0000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00243501  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4980  XRE family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 93 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.213037  normal  0.656597 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2575  XRE family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 230 aa  54.7  0.0000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.556687 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0058  transcriptional regulator, XRE family  43.55 
 
 		 112 aa  54.3  0.0000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0711688  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2195  XRE family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 83 aa  53.5  0.0000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0540  helix-turn-helix domain-containing protein  39.73 
 
 		 90 aa  53.5  0.0000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.229999 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0685  transcriptional regulator, XRE family  44.26 
 
 		 86 aa  53.1  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0936  XRE family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 84 aa  53.1  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000155637  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2388  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  38.75 
 
 		 299 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2112  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  38.75 
 
 		 299 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0280682 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2655  XRE family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 80 aa  52.4  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2012  DNA-binding protein  41.94 
 
 		 67 aa  52.8  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0741905  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2399  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  36.25 
 
 		 328 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.125376 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6198  XRE family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 104 aa  51.6  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2401  XRE family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 97 aa  52  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000242769  hitchhiker  0.0000223583 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4552  XRE family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 76 aa  51.2  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0455  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 78 aa  51.6  0.000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.181853  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2064  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  37.5 
 
 		 299 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.471576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1199  subunit S of type I restriction-modification system  39.34 
 
 		 77 aa  51.2  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0196  subunit S of type I restriction-modification system  39.34 
 
 		 77 aa  51.2  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.525048 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3773  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  37.5 
 
 		 294 aa  51.2  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.38574 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0461  XRE family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 97 aa  50.8  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.171408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0337  XRE family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 76 aa  51.2  0.000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0583349  normal  0.335191 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3803  XRE family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 76 aa  51.2  0.000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.151697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4174  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 81 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.852413  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4003  XRE family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 73 aa  50.8  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.168012 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1481  XRE family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 97 aa  50.8  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.817787 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0433  transcriptional regulator, XRE family  35.21 
 
 		 215 aa  50.8  0.000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0697  transcriptional regulator, XRE family  40.32 
 
 		 90 aa  50.8  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3515  XRE family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 73 aa  50.8  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0078  hypothetical protein  43.55 
 
 		 73 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2624  XRE family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 73 aa  50.4  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.930034 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1080  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 83 aa  50.4  0.000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.492824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3490  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 76 aa  50.4  0.000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.23046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4162  XRE family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 98 aa  50.4  0.000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1547  helix-turn-helix domain-containing protein  34.78 
 
 		 90 aa  50.4  0.000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0103504  normal  0.0779138 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2873  hypothetical protein  35.62 
 
 		 101 aa  49.7  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.305653  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2082  transcriptional regulator, XRE family  34.78 
 
 		 102 aa  50.1  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8538  transcriptional regulator, XRE family  42.86 
 
 		 321 aa  50.1  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000674281  hitchhiker  0.0000867328 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0596  transcriptional regulator, XRE family  35.29 
 
 		 90 aa  49.7  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1806  XRE family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 86 aa  49.7  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.579392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3590  XRE family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 79 aa  50.1  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.334421  normal  0.665085 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5197  transcriptional regulator, XRE family  42.62 
 
 		 88 aa  49.7  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5935  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 67 aa  49.7  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2349  hypothetical protein  39.13 
 
 		 69 aa  49.7  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1921  transcriptional regulator, XRE family  31.17 
 
 		 78 aa  48.9  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.339052  normal  0.010603 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2134  transcriptional regulator, XRE family  37.1 
 
 		 85 aa  49.3  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.123571  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1971  XRE family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 112 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.910423 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1410  DNA-binding protein  36.67 
 
 		 94 aa  48.1  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0931  DNA-binding protein  36.67 
 
 		 94 aa  48.1  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0999  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  36.76 
 
 		 129 aa  48.9  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0364  transcriptional regulator  36.67 
 
 		 94 aa  48.1  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.854921  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0675  XRE family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 213 aa  48.5  0.00003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00384462  hitchhiker  0.000593607 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0284  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 101 aa  48.1  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.214235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2085  XRE family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 207 aa  48.5  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.323846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1820  DNA-binding protein  36.67 
 
 		 94 aa  48.1  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0197  DNA-binding protein  36.67 
 
 		 94 aa  48.1  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.846925  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0695  transcriptional regulator, XRE family  36.23 
 
 		 101 aa  48.5  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.381064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0450  DNA-binding protein  36.67 
 
 		 94 aa  48.1  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.40319  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3421  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 154 aa  48.1  0.00004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5955  transcriptional regulator, XRE family  35.94 
 
 		 81 aa  48.1  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2406  hypothetical protein  34.78 
 
 		 99 aa  48.1  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1135  XRE family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 99 aa  48.1  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>